Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Вирус трансмиссивного гастроэнтерита
02-0042-F1.E.jpg
Электронная микрофотография коронавируса трансмиссивного гастроэнтерита (TGEV)
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Царство :Рибовирия
Королевство:Орторнавиры
Тип:Писувирикота
Учебный класс:Pisoniviricetes
Заказ:Нидовиралес
Семья:Coronaviridae
Род:Альфакоронавирус
Разновидность:Альфакоронавирус 1
Вирус:
Вирус трансмиссивного гастроэнтерита
Изоляты [1]

Вирус трансмиссивного гастроэнтерита или коронавирус трансмиссивного гастроэнтерита ( TGEV ) - это коронавирус, поражающий свиней. Это охватило , положительно чувство , одноцепочечной РНК - вирус , который вступает в клетку - хозяина путем связывания с рецептором APN . [2] Вирус является представителем рода Alphacoronavirus , подрода Tegacovirus, вида Alphacoronavirus 1 . [3] [4]

Белки, которые вносят вклад в общую структуру TGEV, включают шип (S), оболочку (E), мембрану (M) и нуклеокапсид (N). Размер генома коронавирусов составляет примерно 28,6 килобаз. [5] Другой коронавирус , которые принадлежат к видам Alphacoronavirus 1 являются кошачий коронавирус , собачий коронавирус и кошачий вирус инфекционного перитонита .

Биология [ править ]

TGEV принадлежит к семейству Coronaviridae , роду Alphacoronavirus , виду Alphacoronavirus 1 . Это вирус с оболочкой с положительным геномом одноцепочечной РНК. TGEV имеет три основных структурных белка: фосфопротеин (N), интегральный мембранный белок (E1) и большой гликопротеин (E2). Белок N инкапсулирует геномную РНК, а белок S образует вирусные проекции.

3'-сегмент длиной около 8000 нуклеотидов кодирует субгеномные РНК. Оставшаяся часть генома кодирует вирусную репликазу. Три самые большие генные последовательности от 5 'до 3' находятся в порядке от E2 до E1 до N. Существует около семи других открытых рамок считывания, которые структурно не связаны. Между генами очень мало совпадений и они плотно упакованы. Отрицательная цепь синтезируется, чтобы служить в качестве матрицы для транскрипции РНК одного размера генома и нескольких субгеномных размеров РНК.

Белок E2 образует лепестковидный выступ длиной 20 нм с поверхности вируса. Считается, что белок E2 участвует в патогенезе, помогая вирусу проникать в цитоплазму хозяина. Белок E2 изначально имеет 1447 остатков, а затем расщепляется короткая гидрофобная последовательность. После гликозилирования белка в гольджи белок затем включается в новый вирус. В белке E2 есть несколько функциональных доменов. Гидрофобный сегмент из 20 остатков на С-конце закрепляет белок в липидной мембране. Остальной белок делится на две части: гидрофильный участок, который находится внутри вируса, и участок, богатый цистеином, который, возможно, является сайтами ацилирования жира. Белок E1 в основном встроен в липидную оболочку и, следовательно, играет важную роль в архитектуре вируса.Постулируется, что белок E1 взаимодействует с мембраной лимфоцитов, что приводит к индукции генов, кодирующих IFN.

Коронавирусы проникают в хозяина, сначала прикрепляясь к клетке-хозяину с помощью гликопротеина шипа. Белок S взаимодействует со свиной аминопептидазой N (pAPN), клеточным рецептором, чтобы способствовать его проникновению. Тот же клеточный рецептор также является контактным звеном для коронавирусов человека. Домен в белке S-шипа распознается pAPN, и трансфекция pAPN происходит в непермиссивные клетки и инфицирует их TGEV.

Морфология [ править ]

Морфология TGEV в основном определялась методами электронной микроскопии. Морфология сходна с миксовирусом и онкогенным вирусом в том, что они имеют выступы на поверхности и оболочку. Вирусы имеют в основном круглую форму с диаметром от 100 до 150 нм, включая выступы на поверхности. Выступы в основном имели форму лепестков, прикрепленных очень узкой ножкой. Казалось, что проекции очень легко отделить от вируса и были обнаружены только на отдельных участках.

