 | |
|---|---|
| Содержание | |
| Описание | Химическая база данных |
| Типы данных захвачены | Небольшие химические соединения |
| Контакт | |
| Исследовательский центр | Европейская лаборатория молекулярной биологии  |
| Лаборатория | Европейский институт биоинформатики  |
| Первичное цитирование | де Матос и др. [1] |
| Доступ | |
| Интернет сайт | www |
| Скачать URL | ftp |
| URL-адрес веб-службы | www |
| Конечная точка Sparql | BIO2RDF |
| Инструменты | |
| Интернет | www |
| Разное | |
Частота выпуска данных | ежемесячно |
| Политика курирования | Куратор вручную |
Химические Субъекты биологического интереса , также известные как ChEBI , [1] [2] является химической база данных и онтология из молекулярных образований сосредоточены на «малые» химических соединениях, что является частью открытой биомедицины Онтологии усилий (ОВО) в Европейской биоинформатике Институт (EBI). Термин «молекулярная единица» относится к любому «конституционно или изотопно отличному атому , молекуле , иону , ионной паре , радикалу , ион-радикалу , комплексу , конформеру.и т. д., идентифицируемые как отдельно различимые объекты ". [3] Рассматриваемые молекулярные объекты являются либо продуктами природы, либо синтетическими продуктами, которые обладают потенциальной биоактивностью. Молекулы, непосредственно кодируемые геномом, такие как нуклеиновые кислоты , белки и пептиды, полученные белки протеолитическим расщеплением, как правило, не включаются в ChEBI.
ChEBI использует номенклатуру , символику и терминологию, одобренную Международным союзом теоретической и прикладной химии (IUPAC) и комитетом по номенклатуре Международного союза биохимии и молекулярной биологии (NC-IUBMB).
Объем и доступ [ править ]
Все данные в базе данных не являются собственностью или получены из сторонних источников. Таким образом, он свободно доступен и доступен для всех. Кроме того, каждый элемент данных полностью отслеживается и имеет явную ссылку на исходный источник. Он связан с другими базами данных, такими как ChEMBL , ChemSpider , DrugBank , MetaboLights и PubChem .
Данные ChEBI доступны через общедоступное веб-приложение , веб-службы , конечную точку SPARQL и загружаемые файлы. [1] [2]
Ссылки [ править ]
- ^ а б в де Матос П., Алькантара Р., Деккер А., Эннис М., Гастингс Дж., Хауг К., Спитери I, Тернер С., Стейнбек С. (2010). «Химические объекты, представляющие биологический интерес: обновленная информация» . Исследования нуклеиновых кислот . 38 (выпуск базы данных): D249-54. DOI : 10.1093 / NAR / gkp886 . PMC 2808869 . PMID 19854951 .
- ^ a b Дегтяренко К., де Матос П., Эннис М., Гастингс Дж., Збинден М., Макнот А., Алькантара Р., Дарсов М., Гедж М., Эшбёрнер М. (2008). «ЧЭБИ: база данных и онтология химических объектов, представляющих биологический интерес» . Исследования нуклеиновых кислот . 36 (Проблема с базой данных): D344-50. DOI : 10.1093 / NAR / gkm791 . PMC 2238832 . PMID 17932057 .
- ^ ИЮПАК , Сборник химической терминологии , 2-е изд. («Золотая книга») (1997). Исправленная онлайн-версия: (2006–) « молекулярная сущность ». DOI : 10,1351 / goldbook.M03986
 | Викиданные имеют свойство:
|
ChEBI ID (P683) (см.