Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
GC
Протеин GC PDB 1j78.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1J78 , 1J7E , 1KW2 , 1KXP , 1LOT , 1MA9

Идентификаторы
ПсевдонимыGC , DBP, DBP / GRD3, HEL-S-51, VDBG, VDBP, Gc-MAF, GcMAF, белок, связывающий витамин D, DBP-maf, VDB, GC витамин D, связывающий белок
Внешние идентификаторыOMIM: 139200 MGI: 95669 HomoloGene: 486 GeneCard: GC
Расположение гена (человек)
Хромосома 4 (человек)
Chr.Хромосома 4 (человека) [1]
Хромосома 4 (человек)
Геномное расположение для GC
Геномное расположение для GC
Группа4q13.3Начинать71 741 696 п.н. [1]
Конец71 804 041 п.н. [1]
Расположение гена (Мышь)
Хромосома 5 (мышь)
Chr.Хромосома 5 (мышь) [2]
Хромосома 5 (мышь)
Геномное расположение для GC
Геномное расположение для GC
Группа5 E1 | 5 44,32 смНачинать89 417 522 п.н. [2]
Конец89 457 898 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE GC 204965 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• связывание витамина D
• связывание кальцидиола
• связывание актина
• активность трансмембранного переносчика витаминов
Сотовый компонент• микрочастица крови
• внеклеточная область
• просвет лизосомы
• внеклеточная экзосома
• внеклеточная
• цитозоль
Биологический процесс• метаболический процесс витамина D
• транспорт витаминов
• транспорт
• трансмембранный транспорт витамина
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

2638

14473

Ансамбль

ENSG00000145321

ENSMUSG00000035540

UniProt

P02774

P21614

RefSeq (мРНК)

NM_000583
NM_001204306
NM_001204307

NM_008096

RefSeq (белок)

NP_000574
NP_001191235
NP_001191236

NP_032122

Расположение (UCSC)Chr 4: 71,74 - 71,8 МбChr 5: 89.42 - 89.46 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Витамин D-связывающий белок (ДБФ), а также / первоначально известный как Gc-глобулина ( г Роап специфические с omponent), представляет собой белок , который у человека кодируется GC гена . [5] [6]

Структура [ править ]

Человеческий GC представляет собой гликозилированный альфа-глобулин размером ~ 58 кДа. Его 458 аминокислот кодируются 1690 нуклеотидами на хромосоме 4 (4q11 – q13). Первичная структура содержит 28 остатков цистеина, образующих множественные дисульфидные связи. GC содержит 3 домена. Домен 1 состоит из 10 альфа-спиралей, домен 2 из 9 и домен 3 из 4. [7]

Функция [ править ]

Связывающий витамин D белок принадлежит к семейству генов альбумина вместе с человеческим сывороточным альбумином и альфа-фетопротеином . Это многофункциональный белок, обнаруженный в плазме, асцитической жидкости , спинномозговой жидкости и на поверхности многих типов клеток.

Он способен связывать различные формы витамина D, включая эргокальциферол (витамин D 2 ) и холекальциферол (витамин D 3 ), 25-гидроксилированные формы ( кальцифедиол ) и активный гормональный продукт 1,25-дигидроксивитамин D ( кальцитриол ). . Основная часть витамина D в крови связана с этим белком. Он переносит метаболиты витамина D между кожей, печенью и почками, а затем к различным тканям-мишеням. [6] [8]

В качестве фактора активации макрофагов, производных от белка Gc, это фактор активации макрофагов (MAF), который был протестирован для использования в качестве средства лечения рака, которое активирует макрофаги против раковых клеток. [9]

Интерактивная карта проезда [ править ]

Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы ссылки на соответствующие статьи. [§ 1]

  1. ^ Интерактивную карту путей можно редактировать на WikiPathways: "VitaminDSynthesis_WP1531" .

Производство [ править ]

Он синтезируется клетками паренхимы печени и секретируется в кровоток . [8]

Генетическая вариация [ править ]

