главный комплекс гистосовместимости (человек), класс I, B46 | ||
Аллели | В * 4601 | |
Структура (см. HLA-B ) | ||
Символ (ы) | HLA-B | |
EBI-HLA | В * 4601 | |
Locus | чр.6 6п21.31 |
HLA-B46 (B46) является HLA - B серотипа . Серотип идентифицирует генные продукты аллеля HLA-B * 4601. [1] B * 4601 возник в результате редкой интерлокусной конверсии гена между B62 , вероятно, B * 1501, и аллелем HLA-C . [2] B * 4601 является наиболее распространенным аллелем HLA-B, который не имеет происхождения в Африке, и, по оценкам, 400 миллионов человек в Восточной Азии являются носителями аллеля B46. При обнаружении B * 4601 разделяется только с 2 аллелями HLA-Cw , ограниченным количеством HLA-A и HLA-DRB1.аллели, предполагающие, что аллель недавно расширился из группы ограниченного размера в Юго-Восточной Азии. Чрезвычайно низкие частоты за пределами Восточной Азии являются показателями недавнего распространения B46 из недавно небольшой популяции. Распределение частот предполагает, что предковая популяция B46 проживала в юго-восточной части Китая или, возможно, в Бирме (Мьянма или Лаос, не проверено). B46 в Азии коррелирует с выращиванием влажного риса . Исключения примечательны: он был обнаружен в нивхах на северо-востоке острова Сакалин, у айнов и родственной нивхам (генетически) популяции тлинглетов на Аляске на незначительных уровнях.
Серотип
В * 46 | B46 | Другой | Образец |
аллель | % | % | размер (N) |
4601 | 59 | 29 | 1487 |
Серотипирование для B * 4601 плохое, и предпочтительно использовать SSP- PCR . B * 46: 01 - один из четырех аллелей B, который не реагирует ни с Bw4, ни с Bw6. Остальные - B * 18: 06 , B * 55: 03 и B * 73: 01 . [4]
B * 4601 Частоты аллелей
частота | ||
исх. | Население | (%) |
[5] | Буй ( Китай ) | 21,6 |
[5] | Мяо (Китай) | 18,4 |
[6] | Хан (2) ( Юньнань , Китай ) | 17,9 |
[6] | Тайский (в Сингапуре) | 17,2 |
[6] | Южный китайский (на Тайване) | 17,2 |
[6] | Китайский (в Гонконге ) | 16,3 |
[6] | Хакка (2) (Тайвань) | 15,6 |
[6] | Гуанчжоу (Китай) | 15.5 |
[6] | Северо-восточный Таиланд | 15.1 |
[6] | Миннан (в среднем 1 и 2) (Тайвань) | 15.0 |
[6] | Средне-китайский (на Тайване) | 15.0 |
[6] | Хакка (Тайвань) | 13,6 |
[6] | Ухань ( Китай ) | 13,5 |
[6] | Маонан ( Гуанси , Китай) | 13,4 |
[6] | Китайский (в Сингапуре) | 13,4 |
[5] | вьетнамский | 13,2 |
[6] | Южный Хань (Китай) | 11,5 |
[6] | Шанхай, Китай) | 11.2 |
[6] | Мэйчжоу Хан (Гуандун, Китай) | 10.0 |
[6] | Шицзячжуан Тяньцзянь Хан (Пекин) | 9,6 |
[6] | Гуанчжоу Хан (Китай) | 9,4 |
[6] | Таиланд | 9.2 |
[6] | Ну ( Юньнань , Китай) | 9.0 |
[6] | Северный китайский (на Тайване) | 8,6 |
[6] | Пазех (Тайвань) | 8,2 |
[6] | Айти ( Япония ) | 7,6 |
[6] | Лису (Юньнань, Китай) | 7.2 |
[6] | Пекин, Китай) | 6,8 |
[6] | Наси (Юньнань, Китай) | 6.1 |
[6] | Хуэй ( Цинхай , Китай) | 5.9 |
[6] | Северная Хань (Китай) | 5,7 |
[6] | Япония (3) | 5.0 |
[6] | Хиого (Япония) | 4,7 |
[6] | Южная Корея (3) | 4.4 |
[6] | Мужчина (Харбин, Китай) | 4.1 |
[6] | Сирая (Тайвань) | 3.9 |
[6] | Центральная Япония | 3,6 |
[6] | Округ Линьцю ( Шаньдун , Китай) | 3.3 |
[6] | Тиморцы | 2,6 |
[6] | Внутренняя Монголия (Китай) | 2.0 |
