Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
E2F1
Протеин E2F1 PDB 2aze.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1H24 , 1O9K , 2AZE

Идентификаторы
ПсевдонимыE2F1 , E2F-1, RBAP1, RBBP3, RBP3, фактор транскрипции E2F 1
Внешние идентификаторыOMIM : 189971 MGI : 101941 HomoloGene : 3828 GeneCards : E2F1
Расположение гена ( человек )
Хромосома 20 (человек)
Chr.Хромосома 20 (человека) [1]
Хромосома 20 (человек)
Геномное расположение E2F1
Геномное расположение E2F1
Группа20q11.22Начинать33 675 477 п.н. [1]
Конец33 686 385 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 2 (мышь)
Chr.Хромосома 2 (мышь) [2]
Хромосома 2 (мышь)
Геномное расположение E2F1
Геномное расположение E2F1
Группа2 H1 | 2 76,79 смНачинать154 559 407 п.н. [2]
Конец154 569 892 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE E2F1 204947 в формате fs.png

Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• Связывание ДНК
• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 ДНК-связывающий фактор транскрипции
• Связывание фактора транскрипции
• Связывание с белком GO: 0001948
• активность димеризации белка
• GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфическая
для РНК-полимеразы II • Последовательно-специфическое связывание ДНК
• GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфическая
для РНК-полимеразы II • Связывание протеинкиназы
• GO: 0001158 Связывание ДНК проксимальной области корового промотора, специфичное для последовательности
• GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II
Сотовый компонент• цитоплазма
• транскрипция регулятор комплекс
• Rb-E2F комплекс
• ядерного хроматин
• клеточное ядро
• митохондрия
• нуклеоплазма
• центросома
• макромолекулярная комплекс
• РНК - полимераза II фактор транскрипция комплекс
Биологический процесс• клеточный ответ на стимул фактора роста нервов
• негативная регуляция дифференцировки жировых клеток
• регуляция транскрипции, основанная на ДНК
• апоптотический процесс линзовых волокон
• негативная регуляция транскрипции, участвующая в переходе митотического клеточного цикла G1 / S
• позитивная регуляция пролиферации фибробластов
• негативная регуляция связывания ДНК
• негативная регуляция пролиферации жировых клеток
• контрольная точка повреждения ДНК
• клеточный ответ на ксенобиотический стимул
• негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• транскрипция, ДНК-шаблон
• регуляция клеточного цикла
• позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• регуляция перехода G1 / S митотического клеточного цикла
• стабилизация мРНК
• позитивная регуляция встраивания белка в митохондриальную мембрану, участвующую в апоптотическом сигнальном пути
• позитивная регуляция экспрессии гена
• клеточный ответ на жирные кислоты
• аноикис
• сперматогенез
• внутренний путь апоптотической передачи сигналов в ответ на повреждение ДНК
• внутренний путь передачи сигналов апоптоза медиатором класса p53
• клеточный цикл
• развитие переднего мозга
• негативная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• клеточный ответ на гипоксию
• позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• апоптотический процесс
• ответ на повреждение ДНК, передача сигнала медиатором класса p53, приводящая к остановке клеточного цикла
• вовлеченная регуляция транскрипции при переходе G1 / S митотического клеточного цикла
• позитивная регуляция апоптотического процесса
• негативная регуляция перехода G0 в G1
• позитивная регуляция пролиферации глиальных клеток
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

1869 г.

