Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Межвидовая передача ( CST ), также называемая межвидовой передачей , скачком хозяина или вторичным распространением , представляет собой передачу инфекционного патогена , такого как вирус , между хозяевами, принадлежащими к разным видам . Будучи введенным в особь нового вида хозяев, патоген может вызвать заболевание у нового хозяина и / или приобрести способность инфицировать других особей того же вида, позволяя ему распространяться через новую популяцию хозяев. [1] Это явление чаще всего изучается в вирусологии., но межвидовая передача также может происходить с бактериальными патогенами или другими типами микроорганизмов. [2]

Шаги, связанные с передачей патогенов новым хозяевам, включают контакт между патогеном и хозяином; успешное инфицирование исходного индивидуального хозяина, которое может привести к амплификации и вспышке болезни ; и адаптация патогена в пределах исходного или нового хозяина, что может сделать его способным эффективно распространяться между индивидуумами в популяциях нового хозяина. [3] Эта концепция важна для понимания возникающих инфекционных заболеваний человека, особенно вызываемых вирусами, и борьбы с ними. Большинство вирусных заболеваний человека имеют зоонозное происхождение, поскольку исторически передавались человеческим популяциям от различных видов животных; примеры включаютSARS , лихорадка Эбола , свиной грипп , бешенство и птичий грипп . [4]

Точные механизмы, которые способствуют межвидовой передаче, различаются в зависимости от патогена, и даже для общих заболеваний часто недостаточно изучены. Считается, что вирусы с высокой частотой мутаций способны быстро адаптироваться к новым хозяевам и, таким образом, преодолевать специфические иммунологические защиты хозяина , позволяя их дальнейшую передачу. Событие смены хозяина происходит, когда штамм, который ранее был зоонозным, начинает циркулировать исключительно среди новых видов хозяев. [5]

Передача патогенов наиболее вероятна между видами, которые часто находятся в тесном контакте друг с другом. Это также может происходить косвенно между видами с менее частыми контактами, если этому способствует промежуточный вид; например, вид- резервуар может передавать вирус виду- переносчику , который, в свою очередь, передает вирус людям. [6] [7] Степень филогенетического родства между видами хозяев также влияет на вероятность передачи патогена между ними, вероятно, из-за сходства иммунологической защиты хозяев; например, большинство зоонозных передач человека происходит от других видов млекопитающих. С другой стороны, патогены более отдаленных видов, например вирусы растений., могут вообще не заражать людей. Другие факторы, влияющие на скорость передачи, включают географическую близость и внутривидовое поведение. [3]

Распространенность и контроль [ править ]

Межвидовая передача является наиболее важной причиной возникновения болезней у людей и других видов. Зоонозы диких животных микробного происхождения также являются наиболее распространенной группой возникающих болезней человека, и ДКП между дикой природой и домашним скотом оказывает заметное экономическое влияние на сельское хозяйство, снижая продуктивность животноводства и вводя ограничения на экспорт. [2] Это делает CST серьезной проблемой для общественного здравоохранения , сельского хозяйства и управления дикой природой .

Авторы исследования бубонной чумы в Оране подчеркивают, что это заболевание «в первую очередь бактериальный зооноз, поражающий грызунов . Он вызывается Yersinia pestis и передается от животного к животному через блох . Люди обычно заражаются через укус инфицированного человека. грызунов блох ". Мера санитарного контроля, установленная органом здравоохранения, носила химический характер: «Было проведено внутри- и перидоместное распыление перметрина . Дельтаметринпылились следы и норы грызунов, расположенные в радиусе 10 км от жилища больных. Запрещено бесконтрольное убийство крыс » [8].

