• активности пероксидазы • каталитической активность • ГО: связывание 0001948 белка • пероксиредоксина активности • оксидоредуктазы активности • гидролазы активности • убиквитина белка лигазы связывание • антиоксидантный активности • кадгерин связывания • глутатионпероксидазы активности • белок гомодимеризации активность • фосфолипазы А2 активность кальций-независимой • фосфолипазов А2 активность • активность фосфолипазы A2 (потребление 1,2-дипальмитоилфосфатидилхолина) • активность фосфолипазы А2, потребляющей 1,2-диолеоилфосфатидилэтаноламин)
Сотовый компонент
• цитоплазма • цитозоль • мембрана • лизосома • внеклеточная экзосома • внеклеточная область • внеклеточная • просвет азурофильных гранул • ядро клетки • перинуклеарная область цитоплазмы
Биологический процесс
• липидного обмена • липидный катаболический процесс • перекись водорода катаболического процесса • метаболизма • окислительно-восстановительный процесс • клеточного окислительно - восстановительного гомеостаза • нейтрофилы дегрануляции • ответ на окислительный стресс • клеточного ответа на окислительный стресс • глицерофосфолипид процесса катаболический • клеточной детоксикации окислителя • положительное регулирование мРНК сплайсинг, через сплайсосомы
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность
Человек
Мышь
Entrez
9588
11758
Ансамбль
ENSG00000117592
ENSMUSG00000026701
UniProt
P30041
O08709
RefSeq (мРНК)
NM_004905
NM_001303408 NM_007453
RefSeq (белок)
NP_004896
NP_001290337 NP_031479
Расположение (UCSC)
Chr 1: 173.48 - 173.49 Мб
Chr 1: 161.24 - 161.25 Мб
PubMed поиск
[3]
[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Просмотр / редактирование мыши
Пероксиредоксин-6 представляет собой белок , который у человека кодируется PRDX6 гена . [5] [6] Он является членом семейства антиоксидантных ферментов пероксиредоксинов .
СОДЕРЖАНИЕ
1 Функция
1.1 Модельные организмы
2 ссылки
3 Дальнейшее чтение
Функция [ править ]
Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства тиол-специфических антиоксидантных белков. Этот белок представляет собой бифункциональный фермент с двумя различными активными центрами. Он участвует в окислительно-восстановительной регуляции клетки; он может восстанавливать H (2) O (2) и короткоцепочечные органические, жирные кислоты и гидропероксиды фосфолипидов. Он может играть роль в регуляции обмена фосфолипидов, а также в защите от окислительного повреждения. [6]
Модельные организмы [ править ]
Нокаутный фенотип мыши по Prdx6
Характеристика
Фенотип
Жизнеспособность гомозигот
Нормальный
Плодородие
Нормальный
Масса тела
Нормальный
Беспокойство
Нормальный
Неврологическое обследование
Нормальный
Сила захвата
Нормальный
Горячая тарелка
Нормальный
Дисморфология
Нормальный
Косвенная калориметрия
Нормальный
Тест толерантности к глюкозе
Нормальный
Слуховой ответ ствола мозга
Нормальный
DEXA
Нормальный
Рентгенография
Нормальный
Температура тела
Нормальный
Морфология глаза
Нормальный
Клиническая химия
Нормальный
Плазменные иммуноглобулины
Нормальный
Гематология
Нормальный
Микроядерный тест
Нормальный
Вес сердца
Нормальный
Эпидермис хвоста цельный
Нормальный
Гистопатология кожи
Нормальный
Гистопатология головного мозга
Нормальный
Сальмонеллезная инфекция
Нормальный [7]
Citrobacter инфекция
Нормальный [8]
Все тесты и анализ из [9] [10]
Модельные организмы использовались при изучении функции PRDX6. Линия условно нокаутных мышей , названная Prdx6 tm1a (EUCOMM) Wtsi [11] [12], была создана в рамках программы International Knockout Mouse Consortium - проекта высокопроизводительного мутагенеза для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых. Институт Wellcome Trust Sanger . [13] [14] [15]
Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения эффектов делеции. [9] [16] Двадцать пять тестов были проведены на мутантных мышах, но никаких существенных отклонений не наблюдалось. [9]
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000117592 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026701 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Фелан SA (март 2001). «AOP2 (антиоксидантный белок 2): структура и функция уникального тиолоспецифического антиоксиданта». Антиоксидный окислительно-восстановительный сигнал . 1 (4): 571–84. PMID 11233154 .
^ a b «Ген Энтреза: пероксиредоксин 6 PRDX6» .
^ « Данные о заражении сальмонеллой для Prdx6» . Wellcome Trust Институт Сэнгера.
^ « Данные о заражении Citrobacter для Prdx6» . Wellcome Trust Институт Сэнгера.
^ а б в Гердин А.К. (2010). «Программа генетики мыши Сэнгера: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica . 88 (S248). DOI : 10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x .
^ Портал ресурсов мыши , Wellcome Trust Sanger Institute.
^ "Международный Консорциум Нокаут-Мышей" .
^ "Информатика генома мыши" .
^ Скарнес, WC; Rosen, B .; Запад, AP; Koutsourakis, M .; Бушелл, Вт .; Iyer, V .; Мухика, АО; Thomas, M .; Harrow, J .; Cox, T .; Джексон, Д .; Severin, J .; Biggs, P .; Fu, J .; Нефедов, М .; Де Йонг, П.Дж.; Стюарт, AF; Брэдли, А. (2011). «Ресурс с условным нокаутом для полногеномного исследования функции генов мыши» . Природа . 474 (7351): 337–342. DOI : 10,1038 / природа10163 . PMC 3572410 . PMID 21677750 .
^ Долгин E (июнь 2011). "Библиотека мыши настроена на нокаут" . Природа . 474 (7351): 262–3. DOI : 10.1038 / 474262a . PMID 21677718 .
^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (январь 2007). «Мышь по всем причинам». Cell . 128 (1): 9–13. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.12.018 . PMID 17218247 .
↑ van der Weyden L, White JK, Adams DJ, Logan DW (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма» . Genome Biol . 12 (6): 224. DOI : 10.1186 / GB-2011-12-6-224 . PMC 3218837 . PMID 21722353 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Маневич Ю., Фишер А.Б. (2005). «Пероксиредоксин 6, пероксиредоксин 1-Cys, участвует в антиоксидантной защите и метаболизме фосфолипидов в легких». Свободный Радич. Биол. Med . 38 (11): 1422–32. DOI : 10.1016 / j.freeradbiomed.2005.02.011 . PMID 15890616 .
Akesson B; Густавий Б (1975). «Работа в процессе. Возникновение фосфолипазы А1 и А2 в децидуальной оболочке человека». Простагландины . 9 (5): 667–73. DOI : 10.1016 / 0090-6980 (75) 90106-9 . PMID 240188 .
Hochstrasser DF; Frutiger S; Paquet N; и другие. (1993). «Карта белков печени человека: справочная база данных, созданная путем микросеквенирования и сравнения гелей». Электрофорез . 13 (12): 992–1001. DOI : 10.1002 / elps.11501301201 . PMID 1286669 .
Доусон SJ, Белый LA (1992). «Лечение эндокардита Haemophilus aphrophilus ципрофлоксацином». J. Infect . 24 (3): 317–20. DOI : 10.1016 / S0163-4453 (05) 80037-4 . PMID 1602151 .
Йейтс Д.А., Бахле Ю.С. (1989). «Фосфолипазы А2 и С легкого человека; субклеточное распределение и селективность субстрата». Биохим. Биофиз. Acta . 1003 (2): 189–95. DOI : 10.1016 / 0005-2760 (89) 90254-3 . PMID 2730891 .
Nagase T; Miyajima N; Танака А; и другие. (1995). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. III. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0081-KIAA0120), выведенные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1» . ДНК Res . 2 (1): 37–43. DOI : 10.1093 / dnares / 2.1.37 . PMID 7788527 .
Голаз О; Hughes GJ; Frutiger S; и другие. (1994). «Карты белков плазмы и красных кровяных телец: обновление 1993 года». Электрофорез . 14 (11): 1223–31. DOI : 10.1002 / elps.11501401183 . PMID 8313871 .
