Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено из гаплогруппы O-P31 (Y-ДНК) )
Перейти к навигации Перейти к поиску
Гаплогруппа O-M268
Возможное время происхождения34 100 или 29 200 лн [1]

33 103 [95% ДИ 24 460 <-> 40 854] лн [2]

30 100 [95% ДИ 27 800 <-> 32 400] лн [3]
Возраст коалесценции28 500 [95% ДИ 26 200 <-> 30 900] лн [3]
Возможное место происхожденияЮго-Восточная Азия или Восточная Азия [3]
ПредокO1 (O-F265)
ПотомкиO1b1 ; O1b2 (P49 / M176)
Определение мутацийP31, M268, L690 / F167, F256 / M1341, Y9038 / FGC19644, L463 / F330, M1461, F138, Y9317, FGC55566, F292 / M1363, CTS4164, CTS6713 / M1396, CTS5785 / M1314, F435
Самые высокие частотыНароды , говорящие на австроазиатском языке , тайские народы , хлай , балийцы , яванцы , японцы , рюкюанцы , корейцы , маньчжуры , малагасийцы

В генетике человека гаплогруппа O-M268 , также известная как O1b (ранее гаплогруппа O2), является гаплогруппой ДНК Y-хромосомы. Гаплогруппа O-M268 является первичным субкладом гаплогруппы O-F265 , которая сама является первичной дочерней ветвью гаплогруппы O-M175 .

Происхождение [ править ]

В статье, опубликованной в 2011 году группой китайских исследователей, связанных с Фуданьским университетом , было высказано предположение, что Китай является источником распространения гаплогруппы O-P31 (в ней она называется гаплогруппой O2-M268). [4]

Распространение [ править ]

Гаплогруппа O-P31 отличается особенностями своего географического распространения. Как и все клады гаплогруппы O-M175, гаплогруппа O-P31 встречается только среди мужчин современного населения Восточной Евразии . Однако гаплогруппа O-P31 обычно встречается с высокой частотой только среди определенных групп населения, таких как австроазиатские народы Индии, Бангладеш и Юго-Восточной Азии, никобарцы с Никобарских островов в Индийском океане, корейцы и японцы .

Помимо широко распространенного и неоднородного распространения, гаплогруппа O1b-P31 также примечательна тем, что ее можно разделить на три основных субклада, которые демонстрируют почти полностью разобщенное распределение. Один из этих субкладов, O1B1-K18, можно в основном разделить на два субклада O1b1a1-PK4 (ранее O2a) и O1b1a2-PAGE59 (ранее O2 * (xM95, M176)). O1b1a1-PK4 встречается у некоторых ( в основном племенным) населения Южной и Юго - Восточной Азии, а также среди японцев в Японии , в балийском из Индонезии и Южного Китая. O1b1a2-PAGE59 относительно редок и в основном распространен в Восточной Азии, особенно у китайцев хань. Другой субклад, гаплогруппа O1b2-M176 (ранее O2b), встречается почти исключительно средиЯпонцы , корейцы и некоторые маньчжуры .

Филогенетика [ править ]

Филогенетическая история [ править ]

Основная статья: Таблица преобразования для гаплогрупп Y-хромосомы

До 2002 г. в академической литературе было по крайней мере семь систем именования Филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместный документ, в котором было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремясь быть, прежде всего, своевременным. В приведенной ниже таблице собраны все эти работы на основе знакового Дерева YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему ранее опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

