Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
EIF2AK2
EIF2AK2 protein.png 6d3k оранжевый adp зеленый mg.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

3UIU , 1QU6 , 2A19 , 2A1A

Идентификаторы
ПсевдонимыEIF2AK2 , EIF2AK1, PKR, PPP1R83, PRKR, фактор инициации трансляции 2 эукариот, альфа-киназа 2, LEUDEN
Внешние идентификаторыOMIM : 176871 MGI : 1353449 HomoloGene : 48134 GeneCards : EIF2AK2
Номер ЕС2.7.10.2
Расположение гена ( человек )
Хромосома 2 (человек)
Chr.Хромосома 2 (человека) [1]
Хромосома 2 (человек)
Геномное расположение EIF2AK2
Геномное расположение EIF2AK2
Группа2п22.2Начинать37 099 210 п.н. [1]
Конец37 157 065 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 17 (мышь)
Chr.Хромосома 17 (мышь) [2]
Хромосома 17 (мышь)
Геномное расположение EIF2AK2
Геномное расположение EIF2AK2
Группа17 E3 | 17 49,56 смНачинать78 852 564 п.н. [2]
Конец78 882 573 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК


Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• трансферазной активность
• активность протеинкиназы
• нуклеотид связывания
• не-трансмембранные активности протеинкиназы тирозина
• активность киназы
• белок серин / треонин киназа
• ГО: 0001948 связывания белка
• связывание двухцепочечного РНКА
• протеин - тирозин - киназа
• связывание АТФ
• эукариотический фактор инициации трансляции 2-альфа-киназная активность
• активность регулятора протеинфосфатазы
• связывание РНК
• идентичное связывание с белками
Сотовый компонент• цитоплазма
• рибосома
• мембрана
• перинуклеарная область цитоплазмы
• ядро клетки
• цитозоль
• цитозольная рибосома
Биологический процесс• негативная регуляция трансляции
• регуляция пролиферации гемопоэтических стволовых клеток
• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• биосинтез белка
• позитивная регуляция продукции цитокинов
• активация активности MAPKK
• процесс иммунной системы
• фосфорилирование
• клеточный ответ на аминокислотное голодание
• негативная регуляция апоптотического процесса
• уклонение или толерантность вируса к иммунному ответу хозяина
• положительная регуляция передачи сигналов NIK / NF-kappaB
• транскрипция, ДНК-шаблон
• эндоплазматический ретикулум развернутый белковый ответ
• фосфорилирование белка
• негативная регуляция репликации вирусного генома
• регуляция дифференцировки гемопоэтических стволовых клеток
• регуляция гемопоэтических клеток-предшественников
• позитивная регуляция активности фактора транскрипции NF-kappaB
• защитный ответ на вирус
• ответ на интерферон-альфа
• позитивная регуляция продукции хемокинов
• негативная регуляция пролиферации остеобластов
• аутофосфорилирование
• регуляция сборки комплекса инфламмасом NLRP3
• фосфорилирование пептидил-тирозина
• врожденная иммунная система
• вирусный процесс GO: 0022415
• ответ на токсичное вещество
• положительная регуляция стресс-активируемого каскада MAPK
• ответ на вирус
• регуляция инициации трансляции за счет фосфорилирования eIF2-альфа
• регуляция процесса апоптоза
• отрицательная регуляция пролиферация клеток
• регуляция активности фосфопротеинфосфатазы
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

5610

19106

Ансамбль

ENSG00000055332

ENSMUSG00000024079

UniProt

P19525

Q03963

RefSeq (мРНК)

NM_001135651
NM_001135652
NM_002759

NM_011163

RefSeq (белок)

NP_001129123
NP_001129124
NP_002750

NP_035293

Расположение (UCSC)Chr 2: 37,1 - 37,16 МбChr 17: 78,85 - 78,88 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

РНК-активируемая протеинкиназа, также известная как протеинкиназа R ( PKR ), интерферон-индуцированная, двухцепочечная РНК-активированная протеинкиназа или фактор инициации трансляции эукариот 2-альфа-киназа 2 ( EIF2AK2 ) - это фермент, который у человека кодируется EIF2AK2 гена . [5] [6]

PKR защищает от вирусных инфекций .

