Из Википедии, свободной энциклопедии
  (Перенаправлено с HNF4A )
Перейти к навигации Перейти к поиску
См. Также: MODY 1
HNF4A
Белок HNF4A PDB 1m7w.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1PZL , 3CBB , 3FS1 , 4B7W , 4IQR

Идентификаторы
ПсевдонимыHNF4A , HNF4, HNF4a7, HNF4a8, HNF4a9, HNF4alpha, MODY, MODY1, NR2A1, NR2A21, TCF, TCF14, FRTS4, гепатоцитов ядерного фактора 4 альфа
Внешние идентификаторыOMIM : 600281 MGI : 109128 HomoloGene : 395 GeneCards : HNF4A
Расположение гена ( человек )
Хромосома 20 (человек)
Chr.Хромосома 20 (человека) [1]
Хромосома 20 (человек)
Геномное расположение HNF4A
Геномное расположение HNF4A
Группа20q13.12Начинать44 355 700 п.н. [1]
Конец44 434 596 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 2 (мышь)
Chr.Хромосома 2 (мышь) [2]
Хромосома 2 (мышь)
Геномное расположение HNF4A
Геномное расположение HNF4A
Группа2 H3 | 2 84,32 смНачинать163 506 808 п.н. [2]
Конец163 572 910 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК




Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• Связывание ДНК • Связывание ДНК, специфичное
для последовательности
• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции
• GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 ДНК-связывающий активатор транскрипции , активность РНК - полимераза II-специфического
• ион цинка связывание
• ион металла связывание
• связывания РНК - полимераза II активирующего фактора транскрипция
• стероид активности в отношении рецептора гормона
• GO: 0038050, GO: 0004886, GO: 0038051 активности ядерного рецептора
• Связывание с белком GO: 0001948
• активность фактора транскрипции, связывание с дистальной энхансерной последовательностью РНК-полимеразы II.
• связывание рецептора
• жирных кислот связывания
• белок гомодимеризации активность
• ГО: 0000980 РНК - полимеразы II цис-регуляторной области ДНК последовательность-специфическое связывание
• GO: 0001200, ГО: 0001133, ГО: 0001201 ДНК-связывающий фактор активности транскрипции РНК - полимеразы II - специфический
Сотовый компонент• ядро клетки
• цитоплазма
• нуклеоплазма
Биологический процесс• гомеостаз триглицеридов
• метаболический процесс орнитина
• гомеостаз фосфолипидов
• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• передача сигнала белка SMAD
• гомеостаз глюкозы
• регуляция секреции инсулина
• липидный метаболизм
• регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• передача сигнала, участвующая в регуляции экспрессия гена
• дифференциация по полу
• свертывание крови
• ответ на глюкозу
• транскрипция, шаблон ДНК
• позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• регуляция липидного метаболического процесса
• внутриклеточный сигнальный путь рецептора
• регуляция сигнального пути рецептора гормона роста
• негативная регуляция роста клеток
• липидный гомеостаз
• ксенобиотический метаболический процесс
• инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• регуляция гаструляции
• сигнальный путь, опосредованный стероидными гормонами
• позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• негативная регуляция пролиферации клеток
• гомеостаз холестерина
• развитие клеток поджелудочной железы типа B
• дифференцировка гепатоцитов
• регуляция циркадного ритма
• негативная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• ритмический процесс
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

3172

15378

Ансамбль

ENSG00000101076

ENSMUSG00000017950

UniProt

P41235

P49698

RefSeq (мРНК)
NM_000457
NM_001030003
NM_001030004
NM_001258355
NM_001287182

NM_001287183
NM_001287184
NM_175914
NM_178849
NM_178850

NM_008261
NM_001312906
NM_001312907

RefSeq (белок)
NP_000448
NP_001025174
NP_001025175
NP_001245284
NP_001274111

NP_001274112
NP_001274113
NP_787110
NP_849180
NP_849181

NP_001299835
NP_001299836
NP_032287

Расположение (UCSC)Chr 20: 44.36 - 44.43 МбChr 2: 163,51 - 163,57 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Ядерный фактор гепатоцитов 4 альфа ( HNF4A ), также известный как NR2A1 (подсемейство ядерных рецепторов 2, группа A, член 1), представляет собой ядерный рецептор, который у человека кодируется геном HNF4A . [5] [6]

Функция [ править ]

