Протеиновая фосфатаза 2

протеинфосфатаза 2, каталитическая субъединица, альфа-изоформа

Каталитическая (С) субъединица протеинфосфатазы 2А. Белок показан радужным цветом с N-концом синим и C-концом красным. Метилированная карбоксильная группа в С-концевой лейциновым остатка показана на белом фоне. Пурпурные сферы - это два каталитически необходимых иона марганца , а темно-серое соединение в центре - это пептидомиметический токсин, микроцистин , занимающий активный центр . Из PDB : 2IAE . ^[1]

Идентификаторы

Символ

Прочие данные

Chr. 5 q23-q31

Ищи
Структуры	Швейцарская модель
Домены	ИнтерПро

протеинфосфатаза 2, каталитическая субъединица, бета-изоформа

Идентификаторы

Символ

Прочие данные

3.1.3.16

Locus

Chr. 8 стр. 12

Ищи
Структуры	Швейцарская модель
Домены	ИнтерПро

Белок фосфатазы 2 ( PP2 ), также известный как PP2A , является ферментом , который в организме человека кодируется PPP2CA гена . ^[2]^[3] PP2A гетеротримерного протеин фосфатазы повсеместно экспрессируется, что составляет большую долю активности фосфатазы в эукариотических клетках. ^[4] Его активность серин / треонинфосфатазы имеет широкую субстратную специфичность и разнообразные клеточные функции. Среди мишеней PP2A - белки онкогенных сигнальных каскадов, такие как Raf , MEK и AKT., где PP2A может действовать как опухолевый супрессор.

Структура и функции [ править ]

PP2A состоит из димерного ядра фермента, состоящего из структурных субъединиц A и каталитических C, а также регуляторной субъединицы B. Когда каталитическая C-субъединица PP2A ассоциируется с субъединицами A и B, образуются несколько видов холоферментов с различными функциями и характеристиками. Субъединица A, член-основатель семейства белков с повторами HEAT.(Huntington-elongation-A-субъединица-TOR), является каркасом, необходимым для образования гетеротримерного комплекса. Когда субъединица A связывается, это изменяет ферментативную активность каталитической субъединицы, даже если субъединица B отсутствует. В то время как последовательности субъединиц C и A демонстрируют замечательную консервацию последовательностей у эукариот, регуляторные субъединицы B более гетерогены и, как полагают, играют ключевую роль в контроле локализации и специфической активности различных холоферментов. Многоклеточные эукариоты экспрессируют четыре класса вариабельных регуляторных субъединиц: B (PR55), B '(B56 или PR61), B ″ (PR72) и B (PR93 / PR110), по крайней мере, с 16 членами в этих подсемействах. Кроме того, вспомогательные белки и посттрансляционные модификации (такие как метилирование) контролируют ассоциации и активность субъединиц PP2A.

Два каталитических иона металла, расположенные в активном центре PP2A, - это марганец . ^[1]

Функция	Протеин	Описание	Примечание
Структурная субъединица А	PPP2R1A	PP2A 65 кДа регуляторная субъединица А альфа-изоформа	субъединица A, изоформа PR65-альфа
Структурная субъединица А	PPP2R1B	PP2A 65 кДа регуляторная субъединица А бета-изоформа	субъединица A, изоформа PR65-бета
Регуляторная субъединица B	PPP2R2A	PP2A 55 кДа регуляторная субъединица B альфа-изоформа	субъединица A, B-альфа изоформа
	PPP2R2B	PP2A 55 кДа регуляторная субъединица B бета-изоформа	субъединица B, изоформа B-бета
	PPP2R2C	PP2A 55 кДа регуляторная субъединица B гамма-изоформа	субъединица B, B-гамма-изоформа
	PPP2R2D	PP2A 55 кДа регуляторная субъединица B дельта-изоформа	субъединица B, B-дельта-изоформа
	PPP2R3A	PP2A 72/130 кДа регуляторная субъединица B	субъединица B, B '' - PR72 / PR130
	PPP2R3B	PP2A 48 кДа регуляторная субъединица B	субъединица B, изоформа PR48
	PPP2R3C	PP2A регуляторная субъединица B '' субъединица гамма	субъединица G5PR
	PPP2R4	Регуляторная субъединица B 'PP2A	субъединица B ', изоформа PR53
	PPP2R5A	Альфа-изоформа регуляторной субъединицы PP2A 56 кДа	субъединица B, B 'альфа-изоформа
	PPP2R5B	Бета-изоформа регуляторной субъединицы PP2A 56 кДа	субъединица B, B 'бета-изоформа
	PPP2R5C	Гамма-изоформа регуляторной субъединицы PP2A 56 кДа	субъединица B, B 'гамма-изоформа
	PPP2R5D	Дельта-изоформа регуляторной субъединицы PP2A 56 кДа	субъединица B, B 'дельта-изоформа
	PPP2R5E	PP2A изоформа эпсилон регуляторной субъединицы 56 кДа	субъединица B, B 'изоформа эпсилон
Каталитическая субъединица C	PPP2CA	альфа-изоформа каталитической субъединицы
Каталитическая субъединица C	PPP2CB	бета-изоформа каталитической субъединицы