Механизм действия [ править ]

Протеинкиназа-R активируется двухцепочечной РНК (дцРНК), введенной в клетки вирусной инфекцией. PKR также может активироваться белком PACT или гепарином. PKR содержит N-концевой дцРНК-связывающий домен (dsRBD) и C-концевой киназный домен, что придает ему проапоптотические (убивающие клетки) функции. DsRBD состоит из двух тандемных копий консервативного мотива связывания двухцепочечной РНК, dsRBM1 и dsRBM2. PKR индуцируется интерфероном в латентном состоянии. Связывание с дсРНК полагают, активирует PKR, побуждая димеризации и последующего авто- фосфорилированиереакции. В ситуациях вирусной инфекции дцРНК, созданная вирусной репликацией и экспрессией гена, связывается с N-концевым доменом, активируя белок. После активации PKR способна фосфорилировать фактор инициации трансляции эукариот eIF2α.. Это подавляет дальнейшую трансляцию клеточной мРНК, тем самым предотвращая синтез вирусного белка. Поскольку ElF2α участвует в обычно инициирующей трансляции с кодона AUG, вместо этого имеет место альтернативная инициация, не связанная с AUG. Примером мРНК, использующей инициацию без AUG, являются мРНК для белков теплового шока. Активная PKR также способна опосредовать активацию фактора транскрипции NFkB путем фосфорилирования его ингибирующей субъединицы IkB. Активированный NFkB усиливает экспрессию цитокинов интерферона, которые работают для локального распространения противовирусного сигнала. Активный PKR также способен активировать опухолевый супрессор PP2A, который регулирует клеточный цикл и метаболизм. Благодаря сложным механизмам активная PKR также может вызывать апоптоз клеток , чтобы предотвратить дальнейшее распространение вируса.

Путь стресса PKR [ править ]

PKR находится в центре клеточного ответа на различные стрессовые сигналы, такие как патогены, недостаток питательных веществ, цитокинов, облучение, механический стресс или стресс ER . Путь PKR приводит к ответной реакции на стресс через активацию другого пути стресса, такого как JNK , p38 , NFkB , PP2A и фосфорилирование eIF2α . Стресс ER, вызванный избытком развернутых белков, приводит к воспалительным ответам. PKR способствует этому ответу, взаимодействуя с несколькими воспалительными киназами, такими как IKK, JNK, ElF2α, рецептором инсулина и другими. Этот метаболически активируемый воспалительный комплекс называется метаболическим инфламмасомой или метафламмасомой. [7] [8]PKR также участвует в митохондриальном ответе на развернутый белок (UPR mt ). Здесь PKR индуцируется фактором транскрипции AP-1 и активируется независимо от PACT. [9] В этом контексте было показано, что PKR имеет отношение к воспалению кишечника. [9]

Вирусная защита [ править ]

Вирусы разработали множество механизмов противодействия механизму PKR. Это может происходить с помощью дцРНК-приманки , деградации, сокрытия вирусной дцРНК , блока димеризации, дефосфорилирования субстрата или псевдосубстрата .

Например, вирус Эпштейна-Барра (EBV) использует ген EBER1 для производства дцРНК-приманки. Это приводит к таким видам рака, как лимфома Беркитта , болезнь Ходжкина , карцинома носоглотки и различные лейкемии .

Механизмы вирусной защиты против PKR
Тип защитыВирусМолекула
ДцРНК-приманкаАденовирусVAI РНК
Вирус Эпштейна-БарраEBER
ВИЧТАР
Деградация PKRПолиовирус2А про
скрыть вирусную дцРНКВирус осповакциныE3L
Реовирусσ3
Вирус гриппаNS1
Блок димеризацииВирус гриппаp58 IPK
Вирус гепатита сNS5A
ПсевдоподложкаВирус осповакциныK3L
ВИЧTat
Дефосфорилирование субстратаВирус простого герпесаICP34.5

Память и обучение [ править ]

У мышей с нокаутом PKR или ингибированием PKR у мышей улучшается память и обучение. [10]

Болезнь нейрональной дегенерации [ править ]