Считается, что большая часть вирусных патогенов, недавно появившихся у людей, произошла от различных видов животных. Об этом свидетельствуют несколько недавних эпидемий, таких как птичий грипп , лихорадка Эбола , оспа обезьян и вирусы Ханта . [9] Имеются данные, позволяющие предположить, что некоторые болезни потенциально могут быть повторно занесены в человеческую популяцию через животных-хозяев после того, как они будут искоренены среди людей. [10] Существует риск того, что это явление произойдет с морбилливирусами, поскольку они могут легко преодолевать видовые барьеры. [10] CST также может иметь значительное влияние на производственные отрасли. Генотип VI - птичий парамиксовируссеротип 1 (GVI-PMV1) - это вирус, который возник в результате межвидовой передачи от Galliformes (т.е. курицы ) Columbiformes , и стал широко распространенным в птицеводстве . [11]

CST вариантов вируса бешенства между популяциями многих различных видов является серьезной проблемой для управления дикой природой . Введение этих вариантов животным, не являющимся резервуарами, увеличивает риск воздействия на человека и ставит под угрозу текущие достижения в области борьбы с бешенством. [12]

Считается, что многие патогены имеют специализацию хозяина, что объясняет сохранение различных штаммов у видов хозяев. [5] Патогенам придется преодолеть специфичность своего хозяина, чтобы перейти к новому виду хозяина. В некоторых исследованиях утверждается, что специализация хозяев может быть преувеличена, а патогены с большей вероятностью будут демонстрировать CST, чем считалось ранее. [5] Первоначальные хозяева обычно имеют низкий уровень смертности при заражении патогеном, причем показатели летальности , как правило, намного выше у новых хозяев [13]

Между нечеловеческими приматами и людьми [ править ]

Дополнительная информация: Передача от человека к примату

Из-за тесного родства нечеловеческих приматов (НЧП) и людей передача болезней между НЧП и людьми является относительно обычным явлением и может стать серьезной проблемой для общественного здравоохранения. Такие заболевания, как ВИЧ и аденовирусы человека , были связаны с взаимодействиями NHP. [14] [15]

В местах, где часты контакты между людьми и НПЗ, часто принимаются меры предосторожности для предотвращения передачи болезней. Обезьяний пенистый вирус (SFV) - это энзоотический ретровирус, который имеет высокие показатели межвидовой передачи и, как известно, поражает людей, укушенных инфицированными NHP. [16] Это вызвало проблемы со здоровьем в таких местах, как Индонезия, где посетители обезьяньих храмов могут заразиться SFV от храмовых макак ( Macaca fascicularis ). [17] TMAdV ( аденовирус обезьяны titi ) сильно отличается, попарно разделяя <57%идентичность нуклеотидов с другими аденовирусами, вирусом NHP, который имел высокий уровень смертности (83%) у обезьян и способен распространяться через человека-хозяина. [13]

Прогнозирование и предотвращение передачи между видами [ править ]

Прогнозирование и мониторинг важны для изучения CST и их эффектов. Однако факторы, определяющие происхождение и судьбу случаев межвидовой передачи, остаются неясными для большинства патогенов человека. [4] Это привело к использованию различных статистических моделей для анализа CST. Некоторые из них включают модели анализа риска, [18] модели с однократной датировкой (SRDT), [15] и модели филогенетической диффузии. [4] Изучение геномов патогенов, участвующих в событиях CST, очень полезно для определения их происхождения и судьбы. [4] Это связано с генетическим разнообразием и мутацией патогенов.скорость являются ключевыми факторами при определении возможности передачи через несколько хостов. Это делает важным частичное или полное секвенирование геномов трансмиссивных видов. [13] Изменение структуры генома может привести к тому, что патоген, имеющий узкий круг хозяев, станет способен использовать более широкий круг хозяев. [5] Генетическая дистанция между различными видами, географический ареал и другие барьеры взаимодействия также будут влиять на передачу вируса между видами. [4]

Один из подходов к анализу оценки риска CST - это разработка моделей анализа риска, которые разбивают «процесс» передачи болезни на части. Процессы и взаимодействия, которые могут привести к межвидовой передаче болезней, явно описаны как гипотетическая инфекционная цепочка. Данные лабораторных и полевых экспериментов используются для оценки вероятности каждого компонента, ожидаемой естественной вариации и погрешности. [17]

Различные типы исследований CST потребуют разных методов анализа для удовлетворения своих потребностей. В исследовании по идентификации вирусов у летучих мышей, которые могут распространяться на других млекопитающих, использовался рабочий процесс: секвенирование геномных образцов → «очистка» необработанных считываний → устранение считываний хозяина и эукариотических загрязнителей → сборка de novo оставшихся считываний → аннотация вирусных контигов → молекулярное обнаружение конкретных вирусов → филогенетический анализ → интерпретация данных. [19]