YCC 2002/2008 (стенография)(α)(β)(γ)(δ)(е)(ζ)(η)YCC 2002 (от руки)YCC 2005 (от руки)YCC 2008 (от руки)YCC 2010r (от руки)ISOGG 2006ISOGG 2007ISOGG 2008ISOGG 2009ISOGG 2010ISOGG 2011ISOGG 2012
О-М17526 годVII1U28 годEu16H9яО *ОООООООООО
O-M11926 годVII1U32Eu16H9ЧАСO1 *O1aO1aO1aO1aO1aO1aO1aO1aO1aO1a
O-M10126 годVII1U32Eu16H9ЧАСO1aO1a1O1a1aO1a1aO1a1O1a1O1a1aO1a1aO1a1aO1a1aO1a1a
O-M5026 годVII1U32Eu16H10ЧАСO1bO1a2O1a2O1a2O1a2O1a2O1a2O1a2O1a2O1a2O1a2
O-P3126 годVII1U33Eu16H5яO2 *O2O2O2O2O2O2O2O2O2O2
О-М9526 годVII1U34Eu16H11граммO2a *O2aO2aO2aO2aO2aO2aO2aO2aO2a1O2a1
O-M8826 годVII1U34Eu16H12граммO2a1O2a1O2a1O2a1O2a1O2a1O2a1O2a1O2a1O2a1aO2a1a
O-SRY46520VII1U35 годEu16H5яO2b *O2bO2bO2bO2bO2bO2bO2bO2bO2bO2b
О-47з5VII1U26 годEu16H5яO2b1O2b1aO2b1O2b1O2b1aO2b1aO2b1O2b1O2b1O2b1O2b1
О-М12226 годVII1U29Eu16H6LO3 *O3O3O3O3O3O3O3O3O3O3
O-M12126 годVII1U29Eu16H6LO3aO3aO3a1O3a1O3a1O3a1O3a1O3a1O3a1O3a1aO3a1a
O-M16426 годVII1U29Eu16H6LO3bO3bO3a2O3a2O3a2O3a2O3a2O3a2O3a2O3a1bO3a1b
O-M15913VII1U31 годEu16H6LO3cO3cO3a3aO3a3aO3a3O3a3O3a3aO3a3aO3a3aO3a3aO3a3a
O-M726 годVII1U29Eu16H7LO3d *O3cO3a3bO3a3bO3a4O3a4O3a3bO3a3bO3a3bO3a2bO3a2b
О-М11326 годVII1U29Eu16H7LO3d1O3c1O3a3b1O3a3b1-O3a4aO3a3b1O3a3b1O3a3b1O3a2b1O3a2b1
О-М13426 годVII1U30Eu16H8LO3e *O3dO3a3cO3a3cO3a5O3a5O3a3cO3a3cO3a3cO3a2c1O3a2c1
O-M11726 годVII1U30Eu16H8LO3e1 *O3d1O3a3c1O3a3c1O3a5aO3a5aO3a3c1O3a3c1O3a3c1O3a2c1aO3a2c1a
O-M16226 годVII1U30Eu16H8LO3e1aO3d1aO3a3c1aO3a3c1aO3a5a1O3a5a1O3a3c1aO3a3c1aO3a3c1aO3a2c1a1O3a2c1a1

Публикации оригинальных исследований [ править ]

Следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями были представлены в создании Дерева YCC.

  • α Джоблинг и Тайлер-Смит 2000 и Каладжиева 2001
  • β Андерхилл 2000
  • γ Hammer 2001
  • δ Карафет 2001
  • ε Семино 2000
  • ζ вс 1999
  • η Капелли 2001

Филогенетические деревья [ править ]

Это филогенетическое дерево субкладов гаплогруппы O основано на дереве YCC 2008 ( Karafet 2008 ) и последующих опубликованных исследованиях.