Ким Т.С.; Сундареш CS; Файнштейн С.И.; и другие. (1997). «Идентификация клона кДНК человека для Ca2 + -независимой фосфолипазы А2 лизосомального типа и свойств экспрессированного белка» . J. Biol. Chem . 272 (4): 2542–50. DOI : 10.1074 / jbc.272.4.2542 . PMID 8999971 .
Франк С., Мунц Б., Вернер С. (1997). «Человеческий гомолог бычьей неселеновой глутатионпероксидазы представляет собой новый ген, регулируемый фактором роста кератиноцитов» . Онкоген . 14 (8): 915–21. DOI : 10.1038 / sj.onc.1200905 . PMID 9050990 .
Кан С.В., Бейнс И.К., Ри С.Г. (1998). «Характеристика пероксиредоксина млекопитающих, содержащего один консервативный цистеин» . J. Biol. Chem . 273 (11): 6303–11. DOI : 10.1074 / jbc.273.11.6303 . PMID 9497358 .
Choi HJ; Кан SW; Ян СН; и другие. (1998). «Кристаллическая структура нового фермента пероксидазы человека при разрешении 2,0 A». Nat. Struct. Биол . 5 (5): 400–6. DOI : 10.1038 / nsb0598-400 . PMID 9587003 .
Чен JW; Dodia C; Файнштейн С.И.; и другие. (2000). «1-Cys пероксиредоксин, бифункциональный фермент с активностями глутатионпероксидазы и фосфолипазы A2» . J. Biol. Chem . 275 (37): 28421–7. DOI : 10.1074 / jbc.M005073200 . PMID 10893423 .
Фатма Н., Сингх Д.П., Шинохара Т., Чайлак Л.Т. (2002). «Транскрипционная регуляция гена антиоксидантного белка 2, тиол-специфического антиоксиданта, с помощью фактора роста, происходящего из эпителия хрусталика, для защиты клеток от окислительного стресса» . J. Biol. Chem . 276 (52): 48899–907. DOI : 10.1074 / jbc.M100733200 . PMID 11677226 .
Вагнер Э; Luche S; Penna L; и другие. (2002). «Метод обнаружения чрезмерного окисления цистеинов: пероксиредоксины окисляются in vivo в цистеине в активном центре во время окислительного стресса» . Биохим. Дж . 366 (Pt 3): 777–85. DOI : 10.1042 / BJ20020525 . PMC 1222825 . PMID 12059788 .
Leavey PJ; Гонсалес-Аллер С; Турман Г; и другие. (2003). «Белок массой 29 кДа, связанный с p67phox, экспрессирует как пероксиредоксин, так и фосфолипазу А2, и усиливает продукцию супероксид-анионов бесклеточной системой активности НАДФН-оксидазы» . J. Biol. Chem . 277 (47): 45181–7. DOI : 10.1074 / jbc.M202869200 . PMID 12121978 .
Маневич Ю; Sweitzer T; Pak JH; и другие. (2002). «Сверхэкспрессия 1-Cys пероксиредоксина защищает клетки от повреждения мембран, опосредованного перекисным окислением фосфолипидов» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (18): 11599–604. DOI : 10.1073 / pnas.182384499 . PMC 129315 . PMID 12193653 .
Штраусберг Р.Л .; Feingold EA; Рябчик LH; и другие. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Krapfenbauer K; Engidawork E; Cairns N; и другие. (2003). «Аберрантная экспрессия подтипов пероксиредоксина при нейродегенеративных расстройствах». Brain Res . 967 (1–2): 152–60. DOI : 10.1016 / S0006-8993 (02) 04243-9 . PMID 12650976 .
Куда О, Брезинова М., Силхави Дж., Ланда В., Зидек В., Додиа К., Кройхвиг Ф., Врбаки М., Балас Л., Дюран Т., Хюбнер Н., Фишер А. Б., Копецки Дж., Правенец М. (июнь 2018 г.). «Nrf2-опосредованная антиоксидантная защита и пероксиредоксин 6 связаны с биосинтезом пальмитинового эфира 9-гидроксистеариновой кислоты (9-PAHSA)» . Диабет . 67 (6): 1190–1199. DOI : 10,2337 / db17-1087 . PMC 6463562 . PMID 29549163 .
vтеPDB галерея
1prx : HORF6 - НОВЫЙ ПЕРОКСИДАЗНЫЙ ФЕРМЕНТ ЧЕЛОВЕКА
