Эта статья требует дополнительных ссылок для проверки . ( июль 2011 г. ) |
Внутригеномный конфликт относится к эволюционному феномену, при котором гены обладают фенотипическими эффектами, которые способствуют их собственной передаче в ущерб передаче других генов, находящихся в том же геноме . [1] [2] [3] [4] Теория эгоистичных генов постулирует, что естественный отбор увеличит частоту тех генов, фенотипические эффекты которых вызывают их передачу новым организмам, и большинство генов достигают этого, сотрудничая с другими генами в том же самом геном для построения организма, способного воспроизводить и / или помогать родству в воспроизводстве.[5] Предположение о преобладании внутригеномного сотрудничества лежит в основе концепции инклюзивной приспособленности, ориентированной на организм. Однако конфликт между генами в одном и том же геноме может возникать как в событиях, связанных с воспроизводством ( эгоистичный ген может «обмануть» и увеличить свое присутствие в гаметах или потомстве сверх ожидаемого в соответствии со справедливой менделевской сегрегацией и справедливым гаметогенезом ), так и альтруизмом (гены в том же геноме могут не соглашаться относительно того, как оценивать другие организмы в контексте помощи родным, потому что коэффициенты родства различаются между генами в одном и том же геноме). [6] [7] [8]
Аутосомные гены обычно имеют одинаковый способ передачи у видов, размножающихся половым путем из-за справедливости менделевской сегрегации , но конфликты между аллелями аутосомных генов могут возникать, когда аллель изменяет во время гаметогенеза (искажение сегрегации) или удаляет эмбрионы, которые его не содержат ( летальные материнские эффекты). Аллель также может напрямую преобразовывать свой конкурирующий аллель в свою копию (самонаводящиеся эндонуклеазы). Наконец, мобильные генетические элементы полностью обходят менделевскую сегрегацию, имея возможность вставлять новые копии самих себя в новые позиции в геноме (транспозоны).
В принципе, вероятность присутствия двух родительских аллелей в зрелой гамете одинакова . Однако существует несколько механизмов, которые приводят к неравномерной передаче родительских аллелей от родителей к потомству. Одним из примеров является ген, называемый нарушителем сегрегации , который «обманывает» во время мейоза или гаметогенеза и, таким образом, присутствует более чем в половине функциональных гамет. Наиболее изученными примерами являются sd у Drosophila melanogaster ( плодовая муха ), [9] гаплотип t у Mus musculus ( мышь ) и sk у Neurospora.виды ( грибок ). О возможных примерах сообщалось также у людей. [10] Нарушители сегрегации, присутствующие в половых хромосомах (как в случае с Х-хромосомой у некоторых видов дрозофил [11] [12] ), называются искажателями соотношения полов, поскольку они вызывают смещение соотношения полов у потомков физическое лицо-носитель.
Простейшая модель мейотического влечения включает два тесно связанных локуса: локус Killer и локус Target . Набор искажающих сегрегацию состоит из аллеля Killer (в локусе Killer ) и аллеля Resistant (в целевом локусе), в то время как его конкурирующий набор состоит из аллелей Non-killer и Non- Resistant.. Таким образом, набор нарушителей сегрегации производит токсин, к которому он сам устойчив, в то время как его конкурент - нет. Таким образом, он убивает те гаметы, которые содержат конкурирующий набор, и его частота увеличивается. Тесная связь между этими локусами имеет решающее значение, поэтому эти гены обычно лежат в областях генома с низкой рекомбинацией.
Другие системы не связаны с деструкцией гамет, а скорее используют асимметрию мейоза у самок: ведущий аллель с вероятностью больше половины попадает в ооцит, а не в полярные тельца . Это называется истинным мейотическим драйвом , поскольку он не зависит от постмейотического механизма. Наиболее изученными примерами являются неоцентромеры ( выступы ) кукурузы, а также несколько хромосомных перестроек у млекопитающих. Общая молекулярная эволюция центромер , вероятно, включает такие механизмы.
Ген Medea вызывает смерть потомства от гетерозиготной матери, которое не наследует его. Встречается у мучного жука ( Tribolium castaneum ). [13] Эгоистичные гены материнского эффекта были успешно синтезированы в лаборатории. [14]
Транспозоны - это автономные реплицирующиеся гены, которые кодируют способность перемещаться в новые позиции в геноме и, следовательно, накапливаться в геномах. Они воспроизводят себя, несмотря на то, что наносят ущерб остальному геному. Их часто называют «прыгающими генами» или паразитарной ДНК, и они были обнаружены Барбарой МакКлинток в 1944 году.