  • О-П31 (П31, М268)
    • O-K18
      • O-CTS10887 / PAGE59 В основном встречается в китайском языке хань и иногда встречается в китайском (дай), маньчжурском, Таиланде ( Фуан , тай-юань , тайский ), Вьетнаме, на Филиппинах, в Западном Калимантане , Катаре , Хазаре , Японии и Корее
      • О-ПК4
        • O-F838 Найдено в ханьских китайцах [4] [5] и в образце из средневекового Южного Казахстана, приписываемого туркам ; [6] , вероятно , также присутствует в Таиланде ( Kaleun , Phuan , тайский ), [7] Ханой , [5] Амбон , [5] Иравади область , [8] и Ньягронг [9]
        • О-М95 (М95)
          • O-CTS350
            • O-CTS350 * Найдено в Японии
            • O-CTS10007, найденный на ханьском китайском языке в провинции Хунань
          • O-M1310
            • O-F1252
              • O-SK1630 / F5504 Китай ( Шэньси ), [3] Россия ( Рязанская область ) [3]
                • O-SK1636
              • O-F2924
                • O-CTS5854 Найдено в Китае (Хан, Дай ), Лаосе, Таиланде, Японии и на Филиппинах.
                • O-M88 (M88, M111) Найдено во Вьетнаме, Лаосе, Таиланде, Камбодже, Мьянме, Китае (Дай, Буй, Чжуан, Ли, Шуй, Ше, Мяо, Яо, Деанг, Буланг, Цян, Туцзя, Лису, Ачанг, Ну, Лаху, Цзинуо, Хани, Йи, Бай, Хан), Тайвань (Хан, Бунун, Ями), Ява, Борнео, Малайзия, Филиппины
            • O-F789 / M1283 Найдено в Китае, Вьетнаме, Камбодже, Сингапуре (малайский), [2] Индонезии, Лаосе, Таиланде, Мьянме, Бутане, [10] Бангладеш и Индии.
    • O-P49 (SRY465, P49, 022454) Япония, [11] Южная Корея, [11] Китай, [11] Монголия, [11] Вьетнам, [11] Микронезия [11]
      • O-P49 * (xPage92) Япония, Южная Корея
      • O-страница92
        • O-Page90 Япония ( Хиросима ), Цзилинь [3]
        • O-CTS9259
          • O-CTS562 Пекин ( Хан ), [3] Южная Корея , [12] Япония (Фукусима) [3]
          • O-K10 / F1204
            • O-K10 * Япония (Токио [3] )
            • O-CTS10687 Япония, [11] Монголия [11]
            • O-K7 / CTS11723 / 47z Обнаруживается примерно у 24% японских мужчин, реже в Корее и Китае.
              • O-BY130355 Сычуань [3]
              • O-K2 / CTS713
                • O-K2 * Япония (Токио, [3] Аомори [3] ), Южная Корея [3]
                • O-CTS203 Япония (Токио, [3] Мияги [3] ), Хэнань [3]
                • O-K14
                  • O-K14 * Шаньси [3]
                  • O-M776 Япония (Токио [3] )
                  • O-Z24594
                    • O-Z24594 * Южная Корея [3]
                    • O-CTS56 Япония (Токио, [3] Кумамото [3] )
                • O-Y178266 Япония (Токио [3] ), Пекин [3]
                • O-Z24599
                  • O-Z24599 * Япония (Токио, [3] Ямагути [3] )
                  • O-K473 Япония (Токио [3] )
                  • O-Y181118 Южная Корея (Пусан [3] ), Хэбэй [3]
            • O-K4
              • O-K3 / F940 Хунань ( Хан ), Цзянси, Хэнань (Хан)
                • O-F940 * Хунань, [3] Цзянси [3]
                • O-K481 Хунань (Хан) [3]
              • O-L682 Обнаруживается примерно у 19% южнокорейских мужчин [13], реже в Японии и Китае.
                • O-L682 * Шаньси [3]
                • O-K485
                  • O-K485 * Япония (Токио) [3]
                  • O-CTS723
                    • O-CTS723 * Южная Корея [3]
                    • O-A23652
                      • O-A23652 * Японский [3]
                      • O-A23653
                        • O-A23653 * Японский, [3] Южная Корея [3]
                        • O-A23658
                          • O-A23658 * Южная Корея [3]
                          • O-Y165475 Южная Корея [3]
                    • O-Y24057
                      • O-Y24057 * Шаньдун [3]
                      • O-A12448
                        • O-A12448 * Южная Корея (включая Тэгу [3] )
                        • O-PH40 Пекин (Хан), [3] Шаньдун, [3] Южная Корея, [3] Япония [11]
                      • O-MF14220 Южная Корея [3]
                      • O-Y26376 / CTS7620 Япония, [11] Южная Корея [11]
                        • O-MF14346 Южная Корея [3]
                        • O-Y26377
                          • O-Y26377 * Япония (Окаяма), [3] Хэчжэн [3]
                          • O-CTS1175 Япония (Кочи, [3] Токио [3] )