Известно множество генетических вариантов гена GC . Они продуцируют 6 основных гаплотипов и 3 основных варианта белка (Gc1S, Gc1F и Gc2). [10] Генетические вариации связаны с различиями в уровнях циркулирующего 25-гидроксивитамина D. [11] Они были предложены для объяснения некоторых различий в статусе витамина D у разных этнических групп [12], и было обнаружено, что они коррелируют с реакцией на добавку витамина D. [10]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000145321 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: Версия Ensembl 89: ENSMUSG00000035540 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ↑ Mikkelsen M, Jacobsen P, Henningsen K (июль 1977 г.). «Возможная локализация Gc-системы на хромосоме 4. Потеря материала длинной руки 4, связанная с несовместимостью отца и ребенка внутри Gc-системы». Человеческая наследственность . 27 (2): 105–7. DOI : 10.1159 / 000152857 . PMID 558959 . 
  6. ^ a b «Ген Entrez: компонент, специфичный для группы GC (белок, связывающий витамин D)» .
  7. ^ Verboven C, Rabijns A, De Maeyer M, Van Baelen H, Бульон R, De пустослов C (февраль 2002). «Структурная основа уникальных свойств связывания человеческого витамин D-связывающего белка». Структурная биология природы . 9 (2): 131–6. DOI : 10.1038 / nsb754 . PMID 11799400 . S2CID 38990672 .  
  8. ^ а б Норман А.В. (август 2008 г.). «От витамина D к гормону D: основы эндокринной системы витамина D, необходимые для хорошего здоровья» . Американский журнал клинического питания . 88 (2): 491S – 499S. DOI : 10.1093 / ajcn / 88.2.491S . PMID 18689389 . 
  9. ↑ Ямамото Н., Суяма Н., Ямамото Н. (июль 2008 г.). «Иммунотерапия рака простаты с использованием Gc-протеина, активирующего макрофагально-активирующий фактор, GcMAF» ([PDF]) . Трансляционная онкология . 1 (2): 65–72. DOI : 10.1593 / tlo.08106 . PMC 2510818 . PMID 18633461 .   
  10. ^ a b Малик С., Фу Л., Джурас Д.Д., Кармали М., Вонг Б.А., Гоздзик А., Коул Д.Е. (январь – февраль 2013 г.). «Общие варианты гена белка, связывающего витамин D, и неблагоприятные последствия для здоровья» . Критические обзоры в клинических лабораторных науках . 50 (1): 1–22. DOI : 10.3109 / 10408363.2012.750262 . PMC 3613945 . PMID 23427793 .  
  11. ↑ McGrath JJ, Saha S, Burne TH, Eyles DW (июль 2010 г.). «Систематический обзор связи между общими однонуклеотидными полиморфизмами и концентрациями 25-гидроксивитамина D». Журнал стероидной биохимии и молекулярной биологии . 121 (1–2): 471–7. DOI : 10.1016 / j.jsbmb.2010.03.073 . PMID 20363324 . S2CID 20057294 .  
  12. ^ Powe CE, Evans MK, Wenger J, Zonderman AB, Berg AH, Nalls M, Tamez H, Zhang D, Bhan I, Karumanchi SA, Powe NR, Thadhani R (ноябрь 2013 г.). «Витамин D-связывающий белок и статус витамина D у чернокожих американцев и белых американцев» . Медицинский журнал Новой Англии . 369 (21): 1991–2000. DOI : 10.1056 / NEJMoa1306357 . PMC 4030388 . PMID 24256378 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Свасти Дж., Курски А., Беннет А., Боуман Б. Х. (апрель 1979 г.). «Молекулярная основа для трех основных форм человеческого сывороточного белка, связывающего витамин D (группоспецифический компонент)». Биохимия . 18 (8): 1611–7. DOI : 10.1021 / bi00575a036 . PMID  218624 .
  • Браун А., Бихлмайер Р., Клив Г. (июнь 1992 г.). «Молекулярный анализ гена человеческого витамин D-связывающего белка (группоспецифический компонент): аллельные различия общих генетических типов GC». Генетика человека . 89 (4): 401–6. DOI : 10.1007 / BF00194311 . PMID  1352271 . S2CID  1913655 .
  • Эстебан К., Гойскенс М., Эна Дж. М., Мишал З., Мачо А., Торрес Дж. М., Уриэль Дж. (Май 1992 г.). «Рецептор-опосредованное поглощение и обработка витамин D-связывающего белка в человеческих B-лимфоидных клетках». Журнал биологической химии . 267 (14): 10177–83. PMID  1374401 .
  • Шпирер К., Ривьер М., Кортезе Р., Накамура Т., Ислам MQ, Леван Г., Шпирер Дж. (Июнь 1992 г.). «Хромосомная локализация у человека и крысы генов, кодирующих обогащенные печенью факторы транскрипции C / EBP, DBP и HNF1 / LFB-1 (CEBP, DBP и фактор транскрипции 1, TCF1, соответственно) и фактор роста гепатоцитов / ген фактора рассеяния (HGF) ». Геномика . 13 (2): 293–300. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (92) 90245-N . PMID  1535333 .
  • Доусон С.Дж., Белый Лос-Анджелес (май 1992 г.). «Лечение эндокардита Haemophilus aphrophilus ципрофлоксацином». Журнал инфекции . 24 (3): 317–20. DOI : 10.1016 / S0163-4453 (05) 80037-4 . PMID  1602151 .