13555

Ансамбль

ENSG00000101412

ENSMUSG00000027490

UniProt

Q01094

Q61501

RefSeq (мРНК)

NM_005225

NM_007891
NM_001291105

RefSeq (белок)

NP_005216

NP_001278034
NP_031917

Расположение (UCSC)Chr 20: 33.68 - 33.69 МбChr 2: 154,56 - 154,57 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Фактор транскрипции E2F1 является белком , который в организме человека кодируется E2F1 геном . [5]

Функция [ править ]

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства факторов транскрипции E2F . Семейство E2F играет решающую роль в контроле клеточного цикла и действия белков- супрессоров опухолей, а также является мишенью трансформирующих белков небольших ДНК опухолевых вирусов. Белки E2F содержат несколько эволюционно консервативных доменов, обнаруженных у большинства членов этого семейства. Эти домены включают ДНК-связывающий домен., домен димеризации, который определяет взаимодействие с регулируемыми дифференцировкой белками факторов транскрипции (DP), доменом трансактивации, обогащенным кислыми аминокислотами, и доменом ассоциации белка-супрессора опухоли, который встроен в домен трансактивации. Этот белок и еще 2 члена, E2F2 и E2F3, имеют дополнительный связывающий циклин домен. Этот белок связывается преимущественно с белком ретинобластомы pRB зависимым от клеточного цикла образом. Он может опосредовать как пролиферацию клеток, так и р53- зависимый / независимый апоптоз . [6]

Транскрипция [ править ]

Промотор E2F1 [PAX8] => E2F1 PMID  21602887

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что E2F1 взаимодействует с:

  • ARID3A , [7]
  • CUL1 , [8]
  • Циклин А1 , [9]
  • Циклин А2 , [10]
  • GTF2H1 , [11]
  • MDM4 , [12]
  • NCOA6 , [13]
  • NDN , [14] [15]
  • NPDC1 , [16]
  • ПУРА , [17]
  • PHB , [18] [19] [20] [21]
  • RB1 , [14] [22] [23] [24] [25] [26] [27]
  • RBL1 , [22]
  • СКП2 , [8]
  • SP1 , [28] [29] [30]
  • SP2 , [28]
  • SP3 , [28]
  • SP4 , [28]
  • TFDP1 [7] [27] [31] [32]
  • TOPBP1 , [33] [34]
  • TP53BP1 , [25] и
  • UBC . [35]

См. Также [ править ]

  • E2F
  • Белок ретинобластомы

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000101412 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027490 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. Перейти ↑ Neuman E, Sellers WR, McNeil JA, Lawrence JB, Kaelin WG (декабрь 1996 г.). «Структура и частичная геномная последовательность гена E2F1 человека». Джин . 173 (2): 163–9. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (96) 00184-9 . PMID 8964493 . 
  6. ^ «Энтрез Ген: фактор транскрипции E2F1 E2F 1» .
  7. ^ Б Suzuki M, S, Окуяма Окамото S, Shirasuna K, T, Nakajima Hachiya T, H, Nojima Sekiya S, Oda K (август 1998 г.). «Новый связывающий E2F белок с мотивом HLH Myc-типа стимулирует E2F-зависимую транскрипцию путем образования гетеродимера» . Онкоген . 17 (7): 853–65. DOI : 10.1038 / sj.onc.1202163 . PMID 9780002 . 
  8. ^ a b Марти А., Вирбелауэр С., Шеффнер М., Крек В. (май 1999 г.). «Взаимодействие между убиквитин-протеинлигазой SCFSKP2 и E2F-1 лежит в основе регуляции деградации E2F-1». Nat. Cell Biol . 1 (1): 14–9. DOI : 10,1038 / 8984 . PMID 10559858 . S2CID 8884226 .  
  9. Перейти ↑ Yang R, Müller C, Huynh V, Fung YK, Yee AS, Koeffler HP (март 1999 г.). «Функции циклина A1 в клеточном цикле и его взаимодействия с фактором транскрипции E2F-1 и белками семейства Rb» . Мол. Клетка. Биол . 19 (3): 2400–7. DOI : 10.1128 / mcb.19.3.2400 . PMC 84032 . PMID 10022926 .  
  10. ↑ Xu M, Sheppard KA, Peng CY, Yee AS, Piwnica-Worms H (декабрь 1994). «Циклин A / CDK2 связывается непосредственно с E2F-1 и ингибирует ДНК-связывающую активность E2F-1 / DP-1 путем фосфорилирования» . Мол. Клетка. Биол . 14 (12): 8420–31. DOI : 10,1128 / MCB.14.12.8420 . PMC 359381 . PMID 7969176 .  
  11. ^ Vandel L, Kouzarides T (август 1999). «Остатки, фосфорилированные TFIIH, необходимы для разложения E2F-1 во время S-фазы» . EMBO J . 18 (15): 4280–91. DOI : 10.1093 / emboj / 18.15.4280 . PMC 1171504 . PMID 10428966 .  
  12. ^ Strachan GD, Jordan-Sciutto KL, Раллапалли R, Туан RS, зал DJ (февраль 2003). «Фактор транскрипции E2F-1 негативно регулируется своим взаимодействием с белком MDMX» . J. Cell. Биохим . 88 (3): 557–68. DOI : 10.1002 / jcb.10318 . PMID 12532331 . S2CID 38805122 .  
  13. ↑ Kong HJ, Yu HJ, Hong S, Park MJ, Choi YH, An WG, Lee JW, Cheong J (ноябрь 2003 г.). «Взаимодействие и функциональное сотрудничество усиливаемого раком транскрипционного коактиватора, активирующего сигнал коинтегратора-2 и E2F-1 в пролиферации клеток». Мол. Cancer Res . 1 (13): 948–58. PMID 14638867 . 
  14. ^ a b Таниура Х., Танигучи Н., Хара М., Йошикава К. (январь 1998 г.). «Некдин, постмитотический нейрон-специфический супрессор роста, взаимодействует с вирусными трансформирующими белками и клеточным фактором транскрипции E2F1» . J. Biol. Chem . 273 (2): 720–8. DOI : 10.1074 / jbc.273.2.720 . PMID 9422723 . 
  15. ^ Kuwako K, Taniura H, Ёшикава K (январь 2004). «Связанные с некдином белки MAGE по-разному взаимодействуют с фактором транскрипции E2F1 и рецептором нейротрофина p75» . J. Biol. Chem . 279 (3): 1703–12. DOI : 10.1074 / jbc.M308454200 . PMID 14593116 . 
  16. ^ Sansal I, Dupont E, D Toru, Эврард C, Руже P (октябрь 2000). «NPDC-1, регулятор пролиферации и дифференцировки нервных клеток, взаимодействует с E2F-1, снижает его связывание с ДНК и модулирует его транскрипционную активность» . Онкоген . 19 (43): 5000–9. DOI : 10.1038 / sj.onc.1203843 . PMID 11042687 . 