HNF-4α представляет собой фактор ядерной транскрипции, который связывает ДНК как гомодимер. Кодируемый белок контролирует экспрессию нескольких генов, включая ядерный фактор гепатоцитов 1 альфа , фактор транскрипции, который регулирует экспрессию нескольких генов печени. Этот ген играет роль в развитии печени , почек и кишечника . Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к множеству вариантов транскриптов. [7]

HNF4A необходим для PXR и CAR- опосредованной транскрипционной активации CYP3A4 . [8] Генетические мутации в HNF4A ген может влиять на активность ниже по течению белков HNF4α, таких как CYP2D6, в пробирке и в естественных условиях . [9] [10]

Алкалоид берберин усиливает экспрессию HNF4A. [11]

Этот ген также играет ключевую роль в экспрессии и синтезе SHBG , важного гликопротеина, вырабатываемого главным образом в печени , который помимо снижения инсулинорезистентности также служит для снижения уровня свободного эстрогена, а также для продления периода полужизни Тестостерон . [ необходима цитата ]

Функцию гена HNF4A можно эффективно изучить с помощью нокдауна siRNA на основе независимой проверки. [12]

Клиническое значение [ править ]

Мутации в гене HNF4A связаны с формой диабета, называемой диабетом зрелого возраста у молодых (MODY). [13]

Повышенное усиление ядерного фактора гепатоцитов 4 альфа наблюдается при колоректальном раке . [14]

Это также связано с появлением фенотипов синдрома Фанкони, который возникает из-за миссенс-мутации гена. [15]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что ядерный фактор гепатоцитов 4 альфа взаимодействует с:

  • Бета-катенин , [16]
  • CREB-связывающий белок , [17] [18]
  • MED1 , [19] [20]
  • MED14 , [19] [20]
  • Малый гетеродимерный партнер [21]
  • Рецептор яичек 4 , [22]

См. Также [ править ]

