Натриальба

Натриальба
Научная классификация
Домен:	Архей
Королевство:	Euryarchaeota
Тип:	Euryarchaeota
Учебный класс:	Галобактерии
Заказ:	Галобактерии
Семья:	Галобактерии
Род:	Натриальба Камекура и Дьялл-Смит 1996 ^[1]
Разновидность
N. aegyptia ^[2] N. asiatica N. chahannaoensis ^[3] Н. hulunbeirensis N. magadii N. taiwanensis

В систематике , Natrialba является родом из Halobacteriaceae . ^[4] Род состоит из множества разнообразных видов, которые могут выжить в экстремальных экологических нишах, особенно они способны жить в водах, насыщенных или почти насыщенных солью ( галофилы ). ^[5]^[6] У них есть определенные приспособления, чтобы жить в соленой среде. Например, их клеточный аппарат адаптирован к высоким концентрациям соли за счет наличия заряженных аминокислот на своей поверхности, что позволяет клетке удерживать молекулы воды вокруг этих компонентов. Осмотическое давление и эти аминокислоты помогают контролировать количество соли вячейка . ^[7]

Например, N. magadii является аэробным хемоорганотрофом, двойным экстремофилом, которому для оптимального роста требуются щелочные условия и гиперсоленость. Эти суровые условия привели к изменению состава заряженных аминокислот в белках (средняя изоэлектрическая точка составляет всего 4,64, тогда как среднее значение для других организмов составляет 6,5), при этом почти все белки имеют высокую кислотность. ^[8] геном из Н. magadii состоит из четырех репликонов с общей последовательностью 4,443,643 пара оснований и кодируют белки 4,212 предположительных. Анализ генома выявил несколько геновкодирующие предполагаемые белки, участвующие в адаптации к гиперсолености, стрессовой реакции, гликозилированию и биосинтезу полисахаридов . Кроме того, была обнаружена управляемая протонами АТФ-синтаза и множество предполагаемых цитохромов и других белков, необходимых для аэробного дыхания и переноса электронов . Геном кодирует ряд предполагаемых протеаз / пептидаз. ^[9]

Их устойчивость к соли позволяет использовать некоторых представителей этого рода в биотехнологических процессах. ^[10]

Ссылки [ править ]

