Стивен Червиц Трутейн — мое официальное официальное имя, хотя первоначально это было Стивен Аллен Червиц , как описано здесь . Так что вы можете знать меня как имеющую фамилию Трутане или как Червиц , в зависимости от того, из какой эпохи моей жизни или круга друзей вы меня знаете. Я отвечаю на любой, так что используйте тот, который вы хотите. Для простоты можете называть меня просто "Стив".
Днём я работаю инженером-программистом в области биоинформатики в компании Personalis , занимаюсь прецизионной медициной для иммуноонкологии , предоставляя инструменты для аннотирования и помощи в интерпретации вариаций человеческого генома от индивидуумов и их опухолей. Я также работал над программным обеспечением для анализа генома в Omicia , а до этого в Affymetrix , где я помогал аннотировать наборы ДНК-микрочипов для ученых-конечных пользователей через веб-портал NetAffx . Я пришел в Affy в ноябре 2000 года, когда она приобрела Neomorphic (в архиве) , к которой я присоединился в сентябре 1998 года. Так что компьютеры и биологические « омиксные » данные — мои друзья.
У меня есть степень бакалавра биологии в колледже Макалестер и докторская степень. из отдела MCDB CU Boulder , работая под руководством профессора Джозефа Фальке в отделе биохимии, проводя эксперименты по молекулярной биологии в влажной лаборатории с хеморецептором , который опосредует бактериальный хемотаксис . Я провел достаточное количество анализов сайт-направленного мутагенеза и передачи сигнала in vitro, а также 3D-визуализации молекулярной графики и анализа структуры белка и других забавных вещей (например, изучил себя C ).
После Боулдера я переключился на мир геномики (или постгеномики ), присоединившись к лаборатории Дэвида Ботштейна (когда он был в Стэнфорде ), работая над базой данных геномов сахаромицетов ( S. cerevisiae , также известные как пекарские дрожжи, были первыми эукариотами , его геном полностью секвенирован , что произошло в апреле 1996 года, примерно через 3 месяца после того, как я начал с SGD). Во время работы в SGD я разработал множество модулей Perl для работы с данными биоинформатики и внес большую часть этого кода в проект BioPerl с открытым исходным кодом.проект, который примерно в это время только начинался, как отмечалось в ранней истории BioPerl .
Я больше не принимаю активного участия в разработке BioPerl, но продолжаю быть поклонником Open Bioinformatics Foundation (и программного обеспечения с открытым исходным кодом для науки в целом). Другие проекты, в которых я участвовал, включают проекты BioDAS , GenoViz и HCLS . Я состою в правлении FGED Society (с 2002 г.) и продолжаю работать с ними в качестве секретаря и веб-мастера с 2010 г.
В свободное время я либо тусуюсь со своей семьей , либо тренируюсь, либо организую триатлоны , пропагандирую здоровье и фитнес , пишу твиты , вношу свой вклад в Википедию ( моя статистика ) или пытаюсь помочь человечеству с помощью основанной мной организации TeamHuman.org. . Мне кажется, Википедия хорошо согласуется с целью TeamHuman.org «содействовать общему пониманию».