Sinorhizobium medicae | |
---|---|
Научная классификация | |
Королевство: | |
Тип: | |
Класс: | |
Заказ: | |
Семья: | |
Род: | |
Разновидность: | S. medicae |
Биномиальное имя | |
Sinorhizobium medicae Rome et al. 1996 г. |
Sinorhizobium Medicae является одним из видов грамотрицательных , азотфиксирующего , стержнеобразные бактерий . Они могут быть свободноживущими или симбионтами бобовых растений в корневых клубеньках . S.medicae был впервые выделен из корневых клубеньков растений рода Medicago . [1] Некоторые штаммы S.medicae , например WSM419, являются аэробными. Это хемоорганотрофные мезофилы , предпочитающие температуру около 28 ° C. В дополнение к своему первичному геному, эти организмы также имеют три известные плазмиды размером 1 570 951 п.н., 1245 408 п.н. и 219 313 п.н. [2]
Колонии Sinorhizobium medicae имеют слизистую и кольцевидную форму, их можно увидеть здесь .
Филогения / Таксономия [ править ]
Род иногда называют Ensifer (более старый термин) вместо Sinorhizobium . Две основные подгруппы включают S.medicae штамм А321 и S. Medicae штамм WSM419. это филогенетическое дерево показывает родство с остальной частью семейства Rhizobiaceae на основе последовательностей гена 16s рРНК.
Экологическая роль и симбиоз с бобовыми [ править ]
Эта бактерия часто вступает в мутуалистические отношения с бобовыми. Он осуществляет фиксацию атмосферного азота для растений, а взамен получает органический углерод в результате процесса ризоосаждения. Свободноживущие бактерии размещаются внутри специализированных корневых клеток в корневых клубеньках , что создает анаэробную микробиологическую среду, в которой может происходить эффективная N-фиксация. Этот мутуализм наблюдается у многих видов растений, включая растения Medicago polymorpha и Medicago truncatula со всего мира. [3] Степень взаимного влияния может зависеть от pH почвы , поскольку считалось, что кислотность может ограничивать Sinorhizobium medicae.. В настоящее время считается, что устойчивость к кислотам, особенно у штамма WSM419, может передаваться на плазмиды. [4]
Важность сельского хозяйства [ править ]
Поскольку S. medicae хорошо ассоциируется с растениями рода Medicago и увеличивает рост растений, посевные поля обычно заражаются бактериями в дополнение к синтетическим удобрениям или вместо них. [5]
Ссылки [ править ]
- ^ Чен, WX; Ян, GH; Ли, Дж. Л. (1988). «Численное таксономическое исследование быстрорастущих ризобий сои и предложение отнести Rhizobium fredii к Sinorhizobium gen. Nov». Международный журнал систематической бактериологии . 38 (4): 392–397. DOI : 10.1099 / 00207713-38-4-392 .
- ^ Рив, Вт; Цепь, П; О'Хара, G; Ардли, Дж; Nandesena, K; Bräu, L; Tiwari, R; Малфатти, S; Поцелуй, H; Лапидус, А; Коупленд, А; Нолан, М; Земельный участок, м; Хаузер, L; Чанг, YJ; Иванова, Н; Мавроматис, К; Марковиц, V; Кирпид, N; Голлахер, М; Йейтс, Р. Дилворт, М; Ховисон, Дж (2010). «Полная последовательность генома микросимбионта Medicago Ensifer (Sinorhizobium) medicae, штамм WSM419» . Стандарты геномных наук . 2 (1): 77–86. DOI : 10.4056 / sigs.43526 . PMC 3035259 . PMID 21304680 .
- ^ Рим, S; Фернандес, член парламента; Брюнель, Б. Норманд, П; Cleyet-Marel, JC (1996). «Sinorhizobium medicae sp. Nov., Выделенный из однолетних видов Medicago» . Международный журнал систематической бактериологии . 46 (4): 972–980. DOI : 10.1099 / 00207713-46-4-972 . PMID 8863426 .
- ^ "Sinorhizobium medicae WSM419" . Портал генома JGI . Министерство энергетики США.
- ↑ Ши, Руйхуа. Секвенирование генома Sinorhizoibum, аннотации и фиксация азота . Университет Оклахомы. ISBN 9780549576518.