  • Ядерный фактор гепатоцитов 4
  • Ядерные факторы гепатоцитов

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000101076 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000017950 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Шартье FL, Боссю JP, Laudet В, Fruchart JC, Лайне В (сентябрь 1994). «Клонирование и секвенирование кДНК, кодирующих ядерный фактор 4 гепатоцитов человека, указывают на присутствие двух изоформ в печени человека». Джин . 147 (2): 269–72. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90079-5 . PMID 7926813 . 
  6. ^ Argyrokastritis A, Kamakari S, M Kapsetaki, Kritis A, Talianidis I, Moschonas NK (февраль 1997). «Ген ядерного фактора-4 гепатоцитов человека (hHNF-4) картируется в 20q12-q13.1 между PLCG1 и D20S17». Генетика человека . 99 (2): 233–6. DOI : 10.1007 / s004390050345 . PMID 9048927 . S2CID 10943721 .  
  7. ^ «Энтрез Ген: ядерный фактор гепатоцитов HNF4A 4, альфа» .
  8. ^ Тирона RG, Lee W, Лик BF, Lan LB, Cline CB, Ламба V, Парвиз F, Дункан SA, Inoue Y, Гонсалес FJ, Шюц EG, Ким РБ (февраль 2003). «Орфанный ядерный рецептор HNF4alpha определяет PXR- и CAR-опосредованную ксенобиотическую индукцию CYP3A4». Природная медицина . 9 (2): 220–4. DOI : 10.1038 / nm815 . PMID 12514743 . S2CID 8925996 .  
  9. ↑ Lee SS, Cha EY, Jung HJ, Shon JH, Kim EY, Yeo CW, Shin JG (2008). «Генетический полиморфизм ядерного фактора гепатоцитов-4альфа влияет на активность человеческого цитохрома P450 2D6». Гепатология . 48 (2): 635–45. DOI : 10.1002 / hep.22396 . PMID 18666237 . S2CID 205866107 .  
  10. ↑ Jiang F, Yeo CW, Lee SS, Oh MK, Ghim JL, Shon JH, Kim HS, Kim EY, Kim DH, Shin JG (2013). «Влияние генетического полиморфизма G60D HNF4α на фармакокинетику толтеродина субстрата CYP2D6 у здоровых корейцев». Фармакогенетика и геномика . 23 (3): 175–9. DOI : 10.1097 / FPC.0b013e32835de25e . PMID 23292115 . S2CID 19230792 .  
  11. ↑ Wang ZQ, Lu FE, Ленг SH, Fang XS, Chen G, Wang ZS, Dong LP, Yan ZQ (октябрь 2008 г.). «Облегчение воздействия берберина на островки поджелудочной железы крыс посредством модуляции экспрессии ядерного фактора 4 альфа в печени и активности глюкокиназы» . Всемирный журнал гастроэнтерологии . 14 (39): 6004–11. DOI : 10,3748 / wjg.14.6004 . PMC 2760199 . PMID 18932278 .  
  12. ^ Мункачи, Дьёнджи; Штупински, Жофия; Герман, Петер; Бан, Бенце; Пензвальто, Жофия; Сарвас, Нора; Дьёрфи, Балаж (01.01.2016). «Подтверждение эффективности подавления РНКи с использованием данных массива генов показывает 18,5% отказов в 429 независимых экспериментах» . Молекулярная терапия - нуклеиновые кислоты . 5 (9): e366. DOI : 10.1038 / mtna.2016.66 . ISSN 2162-2531 . PMC 5056990 . PMID 27673562 .   
  13. Перейти ↑ Yamagata K (2014). «Роль HNF1α и HNF4α в β-клетках поджелудочной железы: уроки моногенной формы диабета (MODY)». Витамины и гормоны . 95 : 407–23. DOI : 10.1016 / B978-0-12-800174-5.00016-8 . PMID 24559927 . 
  14. ^ Чжан Б, Ван Дж, Ван Х, Чжу Дж, Лю Цюй, Ши З и др. (2014). «Протеогеномная характеристика рака прямой и толстой кишки человека» . Природа . 513 (7518): 382–7. Bibcode : 2014Natur.513..382. . DOI : 10,1038 / природа13438 . PMC 4249766 . PMID 25043054 .  
  15. ^ Kashoor I, Batlle D (сентябрь 2019). «Проксимальный почечный канальцевый ацидоз с синдромом Фанкони и без него» . Исследование почек и клиническая практика . 38 (3): 267–281. DOI : 10,23876 / j.krcp.19.056 . PMC 6727890 . PMID 31474092 .  
  16. ↑ Mulholland DJ, Read JT, Rennie PS, Cox ME, Nelson CC (август 2003). «Функциональная локализация и конкуренция между рецептором андрогена и Т-клеточным фактором за ядерный бета-катенин: средство для ингибирования оси передачи сигналов Tcf» . Онкоген . 22 (36): 5602–13. DOI : 10.1038 / sj.onc.1206802 . PMID 12944908 . 
  17. ↑ Yoshida E, Aratani S, Itou H, Miyagishi M, Takiguchi M, Osumu T, Murakami K, Fukamizu A (декабрь 1997 г.). «Функциональная ассоциация между CBP и HNF4 в трансактивации». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 241 (3): 664–9. DOI : 10.1006 / bbrc.1997.7871 . PMID 9434765 . 
