Applied Maths NV, компания bioMérieux со штаб-квартирой в Синт-Мартенс-Латем , Бельгия , является биоинформатической компанией, разрабатывающей программное обеспечение для бионаук.
Промышленность | Биоинформатика , Биотехнологии |
---|---|
Основан | 1992 г. |
Штаб-квартира | , |
Продукты | BIONUMERICS, GelCompar II, BIONUMERICS Server |
Веб-сайт | www |
История
Компания Applied Maths была основана в 1992 году и получила всемирное признание благодаря программному обеспечению GelCompar, используемому в качестве стандартного инструмента для нормализации и сравнительного анализа образцов электрофореза ( PFGE , AFLP , RAPD , REP-PCR и варианты и т. Д.). [1] [2]
GelCompar II был выпущен в 1998 году для обработки постоянно растущего объема информации после успеха и распространения электрофореза и других методов снятия отпечатков пальцев в различных областях применения в микробиологии , вирусологии и микологии . После введения концепций полифазной таксономии [3] и растущей потребности в сочетании генотипической , фенотипической , электрофорезной и последовательной информации компания Applied Maths выпустила в 1996 году программный пакет BIONUMERICS, который и сегодня является платформой для управления, хранения и (статистической) ) анализ всех видов биологических данных. [4] BIONUMERICS и GelCompar II используются несколькими сетями по всему миру, такими как PulseNet и CaliciNet, для обмена и идентификации информации о деформации. [5] [6]
В январе 2016 года компания «Прикладная математика» была приобретена компанией bioMérieux . [7]
Продукты
BIONUMERICS : BIONUMERICS - коммерческий набор из 4 конфигураций, используемых для анализа всех основных приложений в биоинформатике: гели для одномерного электрофореза , хроматографические и спектрометрические профили, фенотипические признаки, микроматрицы , последовательности и т. Д.
GelCompar II : GelCompar II - это набор из 5 модулей, разработанный для анализа шаблонов отпечатков пальцев, включая нормализацию, импорт в реляционную базу данных и сравнительный анализ.
BNServer : BNserver - это веб-платформа, обычно устанавливаемая между централизованно обслуживаемой базой данных и распределенными клиентами с использованием BIONUMERICS, GelCompar II или веб-браузера для обмена биологической информацией и результатами анализа. BNServer используется с девяностых годов для обнаружения пищевых вспышек. [8]
Прием
Более 15000 рецензируемых научных статей упоминают использование программных пакетов прикладной математики BIONUMERICS или Gelcompar II. [9]
Рекомендации
- ^ Dijkshoorn L., Towner KJ, Struelens M., 2001. Новые подходы к созданию и анализу данных микробного типирования. Эльзевир, ISBN 0-444-50740-X , ISBN 978-0-444-50740-2 .
- ^ Vauterin Л. П. Vauterin. 1992. Компьютерное объективное сравнение образцов электрофореза для группировки и идентификации микроорганизмов. Евро. Microbiol. 1: 37-41.
- ^ [1] Вандамм и др., Полифазная таксономия, консенсусный подход к бактериальной систематике. Microbiol. Мол. Биол. Ред. Июнь 1996 г., т. 60 нет. 2 407-438.
- ^ Vauterin L, Vauterin P. Интегрированная база данных и анализ. В кн .: Молекулярная идентификация, систематика и популяционная структура прокариот (под ред. Эрко Стакебрандта). Спрингер, 2006. ISBN 978-3-540-23155-4
- ^ Хантер С.Б., Вотерин П., Ламберт-Фэйр М.А., Ван Дайн М.С., Кубота К., Грейвс Л., Ригли Д., Барретт Т., Рибо Э (2005). «Создание универсального стандартного штамма для использования со стандартизированными протоколами импульсного гель-электрофореза PulseNet: преобразование национальных баз данных в новый стандарт размера» . J. Clin. Microbiol . 43 (3): 1045–1050. DOI : 10.1128 / JCM.43.3.1045-1050.2005 . PMC 1081233 . PMID 15750058 .
- ^ Vega E .; Barclay L .; Gregoricus N .; Williams K .; Lee D .; Винже Дж. (2011). «Новая сеть эпиднадзора за вспышками норовирусного гастроэнтерита, США» . Emerg Infect Dis . 17 (8): 1389–95. DOI : 10.3201 / eid1708.101837 . PMC 3381557 . PMID 21801614 .
- ^ bioMérieux приобретает Applied Maths и расширяет свои возможности в области биоинформатики с помощью передового опыта и решений для интеллектуального использования сложных биологических данных.
- ^ Swaminathan B, Gerner-Smidt P, Ng LK, Lukinmaa S, Kam KM, Rolando S, Gutiérrez EP, Binsztein N., 2006. «Создание PulseNet International : взаимосвязанная система лабораторных сетей для облегчения своевременного признания общественного здравоохранения и реагирования на Вспышки болезней пищевого происхождения и новые болезни пищевого происхождения ». Пищевые патогены и болезни. Весна 2006 г., 3 (1): 36-50. DOI : 10,1089 / fpd.2006.3.36
- ^ Научные статьи с использованием программных продуктов Applied Maths, последнее посещение - 20 июня 2014 г.
Внешние ссылки
- Официальный веб-сайт