| Валлемия ихтиофага | |
|---|---|
 | |
| Микрофотография, показывающая характерную сарциноподобную морфологию W. ichthyophaga и кристаллы NaCl. | |
| Научная классификация | |
| Царство: | |
| Разделение: | |
| Класс: | |
| Приказ: | |
| Семья: | |
| Род: | |
| Разновидность: | W. ихтиофага |
| Биномиальное имя | |
| Валлемия ихтиофага Йохан-Ольсен 1887 г. | |
Wallemia ichthyophaga - один из трех видов грибов рода Wallemia , который, в свою очередь, является единственным родом класса Wallemiomycetes . [1] Филогенетическое происхождение линии было отнесено к различным частям Basidiomycota , но, согласно анализу более крупных наборов данных, это сестринская группа Agaricomycotina (возрастом 495 миллионов лет). [2] [3] Хотя изначально считалось, что это бесполая геномика, популяционная геномика обнаружила доказательства рекомбинации между штаммами, и локус типа спаривания был идентифицирован во всех секвенированных геномах вида. [3] [4]
К настоящему времени выделено лишь ограниченное количество штаммов W. ichthyophaga (из гиперсоленой воды солнечных солончаков , выпей (богатые магнием остаточные растворы при производстве соли из морской воды) и соленого мяса). [1]
W. ichthyophaga требуется не менее 1,5 М NaCl для роста in vitro (или какой-либо другой осмолит для эквивалентной активности воды ), и он хорошо себя чувствует даже в насыщенном растворе NaCl. Это делает его наиболее галофильным из известных грибов и отличает его от галотолерантных (например, Aureobasidium pullulans ) и чрезвычайно галотолерантных грибов (например, Hortaea werneckii ), которые способны хорошо расти даже при отсутствии соли в среде. [5] Неспособность расти без соли является исключением в царстве грибов, но часто встречается у галофильных архей . [6]
Гриб растет в виде сарциноподобных структур или компактных многоклеточных скоплений. [1] Они увеличиваются в размере почти в четыре раза при воздействии высокой солености, а клеточная стенка утолщается в три раза. Это приводит к значительному уменьшению функционального объема клеток и считается одним из механизмов галотолерантности этого вида. [7]
Целом секвенирование генома из W. ichthyophaga показало , что она имеет один из самых маленьких из всех секвенированных базидиальных геномов (9.6 MBP, только 4884 предсказанных белок). [3] В отличие от того, что наблюдалось для чрезвычайно галотолерантного H. werneckii , у W. ichthyophaga почти нет экспансий в генах переносчиков катионов металлов, и их экспрессия не зависит от соли. С другой стороны, существует огромное количество гидрофобинов (белков клеточной стенки с разнообразными функциями и многими биотехнологическими применениями), которые содержат необычно высокую долю кислых аминокислот. [3]Считается, что высокая доля кислых аминокислот является адаптацией белков к высоким концентрациям соли. [8] После секвенирования геномов почти всех известных штаммов W. ichthyophaga популяционный геномный анализ показал, что эти виды образуют единую рекомбинирующую популяцию. [4]
Ссылки [ править ]
- ^ a b c Zalar, P .; Sybren De Hoog, G .; Schroers, HJ; Франк, JM; Гунде-Цимерман, Н. (2005). «Таксономия и филогения ксерофильного рода Wallemia (Wallemiomycetes and Wallemiales, cl. Et ord. Nov.)». Антони ван Левенгук . 87 (4): 311–328. DOI : 10.1007 / s10482-004-6783-х . PMID 15928984 .
- ^ Padamsee, M .; Кумар, ТКА; Riley, R .; Binder, M .; Boyd, A .; Кальво, AM; Furukawa, K .; Hesse, C .; Hohmann, S .; Джеймс, штат Нью-Йорк; Labutti, K .; Lapidus, A .; Lindquist, E .; Lucas, S .; Miller, K .; Shantappa, S .; Григорьев И.В. Hibbett, DS; Маклафлин, диджей; Spatafora, JW; Эйме, MC (2012). «Геном ксеротолерантной плесени Wallemia sebi показывает адаптацию к осмотическому стрессу и предполагает загадочное половое размножение» (PDF) . Генетика и биология грибов . 49 (3): 217–226. DOI : 10.1016 / j.fgb.2012.01.007 . PMID 22326418 .
- ^ a b c d Zajc, J .; Liu, Y .; Dai, W .; Ян, З .; Hu, J .; Gostin Ar, C .; Гунде-Цимерман, Н. (2013). «Секвенирование генома и транскриптома галофильного гриба Wallemia ichthyophaga: галоадаптации присутствуют и отсутствуют» . BMC Genomics . 14 : 617. DOI : 10.1186 / 1471-2164-14-617 . PMC 3849046 . PMID 24034603 .
- ^ a b Gostinčar, Cene; Сунь, Сяохуань; Зайч, Джанджа; Фанг, Чао; Хоу, Юн; Ло, Юнлунь; Гунде-Цимерман, Нина; Песня, Zewei (2019). "Популяционная геномика облигатно галофильных базидиомицетов Wallemia ichthyophaga" . Границы микробиологии . 10 : 2019. doi : 10.3389 / fmicb.2019.02019 . ISSN 1664-302X . PMC 6738226 . PMID 31551960 .
- ^ Gostinčar, C .; Ленасси, М .; Gunde-Cimerman, N .; Племениташ, А. (2011). Адаптация грибов к чрезвычайно высоким концентрациям соли . Успехи прикладной микробиологии. 77 . С. 71–96. DOI : 10.1016 / B978-0-12-387044-5.00003-0 . ISBN 9780123870445. PMID 22050822 .
- ^ Gostinčar, C .; Grube, M .; De Hoog, S .; Залар, П .; Гунде-Цимерман, Н. (2010). «Экстремотолерантность грибов: эволюция на грани» . FEMS Microbiology Ecology . 71 (1): 2–11. DOI : 10.1111 / j.1574-6941.2009.00794.x . PMID 19878320 .
- ^ Kralj Kuncic, M .; Kogej, T .; Дробне, Д .; Гунде-Цимерман, Н. (2009). «Морфологический ответ галофильных грибов рода Wallemia на высокую соленость» . Прикладная и экологическая микробиология . 76 (1): 329–337. DOI : 10,1128 / AEM.02318-09 . PMC 2798636 . PMID 19897760 .
- ^ Madern, D .; Ebel, C .; Закчай, Г. (2000). «Галофильная адаптация ферментов». Экстремофилы: жизнь в экстремальных условиях . 4 (2): 91–98. DOI : 10.1007 / s007920050142 . PMID 10805563 .
