Анаэрококк - это род бактерий. Типовой вид - Anaerococcus prevotii . [1] Эти бактерии грамположительны и строго анаэробны. [2] [3] [4] Род Anaerococcus был предложен в 2001 году. [2] [4] Его геном был секвенирован в августе 2009 года. Род Anaerococcus является одним из шести родов, классифицированных в группе GPAC (грамположительные анаэробные кокки). ). [5] Эти шесть родов ( Peptostreptococcus , Peptoniphilus , Parvimonas, Finegoldia , Anaerococcus и Murdochiella) встречаются в организме человека как часть комменсальной микробиоты человека. [6] [7] [5]
Анаэрококк | |
---|---|
Научная классификация | |
Домен: | |
Тип: | |
Класс: | |
Заказ: | |
Род: | Анаэрококк |
Он может вызвать инфекцию и является нормальной частью микробиома человека. [8] Большинство видов этого рода можно найти как часть нормальной флоры кожи, человеческого влагалища, носовой полости, ротовой полости и фекалий. [2] Это патоген человека, обнаруживаемый в абсцессах яичников , хронических ранах и выделениях из влагалища . [9] Более того, некоторые виды могут быть выделены из язв стопы и артрита коленного сустава . [2] Это может присутствовать в инфекций мочевых путей , хронических язв , эмпиема плевры , инфекции крови и мягких тканей инфекций . Он участвует в полимикробных инфекциях. [10] Более того, штаммы Anaerococcus были обнаружены в микробиоте подмышек, что позволяет предположить, что некоторые виды этого рода могут играть роль в возникновении запаха подмышек. [10] [11]
Физиология
Род Anaerococcus - неподвижные бактерии, которые не могут образовывать споры и. [4] [12] [2] В зависимости от вида расположение может быть разным. Чаще всего в этом роде встречаются пары, тетрады, короткие цепочки и неправильные образования. [10] [4] Размер их ячеек может варьироваться от 0,6 мкм до 0,9 мкм. [10] Однако, когда они выращиваются с использованием обогащенного кровяного агара, их размер может составлять от 0,5 мкм до 2 мкм. [10] В этом роду существует более одной основных клеточных жирных кислот: C18: 1 , C16: 1 , C18 и C16 . [12] Большинство видов этого рода индол-отрицательные и коагуазо-отрицательные. [10] В целом, виды Anaerococcus обладают чувствительностью к пенициллинам, но устойчивы к тетрациклину , эритромицину и клиндамицину . [9]
Метаболизм
Род Anaerococcus классифицируется как сахаролитические бактерий. [2] [13] Его виды могут быть организованы из слабо сахаролитический (напр. А. prevotii , А. lactolyticus ) сильно сахаролитический (напр. А. hydrogenalis ). [13] Этот вид слабо сбраживает углеводы. [6] Основными источниками энергии, используемой в метаболизме анаэрококка, являются пептоны и аминокислоты. [4] [10] Три основных сахара, ферментируемых в пределах этого рода, - это глюкоза, манноза, фруктоза и сахароза. [12] [4] После ферментации сахаров анаэрококк производит слабые кислоты в качестве конечного продукта метаболизма. [13] В составе этих конечных продуктов метаболизма этот вид может производить масляную кислоту, молочную кислоту и некоторое количество пропионовой и янтарной кислот. [12] Тем не менее, основным метаболитом, продуцируемым Anaerococcus, является бутират. [13] [10] [2]
Разновидность
До недавнего времени у рода Anaerococcus было 14 известных видов. [14] [9] Шесть из видов были первоначально отнесены к роду Peptostreptococcus , но затем на основе их характеристик были повторно классифицирован в новом роде Anaerococcus: А. hydrogenalis , А. lactolyticus , А. Octavius , А. prevotii , . tetradius и A. vaginalis. [5] [2] На протяжении многих лет вид, который чаще всего встречался на теле представителей этого рода, - это A. prevotii. [9]
Anaerococcus Hydrogenalis
A. Hydrogenalis присутствует при выделениях из влагалища и абсцессах яичника. [4] Присутствие Anaerococcus Hydrogenalis в кишечном метаболизме и потребление ими колина связано с сердечно-сосудистыми заболеваниями. [15] В отличие от большинства видов этого рода, Anaerococcus Hydrogenalis является индол-положительным. [4] Кроме того, некоторые штаммы этого вида могут продуцировать уреазу . [4]
Лактолитический анаэрококк