Патология [ править ]

TGEV заражает свиней. У поросят младше 1 недели смертность близка к 100%. Патология TGEV аналогична патологии других коронавирусов. Как только вирус заражает хозяина, он размножается в клеточной оболочке тонкого кишечника, что приводит к потере абсорбирующих клеток, что, в свою очередь, приводит к укорочению ворсинок. Зараженные свиньи теряют способность переваривать пищу и умирают от обезвоживания. [6]

Возникновение [ править ]

TGE был распространен в США, когда он был впервые обнаружен в начале 20 века. Он стал более редким в конце 80-х годов с ростом респираторного коронавируса свиней (PRCV). Считается, что PRCV обеспечивает некоторый иммунитет к TGE. [7]

Инженерный коронавирус TGEV [ править ]

Вирус трансмиссивного гастроэнтерита был сконструирован как вектор экспрессии. Вектор был сконструирован путем замены несущественных ORF 3a и 3b, которые управляются последовательностями, регулирующими транскрипцию (TRS), на зеленый флуоресцентный белок. Полученная конструкция все еще была энтеропатогенной, но с замедленным ростом. Инфекция клеток этим измененным вирусом вызывает специфический лактогенный иммунный ответ против гетерологичного белка. Применение этого вектора заключается в разработке вакцины или даже генной терапии. Мотивация для разработки генома TGEV заключается в том, что коронавирусы имеют большие геномы, поэтому в них есть место для встраивания чужеродных генов. Коронавирусы также заражают дыхательные пути , и их можно использовать для нацеливания антигенов на эту область и создания некоторого иммунного ответа.

См. Также [ править ]

Ссылки [ править ]

  1. ^ «ICTV 9-й отчет (2011) Coronaviridae » . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Проверено 26 января 2019 . Alphacoronavirus 1 Вирус трансмиссивного гастроэнтерита Вирус трансмиссивного гастроэнтерита вирулентный Purdue [AJ271965] (вирулентный Purdue TGEV) Названия видов выделены курсивом; названия подвидов и изолятов пишутся латиницей. Также перечислены порядковые номера доступа [] и присвоенные сокращения ().
  2. Перейти ↑ Fehr AR, Perlman S (2015). Майер Х. Дж., Бикертон Э, Бриттон П. (ред.). «Коронавирусы: обзор их репликации и патогенеза» . Методы молекулярной биологии . Springer. 1282 : 1–23. DOI : 10.1007 / 978-1-4939-2438-7_1 . ISBN 978-1-4939-2438-7. PMC  4369385 . PMID  25720466 . См. Таблицу 1.
  3. ^ Ву, Патрик CY; Хуанг, Йи; Лау, Сусанна КП; Юэн, Квок-Юнг (24 августа 2010 г.). «Геномика и биоинформатический анализ коронавирусов» . Вирусы . 2 (8): 1804–1820. DOI : 10,3390 / v2081803 . ISSN 1999-4915 . PMC 3185738 . PMID 21994708 . Рисунок 2. Филогенетический анализ РНК-зависимых РНК-полимераз (Pol) коронавирусов с доступными полными последовательностями генома. Дерево было построено методом объединения соседей и укоренено с использованием полипротеина вируса Breda.   
  4. ^ "Браузер таксономии (Alphacoronavirus 1)" . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 29 февраля 2020 .
  5. ^ Тиль V, изд. (2007). Коронавирусы: молекулярная и клеточная биология (1-е изд.). Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-16-5.[ требуется страница ]
  6. ^ Харрис, DL Хэнк. «Трансмиссивный гастроэнтерит у свиней» . Ветеринарное руководство Мерк . Merck . Дата обращения 7 июля 2019 .
  7. ^ Трансграничные и новые болезни животных . Государственный университет Айовы. 2016. ISBN. 978-0-9846270-5-9.

Внутренние ссылки [ править ]

  • Коронавирус
  • SADS-CoV

Внешние ссылки [ править ]

  • Лауд Х, Расшерт Д., Дельмас Б., Годе М., Гельфи Дж., Чарли Б. (июнь 1990 г.). «Молекулярная биология вируса трансмиссивного гастроэнтерита» . Ветеринарная микробиология . 23 (1–4): 147–54. DOI : 10.1016 / 0378-1135 (90) 90144-K . PMC  7117338 . PMID  2169670 .
  • Сола I, Алонсо С., Суньига С., Балаш М., Плана-Дуран Дж., Энжуанес Л. (апрель 2003 г.). «Разработка генома вируса трансмиссивного гастроэнтерита как вектора экспрессии, индуцирующего лактогенный иммунитет» . Журнал вирусологии . 77 (7): 4357–69. DOI : 10,1128 / JVI.77.7.4357-4369.2003 . PMC  150661 . PMID  12634392 .
  • Таджима М (март 1970 г.). «Морфология вируса трансмиссивного гастроэнтерита свиней» . Архив вирусологии . 29 (1): 105–8. DOI : 10.1007 / BF01253886 . PMC  7086923 . PMID  4195092 .