Белки группы триторакса ( TrxG ) представляют собой гетерогенный набор белков, основное действие которых заключается в поддержании экспрессии генов . Их можно разделить на три общих класса в зависимости от молекулярной функции:
- гистон- модифицирующие белки TrxG
- ремоделирующие хроматин белки TrxG
- ДНК-связывающие белки TrxG,
плюс другие белки TrxG, не отнесенные к первым трем классам. [1]
Открытие [ править ]
Член-основатель белков TrxG, триторакс (trx), был открыт ~ 1978 г. Филипом Ингхэмом в рамках его докторской диссертации, когда он был аспирантом в лаборатории Дж. Р. С. Уиттла в Университете Сассекса . [2] Гистон-лизин- N- метилтрансфераза 2А является человеческим гомологом trx. [2]
Имя | Символ (ы) |
---|---|
отсутствующие, маленькие или гомеотические диски 1 | ясень1 |
отсутствующие, маленькие или гомеотические диски 2 | пепел 2 |
Брахма | brm |
Брахма-ассоциированный белок 55 кДа | Bap55 |
Связанный с Брахмой белок 60 кДа | Bap60 |
Далао | Далао |
домино | дом |
Усилитель биторакса | E (bx) |
усилитель желтого 3 | САЙП или е (у) 3 |
веко | Эльд или Оса |
женский бесплодный (1) гомеотический | fs (1) h |
граппа | gpp |
Имитация SWI | Iswi |
кисмет | поцелуй |
маленькие имагинальные диски | крышка |
лола нравится | лолал |
модификатор ЦРТ 4 | mod (mdg4), E (var) 3-93D или doom |
Мойра | мор |
Фактор ремоделирования нуклеосом-38 кДа | Нурф38 |
триторакс | trx |
Триторакс как | Trl |
Повсеместно транскрибируемый тетратрикопептидный повтор, Х-хромосома | Utx |
Verthandi | vtd |
зесте | z |
В таблице приведены названия членов TrxG дрозофилы. Гомологи у других видов могут иметь другие названия.
Функция [ править ]
Белки группы триторакса обычно функционируют в виде больших комплексов, образованных с другими белками. Комплексы, образованные белками TrxG, делятся на две группы: гистон-модифицирующие комплексы и АТФ- зависимые ремоделирующие хроматин комплексы. Основная функция белков TrxG, наряду с белками группы поликомб (PcG), - регулирование экспрессии генов. В то время как белки PcG обычно связаны с подавлением гена , белки TrxG чаще всего связаны с активацией генов . Комплекс trithorax активирует транскрипцию гена, индуцируя триметилирование лизина 4 гистона H3 ( H3K4me3 ) в определенных участках хроматина, распознаваемых комплексом. [1]Домен Ash1 участвует в метилировании H3K36. Комплекс Trithorax также взаимодействует с CBP (CREB-связывающим белком), который является актеилтрансферазой для ацетилирования H3K27. [3] Активация гена усиливается ацетилированием гистона H4. Действия белков TrxG часто описываются как «антагонистические» функции белков PcG. [4] Помимо регуляции генов, данные свидетельствуют о том, что белки TrxG также участвуют в других процессах, включая апоптоз , рак и стрессовые реакции. [5] [6] [7]
Роль в развитии [ править ]
Во время развития белки TrxG поддерживают активацию необходимых генов, особенно Hox-генов , после истощения материнских факторов. [8] Это достигается за счет сохранения эпигенетических меток, в частности H3K4me3, установленных материнскими факторами. [9] Белки TrxG также участвуют в инактивации Х-хромосомы , которая происходит во время раннего эмбриогенеза . [10] По состоянию на 2011 г. [Обновить]неясно, требуется ли активность TrxG в каждой клетке на протяжении всего развития организма или только на определенных стадиях в определенных типах клеток. [11]
См. Также [ править ]
- HIstome
- Гистонацетилтрансфераза
- Гистоновые деацетилазы
- Гистоновая метилтрансфераза
- Ферменты, модифицирующие гистоны
- Нуклеосома
- Путь PRMT4
Ссылки [ править ]
- ^ a b Schuettengruber B, Chourrout D, Vervoort M, Leblanc B, Cavalli G (февраль 2007 г.). «Регуляция генома белками polycomb и trithorax». Cell . 128 (4): 735–45. DOI : 10.1016 / j.cell.2007.02.009 . PMID 17320510 .
