Белок, связанный с патогенезом

Связанные с патогенезом (PR) белки - это белки, вырабатываемые в растениях в случае атаки патогена . ^[1] Они индуцируются как часть системной приобретенной резистентности . Инфекции активируют гены, производящие белки PR. Некоторые из этих белков являются антимикробными и атакуют молекулы клеточной стенки бактерии или грибка. Другие могут действовать как сигналы, которые распространяют «новости» об инфекции в соседние клетки. Инфекции также стимулируют сшивание молекул в клеточной стенке и отложение лигнина - реакции, которые создают локальную баррикаду, которая замедляет распространение патогена на другие части растения. ^[2]

Салициловая кислота играет роль в устойчивости к патогенам, индуцируя выработку белков, связанных с патогенезом. ^[3] Многие белки, содержащиеся в вине, связаны с патогенами винограда. ^[4] К ним относятся тауматиноподобные белки и хитиназы .

Многие семейства белков, связанных с патогенезом, также совпадают с группами аллергенов человека, хотя аллергия может не иметь ничего общего с защитной функцией белков. ^[5] Группирование этих белков по признакам их последовательности позволяет находить потенциальные аллергенные белки из секвенированных геномов растений - область исследований, получившая название « аллергеномика ». ^[6]

Классификация [ править ]

В этом разделе отсутствует информация о ссылках на статьи. Пожалуйста, разверните раздел, чтобы включить эту информацию. Более подробная информация может быть на странице обсуждения . ( Май 2019 г. )

По состоянию на 2014 г. ^{[Обновить]}было названо 17 семейств PR-белков: ^[5]

Идентифицированы различные семейства PR-белков и аллергены
Семья	Классификация доменов	Белки	Функции	Аллергены
PR-1	IPR034111 IPR001283	ПР-1 а, ПР-1 б и ПР-1 в	Противогрибковые ( CAP )	Cuc m 3 (дыня; P83834 ) - синдром оральной аллергии.
PR-2	( GH17 )	β-1,3-глюканазы	Расщепляет β-1,3-глюканы	Hev b 2 (латекс; P52407 ) - контактный дерматит. Оле е 9 (оливковое) - респираторная аллергия. Mus a 5 (банан) - синдром оральной аллергии.
PR-3	IPR016283	Типы хитиназы I, II, IV, V, VI и VII	Эндохитиназа	Перс а 1 (авокадо) - воспаление глаз или носа, астма, отек и т. Д. Mus a 2 (банан) - пищевая аллергия, например отек губ, анафилаксия и т. Д.
PR-4	IPR001153	Барвин-домен хитиназы I / II	Противогрибковые и хитиназы	Прогевены : Hev b 6 - контактный дерматит.
PR-5	IPR001938	Тауматин- подобный	Противогрибковый	Jun a 3 (горный кедр), Cry j 1 (японский кедр) и Cup a 3 (аризонский кипарис) - ринит, конъюнктивит и астма. Pru av 2 (вишня), Mal d 2 (яблоко), Cap a 1 (болгарский перец), Act d 2 (киви) и Mus a 4 (банан) - синдром оральной аллергии.
PR-6	IPR000864	Картофельная протеаза I	Ингибитор протеиназы
PR-7	( Субтилизин- подобный)	Эндопротеиназа томата P69 ( O82007 )	Эндопротеиназа
PR-8	( GH18 )	Хитиназа огурца	Хитиназа III	Гевамин (латекс, P23472 ) - контактный дерматит. Ziz m 1 (индийский мармелад, Q2VST0 ) - синдром оральной аллергии. Cof a 1 (кофе, D7REL9 ) - аллергия на глаза и дыхательные пути.
PR-9	( Пероксидаза гема III)	Табачная лигнин-образующая пероксидаза ( P11965 )	Пероксидаза
PR-10	IPR024949 IPR000916	Петрушка "ПР-1"	Рибонуклеазоподобный	Bet v 1 (пыльца березы) - аллергический риноконъюнктивит и астма Pru av 1 (вишня), Mal d 1 (яблоко), Api g 1 (сельдерей) и Dau c 1 (морковь) - синдром оральной аллергии. Gly m 4 (соя), Vig r 1 (маш), Cor a 1 (лесной орех) и Cas s 1 (каштан), Act c 8 (золотой плод киви), Act d 8 (зеленый плод киви) - оральная аллергия. синдром
PR-11	( GH18 )	Табачная хитиназа V ( Q43576 )	Хитиназа
PR-12	IPR008176	Редис Rs-AFP3 ( O24332 )	Растительный дефенсин
PR-13	IPR001010	Арабидопсис THI2.1 ( Q42596 )	Тионин
PR-14	IPR000528	Белки-переносчики липидов	Перемещение фосфолипидов и жирных кислот	Par j 1 (сорняк; P43217 ) - ринит и астма. Pru p 3 (персик), Mal d 3 (яблоко), Pru av 3 (вишня), Pru ar 3 (абрикос), Cor a 8 (лесной орех), Cas s 8 (каштан) и Zea m 14 (кукуруза) - синдром оральной аллергии
PR-15	IPR001929	Ячмень OxOa ( P45850 )	проросток ; Оксалатоксидаза
PR-16	IPR001929	Ячмень OxOLP ( O49871 )	зародышевый
PR-17	IPR007541	Табак NtPRp27 ( Q9XIY9 )	фитофтороз (?) ^[7]

