В вирусоподобные кодируются малые РНК Эпштейна-Барр (Эберс) представляют собой небольшие некодирующие РНК , локализованных в ядре человеческих клеток , инфицированных вирусом Эпштейна-Барра (EBV). Впервые обнаруженные в 1981 году EBER представляют собой наиболее распространенные РНК, присутствующие в инфицированных клетках. [1] EBER взаимодействуют с несколькими белками-хозяевами с образованием комплексов рибонуклеопротеидов (RNP). Хотя точная функция EBERs остается неуловимой, предполагается их роль в трансформации и онкогенезе .
EBER1 | |
---|---|
Идентификаторы | |
Символ | EBER1 |
Рфам | RF01789 |
Прочие данные | |
Тип РНК | Ген |
Домен (ы) | Вирус Эпштейна-Барра |
Структуры PDB | PDBe |
Задний план
EBER1 и EBER2 - короткие, 167 и 172 нуклеотидов в длину, соответственно, некодирующие РНК, обогащенные ядром . Эти две РНК транскрибируется с помощью хозяина РНК - полимеразы III во время латентной инфекции ВЭБ. [2] [3]
EBER 1 и 2 могут быть удалены из вирусного генома без заметных фенотипических изменений, хотя это никогда не было обнаружено удаленными в природе. [2] Экспрессия EBER сама по себе может вызывать опухоли у мышей с тяжелым комбинированным иммунодефицитом . [4] [5]
EBER1
EBER1 связывается с рибосомным белком L22 человека [6] и заставляет этот белок перемещаться из ядрышка в нуклеоплазму . [7] EBER1 также специфически взаимодействует по крайней мере с тремя hnRNP хозяина (A1, A2 / B1 и D / AUF1 ). [8]
EBER2
Подобно EBER1, EBER2 очень высоко экспрессируется в латентно инфицированных клетках. В отличие от EBER1, последовательность EBER2 менее консервативна в родственных герпесвирусах (консервативность ~ 50%). Тем не менее, вторичная структура из EBER2 является высоко консервативным (см рисунок 1). EBER2, как известно, связывает клеточные белки (в частности, домен La ) только на своем конечном участке повторяющихся уридинов ; однако считается, что другие особенности EBER2, особенно его две длинные и высококонсервативные стеблевые петли , также могут служить сайтами связывания для еще неизвестных белков. [9]
Рекомендации
- Перейти ↑ Lerner MR, Andrews NC, Miller G, Steitz JA (февраль 1981). «Две малые РНК, кодируемые вирусом Эпштейна-Барра и связанные с белком, осаждаются антителами пациентов с системной красной волчанкой» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 78 (2): 805–809. DOI : 10.1073 / pnas.78.2.805 . PMC 319891 . PMID 6262773 .
- ^ а б Конрад NK, Fok V, Cazalla D, Borah S, Steitz JA (2006). «Проблема вирусных snRNPs» . Симпозиумы Колд-Спринг-Харбор по количественной биологии . 71 : 377–384. DOI : 10.1101 / sqb.2006.71.057 . PMID 17381320 .
- ^ Мосс В.Н., Ли Н., Пимиента Дж., Стейтц Дж. А. (2014). «Семейства РНК в вирусе Эпштейна-Барра» . Биология РНК . 11 (1): 10–17. DOI : 10,4161 / rna.27488 . PMC 3929418 . PMID 24441309 .
- ^ Комано Дж., Маруо С., Куродзуми К., Ода Т., Такада К. (декабрь 1999 г.). «Онкогенная роль РНК, кодируемых вирусом Эпштейна-Барра, в клеточной линии лимфомы Беркитта Akata» . Журнал вирусологии . 73 (12): 9827–9831. PMC 113031 . PMID 10559294 .
- ^ Ямамото Н., Такидзава Т., Иванага И., Симидзу Н., Ямамото Н. (ноябрь 2000 г.). «Злокачественная трансформация клеточной линии B-лимфомы BJAB небольшими РНК, кодируемыми вирусом Эпштейна-Барра». Письма FEBS . 484 (2): 153–158. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (00) 02145-1 . PMID 11068051 .
- ^ Fok V, Mitton-Fry RM, Grech A, Steitz JA (май 2006 г.). «Множественные домены EBER 1, некодирующей РНК вируса Эпштейна-Барра, рекрутируют человеческий рибосомный белок L22» . РНК . 12 (5): 872–882. DOI : 10,1261 / rna.2339606 . PMC 1440895 . PMID 16556938 .
- ^ Toczyski DP, Matera AG, Ward DC, Steitz JA (апрель 1994). «Малая РНК EBER1 вируса Эпштейна-Барра (EBV) связывает и перемещает рибосомный белок L22 в EBV-инфицированные В-лимфоциты человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (8): 3463–3467. DOI : 10.1073 / pnas.91.8.3463 . PMC 43597 . PMID 8159770 .
- ^ Ли Н., Пимиента Дж., Стейтц Дж. А. (ноябрь 2012 г.). «AUF1 / hnRNP D представляет собой новый белок-партнер некодирующей РНК EBER1 вируса Эпштейна-Барра» . РНК . 18 (11): 2073–2082. DOI : 10,1261 / rna.034900.112 . PMC 3479396 . PMID 23012480 .
- ^ Мосс В.Н., Ли Н., Пимиента Дж., Стейтц Дж. А. (20 декабря 2013 г.). «Семейства РНК в вирусе Эпштейна-Барра» . Биология РНК . 11 (1): 10–17. DOI : 10,4161 / rna.27488 . PMC 3929418 . PMID 24441309 .
Внешние ссылки
- Страница малых ядрышковых РНК вируса герпеса человека 1 в Rfam
- Страница для EBER1 в Rfam
- Страница v-snoRNA1 в Rfam
- Страница IRES_EBNA в Rfam
- Стабильные РНК с интронной последовательностью вируса Эпштейна-Барра