  • Ян Ф., Бержерон Дж. М., Лайнехан Л. А., Лалли П. А., Сакагучи А. Ю., Боуман Б. Х. (август 1990 г.). «Картирование и сохранение гена специфического компонента у мышей». Геномика . 7 (4): 509–16. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (90) 90193-X . PMID  1696927 .
  • Ян Ф., Луна В.Дж., Маканелли Р.Д., Наберхаус К.Х., Купплс Р.Л., Боуман Б.Х. (ноябрь 1985 г.). «Эволюционные и структурные отношения между групповым компонентом, альбумином и альфа-фетопротеином» . Исследования нуклеиновых кислот . 13 (22): 8007–17. DOI : 10.1093 / NAR / 13.22.8007 . PMC  322106 . PMID  2415926 .
  • Ян Ф., Брун Дж. Л., Нейлор С. Л., Куплс Р. Л., Наберхаус К. Х., Боуман Б. Х. (декабрь 1985 г.). «Человеческий специфический для группы компонент (Gc) является членом семейства альбуминов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 82 (23): 7994–8. DOI : 10.1073 / pnas.82.23.7994 . PMC  391428 . PMID  2415977 .
  • Кук NE, Дэвид EV (декабрь 1985 г.). «Сывороточный витамин D-связывающий белок является третьим членом семейства генов альбумина и альфа-фетопротеина» . Журнал клинических исследований . 76 (6): 2420–4. DOI : 10.1172 / JCI112256 . PMC  424397 . PMID  2416779 .
  • Schoentgen F, Metz-Boutigue MH, Jollès J, Constans J, Jollès P (июнь 1986). «Полная аминокислотная последовательность человеческого витамин D-связывающего белка (группоспецифический компонент): свидетельство трехкратной внутренней гомологии, как у сывороточного альбумина и альфа-фетопротеина». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура белка и молекулярная энзимология . 871 (2): 189–98. DOI : 10.1016 / 0167-4838 (86) 90173-1 . PMID  2423133 .
  • McNearney TA, Odell C, Holers VM, Spear PG, Atkinson JP (ноябрь 1987 г.). «Гликопротеины вируса простого герпеса gC-1 и gC-2 связываются с третьим компонентом комплемента и обеспечивают защиту от опосредованной комплементом нейтрализации вирусной инфекционности» . Журнал экспериментальной медицины . 166 (5): 1525–35. DOI : 10,1084 / jem.166.5.1525 . PMC  2189652 . PMID  2824652 .
  • Ян Ф, Наберхаус К. Х., Адриан Г. С., Гарделла Дж. М., Бриссенден Дж. Э., Боуман Б. Х. (1987). «Ген витамин D-связывающего белка содержит консервативные нуклеотидные последовательности, которые отвечают на тяжелые металлы, адипоциты и митотические сигналы». Джин . 54 (2–3): 285–90. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (87) 90499-9 . PMID  2958390 .
  • Кук NE, Уиллард Х.Ф., Дэвид Э.В., Джордж Д.Л. (июль 1986 г.). «Прямое региональное отнесение гена связывающего витамин D белка (Gc-глобулин) к человеческой хромосоме 4q11-q13 и идентификация ассоциированного полиморфизма ДНК». Генетика человека . 73 (3): 225–9. DOI : 10.1007 / BF00401232 . PMID  3015768 . S2CID  38816588 .
  • Нестлер Дж. Э., Маклеод Дж. Ф., Ковальский М. А., Штраус Дж. Ф., Хаддад Дж. Г. (май 1987 г.). «Обнаружение белка, связывающего витамин D, на поверхности цитотрофобластов, выделенных из плаценты человека». Эндокринология . 120 (5): 1996–2002. DOI : 10,1210 / эндо-120-5-1996 . PMID  3552627 .
  • Пирс Э.А., Дама М.С., Бульон Р., Ван Бэлен Х., ДеЛука Х.Ф. (декабрь 1985 г.). «Моноклональные антитела к человеческому витамин D-связывающему белку» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 82 (24): 8429–33. DOI : 10.1073 / pnas.82.24.8429 . PMC  390929 . PMID  3936035 .
  • Вутен М.В., Нел А.Е., Гольдшмидт-Клермонт П.Дж., Гэлбрейт Р.М., Ренн Р.В. (октябрь 1985 г.). «Идентификация основного эндогенного субстрата для фосфолипид / Са2 + -зависимой киназы в ацинусах поджелудочной железы как Gc (витамин D-связывающий белок)» . Письма FEBS . 191 (1): 97–101. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (85) 81001-2 . PMID  4054306 . S2CID  29613843 .
  • Констанс Дж., Оксман Ф., Виау М. (август 1981 г.). «Связывание апо- и холоформ сывороточного витамин D-связывающего белка с цитоплазмой и мембраной лимфоцитов человека путем непрямой иммунофлуоресценции». Письма иммунологии . 3 (3): 159–62. DOI : 10.1016 / 0165-2478 (81) 90120-6 . PMID  7026425 .
  • Браун А., Кофлер А., Моравиц С., Клив Н. (декабрь 1993 г.). «Последовательность и организация гена человеческого витамин D-связывающего белка». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия генов . 1216 (3): 385–94. DOI : 10.1016 / 0167-4781 (93) 90005-х . PMID  7505619 .
  • Свами Н., Рой А., Чанг Р., Бриссон М., Рэй Р. (апрель 1995 г.). «Аффинная очистка человеческого витамин D-связывающего белка плазмы». Экспрессия и очистка белков . 6 (2): 185–8. DOI : 10,1006 / prep.1995.1023 . PMID  7606167 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P02774 (белок, связывающий витамин D) в PDBe-KB .