Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Hortaea werneckii
Гриб Hortaea-werneckii - причины-tinea-nigra.jpg
Микрофотография гриба Hortaea werneckii
Научная классификация
Царство:
Грибы
Разделение:
Аскомикота
Класс:
Дотидеомицеты
Приказ:
Capnodiales
Семья:
Teratosphaeriaceae
Род:
Hortaea
Разновидность:
H. werneckii
Биномиальное имя
Hortaea werneckii
(Орта) Нишим. И Мияджи (1984)

Hortaea werneckii - разновидность дрожжей семейства Teratosphaeriaceae . [1] Это черные дрожжи, которые исследуются на предмет их замечательной галотолерантности . [2] [3] Хотя добавление соли в среду для выращивания не требуется, H. werneckii может расти врастворах NaCl,близких к насыщенным . [4] Чтобы подчеркнуть эту необычно широкую приспособляемость и отличить H. werneckii от других галотолерантных грибов, которые имеют более низкие пределы максимальной солености, некоторые авторы описывают  H. werneckii  как «чрезвычайно галотолерантный». [4]

Некоторые механизмы солеустойчивости H. werneckii были изучены на молекулярном уровне. [4] Например, известно, что его основными совместимыми растворенными веществами являются глицерин , эритрит , арабит и маннит ; Накопление меланина в клеточной стенке способствует удержанию, по крайней мере, глицерина внутри клетки. [3] Некоторые компоненты сигнального пути высокоосмолярного глицерина (HOG) (который контролирует реакцию на осмотический шок ) были подробно изучены, и некоторые из них, по-видимому, отличаются по функциям по сравнению с их аналогами в Saccharomyces cerevisiae . [5][6] [7] Адаптация к высоким концентрациям соли также сопровождается изменениями липидного составамембран, в основном за счет увеличения ненасыщенности фосфолипидных жирных кислот. [8] [9]

H. werneckii вызывает редкую поверхностную и неинвазивную кожную инфекцию, Tinea nigra . [10] Типичные симптомы - гладкие, гладкие, коричнево-черные безболезненные пятна на ладонях рук и подошвах ног.

Рост H. werneckii в жидких средах часто бывает дрожжевым , хотя может переходить в нитевидный рост. Механизм переключателя неизвестен. Клетки кажутся коричневыми из-за выработки меланина. [3]

Всего секвенирование генома из Н. werneckii [11] [12] показал недавнее целое дублирование генома , считается только сообщили дублирование целого генома среди ascomycetous дрожжей помимо более известных один в CEREVISIAE Saccharomyces линии. [13] Основываясь на секвенировании генома дополнительных штаммов, у 10 из 12 штаммов есть геном, который был продублирован в результате нескольких гибридизаций между гаплоидными штаммами, давая сформированные стабильные диплоиды. Помимо этих событий гибридизации, никаких признаков полового размножения обнаружено не было. [14] Как следствие, геном H. werneckii относительно велик (49,9 МБ) с 15974 предсказанными генами. [12]Гены, кодирующие переносчики катионов металлов, которые, как считается, играют роль в галотолерантности , испытали несколько дополнительных дупликаций генов на разных этапах своей эволюции. [11]

Homothallic спаривания локус был обнаружен во всех секвенированных геном, хотя один из генов сопрягаемыхов могут быть инактивированы в некоторых штаммах. Несмотря на это, филогенетический анализ и анализ неравновесия по сцеплению показывают, что H. werneckii бесполый. [14]

Ссылки [ править ]

