Geobacter Metallireducens - это грамотрицательные металлообрабатывающие протеобактерии . [1] Это строгий анаэроб, который окисляет несколько короткоцепочечных жирных кислот , спиртов и моноароматических соединений с Fe (III) в качестве единственного акцептора электронов . [2] Он также может использовать уран для выращивания и превращать U (VI) в U (IV). [3]
Geobacter Metallireducens | |
---|---|
Научная классификация | |
Королевство: | |
Тип: | |
Класс: | |
Заказ: | |
Семья: | |
Род: | |
Разновидность: | G. Metallireducens |
Биномиальное имя | |
Geobacter Metallireducens Lovley et al. 1995 г. |
Geobacter Metallireducens был открыт Дереком Ловли из Университета Массачусетса в Амхерсте в 1993 году. [1] Это железоредуцирующие бактерии, и считалось, что этот микроб можно использовать для обработки промышленных участков, где образовались «комплексы цианид-металл» для заражения сайт. [4] Geobacter Metallireducens становится подвижным, когда это необходимо, образуя жгутик, который перемещается, когда условия окружающей среды становятся неблагоприятными. [4]
Геном Geobacter Metallireducens имеет длину хромосомы 3 997 420 п.н. У него круглая бактериальная хромосома , что означает отсутствие свободных концов ДНК. По форме примерно как яйцо. [5] Geobacter Metallireducens также имеет содержание GC 59,51%. [5] плазмиду имеет более низкое содержание GC , на 52,48%, а это 13762 пар оснований в длину. Плазмида кодирует стабилизирующий белок RelE / ParE, который позволяет Geobacter Metallireducens адаптироваться и процветать в различных и новых условиях окружающей среды. [6]
Было продемонстрировано, что G. Metallireducens восстанавливает хлорамфеникол (CAP) до продуктов полного дехлорирования в чистых условиях культивирования. Исследования с использованием циклической вольтамперометрии и хроноамперометрии показали, что бактерии демонстрируют отрицательную корреляцию эффективности удаления CAP с начальными дозами CAP, показывая потенциальное применение организмом биоремедиации в окружающей среде, загрязненной антибиотиками. [7]
Рекомендации
- ^ a b Ловли Д.Р., Джованнони С.Дж., Белый округ Колумбия, Чампин Дж. Э., Филлипс Е. Дж., Горби Ю. А., Гудвин С. (1993). «Geobacter Metallireducens gen. Nov. Sp. Nov., Микроорганизм, способный сочетать полное окисление органических соединений с восстановлением железа и других металлов». Архив микробиологии . 159 (4): 336–344. DOI : 10.1007 / BF00290916 . PMID 8387263 . S2CID 21365293 .
- ^ Tremblay PL, Aklujkar M, Leang C, Nevin KP, Lovley D (февраль 2012 г.). «Генетическая система для Geobacter Metallireducens: роль флагеллина и пилина в восстановлении оксида Fe (III)». Отчеты по микробиологии окружающей среды . 4 (1): 82–88. DOI : 10.1111 / j.1758-2229.2011.00305.x . PMID 23757233 .
- ^ Корибаникс Н.М., Туорто С.Дж., Лопес-Чиаффарелли Н., Макгиннесс Л.Р., Хэггблом М.М., Уильямс К.Х., Лонг ЧП, Керкхоф Л.Дж. (2015). «Пространственное распределение уран-дышащих бета-протеобактерий на полевых исследованиях в Райфле, штат Колорадо» . PLOS ONE . 10 (4): e0123378. Bibcode : 2015PLoSO..1023378K . DOI : 10.1371 / journal.pone.0123378 . PMC 4395306 . PMID 25874721 .
- ^ а б Чайлдерс С.Е., Чиуфо С., Ловли Д.Р. (апрель 2002 г.). «Geobacter Metallireducens получает доступ к нерастворимому оксиду Fe (III) путем хемотаксиса». Природа . 416 (6882): 767–769. Bibcode : 2002Natur.416..767C . DOI : 10.1038 / 416767a . PMID 11961561 . S2CID 2967856 .
- ^ а б Аклужкар М., Крушкал Дж., ДиБартоло Дж., Лапидус А., Лэнд М.Л., Ловли Д.Р. (май 2009 г.). «Последовательность генома Geobacter Metallireducens: особенности метаболизма, физиологии и регуляции, общие и отличные от Geobacter sulfatereducens» . BMC Microbiology . 9 : 109. DOI : 10,1186 / 1471-2180-9-109 . PMC 2700814 . PMID 19473543 .
- ^ Анантараман В., Аравинд Л. (2003). «Новые связи в прокариотической сети токсин-антитоксин: взаимосвязь с эукариотической нонсенс-опосредованной системой распада РНК» . Геномная биология . 4 (12): R81. DOI : 10.1186 / GB-2003-4-12-R81 . PMC 329420 . PMID 14659018 .
- ^ Сюй, Х., Сяо, Л., Чжэн, С. и др. «Восстановительное разложение хлорамфеникола с помощью Geobacter Metallireducens». Sci. China Technol. Sci. 62, 1688–1694 (2019). DOI : 10.1007 / s11431-018-9415-2
дальнейшее чтение
- Эйкхофф М., Биргель Д., Талбот Х.М., Пекманн Дж., Капплер А. (2013). «Бактериогопаноидный инвентарь Geobacter surreducens и Geobacter Metallireducens». Органическая геохимия . 58 : 107–114. DOI : 10.1016 / j.orggeochem.2013.02.013 . ISSN 0146-6380 .
- Schleinitz KM, Schmeling S, Jehmlich N, von Bergen M, Harms H, Kleinsteuber S, Vogt C, Fuchs G (июнь 2009 г.). «Разложение фенола в строго анаэробной железоредуцирующей бактерии Geobacter Metallireducens GS-15» . Прикладная и экологическая микробиология . 75 (12): 3912–3919. DOI : 10,1128 / AEM.01525-08 . PMC 2698347 . PMID 19376902 .
- Zhang T, Tremblay PL, Chaurasia AK, Smith JA, Bain TS, Lovley DR (22 мая 2014 г.). «Идентификация генов, специально необходимых для анаэробного метаболизма бензола у Geobacter Metallireducens» . Границы микробиологии . 5 : 245. DOI : 10,3389 / fmicb.2014.00245 . PMC 4033198 . PMID 24904558 .
Внешние ссылки
- Геобактер в ЛПСН
- "Geobacter Metallireducens" в Энциклопедии жизни
- Типовой штамм Geobacter Metallireducens в Bac Dive - база метаданных по бактериальному разнообразию