Обнаружить CST и оценить его частоту на основе данных о распространенности - непростая задача. [2] Из-за этих трудностей для анализа событий CST и патогенов, связанных с ними, используются вычислительные методы. Бурное развитие молекулярных методов открыло новые возможности использования филогенетического анализа генетики патогенов для определения эпидемиологических параметров. [2] Это дает некоторое представление об истоках этих событий и о том, как с ними можно бороться. В методах предотвращения CST в настоящее время используются как биологические, так и вычислительные данные. Примером этого является использование как клеточных анализов, так и филогенетических анализов.сравнения, чтобы подтвердить роль TRIM5α, продукта гена TRIM5, в подавлении межвидовой передачи и появления ретровирусов в природе. [20]

Анализ [ править ]

Филогения [ править ]

Сравнение геномных данных очень важно для изучения межвидовой передачи. Филогенетический анализ используется для сравнения генетической изменчивости как патогенов, связанных с CST, так и видов-хозяев, которых они заражают. Взятые вместе, можно сделать вывод, что позволило патогену перейти к новому хозяину (например, мутация в патогене, изменение восприимчивости хозяина) и как это можно предотвратить в будущем. Если механизмы, которые патогены используют для первоначального проникновения в новый вид, хорошо охарактеризованы и поняты, может быть достигнут определенный уровень контроля и предотвращения риска. При контакте плохое понимание патогенов и связанных с ними заболеваний затрудняет принятие профилактических мер [18]

Альтернативные хозяева также потенциально могут играть решающую роль в эволюции и распространении патогена. [21] Когда патоген скрещивается с видами, он часто приобретает новые характеристики, которые позволяют ему преодолевать барьеры хозяина. [18] Различные варианты патогенов могут по-разному влиять на виды-хозяева. [21] Таким образом, анализ CST может быть полезным для сравнения одних и тех же патогенов, встречающихся в разных видах хозяев. Филогенетический анализ может использоваться для отслеживания истории патогенов в популяциях различных видов. Даже если патоген новый и сильно расходящийся, филогенетическое сравнение может быть очень полезным. [13] Полезная стратегия для изучения истории эпидемий, вызванных комбинациями передачи патогенов.анализ молекулярных часов , чтобы оценить временные рамки эпидемии, и объединенную теорию , чтобы сделать вывод о демографической истории патогена. [15] При построении филогении часто используются компьютерные базы данных и инструменты. Такие программы, как BLAST , используются для аннотирования последовательностей патогенов, в то время как базы данных, такие как GenBank, предоставляют информацию о функциях на основе геномной структуры патогенов. Деревья строятся с использованием вычислительных методов, таких как MPR или байесовский вывод, а модели создаются в зависимости от потребностей исследования. [22] Например, модели SRDT позволяют оценить временные рамки.под филогенетическим деревом. [15] Модели для прогнозирования CST будут варьироваться в зависимости от того, какие параметры необходимо учитывать при построении модели.

Самая экономная реконструкция (MPR) [ править ]

Экономия - это принцип, согласно которому человек выбирает простейшее научное объяснение, соответствующее имеющимся данным. Что касается построения филогенетических деревьев, лучшая гипотеза - это та, которая требует наименьшего количества эволюционных изменений. Использование бережливости для реконструкции состояний наследственных признаков на филогенетическом дереве - это метод проверки экологических и эволюционных гипотез. [23] Этот метод можно использовать в исследованиях CST для оценки количества изменений характера, которые существуют между патогенами по отношению к их хозяину. [2]Это делает MPR полезным для отслеживания патогена CST до его происхождения. MPR также можно использовать для сравнения характеристик популяций видов-хозяев. Черты характера и поведение в популяции могут сделать их более восприимчивыми к CST. Например, виды, которые мигрируют в регион, важны для распространения вирусов через популяционные сети. [24]

Несмотря на успех экономичных реконструкций, исследования показывают, что они часто чувствительны и иногда могут быть предвзятыми в сложных моделях. [23] Это может вызвать проблемы для моделей CST, которые должны учитывать множество переменных. Альтернативные методы, такие как метод максимального правдоподобия, были разработаны в качестве альтернативы экономичной реконструкции. [23]

Использование генетических маркеров [ править ]

Два метода измерения генетической изменчивости, тандемных повторов с переменным числом (VNTR) и однонуклеотидных полиморфизмов (SNP), оказались очень полезными для изучения бактериальной передачи. [2] VNTR из-за низкой стоимости и высокой частоты мутаций делают их особенно полезными для обнаружения генетических различий в недавних вспышках , и хотя SNP имеют более низкую частоту мутаций на локус, чем VNTR, они обеспечивают более стабильные и надежные генетические отношения между изолятами . Оба метода используются для построения филогении для генетического анализа, однако SNP больше подходят для исследований сокращения филогении. [2]Однако с помощью этих методов может быть сложно точно моделировать вывертывания CST. Оценки CST, основанные на филогении, сделанные с использованием маркера VNTR, могут быть смещены в сторону обнаружения событий CST по широкому диапазону параметров. SNP, как правило, менее предвзяты и изменчивы в оценках CST, когда оценки CST низкие и используется небольшое количество SNP. В целом, оценки частоты CST с использованием этих методов наиболее надежны в системах с большим количеством мутаций, большим количеством маркеров и высокими генетическими различиями между введенными штаммами. [2] CST очень сложен, и модели должны учитывать множество параметров, чтобы точно представлять явления. Модели, упрощающие реальность, могут привести к смещению данных. Множественные параметры, такие как количество мутаций, накопленных с момента введения,стохастичность , генетическое различие представленных штаммов и усилия по отбору образцов могут затруднить объективные оценки CST даже для полногеномных последовательностей, особенно если отбор ограничен, частота мутаций низка или если патогены были введены недавно. [2] Дополнительная информация о факторах, влияющих на показатели CST, необходима для создания более подходящих моделей для изучения этих событий.

Процесс использования генетических маркеров для оценки показателей CST должен учитывать несколько важных факторов для уменьшения систематической ошибки. Во-первых, филогенетическое дерево, построенное в ходе анализа, должно отражать лежащий в основе эпидемиологический процесс, порождающий дерево. [2] Модели должны учитывать, как генетическая изменчивость патогена влияет на заболевание у вида, а не только общие различия в геномной структуре. Во-вторых, сила анализа будет зависеть от количества мутаций, накопленных с тех пор, как патоген был введен в систему. [2]Это связано с тем, что многие модели используют количество мутаций в качестве индикатора частоты CST. Поэтому усилия сосредоточены на оценке времени с момента введения или скорости замены маркера (на основе лабораторных экспериментов или сравнительного анализа генома). Это важно не только при использовании метода MPR, но и для подходов правдоподобия, которые требуют оценки скорости мутаций. [2] В-третьих, CST также повлияет на распространенность заболевания у потенциального хозяина, поэтому объединение данных эпидемиологических временных рядов с генетическими данными может быть отличным подходом к исследованию CST [2]

Байесовский анализ [ править ]

Байесовские рамки представляют собой форму анализа, основанного на максимальном правдоподобии, и могут быть очень эффективными в исследованиях межвидовой передачи. Байесовский вывод методов эволюции признаков может учитывать неопределенность филогенетического дерева и более сложные сценарии с такими моделями, как модель распространения признаков, которая в настоящее время разрабатывается для изучения CST в РНК-вирусах . [2] Байесовский статистический подход дает преимущества перед другими видами анализа для отслеживания происхождения CST. Вычислительные методы позволяют интегрировать неизвестную филогению, которую нельзя непосредственно наблюдать, и неизвестный процесс миграции, который обычно плохо понимается. [25]

Байесовские рамки также хорошо подходят для объединения различных видов информации. Программное обеспечение BEAST, которое уделяет большое внимание калиброванным филогенезам и генеалогиям, иллюстрирует это, предлагая большое количество дополнительных эволюционных моделей, включая модели замещения, демографические модели и модели ослабленных часов, которые можно объединить в полную вероятностную модель. Добавляя пространственную реконструкцию, эти модели создают вероятность реконструкции биогеографической истории на основе генетических данных. [25] Это может быть полезно для определения источников межвидовой передачи. Высокая эффективность байесовских статистических методов сделала их полезными в эволюционных исследованиях. [26]Байесовская реконструкция предкового хозяина в рамках дискретных диффузионных моделей может использоваться для вывода о происхождении и эффектах патогенов, связанных с CST. Одно исследование аденовирусов человека с использованием байесовского метода подтвердило происхождение вирусов от горилл и шимпанзе , что способствовало профилактическим усилиям. [14] Несмотря на предположительно редкий прямой контакт между симпатрическими популяциями двух видов, между ними могут происходить события CST. Исследование также показало, что произошли два независимых события передачи HAdV-B человеку и что HAdV-B, циркулирующие в организме человека, имеют зоонозное происхождение и, вероятно, влияют на глобальное здоровье на протяжении большей части жизни нашего вида. [14]

Модели филогенетической диффузии часто используются для филогеографического анализа, и вывод о "прыжках" хозяев становится все более интересным. [4] Подход байесовского вывода позволяет моделировать усреднение по нескольким потенциальным предикторам диффузии и оценивает поддержку и вклад каждого предиктора при маргинализации на филогенетической истории. [4] Для изучения вирусных CST гибкость байесовской статистической структуры позволяет реконструировать передачу вируса между различными видами хозяев, одновременно проверяя и количественно оценивая вклад множества экологических и эволюционных влияний как распространения CST, так и смены хозяина. [4]Одно исследование бешенства у летучих мышей показало, что перекрытие географических ареалов является умеренным предиктором для CST, но не для смены хозяев. [4] Это подчеркивает, как байесовские выводы в моделях могут использоваться для анализа CST.

См. Также [ править ]

  • Математическое моделирование инфекционного заболевания
  • Вторичная инфекция
  • Зооноз
  • Зооноз кошек

Ссылки [ править ]

  1. ^ Чайлдс, JE; Mackenzie, JE; Richt, JE (2007), Дикая природа и новые зоонозы: биология, обстоятельства и последствия межвидовой передачи , текущие темы микробиологии и иммунологии, 315 , Springer-Verlag Berlin Heidelberg: Springer Science + Business Media, стр. 129– 134, DOI : 10.1007 / 978-3-540-70962-6 , ISBN 978-3-540-70961-9
  2. ^ Б с д е е г ч я J к л м н Бенавидеса, JA; Крест, ПК; Luikart, G; Крил, С. (2014), «Ограничения оценки бактериальной межвидовой передачи с использованием генетических и геномных маркеров: выводы из имитационного моделирования», Evolutionary Applications , 7 (7): 774–787, doi : 10.1111 / eva.12173 , PMC 4227858 , PMID 25469159  
  3. ^ а б Пэрриш, CR; Холмс, ЕС; Morens, DM; Парк, ВЦ; и другие. (2008), «Межвидовая передача вируса и появление новых эпидемических заболеваний», Microbiol. Мол. Биол. Rev. , 72 (3): 457-470, DOI : 10,1128 / MMBR.00004-08 , ПМК 2546865 , PMID 18772285  
  4. ^ a b c d e f g h я Фариа, Северная Каролина; Сушард, Массачусетс; Рамбаут, А; Streicker, DG; и другие. (2013), "Одновременно реконструируя вирусный межвидовой историю передачи и определение лежащих в основе ограничений", Филос Транс R Soc Лонд Б Biol Sci , 368 (1614): 20120196, DOI : 10.1098 / rstb.2012.0196 , PMC 3678322 , PMID 23382420  
  5. ^ а б в г Хейвен, Дж; Парк, AW (2013), "Суперинфекция примиряет хозяина паразит-ассоциации и межвидовой передачи", Теоретическая популяционная биология , 90 : 129-134, DOI : 10.1016 / j.tpb.2013.09.015 , PMC 7126234 , PMID 24161558  
  6. Перейти ↑ Wang LF, Anderson DE (2019). «Вирусы у летучих мышей и потенциальное распространение на животных и людей» . Текущее мнение в вирусологии . 34 : 79–89. DOI : 10.1016 / j.coviro.2018.12.007 . PMC 7102861 . PMID 30665189 .  
  7. ^ Fagre AC, Kading RC (2019). «Могут ли летучие мыши служить резервуаром для арбовирусов?» . Вирусы . 11 (3): 215. DOI : 10,3390 / v11030215 . PMC 6466281 . PMID 30832426 .  
  8. ^ Бертера, Эрик; Бехуча, Суад; Чуграни, Саада; Разик, Фатхия; Duchemin, Jean B .; Хоути, Лейла; Дехариб, Ларби; Файоль, Коринн; Макреруграсс, Банауда; Дали-Яхья, Радия; Беллал, Рамдан; Бельхабри, Лейла; Чайеб, Амина; Тихомиров, Евгений; Карниэль, Элизабет (2007). «Повторное появление чумы в Алжире через 50 лет, 2003» . Возникающие инфекционные заболевания . 13 (10): 1459–1462. DOI : 10.3201 / eid1310.070284 . PMC 2851531 . PMID 18257987 .  
  9. ^ Gessain, A; Rua, R; Betsem, E; Турпин, J (2013), "HTLV-3/4 и обезьяньи пенистые ретровирусы в организме человека: Обнаружение, эпидемиология, межвидовая передача и молекулярная вирусология", вирусология , 435 (1): 187-199, DOI : 10.1016 / J. virol.2012.09.035 , PMC 7111966 , PMID 23217627  
  10. ^ a b Кросби, Л. (2013), « Межвидовая инфекция морбилливируса : существует ли риск для людей?», Future Virology , 7 (1): 1103–1113, doi : 10.2217 / fvl.12.103 , ProQuest 1179633590 
  11. ^ Чонг, YL; Лам, TT; Ким, О; Лу, Н; и другие. (2013), «Успешное создание и глобальное рассеивание генотипа В.И. птичий парамиксовирус серотип 1 после перекрестной передачи видов», инфекции, генетика и эволюция , 17 : 260-268, DOI : 10.1016 / j.meegid.2013.04.025 , ПМК 7106292 , PMID 23628639  
  12. ^ Уоллес, RM; Гилберт, А; Шифер, D; Чипман, Р. (2014), «Правильное место, неправильные виды: 20-летний обзор межвидовой передачи вируса бешенства среди наземных млекопитающих в Соединенных Штатах», PLOS ONE , 9 (10): e107539, Bibcode : 2014PLoSO ... 9j7539W , DOI : 10.1371 / journal.pone.0107539 , PMC 4189788 , PMID 25295750  
  13. ^ а б в г Чен, ЕС; Яги, S; Келли, КР; Мендоса, ИП; и другие. (2011), « Межвидовая передача нового аденовируса, связанного со вспышкой фульминантной пневмонии в колонии обезьян в Новом Свете», PLOS Pathogens , 7 (7): e1002155, doi : 10.1371 / journal.ppat.1002155 , PMC 3136464 , PMID 21779173  
  14. ^ a b c Хоппе, E; Поли, М; Гиллеспи, TR; Акуа-Коффи, К; и другие. (2015), "Несколько события межвидовой передачи человеческих аденовирусов (HAdV) во время Hominine эволюции", молекулярная биология и эволюция , 32 (8): 2072-2084, DOI : 10,1093 / molbev / msv090 , PMC 4833075 , PMID 25862141  
  15. ^ а б в г Леми, П; Pybus, OG; Ванга, Б; Саксена, Н.К .; и другие. (2003), «Отслеживание происхождения и истории эпидемии ВИЧ-2», Proceedings of the National Academy of Sciences , 100 (11): 6588–6592, Bibcode : 2003PNAS..100.6588L , doi : 10.1073 / pnas. 0936469100 , PMC 164491 , PMID 12743376  
  16. ^ Mouinga-Ondémé, А; Карон, М; Nkoghé, D; Telfer l, P; и другие. (2012), "межвидовая передача обезьяний пенистый вируса людям в сельских районах Габона, в Центральной Африке", журнал вирусологии , 86 (2): 1255-1260, DOI : 10,1128 / jvi.06016-11 , PMC 3255803 , PMID 22072747  
  17. ^ а б Энгель, G; Хангерфорд, LL; Джонс-Энгель, Л; Трэвис, Д. и другие. (2006), «Оценка риска: модель для прогнозирования межвидовой передачи обезьяньего пенистого вируса от макак ( M. fascicularis ) к людям в обезьяньем храме на Бали, Индонезия», Американский журнал приматологии , 68 (9): 934 -948, DOI : 10.1002 / ajp.20299 , PMID 16900504 , S2CID 11821014  
  18. ^ а б в Пэрриш, CR; Холмс, ЕС; Morens, DM; Парк, ВЦ; и другие. (2008), "межвидовая Вирус передача и появление новых эпидемических заболеваний", микробиология и молекулярная биология Отзывы , 72 (3): 457-470, DOI : 10,1128 / MMBR.00004-08 , PMC 2546865 , PMID 18772285  
  19. ^ Dacheux, L; Сервантес-Гонсалес, М; Guigon, G; Thiberge, JM; и другие. (2014), «Предварительное исследование вирусной метагеномики французских видов летучих мышей, контактирующих с людьми: идентификация новых вирусов млекопитающих», PLOS ONE , 9 (1): 845–53, Bibcode : 2014PLoSO ... 987194D , doi : 10.1371 /journal.pone.0087194 , PMC 3906132 , PMID 24489870  
  20. ^ Кирмайер, А; Wu, F; Ньюман, РМ; Холл, LR; и другие. (2013), «TRIM5 подавляет межвидовую передачу вируса иммунодефицита приматов и выбирает для появления устойчивых вариантов у новых видов», PLOS Biology , 8 (8): e1000462, doi : 10.1371 / journal.pbio.1000462 , PMC 2927514 , PMID 20808775  
  21. ^ а б Эллисон, AB; Харбисон, CE; Пэган, я; Стакер, км; и другие. (2012), "Роль нескольких хостов в межвидовой передачи и возникновения пандемии парвовирус", журнал вирусологии , 86 (2): 865-872, DOI : 10,1128 / jvi.06187-11 , PMC 3255849 , PMID 22072763  
  22. ^ Эллисон, AB; Колер, диджей; Fox, KA; Браун, JD (2015), "Сетевой анализ хост-вирусных сообществ в летучих мышей и грызунов показывает детерминанты передачи межвидовой", Экология Letters , 18 (11): 1153-1162, DOI : 10.1111 / ele.12491 , PMC 5014217 , PMID 26299267  
  23. ^ a b c Каннингем, CW; Omland, KE; Оук, TH (1998), "Воссоздание наследственных состояний символов: критическую переоценки", тенденции в экологии и эволюции , 13 (9): 361-366, DOI : 10.1016 / s0169-5347 (98) 01382-2 , PMID 21238344 
  24. ^ Луис, AD; О'Ши, TJ; Хейман, DTS; Wood, JLN (2015), «Сетевой анализ сообществ вирусов-хозяев у летучих мышей и грызунов выявляет детерминанты межвидовой передачи» (PDF) , Ecology Letters , 18 (11): 1153–1162, doi : 10.1111 / ele.12491 , PMC 5014217 , PMID 26299267   
  25. ^ а б Лемей, П; Рамбаут, А; Drummoond, AJ; Сушард, Массачусетс; и другие. (2009), «Байесовская филогеография находит свои корни», PLOS Comput Biol , 5 (9): e1000520, Bibcode : 2009PLSCB ... 5E0520L , doi : 10.1371 / journal.pcbi.1000520 , PMC 2740835 , PMID 19779555  
  26. ^ Ronquist, F (2004), "байесовский вывод об эволюции характера" (PDF) , тенденции в экологии и эволюции , 19 (9): 475-481, DOI : 10.1016 / j.tree.2004.07.002 , PMID 16701310  

Внешние ссылки [ править ]

  • Тео Кипрайос. «Мягкое руководство по байесовской статистике» (PDF) . Проверено 10 июля 2020 .
  • Книга по байесовскому моделированию и примеры доступны для скачивания.
  • Байесовская статистика в Викиверситете