Собранный гетеротример протеинфосфатазы 2А. Структурная субъединица A, состоящая из 15 повторов HEAT , показана радужным цветом с N-концом синим внизу и C-концом красным вверху. Регуляторная субъединица B (B 'гамма), состоящая из нерегулярных псевдо-HEAT повторов, показана голубым цветом. Каталитическая субъединица C показана желтым. (Все из PDB : 2IAE .) Наложена несвязанная форма регуляторной субъединицы A серым цветом (из PDB : 1B3U ), иллюстрирующая гибкость этого альфа-соленоидного белка. Конформационные изменения в HEAT-повторе 11 приводят к сгибанию С-конца белка для обеспечения связывания каталитической субъединицы. ^[1]^[5]

Открытие лекарств [ править ]

PP2 был идентифицирован как потенциальная биологическая мишень для открытия лекарств для лечения болезни Паркинсона и болезни Альцгеймера , однако по состоянию на 2014 год было неясно, какие изоформы будут наиболее полезными для воздействия, а также будет ли активация или ингибирование наиболее терапевтическим. ^[6]^[7]

PP2 также был идентифицирован в качестве супрессора опухоли для рака крови , а также 2015 программ были в стадии реализации для идентификации соединений , которые могут либо непосредственно активировать его, или которые могут ингибировать другие белки , которые подавляют его активность. ^[8]

Ссылки [ править ]

^ a b c Чо США, Сюй В. (январь 2007 г.). «Кристаллическая структура гетеротримерного холофермента протеинфосфатазы 2А». Природа . 445 (7123): 53–7. Bibcode : 2007Natur.445 ... 53С . DOI : 10,1038 / природа05351 . PMID 17086192 . S2CID 4408160 .
^ Джонс Т.А., Баркер Х.М., да Круз и Сильва Е.Ф., Майер-Якель Р.Э., Хеммингс Б.А., Сперр Н.К., Шир Д., Коэн П.Т. (1993). «Локализация генов, кодирующих каталитические субъединицы протеинфосфатазы 2A, в полосах хромосом человека 5q23 → q31 и 8p12 → p11.2, соответственно». Цитогенетика и клеточная генетика . 63 (1): 35–41. DOI : 10.1159 / 000133497 . PMID 8383590 .
^ Виршуп, Дэвид М .; Шеноликар, Шириш (2009). «От беспорядочной половой жизни к точности: протеиновые фосфатазы преображаются». Молекулярная клетка . 33 (5): 537–545. DOI : 10.1016 / j.molcel.2009.02.015 . PMID 19285938 .
^ Mumby M (2007). «PP2A: открытие невосприимчивого супрессора опухолей» . Cell . 130 (1): 21–24. DOI : 10.1016 / j.cell.2007.06.034 . PMID 17632053 . S2CID 16004039 .
^ Groves MR, Hanlon N, Turowski P, Hemmings BA, Barford D (январь 1999). «Структура субъединицы PR65 / A протеинфосфатазы 2A показывает конформацию ее 15 тандемно повторяющихся мотивов HEAT». Cell . 96 (1): 99–110. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80963-0 . PMID 9989501 . S2CID 14465060 .
Перейти ↑ Braithwaite SP, Voronkov M, Stock JB, Mouradian MM (ноябрь 2012 г.). «Ориентация на фосфатазы как на следующее поколение терапевтических средств, изменяющих болезнь Паркинсона». Neurochemistry International . 61 (6): 899–906. DOI : 10.1016 / j.neuint.2012.01.031 . PMID 22342821 . S2CID 30417962 .
^ Зонтаг JM, Зонтаг E (2014). «Дисфункция протеинфосфатазы 2А при болезни Альцгеймера» . Границы молекулярной неврологии . 7 : 16. DOI : 10,3389 / fnmol.2014.00016 . PMC 3949405 . PMID 24653673 .
^ Чикконе М, Калин Г.А., Perrotti D (2015). «От биологии PP2A к PAD для терапии гематологических злокачественных новообразований» . Границы онкологии . 5 : 21. DOI : 10,3389 / fonc.2015.00021 . PMC 4329809 . PMID 25763353 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Сешачарюлу П., Пандей П., Датта К., Батра С.К. (июль 2013 г.). «Фосфатаза: структурное значение PP2A, регуляция и его аберрантное выражение при раке» . Письма о раке . 335 (1): 9–18. DOI : 10.1016 / j.canlet.2013.02.036 . PMC 3665613 . PMID 23454242 .
Сюй И, Син И, Чен И, Чао И, Линь З, Фан Э, Ю Дж.В., Страк С., Джеффри П.Д., Ши И (декабрь 2006 г.). «Структура холофермента протеинфосфатазы 2А». Cell . 127 (6): 1239–51. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.11.033 . PMID 17174897 . S2CID 18584536 .
Xing Y, Xu Y, Chen Y, Jeffrey PD, Chao Y, Lin Z, Li Z, Strack S, Stock JB, Shi Y (октябрь 2006 г.). «Структура основного фермента протеинфосфатазы 2A, связанного с токсинами, вызывающими опухоль». Cell . 127 (2): 341–53. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.09.025 . PMID 17055435 . S2CID 17264021 .
Ори С., Чжоу М., Конрадс Т.П., Венстра Т.Д., Моррисон Д.К. (август 2003 г.). «Протеиновая фосфатаза 2A положительно регулирует передачу сигналов Ras путем дефосфорилирования KSR1 и Raf-1 на критических сайтах связывания 14-3-3». Текущая биология . 13 (16): 1356–64. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (03) 00535-9 . PMID 12932319 . S2CID 15865688 .