См. Также [ править ]

Генетика [ править ]

  • Генетическая генеалогия
  • Гаплогруппа
  • Гаплотип
  • Гаплогруппа ДНК Y-хромосомы человека
  • Молекулярная филогенетика
  • Парагруппа
  • Субклад
  • Гаплогруппы Y-хромосомы в популяциях мира
  • Гаплогруппы Y-ДНК по этнической группе
  • Гаплогруппы Y-ДНК в популяциях Восточной и Юго-Восточной Азии

Y-DNA O Subclades [ править ]

  • О-47з
  • O-M101
  • О-М113
  • O-M117
  • O-M119
  • O-M121
  • О-М122
  • О-М134
  • O-M159
  • O-M162
  • O-M164
  • О-М175
  • О-М176
  • O-M50
  • O-M7
  • O-M88
  • О-М95
  • O-MSY2.2
  • O-P31

Основное дерево Y-ДНК [ править ]

Филогенетическое дерево гаплогрупп ДНК Y-хромосомы человека [χ 1] [χ 2] Эта статья нуждается в обновлении . Обновите эту статью, чтобы отразить недавние события или новую доступную информацию. ( Февраль 2021 г. )
« Y-хромосомный Адам »
A00A0-T  [χ 3]
A0A1  [χ 4]
A1aA1b
A1b1BT
BCT
DECF
DECF
F1 F2 F3 GHIJK
граммHIJK
IJKЧАС
IJK
я  J    LT  [χ 5]      K2  [χ 6]
L    Т   K2a  [χ 7]       K2b  [χ 8]    K2c    K2dK2e  [χ 9]  
K-M2313  [χ 10]    K2b1  [χ 11]П  [χ 12]
НЕТ  S  [χ 13] M  [χ 14]   P1    P2
NОQр
Y-ДНК по населению Y-ДНК гаплогруппы исторических людей Сноски  ^ Ван печь М, Ван Geystelen А, Кайзер М, Decorte R, Larmuseau HD (2014). «Видеть лес за деревьями: минимальная эталонная филогения Y-хромосомы человека». Мутация человека . 35 (2): 187–91. DOI : 10.1002 / humu.22468 . PMID  24166809 . ^ Международное общество генетической генеалогии (ISOGG; 2015), Дерево гаплогруппы Y-ДНК 2015 . (Дата обращения: 1 февраля 2015 г.) ^ Гаплогруппа A0-T также известна как A-L1085 (а ранее как A0'1'2'3'4). ^ Гаплогруппа A1 также известна как A1'2'3'4. ^ Гаплогруппа LT (L298 / P326) также известна как гаплогруппа K1. ^ В период2002 по 2008 год, Гаплогруппа T-M184 был известен как «гаплогруппы К2». Это имя с тех пор было присвоено K-M526 , брату Haplogroup LT. ^ Гаплогруппа K2a (M2308) и ее первичный субклад K-M2313 были отделены от гаплогруппы NO (F549) в 2016 году. (Это последовало за публикацией: Poznik GD, Xue Y, Mendez FL, et al. (2016) ». в мужской демографии человека выведен из +1244 во всем мире последовательностей Y-хромосоме» . Nature Genetics . 48 (6): 593-9. DOI : 10.1038 / ng.3559 . ПМК 4884158 . PMID 27111036 .   В прошлом другие гаплогруппы, включая NO (M214) и K2e, также были идентифицированы с именем «K2a». ^ Гаплогруппа K2b (M1221 / P331 / PF5911) также известна как MPS гаплогруппы. ^ Гаплогруппа K2e (K-M147) ранее была известна как «гаплогруппа X» и «K2a» (но является дочерней субкладой нынешнего K2a). ^ K-M2313 *, у которого пока нет филогенетического названия, был зарегистрирован у двух живых людей, имеющих этнические связи с Индией и Юго-Восточной Азией. Кроме того, K-Y28299, который, по-видимому, является основной ветвью K-M2313, был обнаружен у трех живых людей из Индии. См .: Poznik op. соч. ; YFull YTree v5.08 , 2017, «K-M2335» и; PhyloTree , 2017, «Подробная информация о маркерах Y-SNP, включенных в минимальное дерево Y» (Дата доступа к этим страницам: 9 декабря 2017 г.) ^ Гаплогруппа K2b1 (P397 / P399) также известна как гаплогруппа MS, но имеет более широкую и сложную внутреннюю структуру. ^ Гаплогруппа P (P295) также известна как K2b2. ^ Гаплогруппа S, по состоянию на 2017 год, также известна как K2b1a. (Ранее название Гаплогруппа S было присвоено K2b1a4.) ^ Гаплогруппа M, по состоянию на 2017 год, также известна как K2b1b. (Ранее название Гаплогруппа M было присвоено K2b1d.)