  18. ^ Dell H, Hadzopoulou-Cladaras M (март 1999). «CREB-связывающий белок является коактиватором транскрипции ядерного фактора-4 гепатоцитов и усиливает экспрессию гена аполипопротеина» . Журнал биологической химии . 274 (13): 9013–21. DOI : 10.1074 / jbc.274.13.9013 . PMID 10085149 . 
  19. ^ a b Маеда Y, Рашез К., Хавел Л., Биус CV, Freedman LP, Sladek FM (июль 2002 г.). «Полиамины модулируют взаимодействие между ядерными рецепторами и белком 205, взаимодействующим с рецептором витамина D» . Молекулярная эндокринология . 16 (7): 1502–10. DOI : 10.1210 / mend.16.7.0883 . PMID 12089346 . 
  20. ^ a b Малик S, Валлберг AE, Канг YK, Roeder RG (август 2002 г.). «TRAP / SMCC / зависимая от медиатора активация транскрипции из ДНК и хроматиновых матриц с помощью орфанного ядерного рецептора ядерного фактора 4 гепатоцитов» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (15): 5626–37. DOI : 10.1128 / MCB.22.15.5626-5637.2002 . PMC 133960 . PMID 12101254 .  
  21. ^ Ли Ю.К., Dell H, Dowhan DH, Hadzopoulou-Cladaras M, Moore DD (январь 2000). «Орфанный ядерный рецептор SHP ингибирует ядерный фактор 4 гепатоцитов и трансактивацию рецептора ретиноида X: два механизма репрессии» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (1): 187–95. DOI : 10.1128 / MCB.20.1.187-195.2000 . PMC 85074 . PMID 10594021 .  
  22. ↑ Lin WJ, Li J, Lee YF, Yeh SD, Altuwaijri S, Ou JH, Chang C (март 2003 г.). «Подавление корового промотора вируса гепатита В ядерным сиротским рецептором TR4» . Журнал биологической химии . 278 (11): 9353–60. DOI : 10.1074 / jbc.M205944200 . PMID 12522137 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Winter WE, Nakamura M, House DV (декабрь 1999 г.). «Моногенный сахарный диабет в молодости. Синдромы MODY». Клиники эндокринологии и обмена веществ Северной Америки . 28 (4): 765–85. DOI : 10.1016 / S0889-8529 (05) 70101-8 . PMID  10609119 .
  • Заннис В.И., Кан Х.Й., Критис А., Занни Э., Кардассис Д. (март 2001 г.). «Транскрипционная регуляция генов аполипопротеинов человека». Границы биологических наук . 6 : D456-504. DOI : 10.2741 / Zannis . PMID  11229886 .
  • Гупта Р.К., Кестнер К.Х. (ноябрь 2004 г.). «HNF-4alpha: от MODY до диабета 2 типа с поздним началом». Тенденции в молекулярной медицине . 10 (11): 521–4. DOI : 10.1016 / j.molmed.2004.09.004 . PMID  15519277 .
  • Mohlke KL, Boehnke M (апрель 2005 г.). «Роль вариантов HNF4A в риске диабета 2 типа». Текущие отчеты о диабете . 5 (2): 149–56. DOI : 10.1007 / s11892-005-0043-у . PMID  15794920 . S2CID  1661923 .
  • Любовь-Грегори Л., Пермутт, Массачусетс (июль 2007 г.). «Генетические варианты HNF4A: роль в диабете». Текущее мнение о клиническом питании и метаболическом лечении . 10 (4): 397–402. DOI : 10.1097 / MCO.0b013e3281e3888d . PMID  17563455 . S2CID  10318597 .
  • Белл Г.И., Сян К.С., Ньюман М.В., Ву Ш., Райт Л.Г., Фаянс СС, Спилман Р.С., Кокс, штат Нью-Джерси (февраль 1991 г.). «Ген инсулиннезависимого сахарного диабета (диабет зрелого возраста молодого подтипа) связан с полиморфизмом ДНК на хромосоме 20q человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 88 (4): 1484–8. Bibcode : 1991PNAS ... 88.1484B . DOI : 10.1073 / pnas.88.4.1484 . PMC  51043 . PMID  1899928 .
  • Ктистаки Э., Ктистакис Н. Т., Пападогеоргаки Э., Талианидис I (октябрь 1995 г.). «Рекрутирование ядерного фактора 4 гепатоцитов в определенные внутриядерные компартменты зависит от фосфорилирования тирозина, которое влияет на его ДНК-связывающий и трансактивационный потенциал» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (21): 9876–80. Bibcode : 1995PNAS ... 92.9876K . DOI : 10.1073 / pnas.92.21.9876 . PMC  40905 . PMID  7568236 .
  • Ginsburg GS, Ozer J, Karathanasis SK (июль 1995 г.). «Транскрипция гена аполипопротеина AI кишечника регулируется множеством различных элементов ДНК и синергетически активируется орфанным ядерным рецептором, ядерным фактором гепатоцита 4» . Журнал клинических исследований . 96 (1): 528–38. DOI : 10.1172 / JCI118065 . PMC  185227 . PMID  7615825 .