Первое сообщение в 2002 году показало, что иммуногистохимический маркер фосфорилированной PKR и eIF2α положительно отображается в дегенерирующих нейронах гиппокампа и лобной коры головного мозга пациентов с болезнью Альцгеймера (AD), что указывает на связь между PKR и AD. Кроме того, многие из этих нейронов также были иммуноокрашены антителом к ​​фосфорилированному белку тау-белка . [11] Активированная PKR была специфически обнаружена в цитоплазме и ядре, а также совместно локализована с нейрональными маркерами апоптоза. [12] Дальнейшие исследования оценили уровни PKR в крови и спинномозговой жидкости.(CSF) пациентов с БА и контрольной группы. Результат анализа концентраций общей и фосфорилированной PKR (pPKR) в мононуклеарных клетках периферической крови (PBMC) у 23 пациентов с БА и 19 контрольных лиц показал статистически значимое повышение уровней отношения фосфорилированных PKR / PKR у пациентов с БА по сравнению с контроль. [13] Оценка биомаркеров спинномозговой жидкости , таких как Aβ1-42 , Aβ1-40., Тау-белок и фосфорилированный тау-белок по треонину 181 были подтверждены в клинических исследованиях и в рутинной практике для определения наличия у пациентов аномалий спинномозговой жидкости и поражений головного мозга БА. Исследование показало, что «общие концентрации PKR и pPKR были повышены у субъектов с БА и амнестическими легкими когнитивными нарушениями со значением pPKR (единицы оптической плотности), отличающим пациентов с БА от контрольных субъектов с чувствительностью 91,1% и специфичностью 94,3%. Среди БА. У пациентов, общие уровни PKR и pPKR коррелируют с уровнями p181tau в CSF. У некоторых пациентов с AD с нормальными уровнями CSF Aß, T-tau или p181tau наблюдались аномальные уровни общих PKR и pPKR ». [14] Был сделан вывод, что проапоптотический путь PKR-eIF2α может участвовать в дегенерации нейронов. что приводит к различным невропатологическим поражениям в зависимости от восприимчивости нейронов.

PKR и бета-амилоид

Активация PKR может вызывать накопление амилоидного β-пептида (Aβ) посредством дерепрессии экспрессии BACE1 (ß-сайт расщепляющего фермента АРР) у пациентов с болезнью Альцгеймера. [15] Обычно 5'-нетранслируемая область (5'UTR) в промоторе BACE1 фундаментально подавляет экспрессию гена BACE1. Однако экспрессия BACE1 может быть активирована фосфорилированием eIF2a, которое отменяет ингибирующий эффект, оказываемый BACE1 5'UTR. Фосфорилирование eIF2a запускается активацией PKR. Вирусная инфекция, такая как вирус простого герпеса (ВПГ), или окислительный стресс могут увеличивать экспрессию BACE1 за счет активации пути PKR-eIF2a. [16]

Кроме того, повышенная активность BACE1 может также приводить к β-расщепленному карбоксиконцевому фрагменту белка-предшественника β-амилоида (APP-βCTF), вызывающему дисфункцию эндосом при AD. [17] Эндосомы являются высокоактивными сайтами процессинга белка-предшественника β-амилоида (АРР), и аномалии эндосом связаны с повышенной экспрессией раннего эндосомного регулятора rab5 . Это самые ранние известные нейронные реакции при БА, связанные с заболеванием. Повышенная активность BACE1 приводит к синтезу APP-βCTF. Затем повышенный уровень βCTF вызывает чрезмерную активацию rab 5. βCTF рекрутирует APPL1 в эндосомы rab5, где он стабилизирует активный GTP-rab5, что приводит к патологически ускоренному эндоцитозу, набуханию эндосом и избирательному нарушению аксонального транспорта эндосом rab5.

PKR и фосфорилирование тау-белка

Ранее сообщалось, что фосфорилированный PKR может совместно локализоваться с фосфорилированным белком тау в пораженных нейронах. [18] [11] Известно, что ингибитор протеинфосфатазы-2A (ингибитор PP2A) - окадаиновая кислота (OA) - увеличивает фосфорилирование тау, отложение Aβ и гибель нейронов. Исследовано, что ОА также индуцирует фосфорилирование PKR и, следовательно, фосфорилирование eIF2a. Затем фосфорилирование eIF2a индуцирует активацию фактора транскрипции 4 (ATF4), который вызывает апоптоз и ядерную транслокацию, способствуя гибели нейронов. [19]