  17. ^ Дарбинян N, Галлий Г.Л., Кунда М, Shcherbik Н, Третьякова А, Джордано А, Халили К (ноябрь 1999 года). «Ассоциация Pur альфа и E2F-1 подавляет транскрипционную активность E2F-1» . Онкоген . 18 (46): 6398–402. DOI : 10.1038 / sj.onc.1203011 . PMID 10597240 . 
  18. Перейти ↑ Joshi B, Ko D, Ordonez-Ercan D, Chellappan SP (декабрь 2003 г.). «Предполагаемого домена в форме спиральной спирали запрета достаточно для репрессии E2F1-опосредованной транскрипции и индукции апоптоза». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 312 (2): 459–66. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2003.10.148 . PMID 14637159 . 
  19. ^ Fusaro G Дасгупта P, S Rastogi, Joshi B, Chellappan S (ноябрь 2003). «Prohibitin индуцирует транскрипционную активность p53 и экспортируется из ядра при передаче сигналов апоптоза» . J. Biol. Chem . 278 (48): 47853–61. DOI : 10.1074 / jbc.M305171200 . PMID 14500729 . 
  20. ↑ Wang S, Zhang B, Faller DV (июнь 2002 г.). «Prohibitin требует Brg-1 и Brm для подавления E2F и роста клеток» . EMBO J . 21 (12): 3019–28. DOI : 10,1093 / emboj / cdf302 . PMC 126057 . PMID 12065415 .  
  21. Перейти ↑ Wang S, Nath N, Fusaro G, Chellappan S (ноябрь 1999 г.). «Rb и запретитин нацелены на отдельные области E2F1 для репрессии и отвечают на разные восходящие сигналы» . Мол. Клетка. Биол . 19 (11): 7447–60. DOI : 10.1128 / mcb.19.11.7447 . PMC 84738 . PMID 10523633 .  
  22. ^ a b Дайсон Н., Дембски М., Фаттей А., Нгву С., Юэн М., Хелин К. (декабрь 1993 г.). «Анализ p107-ассоциированных белков: p107 ассоциирует с формой E2F, которая отличается от pRB-ассоциированного E2F-1» . J. Virol . 67 (12): 7641–7. DOI : 10,1128 / JVI.67.12.7641-7647.1993 . PMC 238233 . PMID 8230483 .  
  23. ^ Николас Е, айт-Си-Али С, Trouche D (август 2001 г.). «Гистондеацетилаза HDAC3 нацеливает RbAp48 на белок ретинобластомы» . Nucleic Acids Res . 29 (15): 3131–6. DOI : 10.1093 / NAR / 29.15.3131 . PMC 55834 . PMID 11470869 .  
  24. Перейти ↑ Pardo PS, Leung JK, Lucchesi JC, Pereira-Smith OM (декабрь 2002 г.). «MRG15, новый белок хромодомена, присутствует в двух различных мультибелковых комплексах, участвующих в активации транскрипции» . J. Biol. Chem . 277 (52): 50860–6. DOI : 10.1074 / jbc.M203839200 . PMID 12397079 . 
  25. ^ a b Choubey D, Li SJ, Datta B, Gutterman JU, Lengyel P (октябрь 1996 г.). «Ингибирование E2F-опосредованной транскрипции с помощью p202» . EMBO J . 15 (20): 5668–78. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00951.x . PMC 452311 . PMID 8896460 .  
  26. ^ Fajas л, Пол С, Zugasti О, Ле Кулачковые л, Polanowska Дж, Fabbrizio Е, Medema R, Vignais М.Л., Sardet С (июль 2000 г.). «pRB связывает и модулирует трансрепрессирующую активность E1A-регулируемого фактора транскрипции p120E4F» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 97 (14): 7738–43. Bibcode : 2000PNAS ... 97.7738F . DOI : 10.1073 / pnas.130198397 . PMC 16614 . PMID 10869426 .  
  27. ^ a b Wu CL, Zukerberg LR, Ngwu C, Harlow E, Lees JA (май 1995 г.). «Связь in vivo белков семейства E2F и DP» . Мол. Клетка. Биол . 15 (5): 2536–46. DOI : 10.1128 / mcb.15.5.2536 . PMC 230484 . PMID 7739537 .  
  28. ^ a b c d Rotheneder H, Geymayer S, Haidweger E (ноябрь 1999 г.). «Факторы транскрипции семейства Sp1: взаимодействие с E2F и регуляция промотора мышиной тимидинкиназы». J. Mol. Биол . 293 (5): 1005–15. DOI : 10.1006 / jmbi.1999.3213 . PMID 10547281 . 