Внешние ссылки [ править ]

PPP2CA + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
Рубратоксин

[cho_2006-1] Чо США, Сюй В. (январь 2007 г.). «Кристаллическая структура гетеротримерного холофермента протеинфосфатазы 2А». Природа . 445 (7123): 53–7. Bibcode : 2007Natur.445 ... 53С . DOI : 10,1038 / природа05351 . PMID 17086192 . S2CID 4408160 .

[pmid8383590-2] Джонс Т.А., Баркер Х.М., да Круз и Сильва Е.Ф., Майер-Якель Р.Э., Хеммингс Б.А., Сперр Н.К., Шир Д., Коэн П.Т. (1993). «Локализация генов, кодирующих каталитические субъединицы протеинфосфатазы 2A, в полосах хромосом человека 5q23 → q31 и 8p12 → p11.2, соответственно». Цитогенетика и клеточная генетика . 63 (1): 35–41. DOI : 10.1159 / 000133497 . PMID 8383590 .

[3] Виршуп, Дэвид М .; Шеноликар, Шириш (2009). «От беспорядочной половой жизни к точности: протеиновые фосфатазы преображаются». Молекулярная клетка . 33 (5): 537–545. DOI : 10.1016 / j.molcel.2009.02.015 . PMID 19285938 .

[pmid17632053-4] Mumby M (2007). «PP2A: открытие невосприимчивого супрессора опухолей» . Cell . 130 (1): 21–24. DOI : 10.1016 / j.cell.2007.06.034 . PMID 17632053 . S2CID 16004039 .

[groves_1999-5] Groves MR, Hanlon N, Turowski P, Hemmings BA, Barford D (январь 1999). «Структура субъединицы PR65 / A протеинфосфатазы 2A показывает конформацию ее 15 тандемно повторяющихся мотивов HEAT». Cell . 96 (1): 99–110. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80963-0 . PMID 9989501 . S2CID 14465060 .

[pmid22342821-6] Перейти ↑ Braithwaite SP, Voronkov M, Stock JB, Mouradian MM (ноябрь 2012 г.). «Ориентация на фосфатазы как на следующее поколение терапевтических средств, изменяющих болезнь Паркинсона». Neurochemistry International . 61 (6): 899–906. DOI : 10.1016 / j.neuint.2012.01.031 . PMID 22342821 . S2CID 30417962 .

[pmid24653673-7] Зонтаг JM, Зонтаг E (2014). «Дисфункция протеинфосфатазы 2А при болезни Альцгеймера» . Границы молекулярной неврологии . 7 : 16. DOI : 10,3389 / fnmol.2014.00016 . PMC 3949405 . PMID 24653673 .

[pmid25763353-8] Чикконе М, Калин Г.А., Perrotti D (2015). «От биологии PP2A к PAD для терапии гематологических злокачественных новообразований» . Границы онкологии . 5 : 21. DOI : 10,3389 / fonc.2015.00021 . PMC 4329809 . PMID 25763353 .

[1]

vтеФерменты
Мероприятия	Активный сайт Связывающий сайт Каталитическая триада Оксианионная дыра Ферментная неразборчивость Каталитически совершенный фермент Коэнзим Кофактор Ферментный катализ
Регулирование	Аллостерическая регуляция Сотрудничество Ингибитор ферментов Активатор ферментов
Классификация	Номер ЕС Ферментное суперсемейство Семейство ферментов Список ферментов
Кинетика	Кинетика ферментов Диаграмма Иди – Хофсти Заговор Ханеса – Вульфа Заговор Лайнуивера – Берка Кинетика Михаэлиса – Ментен
Типы	EC1 Оксидоредуктазы ( список ) EC2 Трансферазы ( список ) EC3 Гидролазы ( список ) EC4 Lyases ( список ) EC5 Изомеразы ( список ) Лигазы EC6 ( список ) EC7 Translocases ( список )