Гликоген-синтаза-киназа Aβ (GSK-3β) отвечает за фосфорилирование тау-белка и контролирует несколько клеточных функций, включая апоптоз. Другое исследование продемонстрировало, что лечение туникамицином или Aβ может индуцировать активацию PKR в клетках нейробластомы человека и может запускать активацию GSK3β, а также фосфорилирование тау. Они обнаружили, что в мозге с БА как активированные PKR, так и GSK3β совместно локализуются с фосфорилированным тау в нейронах. В культурах клеток SH-SY5Y туникамицин и Aβ (1-42) активируют PKR, которая затем может модулировать активацию GSK-3β и индуцировать фосфорилирование тау, апоптоз. Все эти процессы ослабляются ингибиторами PKR или siRNA PKR . PKR может представлять собой важную сигнальную точку, передающую сигналы стресса в нейрональные пути, взаимодействуя сфактор транскрипции или косвенно контролирующий активацию GSK3β, что приводит к клеточной дегенерации при БА. [20]

Фетальный алкогольный синдром [ править ]

PKR также опосредует индуцированное этанолом ингибирование синтеза белка и апоптоз, который связан с алкогольным синдромом плода. [21]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что протеинкиназа R взаимодействует с:

  • ASK1 , [22]
  • DNAJC3 , [23]
  • ILF3 , [24] [25] [26] [27]
  • METAP2 , [28]
  • P53 , [29]
  • PPP1CA , [30]
  • ПРКРА , [31] [32]
  • STAT1 , [33] [34] и
  • TARBP2 . [35] [36]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000055332 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024079 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ "Entrez Gene: EIF2AK2 фактор инициации трансляции эукариот 2-альфа-киназа 2" .
  6. ↑ Feng GS, Chong K, Kumar A, Williams BR (июнь 1992 г.). «Идентификация двухцепочечных РНК-связывающих доменов в интерферон-индуцированной двухцепочечной РНК-активируемой киназе р68» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 89 (12): 5447–51. DOI : 10.1073 / pnas.89.12.5447 . PMC 49309 . PMID 1351683 .  
  7. ↑ Гарсия М.А., Гил Дж., Вентосо I, Герра С., Доминго Е., Ривас С., Эстебан М. (декабрь 2006 г.). «Влияние протеинкиназы PKR на клеточную биологию: от противовирусного к антипролиферативному действию» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 70 (4): 1032–60. DOI : 10.1128 / MMBR.00027-06 . PMC 1698511 . PMID 17158706 .  
  8. ^ Hotamisligil GS (март 2010). «Стресс эндоплазматического ретикулума и воспалительные основы нарушения обмена веществ» . Cell . 140 (6): 900–17. DOI : 10.1016 / j.cell.2010.02.034 . PMC 2887297 . PMID 20303879 .  
  9. ^ а б Рат Э, Бергер Э, Месслик А., Нуньес Т., Лю Б., Ким С.К. и др. (Сентябрь 2012 г.). «Индукция дцРНК-активированной протеинкиназы связывает митохондриальный ответ развернутого белка с патогенезом воспаления кишечника» . Кишечник . 61 (9): 1269–1278. DOI : 10.1136 / gutjnl-2011-300767 . PMC 4514769 . PMID 21997551 .  
  10. ^ Zhu PJ, Huang W, Kalikulov D, Yoo JW, Плачек А.Н., Стоика L, Чжоу H, Bell JC, Фридлендер MJ, Krnjević K, Небельс JL, Коста-Маттиоли M (декабрь 2011). «Подавление PKR способствует возбудимости сети и улучшению познания за счет растормаживания, опосредованного интерфероном-γ» . Cell . 147 (6): 1384–96. DOI : 10.1016 / j.cell.2011.11.029 . PMC 3569515 . PMID 22153080 . Краткое содержание - canada.com .  