Идентификация [ править ]

Поскольку белки PR продуцируются, когда ткань растения подвергается стрессу, используются различные способы передачи сигналов стресса, чтобы «приманить» растение к экспрессии генов PR для идентификации. Полезные факторы стресса включают фактическую инфекцию или просто защитные сигналы, такие как салицилат и метилжасмонат . Белки можно идентифицировать путем выделения, расщепления пептидов и сопоставления с геномными последовательностями ( секвенирование белков ). Затем полученные последовательности могут быть проверены на соответствие известным семействам белков PR для классификации. ^[8]^[9]

См. Также [ править ]

Ацибензолар-S-метил
Глоссарий фитопатологии
Ген R , неродственные белки устойчивости

Ссылки [ править ]

^ Loon LC (1985). «Белки, связанные с патогенезом». Молекулярная биология растений . 4 (2–3): 111–116. DOI : 10.1007 / BF02418757 . PMID 24310747 .
Перейти ↑ Campbell, NA и Reece, JB (2005). Биология (7-е изд). Сан-Франциско: Бенджамин Каммингс.
^ Van Huijsduijnen RAMH; Alblas SW; Де Райк Р.Х .; Бол Дж. Ф. (1986). «Индукция салициловой кислотой белков, связанных с патогенезом, и устойчивость к инфекции вируса мозаики люцерны у различных видов растений» . Журнал общей вирусологии . 67 (10): 2135–2143. DOI : 10.1099 / 0022-1317-67-10-2135 .
^ Воды EJ, Ширли NJ, Williams PJ (1996). «Мешающие белки вина являются белками, связанными с патогенезом винограда». Журнал сельскохозяйственной и пищевой химии . 44 (1): 3–5. DOI : 10.1021 / jf9505584 .
^ а б Синха, Мау; Сингх, Рашми Прабха; Кушваха, Гаджрадж Сингх; Икбал, Насир; Сингх, Авинаш; Кошик, Санкет; Каур, Пунит; Шарма, Суджата; Сингх, Тедж П. (2014). «Текущий обзор аллергенов семейств белков, связанных с патогенезом растений» . Научный мировой журнал . 2014 : 543195. дои : 10,1155 / 2014/543195 . PMC 3947804 . PMID 24696647 . Эта статья содержит цитаты из этого источника, доступного по лицензии Creative Commons Attribution 3.0 (CC BY 3.0) .
^ Ди Джироламо, F; Muraca, M; Маццина, О; Ланте, я; Дахдах, Л. (июнь 2015 г.). «Протеомные приложения при пищевой аллергии: пищевая аллергеномика». Текущее мнение в области аллергии и клинической иммунологии . 15 (3): 259–66. DOI : 10.1097 / ACI.0000000000000160 . PMID 25899690 .
^ Ши, X; Тиан, Z; Лю, Дж; ван дер Фоссен, EA; Се, К. (февраль 2012 г.). «Ген белка, связанного с патогенезом картофеля, StPRp27, способствует расовой неспецифической устойчивости против Phytophthora infestans». Отчеты по молекулярной биологии . 39 (2): 1909–16. DOI : 10.1007 / s11033-011-0937-5 . PMID 21667110 .
^ Эльвира, Мичиган; Гальдеано, ММ; Gilardi, P .; Гарсиа-Луке, I .; Серра, MT (19 марта 2008 г.). «Протеомный анализ белков, связанных с патогенезом (PR), индуцированных совместимыми и несовместимыми взаимодействиями вируса легкой крапчатости перца (PMMoV) в растениях Capsicum chinense L3» . Журнал экспериментальной ботаники . 59 (6): 1253–1265. DOI : 10.1093 / JXB / ern032 . PMID 18375936 .
^ Сабатер-Джара, AB; Альмагро, Л; Бельчи-Наварро, S; Барсело, Арканзас; Педреньо, Массачусетс (март 2011 г.). «Метилжасмонат индуцирует внеклеточные белки, связанные с патогенезом, в культурах клеток Capsicum chinense» . Сигнализация и поведение растений . 6 (3): 440–2. DOI : 10.4161 / psb.6.3.14451 . PMC 3142433 . PMID 21346408 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Мутукришнан С., Датта С.П. (1999). Белки, связанные с патогенезом растений . Бока-Ратон: CRC Press. С. 291 . ISBN 0-8493-0697-3.
«Защитные белки высших растений» . dmd.nihs.go.jp .

В эту статью включены тексты Мау Синхи, Рашми Прабхи Сингха, Гаджраджа Сингха Кушвахи, Насира Икбала, Авинаша Сингха, Санкета Кошика, Пунита Каура, Суджаты Шармы и Тедж П. Сингха, доступные по лицензии CC BY 3.0 .

Внешние ссылки [ править ]

Номенклатура аллергенов ВОЗ для преобразования аллергенов в определенные последовательности.
Ключевое слово UniProt : KW-0568
Отображение онтологии генов : GO: 0009607 , GO: 0006952

Эта статья о белках незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[Loon_1985-1] Loon LC (1985). «Белки, связанные с патогенезом». Молекулярная биология растений . 4 (2–3): 111–116. DOI : 10.1007 / BF02418757 . PMID 24310747 .

[2] Перейти ↑ Campbell, NA и Reece, JB (2005). Биология (7-е изд). Сан-Франциско: Бенджамин Каммингс.

[Van_Huijsduijnen_1986-3] Van Huijsduijnen RAMH; Alblas SW; Де Райк Р.Х .; Бол Дж. Ф. (1986). «Индукция салициловой кислотой белков, связанных с патогенезом, и устойчивость к инфекции вируса мозаики люцерны у различных видов растений» . Журнал общей вирусологии . 67 (10): 2135–2143. DOI : 10.1099 / 0022-1317-67-10-2135 .

[Waters_1996-4] Воды EJ, Ширли NJ, Williams PJ (1996). «Мешающие белки вина являются белками, связанными с патогенезом винограда». Журнал сельскохозяйственной и пищевой химии . 44 (1): 3–5. DOI : 10.1021 / jf9505584 .

[17allergens-5] а б Синха, Мау; Сингх, Рашми Прабха; Кушваха, Гаджрадж Сингх; Икбал, Насир; Сингх, Авинаш; Кошик, Санкет; Каур, Пунит; Шарма, Суджата; Сингх, Тедж П. (2014). «Текущий обзор аллергенов семейств белков, связанных с патогенезом растений» . Научный мировой журнал . 2014 : 543195. дои : 10,1155 / 2014/543195 . PMC 3947804 . PMID 24696647 . Эта статья содержит цитаты из этого источника, доступного по лицензии Creative Commons Attribution 3.0 (CC BY 3.0) .

[6] Ди Джироламо, F; Muraca, M; Маццина, О; Ланте, я; Дахдах, Л. (июнь 2015 г.). «Протеомные приложения при пищевой аллергии: пищевая аллергеномика». Текущее мнение в области аллергии и клинической иммунологии . 15 (3): 259–66. DOI : 10.1097 / ACI.0000000000000160 . PMID 25899690 .

[7] Ши, X; Тиан, Z; Лю, Дж; ван дер Фоссен, EA; Се, К. (февраль 2012 г.). «Ген белка, связанного с патогенезом картофеля, StPRp27, способствует расовой неспецифической устойчивости против Phytophthora infestans». Отчеты по молекулярной биологии . 39 (2): 1909–16. DOI : 10.1007 / s11033-011-0937-5 . PMID 21667110 .

[8] Эльвира, Мичиган; Гальдеано, ММ; Gilardi, P .; Гарсиа-Луке, I .; Серра, MT (19 марта 2008 г.). «Протеомный анализ белков, связанных с патогенезом (PR), индуцированных совместимыми и несовместимыми взаимодействиями вируса легкой крапчатости перца (PMMoV) в растениях Capsicum chinense L3» . Журнал экспериментальной ботаники . 59 (6): 1253–1265. DOI : 10.1093 / JXB / ern032 . PMID 18375936 .

[9] Сабатер-Джара, AB; Альмагро, Л; Бельчи-Наварро, S; Барсело, Арканзас; Педреньо, Массачусетс (март 2011 г.). «Метилжасмонат индуцирует внеклеточные белки, связанные с патогенезом, в культурах клеток Capsicum chinense» . Сигнализация и поведение растений . 6 (3): 440–2. DOI : 10.4161 / psb.6.3.14451 . PMC 3142433 . PMID 21346408 .

[1]