Anaerococcus lactolyticus [10] - один из двух видов рода Anaerococcus, обнаруженных при диабетической стопе . [9] Кроме того, А. lactolyticus может быть извлечен из пролежней . [9]
Анаэрококк октавий
В отличие от большинства видов этого рода, Anaerococcus octavius не был связан с инфекциями человека. [9] Тем не менее, недавно новый случай показал, что A. octavius может вызывать бактериемию . [9] Хотя Anaerococcus octavius встречается редко, он может быть причиной инфекций у людей. [9] Другие исследования показали, что A. octavius является частью нормальной флоры носовой полости, кожи и влагалища. [9] [4] Эти бактерии могут ферментировать рибозу, глюкозу и маннозу. [4]
Anaerococcus prevotii
A. prevotii обычно обнаруживается в выделениях из влагалища, плазме человека и некоторых типах абсцессов, таких как абсцессы яичников, брюшины, крестца и / или легких. [9] [6] Более того, Anaerococcus prevotii является частью нормальной флоры кожи, ротовой полости и кишечника. [6] Исследования показали, что Anaerococcus prevotii обладает устойчивостью к цефтазидиму , клиндамицину , левофлоксацину . [9] В отличие от других видов, A. prevotii не может сбраживать глюкозу. [16]
Анаэрококк тетрадиус
A. tetradius был впервые выделен из выделений из влагалища и абсцессов яичников. [4] Эти бактерии могут сбраживать глюкозу и маннозу. [4]
Анаэрококк вагинальный
A. vaginalis впервые был извлечен из выделений из влагалища и абсцессов яичников, хотя эти бактерии также можно найти при пролежнях и диабетической стопе. [4] [9] Некоторые штаммы этого вида могут быть индол-положительными. [4]
Анаэрококк мурдохийский
A. murdochii обладает устойчивостью к антибиотикам клиндамицину и канамицину . [9] Кроме того, исследования показали, что этот вид обладает промежуточной устойчивостью к пенциллинам . [9]
Анаэрококк degenerii
A. degenerii
Анаэрококк провансенсис
A. Провансенсис был выделен из абсцесса шейки матки. [17] Этот вид может сбраживать лактозу, в отличие от A. tetradius, A. prevotii и A. octavius . [17] Первый анализ Anaerococcus provncensis показал, что он чувствителен к пенициллину G , имипенему , амоксиллину , метронидазолу , цефотетану и ванкомицину . [17]
Анаэрококк сенегальский
A. senegalensis - один из немногих видов Anerococcus, чей геном секвенирован. [2] В геноме имеет размер 1,790,835 пар оснований . [2] Проведенный анализ не показал присутствия плазмиды. [2] Первоначально Anaerococcus senegalensis был обнаружен в фекальной флоре здорового человека. [2]
Анаэрококк рубиинфантис
A. rubiinfantis был обнаружен в образце стула, взятом у младенца с тяжелым острым недоеданием в Сенегале. [18] Согласно геномному анализу, Anaerococcus rubiinfantis обладает высокой чувствительностью к антибиотикам. [18] По этой причине эти бактерии можно лечить обычными пероральными антибиотиками. [18] A. rubiinfantis обладают активностью каталазы, которая не характерна для анаэробных бактерий. [18]
Анаэрококк маразм
A. marasmi впервые был обнаружен в 2016 году в образце стула у ребенка с маразмом . [14] Так же, как A. rubiinfantis, Anaerococcus marasmi является каталтиположительным. [14] A. marasmi может расти в диапазоне pH от 6,5 до 8. [14] Более того, A. marasmi имеет высокое сходство последовательностей (97,6%) с A. prevotii на основе их 16S рРНК. [14]
Анаэрококк urinomassiliensis
A. urinomassiliensis был выделен из образца мочи подростка мужского пола с мембранопролиферативным гломерулонефритом и аутоинмунным гепатитом . [19] Потребовалось 10 дней анаэробной инкубации, чтобы наблюдать рост этих бактерий. [19] Anaerococcus urinomassiliensis не обладает оксидазной или каталитической активностью. [19]
Anaerococcus nagyae
A. nagyae был впервые обнаружен в посеве крови пациента с ишемией и гриппом. [5] Клетки Anaerococcus nagyae расположены парами. [5] Хотя они могут слабо ферментировать маннозу, исследования показали, что эти анаэробные бактерии не могут сбраживать глюкозу и раффинозу. [5] A. nagyae устойчив к колистину , но чувствителен к ванкомицину и канамицину. [5]
Рекомендации
- ^ Parte, AC «Анаэрококк» . Проверено 27 марта 2017 года .