  11. ↑ a b Chang RC, Wong AK, Ng HK, Hugon J (декабрь 2002 г.). «Фосфорилирование эукариотического фактора инициации-2альфа (eIF2alpha) связано с дегенерацией нейронов при болезни Альцгеймера». NeuroReport . 13 (18): 2429–32. DOI : 10.1097 / 00001756-200212200-00011 . PMID 12499843 . 
  12. ^ Page G, Rioux Bilan A, Ingrand S, Lafay-Chebassier C, Pain S, Perault Pochat MC, Bouras C, Bayer T, Hugon J (2006). «Активированная двухцепочечная РНК-зависимая протеинкиназа и гибель нейронов в моделях болезни Альцгеймера». Неврология . 139 (4): 1343–54. DOI : 10.1016 / j.neuroscience.2006.01.047 . PMID 16581193 . S2CID 36700744 .  
  13. ^ Paccalin М, Боль-Barc S, Pluchon С, Пол С, Бессон М.Н., Carret-Rebillat А.С., Rioux-Билан А, Жиль R, Hugon J (2006). «Активированные киназы mTOR и PKR в лимфоцитах коррелируют с ухудшением памяти и когнитивных функций при болезни Альцгеймера». Деменция и гериатрические когнитивные расстройства . 22 (4): 320–6. DOI : 10.1159 / 000095562 . PMID 16954686 . S2CID 45647507 .  
  14. ^ Мутон-Liger Р, Паке С, Dumurgier Дж, Lapalus Р, Р - серый, Лапланш ДЛ, Hugon J (май 2012). «Повышенные уровни спинномозговой жидкости двухцепочечной РНК-зависимой протеинкиназы при болезни Альцгеймера». Биологическая психиатрия . 71 (9): 829–35. DOI : 10.1016 / j.biopsych.2011.11.031 . PMID 22281122 . S2CID 21131086 .  
  15. ^ Недозволенной Рага G, Palomer Е, Возняк М.А., Рамос-Фернандес Е, Бош-Морато М, Tajes М, Guix FX, Галан JJ, Clarimón Дж, Антунесли С, Реальным Л.М., Боад М, Ицхаки РФ, Fandos С, Муньос FJ (28 июня 2011 г.). «Активация PKR вызывает накопление амилоидного ß-пептида посредством дерепрессии экспрессии BACE1» . PLOS ONE . 6 (6): e21456. DOI : 10.1371 / journal.pone.0021456 . PMC 3125189 . PMID 21738672 .  
  16. ^ Мутон-Liger Р, Паке С, Dumurgier Дж, Bouras С, Прадье л, серый F, J Hugon (июнь 2012). «Окислительный стресс увеличивает уровни белка BACE1 за счет активации пути PKR-eIF2α» . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Молекулярная основа болезни . 1822 (6): 885–96. DOI : 10.1016 / j.bbadis.2012.01.009 . PMID 22306812 . 
  17. ↑ Kim S, Sato Y, Mohan PS, Peterhoff C, Pensalfini A, Rigoglioso A, Jiang Y, Nixon RA (май 2016). «Доказательства того, что эффектор APPL1 rab5 опосредует APP-βCTF-индуцированную дисфункцию эндосом при синдроме Дауна и болезни Альцгеймера» . Молекулярная психиатрия . 21 (5): 707–16. DOI : 10.1038 / mp.2015.97 . PMC 4721948 . PMID 26194181 .  
  18. Перейти ↑ Peel AL, Bredesen DE (октябрь 2003 г.). «Активация киназы клеточного стресса PKR у трансгенных мышей с болезнью Альцгеймера и человеческим трансгенным белком-предшественником амилоида». Нейробиология болезней . 14 (1): 52–62. DOI : 10.1016 / S0969-9961 (03) 00086-X . PMID 13678666 . S2CID 13109874 .  
  19. ^ Ким SM, Yoon SY, Choi JE, Парк JS, Choi JM, Нгуен T, Ким DH (сентябрь 2010). «Активация а-киназ фактора инициации эукариот-2 в нейронах, обработанных окадаиновой кислотой». Неврология . 169 (4): 1831–9. DOI : 10.1016 / j.neuroscience.2010.06.016 . PMID 20600673 . S2CID 207248721 .  
  20. Перейти ↑ Bose A, Mouton-Liger F, Paquet C, Mazot P, Vigny M, Gray F, Hugon J (март 2011). «Модуляция тау-фосфорилирования с помощью киназы PKR: последствия болезни Альцгеймера». Патология головного мозга . 21 (2): 189–200. DOI : 10.1111 / j.1750-3639.2010.00437.x . PMID 21029237 . S2CID 39517621 .  