Ссылки [ править ]

  1. ^ Г. Дэвид Позник, Яли Сюэ, Фернандо Л. Мендес и др. , «Пунктированные всплески в демографии мужчин-мужчин, выведенные из 1244 всемирных последовательностей Y-хромосомы». Нат Жене. 2016 июнь; 48 (6): 593–599. DOI: 10,1038 / нг. 3559.
  2. ^ а б Моника Кармин, Лаури Сааг, Марио Висенте и др. , «Недавнее узкое место разнообразия Y-хромосомы совпадает с глобальным изменением культуры». Исследование генома 25: 1–8; ISSN 1088-9051 / 15; www.genome.org
  3. ^ a b c d e f g h i j k l m n o p q r s t u v w x y z aa ab ac ad ae af ag ah ai aj ak al am an ao ap aq ar as at au av aw ax YFull Haplogroup YTree v5.04 на 16 мая 2017 г.
  4. ^ a b Ши Янь, Чуан-Чао Ван, Хуэй Ли, Ши-Линь Ли, Ли Цзинь и Генографический консорциум, «Обновленное дерево гаплогруппы O Y-хромосомы и пересмотренное филогенетическое положение мутаций P164 и PK4». Европейский журнал генетики человека (2011) 19, 1013–1015; DOI: 10.1038 / ejhg.2011.64
  5. ^ a b c Жан А Трежо, Эстелла С Полони, Джу-Чен Йен и др. (2014), «Тайваньская вариация ДНК Y-хромосомы и ее связь с островом Юго-Восточной Азии». BMC Genetics 2014, 15:77. http://www.biomedcentral.com/1471-2156/15/77
  6. ^ Питер де Баррос Дамгаард, Нина Марчи, Саймон Расмуссен и др. (2018), «137 древних геномов человека со всех концов евразийских степей». Природа объем 557, стр 369-374 (2018). https://doi.org/10.1038/s41586-018-0094-2
  7. ^ Wibhu Kutanan, Jatupol Kampuansai, Metawee Srikummool, Андреа Brunelli, Сильвия Ghirotto, Леонардо Arias, Энрико Macholdt, Александр Хюбнер, Роланд Шредер и Марк Стоункинг, «Контрастные Отцовские и материнские Генетические Истории тайского и лаосское население.» Мол. Биол. Evol. Публикация для расширенного доступа 12 апреля 2019 г. doi : 10.1093 / molbev / msz083
  8. ^ Мин-Шэн Пэн, Цзюнь-Донг Хэ, Лонг Фан и др. (2013), «Получение деревьев гаплогруппы Y хромосомы с использованием данных GWAS». Европейский журнал генетики человека (2013), 1–5. DOI: 10.1038 / ejhg.2013.272
  9. ^ Wang CC, Wang LX, Shrestha R, Zhang M, Huang XY и др. (2014), «Генетическая структура популяций Qiangic, проживающих в Западном коридоре Сычуань». PLoS ONE 9 (8): e103772. DOI: 10.1371 / journal.pone.0103772
  10. ^ Пилле Халласт, Кьяра Батини, Даниэль Задик и др. (2015), «Дерево Y-хромосомы превращается в лист: 13 000 высоконадежных SNP, покрывающих большинство известных клад». Молекулярная биология и эволюция 2015 Март; 32 (3): 661-73. DOI: 10.1093 / molbev / msu327
  11. ^ a b c d e f g h i j k Y-ДНК Haplotree at Family Tree DNA
  12. ^ O Y-гаплогруппа проекта в семейной ДНК дерева
  13. ^ Со Ён Квон, Хван Ён Ли, Ын Ён Ли, У Ик Ян и Кён-Джин Шин, «Подтверждение топологии дерева гаплогрупп Y с недавно предложенными Y-SNP для подгаплогрупп C2, O2b и O3a». Forensic Science International: Genetics 19 (2015) 42–46. https://dx.doi.org/10.1016/j.fsigen.2015.06.003