[6] | Яванский (в Сингапуре) | 2.0 |
[6] | Оолд (Монголия) | 1.9 |
[6] | Нивхи (Сахалин I, Россия) остров | 1.9 |
[6] | Тао (Тайвань) | 1,7 |
[6] | Риау малайский (в Сингапуре) | 1.5 |
[6] | Тува (2) (Россия) | 1.4 |
[6] | Тибетский (Китай) | 1.3 |
[6] | Халх ( Улан-Батор , Монголия ) | 1.2 |
[6] | Айну ( Хоккайдо , Япония) | 1.0 |
[6] | Окинава (на Гавайях, США) | 1.0 |
[6] | Коренное население (Тайвань) | 0,9 |
[6] | Халха (Монголия) | 0,5 |
[6] | Брахуи (Пакистан) | 0,5 |
A2-Cw11 (1) -B46
Этот гаплотип уникален в нескольких отношениях, во-первых, и, что наиболее важно, серотип B46 не из Африки, это отличает его от всех других известных серотипов B. Это результат рекомбинации между B62 (B * 1501) и аллелем HLA-C в Азии. Это событие произошло недавно, так как есть только один основной аллель, а второстепенные аллели находятся на частотах следов. Между этим гаплотипом, аллелями, несущими A24 и A11, произошла некоторая рекомбинация, вероятно, в местной (или племенной популяции). B46 встречается везде, где бывают азиатские народы, занимающиеся выращиванием влажного риса, и редко встречается у несельскохозяйственных коренных народов. Единственное исключение - это Нинхвет Сибири и Восточный тлинглет на Аляске. Этот вклад B46, по-видимому, был недавним. Из-за количества людей, представленных в группах выборки, и его относительной высокой частоты в этой группе, A2-B46 является одним из наиболее частых, если не самым частым гаплотипом AB в мире, даже при том, что он отсутствует в коренном населении. большинства народов мира.
частота | Ранг в | |||
исх. | Население | (%) | Поп. | |
[5] | Буй | 16,6 | 1 | 1 |
[5] | Мяо | 13,6 | 1 | |
[5] | Сингапур (китайский) | 11,4 | 2 | |
[7] | Хаошань | 10.1 | 1 | |
[5] | Южный Хань | 7,8 | 2 | |
[5] | Вьетнам | 7,8 | 1 | |
[5] | Тайский | 7.2 | 1 | |
[5] | Тайский китайский | 4.0 | ||
[5] | Японский | 3.3 | 4 | |
[5] | Ли | 3.0 | ||
[5] | Корея | 2,8 | ||
[5] | Уйгар | 2,7 | ||
[5] | Маньчжурский | 2,6 | ||
[5] | Внутренний Монг. | 1.9 | ||
[5] | Северная Хань | 1,8 | ||
1 самая высокая частота. AB в Азии. |
Этот гаплотип уникален в нескольких отношениях, во-первых, и, что наиболее важно, серотип B46 не из Африки, это отличает его от всех других основных серотипов B, кроме B * 48 . Это результат рекомбинации между B62 ( B * 1501 ) и аллелем HLA-C в Азии. Это событие произошло недавно, так как есть только один основной аллель, а второстепенные аллели находятся на частотах следов. Между этим гаплотипом, аллелями, несущими A24 и A11, произошла некоторая рекомбинация, вероятно, в местной (или племенной популяции). B46 встречается везде, где бывают азиатские народы, занимающиеся выращиванием влажного риса, и редко встречается у несельскохозяйственных коренных народов. Единственное исключение - это Нинхвет в Сибири и восточный тлинглет на Аляске. Этот вклад B46, по-видимому, был недавним. Из-за количества людей, представленных в группах выборки, и его относительной высокой частоты в этой группе, A2-B46 является одним из наиболее частых, если не самым частым гаплотипом AB в мире, даже при том, что он отсутствует у коренного населения. большинства народов мира.
Наиболее распространенный гаплотип и, вероятно, наследственный гаплотип, учитывая его распространение от Нинхивета до Индонезии:
A * 0207 : C * 0102 : B * 4601 : DRB1 * 0901 : DQA1 * 0302 : DQB1 * 0303
Другой гаплотип, более распространенный в Корее и Японии, - это
A * 0207 : C * 0102 : B * 4601 : DRB1 * 0803 : DQA1 * 0103 : DQB1 * 0601
B46, или тесно связанный аллель, возможно, находился в процессе положительного отбора у рисоводов в Азии.
Рекомендации
- ^ Марш, SG; Альберт, ED; Бодмер, ВФ; Bontrop, RE; Dupont, B .; Эрлих, HA; Fernández-Viña, M .; Geraghty, DE; Holdsworth, R .; Херли, СК; Lau, M .; Ли, кВт; Мах, Б .; Maiers, M .; Mayr, WR; Мюллер, CR; Parham, P .; Петерсдорф, EW; Sasazuki, T .; Strominger, JL; Svejgaard, A .; Терасаки, ИП; Tiercy, JM; Троусдейл, Дж. (2010). «Номенклатура факторов системы HLA, 2010» . Тканевые антигены . 75 (4): 291–455. DOI : 10.1111 / j.1399-0039.2010.01466.x . PMC 2848993 . PMID 20356336 .
- ^ Hildebrand WH, Domena JD, Shen SY и др. (1994). «HLA-B15: широко распространенное и разнообразное семейство аллелей HLA-B». Тканевые антигены . 43 (4): 209–18. DOI : 10.1111 / j.1399-0039.1994.tb02327.x . PMID 7521976 .
- ^ Форма запроса аллеля IMGT / HLA - Европейский институт биоинформатики
- ^ Voorter, CE; ван дер Влис, S; Кик, М; ван ден Берг-Лунен, EM (октябрь 2000 г.). «Неожиданные паттерны реактивности Bw4 и Bw6 в новых аллелях». Тканевые антигены . 56 (4): 363–70. DOI : 10.1034 / j.1399-0039.2000.560409.x . PMID 11098937 .
- ^ Б с д е е г ч я J к л м п о р д Сасадзуки, Такехико; Цудзи, Кимиёси; Айзава, Мики (1992). HLA 1991: Труды одиннадцатого Международного гистосовместимости семинара и конференции, состоявшейся в Иокогаме, Япония, 6-13 ноября 1991 . Оксфорд [Оксфордшир]: Издательство Оксфордского университета. ISBN 978-0-19-262390-4.
- ^ a b c d e f g h i j k l m n o p q r s t u v w x y z aa ab ac ad ae af ag ah ai aj ak al am an ao ap aq ar as at au av aw топор Миддлтон Д., Менчака Л., Руд Н., Комеровски Р. (2003). «Новая база данных частот аллелей: http://www.allelefrequencies.net ». Тканевые антигены . 61 (5): 403–7. DOI : 10.1034 / j.1399-0039.2003.00062.x . PMID 12753660 . Внешняя ссылка в
|title=
( помощь ) - ^ Ху С.П., Луан Дж.А., Ли Б. и др. (2007). «Генетическая связь между Chaoshan и другими китайскими ханьскими популяциями: данные по распределению частот аллелей HLA-A и HLA-B». Являюсь. J. Phys. Антрополь . 132 (1): 140–50. DOI : 10.1002 / ajpa.20460 . PMID 16883565 .