  21. ↑ Chen G, Ma C, Bower KA, Ke Z, Luo J (июнь 2006 г.). «Взаимодействие между RAX и PKR модулирует эффект этанола на синтез белка и выживаемость нейронов» . Журнал биологической химии . 281 (23): 15909–15. DOI : 10.1074 / jbc.M600612200 . PMID 16574643 . 
  22. ^ Такидзав T, Tatematsu C, Наканисуйте Y (декабрь 2002). «Двухцепочечная РНК-активируемая протеинкиназа взаимодействует с киназой 1, регулирующей сигнал апоптоза». Влияние на пути передачи сигналов апоптоза ». Европейский журнал биохимии . 269 (24): 6126–32. DOI : 10.1046 / j.1432-1033.2002.03325.x . PMID 12473108 . 
  23. ^ Поляк SJ, Тан N, M Wambach, Barber Г.Н., Катец М.Г. (январь 1996). «Комплексы клеточного ингибитора P58 с индуцированной интерфероном двухцепочечной РНК-зависимой протеинкиназой, PKR, для регулирования ее аутофосфорилирования и активности» . Журнал биологической химии . 271 (3): 1702–7. DOI : 10.1074 / jbc.271.3.1702 . PMID 8576172 . 
  24. ^ Сондерс LR, Perkins DJ, Balachandran S, Michaels R, Ford R, Майеда A, Barber GN (август 2001). «Характеристика двух эволюционно консервативных, альтернативно сплайсированных ядерных фосфопротеинов, NFAR-1 и -2, которые участвуют в процессинге мРНК и взаимодействуют с двухцепочечной РНК-зависимой протеинкиназой, PKR» . Журнал биологической химии . 276 (34): 32300–12. DOI : 10.1074 / jbc.M104207200 . PMID 11438536 . 
  25. ^ Langland JO, Kao PN, Jacobs BL (май 1999). «Ядерный фактор-90 активированных Т-клеток: двухцепочечный РНК-связывающий белок и субстрат для двухцепочечной РНК-зависимой протеинкиназы, PKR». Биохимия . 38 (19): 6361–8. DOI : 10.1021 / bi982410u . PMID 10320367 . 
  26. Перейти ↑ Parker LM, Fierro-Monti I, Mathews MB (август 2001). «Ядерный фактор 90 является субстратом и регулятором киназы эукариотического фактора инициации 2, двухцепочечной РНК-активируемой протеинкиназы» . Журнал биологической химии . 276 (35): 32522–30. DOI : 10.1074 / jbc.M104408200 . PMID 11438540 . 
  27. ↑ Patel RC, Vestal DJ, Xu Z, Bandyopadhyay S, Guo W, Erme SM, Williams BR, Sen GC (июль 1999 г.). «DRBP76, двухцепочечный РНК-связывающий ядерный белок, фосфорилируется интерферон-индуцированной протеинкиназой PKR» . Журнал биологической химии . 274 (29): 20432–7. DOI : 10.1074 / jbc.274.29.20432 . PMID 10400669 . 
  28. Перейти ↑ Gil J, Esteban M, Roth D (декабрь 2000 г.). «Регулирование in vivo дцРНК-зависимой протеинкиназы PKR клеточным гликопротеином p67». Биохимия . 39 (51): 16016–25. DOI : 10.1021 / bi001754t . PMID 11123929 . 
  29. ^ Cuddihy AR, Вонг AH, Tam NW, Ли S, Koromilas AE (апрель 1999). «Двухцепочечная РНК-активированная протеинкиназа PKR физически связывается с опухолевым супрессорным белком p53 и фосфорилирует человеческий p53 по серину 392 in vitro» . Онкоген . 18 (17): 2690–702. DOI : 10.1038 / sj.onc.1202620 . PMID 10348343 . 
  30. ^ Tan SL, SU Тарин, Melville МВт, Блейк CM, Катец MG (сентябрь 2002). «Прямое связывание каталитической субъединицы протеинфосфатазы 1 с протеинкиназой PKR необходимо, но не достаточно для инактивации и нарушения образования димера фермента» . Журнал биологической химии . 277 (39): 36109–17. DOI : 10.1074 / jbc.M205109200 . PMID 12138106 . 
  31. Перейти ↑ Huang X, Hutchins B, Patel RC (август 2002). «С-концевой, третий консервативный мотив белкового активатора PACT играет важную роль в активации двухцепочечной РНК-зависимой протеинкиназы (PKR)» . Биохимический журнал . 366 (Pt 1): 175–86. DOI : 10.1042 / BJ20020204 . PMC 1222748 . PMID 11985496 .  
  32. ^ Patel RC, Sen GC (август 1998). «PACT, белковый активатор интерферон-индуцированной протеинкиназы PKR» . Журнал EMBO . 17 (15): 4379–90. DOI : 10.1093 / emboj / 17.15.4379 . PMC 1170771 . PMID 9687506 .  
  33. ^ Вонг AH, Tam NW, Ян Ю.Л., Cuddihy AR, Ли S, S Кирхгофа, Hauser H, T Decker, Koromilas AE (март 1997). «Физическая связь между STAT1 и интерферон-индуцируемой протеинкиназой PKR и последствия для путей передачи сигналов интерферона и двухцепочечной РНК» . Журнал EMBO . 16 (6): 1291–304. DOI : 10.1093 / emboj / 16.6.1291 . PMC 1169727 . PMID 9135145 .  
  34. ↑ Wong AH, Durbin JE, Li S, Dever TE, Decker T, Koromilas AE (апрель 2001 г.). «Усиленные противовирусные и антипролиферативные свойства мутанта STAT1, неспособного взаимодействовать с протеинкиназой PKR» . Журнал биологической химии . 276 (17): 13727–37. DOI : 10.1074 / jbc.M011240200 . PMID 11278865 . 
  35. ^ Cosentino GP, Venkatesan S, Serluca FC, Green SR, Mathews MB, Sonenberg N (октябрь 1995). «Двухцепочечная РНК-зависимая протеинкиназа и РНК-связывающий белок TAR образуют гомо- и гетеродимеры in vivo» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (21): 9445–9. DOI : 10.1073 / pnas.92.21.9445 . PMC 40818 . PMID 7568151 .  
  36. ^ Дахер А., Лонге М, Дорин Д., Буа Ф, Сегерал Е, Баннварт С., Баттисти П.Л., Перселл Д.Ф., Бенароус Р., Вакеро С., Мерс EF, Гатиньол А (сентябрь 2001 г.). «Два домена димеризации в РНК-связывающем белке (TRBP) ответа на трансактивацию индивидуально обращают обратное ингибирование протеинкиназой R экспрессии длинных концевых повторов ВИЧ-1» . Журнал биологической химии . 276 (36): 33899–905. DOI : 10.1074 / jbc.M103584200 . PMID 11438532 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Уильямс BR (ноябрь 1999 г.). «PKR; сигнальная киназа для клеточного стресса» . Онкоген . 18 (45): 6112–20. DOI : 10.1038 / sj.onc.1203127 . PMID  10557102 .
  • Гарсия М.А., Мерс Э.Ф., Эстебан М. (2007). «Протеинкиназа дцРНК PKR: вирус и клеточный контроль». Биохимия . 89 (6–7): 799–811. DOI : 10.1016 / j.biochi.2007.03.001 . PMID  17451862 .
  • Томис, округ Колумбия, Духан Дж. П., Самуэль К.Э. (май 1992 г.). «Механизм действия интерферона: структура кДНК, экспрессия и регуляция интерферон-индуцированной РНК-зависимой протеинкиназы P1 / eIF-2 альфа из клеток человека». Вирусология . 188 (1): 33–46. DOI : 10.1016 / 0042-6822 (92) 90732-5 . PMID  1373553 .
  • Маккормак SJ, Томис, округ Колумбия, Самуэль CE (май 1992 г.). «Механизм действия интерферона: идентификация РНК-связывающего домена в N-концевой области РНК-зависимой протеинкиназы P1 / eIF-2 альфа человека». Вирусология . 188 (1): 47–56. DOI : 10.1016 / 0042-6822 (92) 90733-6 . PMID  1373554 .
  • Меллор Х., Гордый К.Г. (июль 1991 г.). «Синтетический пептидный субстрат для киназ фактора инициации-2». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 178 (2): 430–7. DOI : 10.1016 / 0006-291X (91) 90125-Q . PMID  1677563 .
  • Мерс Э., Чонг К., Галабру Дж., Томас Н.С., Керр И.М., Уильямс Б.Р., Ованесиан А.Г. (июль 1990 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика человеческой двухцепочечной РНК-активированной протеинкиназы, индуцированной интерфероном». Cell . 62 (2): 379–90. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (90) 90374-N . PMID  1695551 . S2CID  20477995 .
  • Сильверман Р. Х., Сенгупта Д. Н. (1991). «Регулирование трансляции с помощью лидерной РНК ВИЧ, ТАТ и ферментов, индуцируемых интерфероном». Журнал экспериментальной патологии . 5 (2): 69–77. PMID  1708818 .
  • Рой С., Катце М.Г., Паркин Н.Т., Эдери И., Ованесян А.Г., Зоненберг Н. (март 1990 г.). «Контроль интерферон-индуцированной протеинкиназы 68 килодальтон с помощью продукта гена tat ВИЧ-1». Наука . 247 (4947): 1216–9. DOI : 10.1126 / science.2180064 . PMID  2180064 .
  • Макмиллан Н.А., Чун Р.Ф., Сидеровски Д.П., Галабру Дж., Тун В.М., Самуэль С.Е., Мак Т.В., Хованесян А.Г., Джанг К.Т., Уильямс Б.Р. (ноябрь 1995 г.). «Tat ВИЧ-1 напрямую взаимодействует с индуцированной интерфероном двухцепочечной РНК-зависимой киназой, PKR». Вирусология . 213 (2): 413–24. DOI : 10.1006 / viro.1995.0014 . PMID  7491766 .
  • Барбер Г. Н., Эдельхофф С., Катце М. Г., Disteche CM (июнь 1993 г.). «Хромосомное отнесение интерферон-индуцируемой двухцепочечной РНК-зависимой протеинкиназы (PRKR) к хромосоме 2p21-p22 человека и хромосоме 17 E2 мыши». Геномика . 16 (3): 765–7. DOI : 10.1006 / geno.1993.1262 . PMID  7686883 .
  • Сквайр Дж., Мерс Э. Ф., Чонг К. Л., Макмиллан Н. А., Хованесян А. Г., Уильямс Б. Р. (июнь 1993 г.). «Локализация человеческого интерферон-индуцированного гена киназы р68 (PRKR), активируемого дц-РНК, в хромосоме 2p21-p22». Геномика . 16 (3): 768–70. DOI : 10.1006 / geno.1993.1263 . PMID  7686884 .
  • Пригмор Э., Ахмед С., Бест А., Козма Р., Мансер Э, Сигал А. В., Лим Л. (май 1995 г.). «Киназа 68 кДа и компонент NADPH-оксидазы p67phox являются мишенями для Cdc42Hs и Rac1 в нейтрофилах» . Журнал биологической химии . 270 (18): 10717–22. DOI : 10.1074 / jbc.270.18.10717 . PMID  7738010 .
  • Барбер Г.Н., Вамбах М., Вонг М.Л., Девер Т.Е., Хиннебуш А.Г., Катце М.Г. (май 1993 г.). «Регуляция трансляции с помощью интерферон-индуцированной двухцепочечной РНК-активируемой протеинкиназы 68 кДа» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 90 (10): 4621–5. DOI : 10.1073 / pnas.90.10.4621 . PMC  46564 . PMID  8099444 .
  • Чен З.Дж., Родитель Л., Маниатис Т. (март 1996 г.). «Сайт-специфическое фосфорилирование IkappaBalpha с помощью новой убиквитинирующей протеинкиназной активности». Cell . 84 (6): 853–62. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81064-8 . PMID  8601309 . S2CID  112412 .
  • Kuhen KL, Shen X, Carlisle ER, Richardson AL, Weier HU, Tanaka H, ​​Samuel CE (август 1996). «Структурная организация человеческого гена (PKR), кодирующего интерферон-индуцируемую РНК-зависимую протеинкиназу (PKR), и отличия от его гомолога мыши». Геномика . 36 (1): 197–201. DOI : 10.1006 / geno.1996.0446 . PMID  8812437 .
  • Тейлор Д.Р., Ли С.Б., Романо П.Р., Маршак Д.Р., Хиннебуш АГ, Эстебан М., Мэтьюз М.Б. (ноябрь 1996 г.). «Сайты аутофосфорилирования участвуют в активации двухцепочечной РНК-активируемой протеинкиназы PKR» . Молекулярная и клеточная биология . 16 (11): 6295–302. DOI : 10.1128 / mcb.16.11.6295 . PMC  231632 . PMID  8887659 .
  • Кухен К.Л., Шен Х, Самуэль К.Э. (октябрь 1996 г.). «Механизм действия интерферона, последовательность человеческой интерферон-индуцируемой РНК-зависимой протеинкиназы (PKR), выведенная из геномных клонов». Джин . 178 (1–2): 191–3. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (96) 00314-9 . PMID  8921913 .