Массивы гликанов , подобные тем, которые предлагаются Консорциумом функциональной гликомики (CFG), Национальным центром функциональной гликомики (NCFG) и Z Biotech, LLC , содержат углеводные соединения, которые можно скринировать с помощью лектинов, антител или клеточных рецепторов для определения специфичности углеводов и идентификации. лиганды. Скрининг с помощью гликанового массива работает во многом так же, как и другие микроматрицы, которые используются, например, для изучения ДНК-микрочипов экспрессии генов или взаимодействия белков .
Массивы гликанов состоят из различных олигосахаридов и / или полисахаридов, иммобилизованных на твердой подложке в пространственно определенном расположении. [1] Эта технология предоставляет средства для изучения взаимодействия гликанов и белков в высокопроизводительной среде. Эти природные или синтетические (см. Синтез углеводов ) гликаны затем инкубируются с любым гликан-связывающим белком, таким как лектины , рецепторы клеточной поверхности или, возможно, с целым организмом, таким как вирус . Связывание количественно определяют с использованием методов обнаружения на основе флуоресценции.
Приложения [ править ]
Технология гликанового массива применялась и до сих пор применяется для изучения специфичности взаимодействий хозяин-патоген .[2]
В самом начале гликановые массивы оказались полезными при определении специфичности гемагглютинина (грипп) от вируса гриппа A связываний с хостом и различия между различными штаммами грипп ( в том числе птиц от млекопитающих). Это было показано с массивами CFG [3], а также с настраиваемыми массивами. [4] Межплатформенные тесты позволили выявить влияние представления гликанов и их размещения на связывание. [5]
Массивы гликанов, возможно, комбинируются с другими методами, такими как поверхностный плазмонный резонанс (SPR), для уточнения характеристик связывания гликанов . Например, эта комбинация позволила продемонстрировать кальций-зависимое связывание с гепарином аннексина A1, который участвует в нескольких биологических процессах, включая воспаление , апоптоз и перенос через мембрану . [6]
Ссылки [ править ]
- ^ Oyelaran O, Гилдерслив JC (октябрь 2009). «Массивы гликанов: последние достижения и будущие задачи» . Curr Opin Chem Biol . 13 (4): 406–413. DOI : 10.1016 / j.cbpa.2009.06.021 . PMC 2749919 . PMID 19625207 .
- ^ Geissner A, Аниш C, Seeberger PH (февраль 2014). «Массивы гликанов как инструменты для исследования инфекционных заболеваний». Curr Opin Chem Biol . 18 : 38–45. DOI : 10.1016 / j.cbpa.2013.11.013 . PMID 24534751 .
- ^ Стивенс J, Blixt O, Тампи TM, Таубенбергер JK, Полсон JC, Wilson IA (апрель 2006). «Структура и рецепторная специфичность гемагглютинина вируса гриппа H5N1» . Наука . 312 (5772): 404–410. Bibcode : 2006Sci ... 312..404S . DOI : 10.1126 / science.1124513 . PMID 16543414 .
- ↑ Childs RA, Palma AS, Wharton S, Matrosovich T, Liu Y, Chai W, Campanero-Rhodes MA, Zhang Y, Eickmann M, Kiso M, Hay A, Matrosovich M, Feizi T (сентябрь 2009 г.). «Рецептор-связывающая специфичность вируса пандемического гриппа A (H1N1) 2009, определенная с помощью углеводного микрочипа» . Nat Biotechnol . 27 (9): 797–799. DOI : 10.1038 / nbt0909-797 . PMC 3771066 . PMID 19741625 .
- ^ Ван л, Каммингз РД, Смит Д. Ф., Huflejt М, Кэмпбелл КТ, Гилдерслив JC, Герлах JQ, Kilcoyne М, Джоши л, Серна S, Рейхардт NC, Parera Пера N, Питерс RJ, Eng Вт, Махала ЛК июнь (2014) . «Межплатформенное сравнение форматов микрочипов гликанов» . Гликобиология . 24 (6): 507–17. DOI : 10.1093 / glycob / cwu019 . PMC 4001710 . PMID 24658466 .
- ^ Horlacher T, Noti C, де Пас JL, Bindschadler P, Хехт ML, Smith DF, Fukuda MN, Seeberger PH (апрель 2011). «Характеристика связывания гликанов аннексина A1 показывает связывание с высокосульфатированными гликанами с предпочтением высокосульфатированного гепарансульфата и гепарина» . Биохимия . 50 (13): 2650–9. DOI : 10.1021 / bi101121a . PMC 3068229 . PMID 21370880 .