Сноски [ править ]

Цитированные работы [ править ]

Журналы

  • Су, Бинг; Сяо, Цзюньхуа; Андерхилл, Питер; Дека, Ранджан; Чжан, Вэйлин; Акей, Джошуа; Хуанг, Вэй; Шен, Ди; и другие. (1999). «Свидетельства Y-хромосомы для миграции современного человека на север в Восточную Азию во время последнего ледникового периода» . Американский журнал генетики человека . 65 (6): 1718–24. DOI : 10.1086 / 302680 . PMC  1288383 . PMID  10577926 .

Сайты

  • «Описание гаплогруппы Y-ДНК» . Архивировано из оригинала на 2009-03-19.

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Firasat, Sadaf; Халик, Шагуфта; Мохьюддин, Аиша; Папайоанну, Мирто; Тайлер-Смит, Крис; Андерхилл, Питер А; Аюб, Касим (2006). «Y-хромосомные доказательства ограниченного вклада Греции в патанское население Пакистана» . Европейский журнал генетики человека . 15 (1): 121–6. DOI : 10.1038 / sj.ejhg.5201726 . PMC  2588664 . PMID  17047675 .
  • Форнарино, Симона; Пала, Мария; Батталья, Винченца; Маранта, Рамона; Ахилли, Алессандро; Модиано, Гвидо; Торрони, Антонио; Семино, Орнелла; Сантачиара-Бенеречетти, Сильвана А (2009). «Митохондриальное и Y-хромосомное разнообразие Tharus (Непал): резервуар генетической изменчивости» . BMC Evolutionary Biology . 9 : 154. DOI : 10.1186 / 1471-2148-9-154 . PMC  2720951 . PMID  19573232 .
  • Hurles, M; Сайкс, Б; Джоблинг, М; Форстер, П. (2005). «Двойное происхождение малагасийцев на островах Юго-Восточной Азии и Восточной Африки: свидетельства материнского и отцовского происхождения» . Американский журнал генетики человека . 76 (5): 894–901. DOI : 10.1086 / 430051 . PMC  1199379 . PMID  15793703 .
  • Карафет, Татьяна М .; Lansing, JS; Редд, Алан Дж .; Уоткинс, Джозеф С .; Сурата, СПК; Артхавигуна, Вашингтон; Майер, Лаура; Бамшад, Майкл; и другие. (2005). «Балийская перспектива Y-хромосомы на заселение Индонезии: генетический вклад от донеолитических охотников-собирателей, австронезийских фермеров и индийских торговцев». Биология человека . 77 (1): 93–114. DOI : 10,1353 / hub.2005.0030 . hdl : 1808/13586 . PMID  16114819 . S2CID  7953854 .
  • Саху, Сангхамитра; Кашьяп, ВК (2006). «Филогеография митохондриальной ДНК и гаплогрупп Y-хромосомы выявляет асимметричный поток генов в популяциях Восточной Индии». Американский журнал физической антропологии . 131 (1): 84–97. DOI : 10.1002 / ajpa.20399 . PMID  16485297 .
  • Триведи, Раджни; Sitalaximi, T .; Банерджи, Джилам; Сингх, Анамика; Sircar, PK; Кашьяп, ВК (2006). «Молекулярное понимание происхождения Шомпена, сокращающегося населения Никобарского архипелага» . Журнал генетики человека . 51 (3): 217–26. DOI : 10.1007 / s10038-005-0349-2 . PMID  16453062 .