  29. ^ Лин С.Ю., черный AR, Kostic D, Pajovic S, Hoover CN, Azizkhan JC (апрель 1996). «Регулируемая клеточным циклом ассоциация E2F1 и Sp1 связана с их функциональным взаимодействием» . Мол. Клетка. Биол . 16 (4): 1668–75. DOI : 10,1128 / MCB.16.4.1668 . PMC 231153 . PMID 8657142 .  
  30. ^ Karlseder Дж, Rotheneder Н, Wintersberger Е (апрель 1996 г.). «Взаимодействие Sp1 с фактором транскрипции E2F, регулируемым ростом и клеточным циклом» . Мол. Клетка. Биол . 16 (4): 1659–67. DOI : 10.1128 / mcb.16.4.1659 . PMC 231152 . PMID 8657141 .  
  31. ^ Sardet C, Vidal M, Cobrinik D, Гэн Y, Onufryk C, Чен, Weinberg RA (март 1995). «E2F-4 и E2F-5, два члена семейства E2F, экспрессируются на ранних фазах клеточного цикла» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 92 (6): 2403–7. Bibcode : 1995PNAS ... 92.2403S . DOI : 10.1073 / pnas.92.6.2403 . PMC 42492 . PMID 7892279 .  
  32. ↑ Helin K, Wu CL, Fattaey AR, Lees JA, Dynlacht BD, Ngwu C, Harlow E (октябрь 1993 г.). «Гетеродимеризация факторов транскрипции E2F-1 и DP-1 приводит к совместной трансактивации» . Genes Dev . 7 (10): 1850–61. DOI : 10,1101 / gad.7.10.1850 . PMID 8405995 . 
  33. Перейти ↑ Liu K, Lin FT, Ruppert JM, Lin WC (май 2003 г.). «Регулирование E2F1 с помощью белка TopBP1, содержащего домен BRCT» . Мол. Клетка. Биол . 23 (9): 3287–304. DOI : 10.1128 / mcb.23.9.3287-3304.2003 . PMC 153207 . PMID 12697828 .  
  34. ↑ Yu X, Chini CC, He M, Mer G, Chen J (октябрь 2003 г.). «Домен BRCT представляет собой домен, связывающий фосфо-белок». Наука . 302 (5645): 639–42. Bibcode : 2003Sci ... 302..639Y . DOI : 10.1126 / science.1088753 . PMID 14576433 . S2CID 29407635 .  
  35. ↑ Zhou F, Zhang L, Wang A, Song B, Gong K, Zhang L, Hu M, Zhang X, Zhao N, Gong Y (май 2008 г.). «Ассоциация GSK3 beta с E2F1 способствует дифференцировке нервных клеток, индуцированной фактором роста нервов» . J. Biol. Chem . 283 (21): 14506–15. DOI : 10.1074 / jbc.M706136200 . PMID 18367454 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Dupont E, Sansal I, Toru D, Evrard C, Rouget P (1997). «[Идентификация NPDC-1, гена, участвующего в контроле пролиферации и дифференцировки нейральных и глиальных предшественников]». CR Séances Soc. Биол. Fil . 191 (1): 95–104. PMID  9181131 .
  • Стивенс К., Ла Танге Н.Б. (2005). «Возникающая роль E2F-1 в ответе на повреждение ДНК и контроле контрольных точек» . Ремонт ДНК (Amst.) . 3 (8–9): 1071–9. DOI : 10.1016 / j.dnarep.2004.03.034 . PMID  15279795 .
  • Чжан З., Ван Х., Ли М., Рейберн Э., Агравал С., Чжан Р. (2006). «Новые р53-независимые функции MDM2, идентифицированные с помощью технологий подавления РНК». Анна. NY Acad. Sci . 1058 (1): 205–14. DOI : 10.1196 / annals.1359.030 . PMID  16394138 . S2CID  35683657 .
  • Шильд С., Вирт М., Райхерт М., Шмид Р.М., Заур Д., Шнайдер Г. (июль 2009 г.). «Передача сигналов PI3K поддерживает экспрессию c-myc для регулирования транскрипции E2F1 в клетках рака поджелудочной железы». Мол. Канцерогенный . 48 (12): 1149–58. DOI : 10.1002 / mc.20569 . PMID  19603422 . S2CID  41545085 .

Внешние ссылки [ править ]

  • E2F1 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
  • FactorBook E2F1

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .