| Роданский домен | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Роданский | ||||||||
| Pfam | PF00581 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR001763 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00322 | ||||||||
| SCOP2 | 2ora / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| OPM суперсемейство | 413 | ||||||||
| Белок OPM | 2mpn | ||||||||
| CDD | cd00158 | ||||||||
| Мембранома | 571 | ||||||||
| |||||||||
Роданезы , также известные как rhodanase , тиосульфат sulfurtransferase , тиосульфат цианид transsulfurase и тиосульфат thiotransferase , [1] является митохондриальным ферментом , который выводит токсины цианида (CN - ) , путь преобразования его в тиоцианата (SCN - ). [2]
Реакция протекает в два этапа. На диаграмме справа показана кристаллографически определенная структура роданезы. На первой стадии тиосульфат восстанавливается тиоловой группой цистеина- 247 1 с образованием персульфида и сульфита 2 . На втором этапе персульфид реагирует с цианидом с образованием тиоцианата, регенерируя цистеин тиол 1 . [3]
Эта реакция важна для лечения воздействия цианида, так как образующийся тиоцианат токсичен примерно на 1/200. [4] : с. 15938 Использование раствора тиосульфата в качестве противоядия при отравлении цианидом основано на активации этого ферментативного цикла.
Роданезия разделяет эволюционные отношения с большим семейством белков, включая
- Каталитический домен фосфатазы Cdc25.
- некаталитические домены эукариотических MAPK-фосфатаз с двойной специфичностью
- некаталитические домены дрожжевых PTP-типа MAPK-фосфатаз
- некаталитические домены дрожжей Ubp4, Ubp5, Ubp7
- некаталитические домены Ubp-Y млекопитающих
- Белок теплового шока дрозофилы HSP-67BB
- несколько белков бактериального холодового шока и фагового шока
- белки, связанные со старением растений
- каталитические и некаталитические домены роданезы [5]
Роданезия имеет внутреннее дублирование. Этот домен находится в виде единственной копии в других белках, включая фосфатазы и С-концевые гидролазы убиквитина. [6]
Белки человека, содержащие этот домен [ править ]
CDC25A ; CDC25B ; CDC25C ; ДУСП ; DUSP1 ; DUSP10 ; DUSP16 ; DUSP2 ; DUSP4 ; DUSP5 ; DUSP6 ; DUSP7 ; КАТ ; MKP7 ; MOCS3 ; МПСТ ; TBCK ; ЦГА14 ; TST ; USP8 ;
Номенклатура [ править ]
Хотя стандартные правила номенклатуры для ферментов указывают, что их названия должны заканчиваться буквами «-аза», роданеза была впервые описана в 1933 году [7], до создания Комиссии по ферментам в 1955 году; как таковое, старое название уже получило широкое распространение.
Тиосульфат серотрансфераза [ править ]
| тиосульфат-серотрансфераза | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Номер ЕС | 2.8.1.1 | ||||||||
| Количество CAS | 9026-04-4 | ||||||||
| Базы данных | |||||||||
| IntEnz | Просмотр IntEnz | ||||||||
| BRENDA | BRENDA запись | ||||||||
| ExPASy | Просмотр NiceZyme | ||||||||
| КЕГГ | Запись в KEGG | ||||||||
| MetaCyc | метаболический путь | ||||||||
| ПРИАМ | профиль | ||||||||
| Структуры PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Генная онтология | Amigo / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
В энзимологии , A тиосульфат sulfurtransferase ( ЕС 2.8.1.1 ) представляет собой фермент , который катализирует в химическую реакцию
- тиосульфат + цианид сульфит + тиоцианат
Таким образом, двумя субстратами этого фермента являются тиосульфат и цианид , а двумя его продуктами являются сульфит и тиоцианат .
Номенклатура [ править ]
Этот фермент принадлежит к семейству трансфераз , а именно к серотрансферазам, которые переносят серосодержащие группы. Систематическое название данного фермента класса тиосульфат: цианид sulfurtransferase. Другие широко используемые названия включают тиосульфатцианид транссульфуразу, тиосульфаттиотрансферазу, роданезу и роданазу.
Ссылки [ править ]
- ^ EC 2.8.1.1 , Международный союз биохимии и молекулярной биологии
- ^ Cipollone R, Ascenzi P, P Tomao, Imperi F, P Виска (2008). «Ферментативная детоксикация цианида: ключи от Pseudomonas aeruginosa Rhodanese». Журнал молекулярной микробиологии и биотехнологии . 15 (2–3): 199–211. DOI : 10.1159 / 000121331 . PMID 18685272 . S2CID 25431686 .
- ^ Cipollone R, Ascenzi P, P Tomao, Imperi F, P Виска (2008). «Ферментативная детоксикация цианида: ключи от Pseudomonas aeruginosa Rhodanese». Журнал молекулярной микробиологии и биотехнологии . 15 (2–3): 199–211. DOI : 10.1159 / 000121331 . PMID 18685272 . S2CID 25431686 .
- ^ Jaszczak Е, Polkowska г, Narkowicz S, Namieśnik J (июль 2017 г.). «Цианиды в окружающей среде - анализ - проблемы и вызовы» . Международная ассоциация экологических наук и исследований загрязнения . 24 (19): 15929–15948. DOI : 10.1007 / s11356-017-9081-7 . PMC 5506515 . PMID 28512706 .
- ^ «Тиосульфат серотрансфераза, консервативный сайт (IPR001307)» . EMBL-EBI . ИнтерПро.
- ^ Gliubich F, Gazerro M, Zanotti G, Delbono S, Бомбьери G, Berni R (август 1996). «Особенности структуры активного центра для химически модифицированных форм роданезы» . Журнал биологической химии . 271 (35): 21054–61. DOI : 10.1074 / jbc.271.35.21054 . PMID 8702871 .
- ^ Cipollone R, Ascenzi P, P Виска (февраль 2007). «Общие темы и вариации в надсемействе роданских». IUBMB Life . 59 (2): 51–9. DOI : 10.1080 / 15216540701206859 . PMID 17454295 .
Внешние ссылки [ править ]
 | Викискладе есть медиафайлы по теме роданского языка . |
- Роданский язык в Национальной медицинской библиотеке США по предметным медицинским рубрикам (MeSH)