- ^ Б с д е е г ч я J K L Lagier JC, El Karkouri K, Nguyen TT, Armougom F, Raoult D, Fournier PE (март 2012 г.). «Несмежная законченная последовательность генома и описание Anaerococcus senegalensis sp. Nov» . Стандарты геномных наук . 6 (1): 116–25. DOI : 10.4056 / sigs.2415480 . PMC 3359877 . PMID 22675604 .
- ^ Версалович Дж., Кэрролл К.С., Функе Дж., Йоргенсен Дж. Х., Ландри М.Л., Уорнок Д.В., ред. (01.01.2011). «Пептострептококк, Finegoldia, Anaerococcus, Peptoniphilus, Veillonella и другие анаэробные кокки» . Руководство по клинической микробиологии (10-е изд.). Американское общество микробиологов. С. 803–816. DOI : 10.1128 / 9781555816728.ch48 . ISBN 978-1-55581-463-2. Проверено 2 августа 2020 .
- ^ Б с д е е г ч я J к л м п о Ezaki T, Kawamura Y, Li N, Li ZY, Zhao L, Shu S. (июль 2001 г.). «Предложение родов Anaerococcus gen. Nov., Peptoniphilus gen. Nov. И Gallicola gen. Nov. Для представителей рода Peptostreptococcus» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 51 (Pt 4): 1521–1528. DOI : 10.1099 / 00207713-51-4-1521 . PMID 11491354 .
- ^ Б с д е е г Veloo AC, de Vries ED, Jean-Pierre H, van Winkelhoff AJ (апрель 2016 г.). «Anaerococcus nagyae sp. Nov., Выделенный из клинических образцов человека» . Анаэроб . 38 : 111–115. DOI : 10.1016 / j.anaerobe.2015.11.009 . PMID 26639871 .
- ^ а б в г Лабутти К., Пукалл Р., Стинблок К., Глава Дель Рио Т, Тайс Х, Коупленд А. и др. (Сентябрь 2009 г.). «Полная последовательность генома штамма типа Anaerococcus prevotii (PC1)» . Стандарты геномных наук . 1 (2): 159–65. DOI : 10.4056 / sigs.24194 . PMC 3035230 . PMID 21304652 .
- ^ Veloo AC, Elgersma PE, van Winkelhoff AJ (июнь 2015 г.). «Anaerococcus degenerii sp. Nov., Выделенный из клинических образцов человека». Анаэроб . 33 : 71–5. DOI : 10.1016 / j.anaerobe.2015.02.002 . PMID 25680238 .
- ^ «BacMap» . Проверено 27 марта 2017 года .
- ^ Б с д е е г ч я J к л м п о Cobo F, Navarro-Marí JM (февраль 2020 г.). «Первое описание Anaerococcus octavius как причины бактериемии» . Анаэроб . 61 : 102130. дои : 10.1016 / j.anaerobe.2019.102130 . PMID 31765706 .
- ^ Б с д е е г ч I Мерфи ЕС, Фрик И.М. (июль 2013 г.). «Грамположительные анаэробные кокки - комменсалы и условно-патогенные микроорганизмы» . FEMS Microbiology Reviews . 37 (4): 520–53. DOI : 10.1111 / 1574-6976.12005 . PMID 23030831 .