^ Камекура, М .; Seno, Y .; Дьял-Смит, М. (1996-05-23). «Галолизин R4, сериновая протеиназа из галофильной археи Haloferax mediterranei; клонирование, экспрессия и структурные исследования генов». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура белка и молекулярная энзимология . 1294 (2): 159–167. DOI : 10.1016 / 0167-4838 (96) 00016-7 . ISSN 0006-3002 . PMID 8645734 .
^ Hezayen, FF; Rehm, BH; Тиндалл, Б.Дж.; Steinbüchel, А (2001). «Перенос Natrialba asiatica B1T в Natrialba taiwanensis sp. Nov. И описание Natrialba aegyptiaca sp. Nov., Нового чрезвычайно галофильного, аэробного, непигментированного представителя архей из Египта, который производит внеклеточную поли (глутаминовую кислоту)» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 51 (3): 1133–1142. DOI : 10.1099 / 00207713-51-3-1133 . PMID 11411682 .
^ Xu, Y .; Wang, Z .; Xue, Y .; Чжоу, П .; Май.; Ventosa, A .; Грант, WD (сентябрь 2001 г.). «Natrialba hulunbeirensis sp. Nov. И Natrialba chahannaoensis sp. Nov., Новые галоалкалифильные археи из содовых озер в автономном районе Внутренняя Монголия, Китай» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 51 (Pt 5): 1693–1698. DOI : 10.1099 / 00207713-51-5-1693 . ISSN 1466-5026 . PMID 11594597 .
^ См. Веб-страницу NCBI на Natrialba . Данные извлечены из "ресурсов таксономии NCBI" . Национальный центр биотехнологической информации . Проверено 19 марта 2007 .
^ КАМЕКУРА, МАСАХИРО; ДАЙЛЛ-СМИТ, МАЙКЛ Л. (1995). «Таксономия семейства Halobacteriaceae и описание двух новых родов Halorubrobacterium и Natrialba» . Журнал общей и прикладной микробиологии . 41 (4): 333–350. DOI : 10,2323 / jgam.41.333 . ISSN 0022-1260 .
^ Камекура, М .; Дьялл-Смит, ML; Упасани, В .; Ventosa, A .; Кейтс, М. (июль 1997 г.). "Разнообразие алкалифильных галобактерий: предложения по переносу Natronobacterium vacuolatum, Natronobacterium magadii и Natronobacterium pharaonis на Halorubrum, Natrialba и Natronomonas gen. Nov., Соответственно, как Halorubrum vacuolatum. Nov. И Natron. pharaonis comb. nov., соответственно " . Международный журнал систематической бактериологии . 47 (3): 853–857. DOI : 10.1099 / 00207713-47-3-853 . ISSN 0020-7713 . PMID 9226918 .
^ Рид, Кристофер Дж .; Льюис, Хантер; Трехо, Эрик; Уинстон, Верн; Эвилия, Кэрин (2013). «Белковые адаптации у архей-экстремофилов» . Археи . 2013 : 373275. дои : 10,1155 / 2013/373275 . ISSN 1472-3646 . PMC 3787623 . PMID 24151449 .
^ Козловский, Лукаш П. (2017-01-04). «Proteome-pI: база данных изоэлектрических точек протеома» . Исследования нуклеиновых кислот . 45 (D1): D1112 – D1116. DOI : 10.1093 / NAR / gkw978 . PMC 5210655 . PMID 27789699 .
^ Сиддарамаппа, Шивакумара; Challacombe, Жан Ф .; Декастро, Розана Э .; Пфайффер, Фридхельм; Састре, Диего Э .; Хименес, Мария I .; Паджи, Роберто А .; Деттер, Джон С.; Давенпорт, Карен В. (2012-05-04). "Сравнительный взгляд на геномику генетического содержания алкалифильной галоархеи Natrialba magadii ATCC 43099T" . BMC Genomics . 13 : 165. DOI : 10.1186 / 1471-2164-13-165 . PMC 3403918 . PMID 22559199 .
^ Кеббуш-Гана, Салима; Гана, Мохамед Ламин; Ферриун, Имен; Хемили, Суад; Ленчи, Несрин; Акмоуси-Туми, Сихем; Буанане-Даренфед, Набила Амель; Джелали, Насер-Эддин (01.11.2013). «Производство биосурфактанта на сыром финиковом сиропе в солевых условиях захваченными клетками штамма E21 Natrialba sp., Чрезвычайно галофильной бактерии, выделенной из солнечного солярия (Айн Салах, Алжир)» Экстремофилы . 17 (6): 981–993. DOI : 10.1007 / s00792-013-0580-2 . ISSN 1431-0651 . PMID 24061687 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Научные журналы [ править ]

Conde, JD; Guillen, J .; Nercessian, D .; Ордонез, МВ; и другие. (Сентябрь 2011 г.). «Определение вторичной структуры с помощью FTIR архейного убиквитин-подобного полипептида из Natrialba magadii». Европейский биофизический журнал . 40 (9): 1101–1107. DOI : 10.1007 / s00249-011-0719-у . PMID 21701865 .
Орен А; Ventosa A (2000). «Подкомитет Международного комитета по систематической бактериологии по таксономии Halobacteriaceae. Протоколы заседаний, 16 августа 1999 г., Сидней, Австралия» . Int. J. Syst. Evol. Microbiol . 50 (3): 1405–1407. DOI : 10.1099 / 00207713-50-3-1405 . PMID 10843089 .

Научные книги [ править ]

Гиббонс, NE (1974). «Семейство V. Halobacteriaceae fam. Nov.». В RE Бьюкенен; NE Гиббонс (ред.). Руководство Берджи по детерминантной бактериологии (8-е изд.). Балтимор: Williams & Wilkins Co.

Научные базы данных [ править ]

Ссылки PubMed на Натриальба
Ссылки PubMed Central на Натриальба
Ссылки Google Scholar для Natrialba

Внешние ссылки [ править ]

Страница таксономии NCBI для Natrialba
Поиск по страницам таксономии Tree of Life для Natrialba
Поиск видов 2000 страниц для Natrialba
Страница MicrobeWiki для Natrialba
Страница LPSN для Натриальба
Natrialba в Bac Dive - база метаданных по разнообразию бактерий
Natrialba magadii в базе данных Proteme- pI, показывающая экстремальное распределение заряда белков.

Эта статья про архей незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[1] Камекура, М .; Seno, Y .; Дьял-Смит, М. (1996-05-23). «Галолизин R4, сериновая протеиназа из галофильной археи Haloferax mediterranei; клонирование, экспрессия и структурные исследования генов». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура белка и молекулярная энзимология . 1294 (2): 159–167. DOI : 10.1016 / 0167-4838 (96) 00016-7 . ISSN 0006-3002 . PMID 8645734 .

[2] Hezayen, FF; Rehm, BH; Тиндалл, Б.Дж.; Steinbüchel, А (2001). «Перенос Natrialba asiatica B1T в Natrialba taiwanensis sp. Nov. И описание Natrialba aegyptiaca sp. Nov., Нового чрезвычайно галофильного, аэробного, непигментированного представителя архей из Египта, который производит внеклеточную поли (глутаминовую кислоту)» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 51 (3): 1133–1142. DOI : 10.1099 / 00207713-51-3-1133 . PMID 11411682 .

[3] Xu, Y .; Wang, Z .; Xue, Y .; Чжоу, П .; Май.; Ventosa, A .; Грант, WD (сентябрь 2001 г.). «Natrialba hulunbeirensis sp. Nov. И Natrialba chahannaoensis sp. Nov., Новые галоалкалифильные археи из содовых озер в автономном районе Внутренняя Монголия, Китай» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 51 (Pt 5): 1693–1698. DOI : 10.1099 / 00207713-51-5-1693 . ISSN 1466-5026 . PMID 11594597 .

[4] См. Веб-страницу NCBI на Natrialba . Данные извлечены из "ресурсов таксономии NCBI" . Национальный центр биотехнологической информации . Проверено 19 марта 2007 .

[5] КАМЕКУРА, МАСАХИРО; ДАЙЛЛ-СМИТ, МАЙКЛ Л. (1995). «Таксономия семейства Halobacteriaceae и описание двух новых родов Halorubrobacterium и Natrialba» . Журнал общей и прикладной микробиологии . 41 (4): 333–350. DOI : 10,2323 / jgam.41.333 . ISSN 0022-1260 .

[6] Камекура, М .; Дьялл-Смит, ML; Упасани, В .; Ventosa, A .; Кейтс, М. (июль 1997 г.). "Разнообразие алкалифильных галобактерий: предложения по переносу Natronobacterium vacuolatum, Natronobacterium magadii и Natronobacterium pharaonis на Halorubrum, Natrialba и Natronomonas gen. Nov., Соответственно, как Halorubrum vacuolatum. Nov. И Natron. pharaonis comb. nov., соответственно " . Международный журнал систематической бактериологии . 47 (3): 853–857. DOI : 10.1099 / 00207713-47-3-853 . ISSN 0020-7713 . PMID 9226918 .

[7] Рид, Кристофер Дж .; Льюис, Хантер; Трехо, Эрик; Уинстон, Верн; Эвилия, Кэрин (2013). «Белковые адаптации у архей-экстремофилов» . Археи . 2013 : 373275. дои : 10,1155 / 2013/373275 . ISSN 1472-3646 . PMC 3787623 . PMID 24151449 .

[8] Козловский, Лукаш П. (2017-01-04). «Proteome-pI: база данных изоэлектрических точек протеома» . Исследования нуклеиновых кислот . 45 (D1): D1112 – D1116. DOI : 10.1093 / NAR / gkw978 . PMC 5210655 . PMID 27789699 .

[9] Сиддарамаппа, Шивакумара; Challacombe, Жан Ф .; Декастро, Розана Э .; Пфайффер, Фридхельм; Састре, Диего Э .; Хименес, Мария I .; Паджи, Роберто А .; Деттер, Джон С.; Давенпорт, Карен В. (2012-05-04). "Сравнительный взгляд на геномику генетического содержания алкалифильной галоархеи Natrialba magadii ATCC 43099T" . BMC Genomics . 13 : 165. DOI : 10.1186 / 1471-2164-13-165 . PMC 3403918 . PMID 22559199 .

[10] Кеббуш-Гана, Салима; Гана, Мохамед Ламин; Ферриун, Имен; Хемили, Суад; Ленчи, Несрин; Акмоуси-Туми, Сихем; Буанане-Даренфед, Набила Амель; Джелали, Насер-Эддин (01.11.2013). «Производство биосурфактанта на сыром финиковом сиропе в солевых условиях захваченными клетками штамма E21 Natrialba sp., Чрезвычайно галофильной бактерии, выделенной из солнечного солярия (Айн Салах, Алжир)» Экстремофилы . 17 (6): 981–993. DOI : 10.1007 / s00792-013-0580-2 . ISSN 1431-0651 . PMID 24061687 .

[1]