  1. ^ "Архивная копия" . Архивировано из оригинала на 2009-08-21 . Проверено 10 августа 2009 .CS1 maint: заархивированная копия как заголовок ( ссылка )
  2. ^ Гунда-Cimerman Н, Рамос Дж, Plemenitas А (ноябрь 2009 г.). «Галотолерантные и галофильные грибы». Микологические исследования . 113 (Pt 11): 1231–41. DOI : 10.1016 / j.mycres.2009.09.002 . PMID 19747974 . 
  3. ^ a b c Когей Т., Стейн М., Фолькманн М., Горбушина А.А., Галински Е.А., Гунде-Цимерман Н. (декабрь 2007 г.). «Осмотическая адаптация галофильного гриба Hortaea werneckii: роль осмолитов и меланизация». Микробиология . 153 (Pt 12): 4261–73. DOI : 10.1099 / mic.0.2007 / 010751-0 . PMID 18048939 . 
  4. ^ a b c Gostinčar C, Lenassi M, Gunde-Cimerman N, Plemenitaš A (2011). «Адаптация грибов к чрезвычайно высоким концентрациям солей». Успехи прикладной микробиологии . 77 : 71–96. DOI : 10.1016 / B978-0-12-387044-5.00003-0 . PMID 22050822 . 
  5. ^ Turk M, Plemenitas A (ноябрь 2002). «Путь HOG в галофильных черных дрожжах Hortaea werneckii: выделение гена гомолога HOG1 и активация HwHog1p» . Письма о микробиологии FEMS . 216 (2): 193–9. DOI : 10.1111 / j.1574-6968.2002.tb11435.x . PMID 12435502 . 
  6. ^ Lenassi M, Vaupotic T, Гунда-Cimerman N, Plemenitas A (март 2007). «Киназа MAP HwHog1 из галофильных черных дрожжей Hortaea werneckii: справляется со стрессами в солнечных солях» . Солевые системы . 3 : 3. DOI : 10,1186 / 1746-1448-3-3 . PMC 1828057 . PMID 17349032 .  
  7. ^ Fettich M, Lenassi M, Veranič P, Гунда-Cimerman N, Plemenitaš A (май 2011). «Идентификация и характеристика предполагаемых осмосенсоров, HwSho1A и HwSho1B, из чрезвычайно галотолерантных черных дрожжей Hortaea werneckii». Генетика и биология грибов . 48 (5): 475–84. DOI : 10.1016 / j.fgb.2011.01.011 . PMID 21281727 . 
  8. ^ Турок М, Méjanelle л, Sentjurc М, Grimalt JO, Гунда-Cimerman Н, Plemenitas А (февраль 2004 г.). «Солевые изменения липидного состава и текучести мембран галофильных дрожжеподобных меланизированных грибов». Экстремофилы . 8 (1): 53–61. DOI : 10.1007 / s00792-003-0360-5 . PMID 15064990 . 
  9. ^ Gostincar C, Turk M, Plemenitas A, Гунда-Cimerman N (март 2009). «Выражение дельта-9-, дельта-12-десатураз и элонгазы чрезвычайно галотолерантными черными дрожжами Hortaea werneckii зависит от соли» . FEMS Yeast Research . 9 (2): 247–56. DOI : 10.1111 / j.1567-1364.2009.00481.x . PMID 19220869 . 
  10. ^ Reid BJ (июль 1998). «Exophiala werneckii, вызывающая черный опоясывающий лишай в Шотландии». Британский журнал дерматологии . 139 (1): 157–8. DOI : 10.1046 / j.1365-2133.1998.02340.x . PMID 9764175 . 
  11. ^ Б Lenassi М, С, Gostinčar Jackman S, M, Turk Садовского I, Nislow C, S, Jones Birol I, Cimerman Н.Г., Plemenitaš A (2013). «Дублирование всего генома и обогащение переносчиков катионов металлов, выявленное путем секвенирования de novo генома чрезвычайно галотолерантных черных дрожжей Hortaea werneckii» . PLOS One . 8 (8): e71328. DOI : 10.1371 / journal.pone.0071328 . PMC 3744574 . PMID 23977017 .  
  12. ^ a b Sinha S, Flibotte S, Neira M, Formby S, Plemenitaš A, Cimerman NG, Lenassi M, Gostinčar C, Stajich JE, Nislow C (июль 2017 г.). «Hortaea werneckii: сочетание улучшенного генома с экспрессией генов и структурой хроматина» . G3 . 7 (7): 2015–2022. DOI : 10,1534 / g3.117.040691 . PMC 5499112 . PMID 28500048 .  
  13. ^ Dujon B (август 2015). «Основные принципы геномики дрожжей, личное воспоминание» . FEMS Yeast Research . 15 (5): fov047. DOI : 10.1093 / femsyr / fov047 . PMID 26071597 . 
  14. ^ a b Gostinčar C, Stajich JE, Zupančič J, Zalar P, Gunde-Cimerman N (май 2018 г.). «Геномные доказательства внутривидовой гибридизации в клональных и чрезвычайно галотолерантных дрожжах» . BMC Genomics . 19 (1): 364. DOI : 10,1186 / s12864-018-4751-5 . PMC 5952469 . PMID 29764372 .