- ^ a b Ingham PW (1998). «Триторакс и регуляция экспрессии гомеотических генов у дрозофилы: историческая перспектива». Int. J. Dev. Биол . 42 (3): 423–9. PMID 9654027 .
- ^ Гейслер, Сара Дж .; Паро, Ренато (01.09.2015). «Групповое регулирование Trithorax и Polycomb: рассказ о противоположных действиях» . Развитие . 142 (17): 2876–2887. DOI : 10.1242 / dev.120030 . ISSN 0950-1991 . PMID 26329598 .
- ^ Гримо C, Nègre N, Cavalli G (2006). «От генетики к эпигенетике: рассказ о генах группы Polycomb и группы триторакса». Chromosome Res . 14 (4): 363–75. DOI : 10.1007 / s10577-006-1069-у . PMID 16821133 .
- ^ Tyagi S, г - н W (октябрь 2009). «E2F1 опосредует повреждение ДНК и апоптоз через HCF-1 и семейство гистоновых метилтрансфераз MLL» . EMBO J . 28 (20): 3185–95. DOI : 10.1038 / emboj.2009.258 . PMC 2771094 . PMID 19763085 .
- Перейти ↑ Siebold AP, Banerjee R, Tie F, Kiss DL, Moskowitz J, Harte PJ (январь 2010 г.). «Polycomb Repressive Complex 2 и Trithorax модулируют продолжительность жизни и стрессоустойчивость дрозофилы» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 107 (1): 169–74. DOI : 10.1073 / pnas.0907739107 . PMC 2806727 . PMID 20018689 .
- ^ Багчи А, Papazoglu С, В Y, Капурс D, Brodt М, Фрэнсис Д, Бредели М, Vogel Н, Миллс АА (февраль 2007 г.). «CHD5 является опухолевым супрессором 1p36 человека». Cell . 128 (3): 459–75. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.11.052 . PMID 17289567 .
- ^ Brock HW, Fisher CL (март 2005). «Поддержание паттернов экспрессии генов» . Dev. Дин . 232 (3): 633–55. DOI : 10.1002 / dvdy.20298 . PMID 15704101 .
- ↑ Сошникова N (август 2011). «Динамика активности Polycomb и Trithorax в процессе разработки». Исследование врожденных дефектов. Часть A: Клиническая и молекулярная тератология . 91 (8): 781–7. DOI : 10.1002 / bdra.20774 . PMID 21290568 .
- ^ Pullirsch D, Härtel R, Kishimoto H, Лейба M, Steiner G, Wutz A (март 2010). «Белки группы Trithorax Ash2l и Saf-A рекрутируются в неактивную Х-хромосому в начале стабильной инактивации Х-хромосомы» . Развитие . 137 (6): 935–43. DOI : 10.1242 / dev.035956 . PMC 2834461 . PMID 20150277 .
- ^ Schuettengruber B, Martinez AM, Iovino N, Cavalli G (декабрь 2011). «Белки группы Trithorax: включение генов и поддержание их активности». Nat. Rev. Mol. Cell Biol . 12 (12): 799–814. DOI : 10.1038 / nrm3230 . hdl : 21.11116 / 0000-0006-0774-0 . PMID 22108599 .
Внешние ссылки [ править ]
- Страница Polycomb и Trithorax лаборатории Cavalli Эта страница содержит полезную информацию о белках Polycomb и trithorax в форме введения, ссылки на опубликованные обзоры, список белков Polycomb и trithorax, иллюстративные слайды Power Point и ссылку на браузер генома демонстрируя распределение этих белков по всему геному у Drosophila melanogaster.
- Интерактивная муха - Общество биологии развития