Гены самонаводящейся эндонуклеазы (HEG) превращают свой конкурирующий аллель в свою копию и, таким образом, наследуются почти всеми дочерними мейотическими клетками гетерозиготной клетки. Они достигают этого, кодируя эндонуклеазу, которая разрушает конкурирующий аллель. Этот разрыв восстанавливается с использованием последовательности HEG в качестве шаблона. [15]
HEG кодируют специфичные для последовательности эндонуклеазы. Последовательность узнавания (RS) имеет длину 15–30 п.н. и обычно встречается один раз в геноме. HEG расположены в середине своих собственных последовательностей распознавания. Большинство HEG кодируются самосплайсинговыми интронами (группы I и II) и интеинами . Интеины - это внутренние фрагменты белка, полученные в результате сплайсинга белков, обычно содержащие эндонуклеазную и сплайсинговую активности. Аллель без HEG расщепляется самонаводящейся эндонуклеазой, а двухцепочечный разрыв репарируется путем гомологичной рекомбинации (преобразования гена) с использованием аллеля, содержащего HEG, в качестве матрицы. Обе хромосомы будут содержать HEG после ремонта. [16]
В-хромосомы - несущественные хромосомы ; не гомологичен какому-либо члену нормального (A) набора хромосом; морфологически и структурно отличается от А; и они передаются с более высокой, чем ожидалось, частотой, что приводит к их накоплению в потомстве. В некоторых случаях есть веские доказательства того, что они просто эгоистичны и существуют как паразитические хромосомы . [17] Они встречаются во всех основных таксономических группах растений и животных .
Поскольку ядерные и цитоплазматические гены обычно имеют разные способы передачи, между ними могут возникать внутригеномные конфликты. [18] Митохондрии и хлоропласты являются двумя примерами наборов цитоплазматических генов, которые обычно наследуются исключительно от матери, подобно паразитам эндосимбионтов у членистоногих, таких как Wolbachia . [19]
Анизогамия обычно производит зиготы, которые наследуют цитоплазматические элементы исключительно от женской гаметы. Таким образом, самцы представляют собой тупик для этих генов. Из-за этого цитоплазматические гены развили ряд механизмов для увеличения производства потомков женского пола и устранения потомства, не содержащего их. [20]
Мужские организмы превращаются в женщин цитоплазматическими унаследованными протистами ( Microsporidia ) или бактериями ( Wolbachia ), независимо от ядерных факторов, определяющих пол. Это происходит у амфипод и равноногих ракообразных и чешуекрылых .
Мужские эмбрионы (в случае цитоплазматических унаследованных бактерий) или личинки мужского пола (в случае микроспоридий) погибают. В случае гибели эмбриона это отвлекает инвестиции от самцов к самкам, которые могут передавать эти цитоплазматические элементы (например, у божьих коровок инфицированные самки-хозяева съедают своих мертвых братьев-самцов, что положительно с точки зрения бактерии). В случае гибели личинок, вызванной микроспоридиями, возбудитель передается от мужской линии (через которую он не может передаваться) в окружающую среду, где он может снова заразиться другими особями. Гибель самцов происходит у многих насекомых . В случае смерти мужского эмбриона были замешаны различные бактерии, в том числе Wolbachia.
В некоторых случаях ткань пыльника (мужской гаметофит ) убивается митохондриями у однодомных покрытосеменных , увеличивая энергию и материал, расходуемые на развитие женских гаметофитов. Это приводит к переходу от моноэции к гинодиэзии , когда часть растений в популяции имеет мужскую стерильность.
У некоторых гаплодиплоидных перепончатокрылых и клещей , у которых самцы образуются бесполым путем, Wolbachia и Cardinium могут вызывать дупликацию хромосом и таким образом превращать организмы в самок. Цитоплазматическая бактерия заставляет гаплоидные клетки пройти неполный митоз с образованием диплоидных клеток, которые, следовательно, будут женскими. Это дает полностью женское население. Если антибиотики вводятся популяциям, которые таким образом стали бесполыми, они мгновенно возвращаются к сексуальности, поскольку цитоплазматические бактерии, вынуждающие их к такому поведению, удаляются.
У многих членистоногих зиготы, продуцируемые спермой инфицированных самцов и яйцеклетками неинфицированных самок, могут быть убиты Wolbachia или Cardinium . [19]
Конфликт между хромосомами был предложен как элемент эволюции пола . [21]