- ^ Фудзии, Такаяоши; Шинозаки, Дзюнко; Кадзиура, Такаяки; Ивасаки, Кейджи; Фудо, Рёске (июль 2014 г.). «Недавно обнаруженный штамм Anaerococcus, ответственный за запах из подмышечных впадин, и новый ингибитор запаха из подмышечных впадин, пентагаллоил глюкоза» . FEMS Microbiology Ecology . 89 (1): 198–207. DOI : 10.1111 / 1574-6941.12347 . PMID 24784923 .
- ^ а б в г Эзаки, Такаяки; Окусу, Кийофуми (2015), «Anaerococcus», Руководство Берджи по систематике архей и бактерий , Американское онкологическое общество, стр. 1–5, doi : 10.1002 / 9781118960608.gbm00712 , ISBN 978-1-118-96060-8
- ^ а б в г Эзаки, Такаяки; Ли, На; Кавамура, Йошиаки (2006), Дворкин, Мартин; Фалькоу, Стэнли; Розенберг, Евгений; Шлейфер, Карл-Хайнц (ред.), «Анаэробные грамположительные кокки», Прокариоты: Том 4: Бактерии: Firmicutes, Cyanobacteria , Нью-Йорк, Нью-Йорк: Springer US, стр. 795–808, doi : 10.1007 / 0 -387-30744-3_26 , ISBN 978-0-387-30744-2
- ^ а б в г д Tall ML, Pham TP, Bellali S, Ngom II, Delerce J, Lo C.I и др. (Май 2020 г.). «marasmi sp. nov., новая бактерия, выделенная из микробиоты кишечника человека» . Новые микробы и новые инфекции . 35 : 100655. дои : 10.1016 / j.nmni.2020.100655 . PMC 7082211 . PMID 32211195 .
- ^ Ядав М., Верма М.К., Чаухан Н.С. (март 2018 г.). «Обзор метаболического потенциала микробиома кишечника человека в питании человека». Архив микробиологии . 200 (2): 203–217. DOI : 10.1007 / s00203-017-1459-х . PMID 29188341 . S2CID 3464103 .
- ^ Песня Y, Лю Ц., Finegold SM (июнь 2007 г.). «Peptoniphilus gorbachii sp. Nov., Peptoniphilus olsenii sp. Nov. И Anaerococcus murdochii sp. Nov., Выделенные из клинических образцов человеческого происхождения» . Журнал клинической микробиологии . 45 (6): 1746–52. DOI : 10.1128 / JCM.00213-07 . PMC 1933094 . PMID 17428937 .
- ^ а б в Pagnier I, Croce O, Robert C, Raoult D, La Scola B (июнь 2014 г.). «Несмежная законченная последовательность генома и описание Anaerococcus provenciensis sp. Nov» . Стандарты геномных наук . 9 (3): 1198–210. DOI : 10.4056 / sigs.5501035 . PMC 4149013 . PMID 25197492 .
- ^ а б в г Тиджани Алоу М., Хелаифия С., Мишель С., Андрие С., Армстронг Н., Биттар Ф. и др. (Август 2016 г.). «Anaerococcus rubiinfantis sp. Nov., Выделенный из кишечной микробиоты сенегальского младенца с тяжелой острой недостаточностью питания» . Анаэроб . 40 : 85–94. DOI : 10.1016 / j.anaerobe.2016.06.007 . PMID 27328611 .
- ^ а б в Моран А, Корню Ф, Цимаратос М, Лагье Дж. К., Кадорет Ф, Фурнье П. Е., Рауль Д. (сентябрь 2016 г.). «Anaerococcus urinomassiliensis sp. Nov., Выделенный из образца мочи 17-летнего мальчика, страдающего аутоиммунным гепатитом и мембранопролиферативным гломерулонефритом» . Новые микробы и новые инфекции . 13 : 56–8. DOI : 10.1016 / j.nmni.2016.06.001 . PMC 4933030 . PMID 27408746 .