  • Jiang G, Nepomuceno L, Hopkins K, Sladek FM (сентябрь 1995 г.). «Исключительная гомодимеризация орфанного рецептора ядерного фактора 4 гепатоцита определяет новый подкласс ядерных рецепторов» . Молекулярная и клеточная биология . 15 (9): 5131–43. DOI : 10.1128 / mcb.15.9.5131 . PMC  230760 . PMID  7651430 .
  • Chartier FL, Bossu JP, Laudet V, Fruchart JC, Laine B (сентябрь 1994 г.). «Клонирование и секвенирование кДНК, кодирующих ядерный фактор 4 гепатоцитов человека, указывают на присутствие двух изоформ в печени человека». Джин . 147 (2): 269–72. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90079-5 . PMID  7926813 .
  • Дрюс Т., Сенкель С., Холева Б., Риффель Г.У. (март 1996 г.). «Изоформы ядерного фактора 4 гепатоцитов человека кодируются отдельными и дифференциально экспрессируемыми генами» . Молекулярная и клеточная биология . 16 (3): 925–31. DOI : 10.1128 / mcb.16.3.925 . PMC  231074 . PMID  8622695 .
  • Ямагата К., Фурута Х., Ода Н., Кайсаки П.Дж., Мензель С., Кокс, штат Нью-Джерси, Фаянс С.С., Синьорини С., Стоффель М., Белл Г.И. (декабрь 1996 г.). «Мутации в гене ядерного фактора гепатоцитов-4альфа при диабете зрелого возраста у молодых (MODY1)». Природа . 384 (6608): 458–60. Bibcode : 1996Natur.384..458Y . DOI : 10.1038 / 384458a0 . ЛВП : 2027,42 / 62605 . PMID  8945471 . S2CID  4253951 .
  • Kritis AA, Argyrokastritis A, Moschonas NK, Power S, Katrakili N, Zannis VI, Cereghini S, Talianidis I (сентябрь 1996 г.). «Выделение и характеристика третьей изоформы ядерного фактора 4 гепатоцитов человека». Джин . 173 (2): 275–80. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (96) 00183-7 . PMID  8964514 .
  • Argyrokastritis A, Kamakari S, Kapsetaki M, Kritis A, Talianidis I, Moschonas NK (февраль 1997 г.). «Ген ядерного фактора-4 гепатоцитов человека (hHNF-4) картируется в 20q12-q13.1 между PLCG1 и D20S17». Генетика человека . 99 (2): 233–6. DOI : 10.1007 / s004390050345 . PMID  9048927 . S2CID  10943721 .
  • Тено С., Анрике С., Рошфор Н., Кавай В. (май 1997 г.). «Дифференциальное взаимодействие ядерных рецепторов с предполагаемым коактиватором транскрипции человека hTIF1» . Журнал биологической химии . 272 (18): 12062–8. DOI : 10.1074 / jbc.272.18.12062 . PMID  9115274 .
  • Bulman MP, Dronsfield MJ, Frayling T., Appleton M, Bain SC, Ellard S, Hattersley AT (июль 1997 г.). «Миссенс-мутация в гене альфа ядерного фактора 4 гепатоцитов в британской родословной с диабетом зрелого возраста у молодых» . Диабетология . 40 (7): 859–62. DOI : 10.1007 / s001250050760 . PMID  9243109 .
  • Мёллер А.М., Урхаммер С.А., Далгаард Л.Т., Ренеланд Р., Берглунд Л., Хансен Т., Клаузен Дж. О., Лителл Г., Педерсен О. (август 1997 г.). «Исследования генетической изменчивости кодирующей области ядерного фактора гепатоцитов-4альфа у кавказцев с наступлением зрелости NIDDM» . Диабетология . 40 (8): 980–3. DOI : 10.1007 / s001250050778 . PMID  9267996 .
  • Линднер Т., Граньоли С., Фурута Х., Кокберн Б.Н., Петцольд С., Рицш Х., Вайс Ю., Шульце Дж., Белл Г.И. (сентябрь 1997 г.). «Функция печени в семье с нонсенс-мутацией (R154X) в гене ядерного фактора гепатоцитов-4альфа / MODY1» . Журнал клинических исследований . 100 (6): 1400–5. DOI : 10.1172 / JCI119660 . PMC  508318 . PMID  9294105 .
  • Фурута Х., Ивасаки Н., Ода Н., Хинокио ​​Ю., Хорикава Ю., Ямагата К., Яно Н., Сугахиро Дж., Огата М., Огавара Х., Омори И., Ивамото Ю., Белл Г. И. (октябрь 1997 г.). «Организация и частичная последовательность гена ядерного фактора гепатоцитов-4 альфа / MODY1 и идентификация миссенс-мутации, R127W, в японской семье с MODY». Диабет . 46 (10): 1652–7. DOI : 10.2337 / diabetes.46.10.1652 . PMID  9313765 .
  • Стоффель М., Дункан С.А. (ноябрь 1997 г.). «Сахарный диабет молодых людей (MODY1), транскрипционный фактор HNF4alpha регулирует экспрессию генов, необходимых для транспорта и метаболизма глюкозы» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (24): 13209–14. Bibcode : 1997PNAS ... 9413209S . DOI : 10.1073 / pnas.94.24.13209 . PMC  24288 . PMID  9371825 .

Внешние ссылки [ править ]

  • FactorBook HNF4A

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .