Перейти к навигации Перейти к поиску
Структура человеческого модуля CNOT1-CNOT2-CNOT3 (PDB 4C0D). [1]
С Арбоном С atabolite Р epression- Н egative О н Т АТА-меньше, или CCR4-Не , является белковым комплексом , который функционирует в экспрессии генов. [2] [3] Комплекс обладает множественной ферментативной активностью как поли (A) 3'-5 ' экзонуклеаза, так и убиквитинлигаза . [4] [5] [6] [7] Комплекс присутствует как в ядре, где он регулирует транскрипцию, так и в цитоплазме, где он связан с трансляцией рибосом иТела процессоров РНК . [2] [3]
Подразделения [ править ]
Комплекс CCR4-Not человека состоит из структурных (некаталитических) субъединиц и субъединиц, обладающих экзонуклеазной и E3-лигазной активностью. Некоторые, но не все субъединицы человека сохраняются в почкующихся дрожжах . [8]
| Подразделение | МВт (кДа) [A] | Ключевая особенность |
|---|---|---|
| CNOT1 | 267 | «Каркас» с некаталитической функцией. Связан с поддержанием эмбриональных стволовых клеток . [9] |
| CNOT2 | 60 | Структурная составляющая. Связан с поддержанием эмбриональных стволовых клеток . [9] |
| CNOT3 | 82 | Структурная составляющая. Связан с поддержанием эмбриональных стволовых клеток . [10] [9] |
| CNOT4 | 64 | Активен как убиквитинлигаза E3 . [7] |
| CNOT6 | 63 | 3'-5'- экзонуклеаза с предпочтением полиаденилированных подсостояний мРНК. [5] Имеет человеческий паралог CNOT6L . |
| CNOT7 | 33 | 3'-5'- экзонуклеаза , частично дублирующая CNOT7. [4] |
| CNOT8 | 34 | 3'-5'- экзонуклеаза . [4] |
| CNOT9 | 34 | Выполняет некаталитическую функцию. [11] |
| CNOT10 | 82 | Некаталитическая субъединица, образующая модуль с CNOT11, отсутствующий у грибов. [12] |
| CNOT11 | 55 | Некаталитическая субъединица, образующая модуль с CNOT10, отсутствующий у грибов. [12] |
Молекулярная масса человека субъединиц из UniProt.
См. Также [ править ]
- Деаденилирование
- Экспрессия гена
Ссылки [ править ]
- ^ Боланд, Андреас; Чен, Инь; Райш, Тобиас; Йонас, Стефани; Кузуоглу-Озтюрк, Дуйгу; Вольболд, Лара; Weichenrieder, Оливер; Изаурральде, Элиза (13.10.2013). «Строение и сборка модуля НЕ человеческого комплекса CCR4 – НЕ». Структурная и молекулярная биология природы . ООО "Спрингер Сайенс энд Бизнес Медиа". 20 (11): 1289–1297. DOI : 10.1038 / nsmb.2681 . ISSN 1545-9993 . PMID 24121232 .
- ^ a b Колларт, Мартина А. (29 января 2016 г.). «Комплекс Ccr4-Not является ключевым регулятором экспрессии эукариотических генов» . Междисциплинарные обзоры Wiley: РНК . Вайли. 7 (4): 438–454. DOI : 10.1002 / wrna.1332 . ISSN 1757-7004 . PMC 5066686 . PMID 26821858 .
- ^ a b Миллер, Джейсон Э .; Риз, Джозеф К. (15 марта 2012 г.). «Ccr4-Не комплекс: уродство контроля над эукариотическими клетками» . Критические обзоры в биохимии и молекулярной биологии . Informa UK Limited. 47 (4): 315–333. DOI : 10.3109 / 10409238.2012.667214 . ISSN 1040-9238 . PMC 3376659 . PMID 22416820 .
- ^ a b c Аслам Ахмед; Миттал, Салони; Кох, Фредерик; Андрау, Жан-Кристоф; Винклер, Г. Себастьян (2009). Виккенс, Марвин (ред.). «Ccr4 – недеаденилазные субъединицы CNOT7 и CNOT8 имеют перекрывающиеся роли и модулируют пролиферацию клеток» . Молекулярная биология клетки . Американское общество клеточной биологии (ASCB). 20 (17): 3840–3850. DOI : 10.1091 / mbc.e09-02-0146 . ISSN 1059-1524 . PMC 2735483 . PMID 19605561 .
- ^ а б Чен Дж, Чианг YC, Денис CL (март 2002). «CCR4, 3'-5'-поли (A) РНК и экзонуклеаза оцДНК, является каталитическим компонентом цитоплазматической деаденилазы» . EMBO J . 21 (6): 1414–26. DOI : 10.1093 / emboj / 21.6.1414 . PMC 125924 . PMID 11889047 .
- ^ «Энтрез Ген: CNOT6 CCR4-НЕ транскрипционный комплекс, субъединица 6» . CS1 maint: discouraged parameter (link)
- ^ а б Альберт, Томас К .; Ханзава, Хироюки; Легтенберг, Ивонн ИА; de Ruwe, Marjolein J .; ван ден Хеувель, Фиона А.Дж.; Collart, Martine A .; Боеленс, Рольф; Тиммерс, Х.Т. Марк (01.02.2002). «Идентификация субъединицы убиквитин-протеин-лигаза в репрессорном комплексе транскрипции CCR4-NOT» . Журнал EMBO . Вайли. 21 (3): 355–364. DOI : 10.1093 / emboj / 21.3.355 . ISSN 0261-4189 . PMC 125831 . PMID 11823428 .
- ^ Альберт, TK (2000-02-01). «Выделение и характеристика человеческих ортологов дрожжевых субъединиц CCR4-NOT» . Исследования нуклеиновых кислот . Издательство Оксфордского университета (ОУП). 28 (3): 809–817. DOI : 10.1093 / NAR / 28.3.809 . ISSN 1362-4962 . PMC 102560 . PMID 10637334 .
- ^ a b c Чжэн, Сяофэн; Думитру, Ралука; Lackford, Brad L .; Freudenberg, Johannes M .; Singh, Ajeet P .; Арчер, Тревор К .; Джоти, Раджа; Ху, Гуан (2012-04-09). «Cnot1, Cnot2 и Cnot3 поддерживают идентичность ESC мыши и человека и подавляют внеэмбриональную дифференцировку» . Стволовые клетки . Вайли. 30 (5): 910–922. DOI : 10.1002 / stem.1070 . ISSN 1066-5099 . PMC 3787717 . PMID 22367759 .
- ^ Ху, G .; Kim, J .; Xu, Q .; Ленг, Y .; Оркин, Ш; Элледж, SJ (2009-04-01). «Скрининг РНКи всего генома определяет новый модуль транскрипции, необходимый для самообновления» . Гены и развитие . Лаборатория Колд-Спринг-Харбор. 23 (7): 837–848. DOI : 10,1101 / gad.1769609 . ISSN 0890-9369 . PMC 2666338 . PMID 19339689 .
- ^ Паванелло, Лоренцо; Холл, Бенджамин; Airhihen, Благословение; Винклер, Герлоф Себастьян (2018-11-09). «Центральная область CNOT1 и CNOT9 стимулирует деаденилирование с помощью модуля нуклеазы Ccr4-Not». Биохимический журнал . Портленд Пресс Лтд. 475 (21): 3437–3450. DOI : 10.1042 / bcj20180456 . ISSN 0264-6021 . PMID 30309886 .
- ^ a b Mauxion, Fabienne; Прев, Бриджит; Серафин, Бертран (2013). «C2ORF29 / CNOT11 и CNOT10 образуют новый модуль комплекса CCR4-NOT» . Биология РНК . Informa UK Limited. 10 (2): 267–276. DOI : 10,4161 / rna.23065 . ISSN 1547-6286 . PMID 23232451 .