Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Домен лектина С-типа
PDB 1jzn EBI.jpg
Пентамерная структура лектина яда гремучей змеи, который представляет собой лектин, связывающий галактозу. [1] [2]
Идентификаторы
СимволЛектин_С
PfamPF00059
ИнтерПроIPR001304
УМНАЯCLECT
PROSITEPS50041
SCOP22msb / SCOPe / SUPFAM
CDDcd00037
Мембранома52
Доступные белковые структуры:
Pfam  структуры / ECOD  
PDBRCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumкраткое изложение структуры

Лектин С-типа ( CLEC ) - это тип углеводсвязывающего белкового домена, известный как лектин . [3] Обозначение C-типа связано с их потребностью в кальции для связывания. [4] Белки, содержащие лектиновые домены С-типа, выполняют широкий спектр функций, включая клеточную адгезию, иммунный ответ на патогены и апоптоз . [5] [6]

Классификация [ править ]

Drickamer et al. классифицировали лектины C-типа на 7 подгрупп (от I до VII) на основе порядка расположения различных белковых доменов в каждом белке. [7] Эта классификация была впоследствии обновлена ​​в 2002 году, в результате чего были выделены семь дополнительных групп (с VIII по XIV). [8] Совсем недавно были добавлены еще три подгруппы (с XV по XVII). [3]

ГруппаИмяСвязанные домены
яЛектиканыEGF , Sushi , Ig и Link домены
IIАсиалогликопротеиновые и DC рецепторыНикто
IIIКоллектиныНикто
IVSelectinsСуши и EGF домены
VNK - клеточные рецепторыНикто
VIЭндоцитарные рецепторы мульти-CTLDДомены FnII и Ricin
VIIРег группаНикто
VIIIChondrolectin , LayilinНикто
IXТетранектинНикто
ИксПолицистинДомены WSC, REJ, PKD
XIАттрактин ( ATRN )PSI, EGF и CUB домены
XIIОсновной основной белок эозинофилов (EMBP)Никто
XIIIDGCR2Никто
XIVТромбомодулин , CD93 , CD248 , CLEC14AEGF домены [9]
XVBimlecНикто
XVISEECДомены SCP и EGF
XVIICBCP / Frem1 / QBRICKCSPG повторы и окалины-бета домены

CLEC включают:

  • CLEC1A , CLEC1B
  • CLEC2A , CLEC2B , CD69 (CLEC2C), CLEC2D , CLEC2L
  • CLEC3A , CLEC3B
  • CLEC4A , CLEC4C , CLEC4D , CLEC4E , CLEC4F , CLEC4G , ASGR1 (CLEC4H1), ASGR2 (CLEC4H2), FCER2 (CLEC4J), CD207 (CLEC4K), CD209 (CLEC4L), CLEC4M
  • CLEC5A
  • CLEC6A
  • CLEC7A
  • OLR1 (CLEC8A)
  • CLEC9A
  • CLEC10A
  • CLEC11A
  • CLEC12A , CLEC12B
  • CD302 (CLEC13A), LY75 (CLEC13B), PLA2R1 (CLEC13C), MRC1 (CLEC13D), MRC2 (CLEC13E)
  • CLEC14A
  • CLEC16A
  • CLEC17A

«Лектин-подобные рецепторы NK-клеток» представляют собой очень близкую группу: [10]

  • KLRA1
  • KLRB1 (CLEC5B)
  • KLRC1 , KLRC2 , KLRC3 , KLRC4
  • KLRD1
  • KLRF1 (CLEC5C)
  • KLRG1 (CLEC15A), KLRG2 (CLEC15B)
  • KLRK1

Дополнительные белки, содержащие этот домен, включают:

  • AGC1 ; ATRNL1
  • BCAN
  • CD248 ; CD72 ; CD93 ; ХОДЛ ; CL-K1-Ia ; CL-K1-Ib ; CL-K1-Ic ; CLECSF5 ; COLEC10 ; COLEC11 ; COLEC12 ; CSPG3
  • FCER2 ; FREM1 ; HBXBP ;
  • LAYN ; LOC348174 ; LOC728276
  • MAFA ; MBL2 ; MGC34761 ; MICL ; MRC1L1
  • OLR1
  • PAP ; ПКД1 ; PKD1L2 ; PLA2R1 ; PRG2 ; PRG3
  • REG1A ; REG1B ; REG3A ; REG3G ; REG4
  • SELE ; ПРОДАТЬ ; SELP ; SFTPA1 ; SFTPA2 ; SFTPA2B ; SFTPD ; SRCL
  • THBD
  • VCAN

Ссылки [ править ]

  1. ^ Walker JR, Нагар B, Young NM, Hirama T, Рини JM (апрель 2004). «Рентгеновская кристаллическая структура галактозоспецифического лектина С-типа, обладающего новой декамерной четвертичной структурой». Биохимия . 43 (13): 3783–92. DOI : 10.1021 / bi035871a . PMID  15049685 .
  2. ^ Mahla RS, Reddy MC, Прасад DV, Кумар H (сентябрь 2013). «Подслащенные PAMPs: роль сахарных комплексов PAMPs в врожденном иммунитете и биологии вакцины» . Границы иммунологии . 4 : 248. DOI : 10.3389 / fimmu.2013.00248 . PMC 3759294 . PMID 24032031 .  
  3. ^ a b Зеленский А.Н., Греди Дж. Э. (декабрь 2005 г.). «Суперсемейство лектинподобных доменов С-типа». FEBS Дж . 272 (24): 6179–217. DOI : 10.1111 / j.1742-4658.2005.05031.x . PMID 16336259 . 
  4. ^ C-Type + Lectin в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
  5. ^ Дрикамер K (октябрь 1999). «Лектин-подобные домены С-типа». Curr. Opin. Struct. Биол . 9 (5): 585–90. DOI : 10.1016 / S0959-440X (99) 00009-3 . PMID 10508765 . 
  6. ^ Cambi A, Figdor C (май 2009). «Некроз: лектины С-типа чувствуют гибель клеток». Curr. Биол . 19 (9): R375–8. DOI : 10.1016 / j.cub.2009.03.032 . PMID 19439262 . S2CID 17409821 .  
  7. ^ Дрикамер K (1993). «Эволюция Са (2 +) - зависимых лектинов животных». Прог. Nucleic Acid Res. Мол. Биол . Прогресс в исследованиях нуклеиновых кислот и молекулярной биологии. 45 : 207–32. DOI : 10.1016 / S0079-6603 (08) 60870-3 . ISBN 978-0-12-540045-9. PMID  8341801 .
  8. ^ Дрикамер K, Фадден AJ (2002). «Геномный анализ лектинов С-типа». Биохим. Soc. Symp . 69 (69): 59–72. DOI : 10,1042 / bss0690059 . PMID 12655774 . 
  9. ^ Хан, KA; McMurray, JL; Mohammed, F .; Бикнелл, Р. (2019). «Белки группы 14 лектинового домена С-типа в биологии сосудов, раке и воспалении» . Журнал FEBS . 286 (17): 3299–3332. DOI : 10.1111 / febs.14985 . PMC 6852297 . PMID 31287944 .  
  10. ^ NK + Cell + Lectin-Like + Receptors в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Внешние ссылки [ править ]

  • Functional Glycomics Gateway , результат сотрудничества Консорциума функциональных гликомик и Nature Publishing Group