Streptococcus sanguinis , ранее известный как Streptococcus sanguis , является грамположительным факультативным анаэробным [1] кокковым видом бактерий и членом группы Viridans Streptococcus . S. sanguinis - нормальный обитатель здорового рта человека, где он особенно присутствует в зубном налете , где он изменяет окружающую среду, делая ее менее благоприятной для других штаммов Streptococcus, вызывающих кариес , таких как Streptococcus mutans .
Streptococcus sanguinis | |
---|---|
Научная классификация | |
Домен: | Бактерии |
Тип: | Фирмикуты |
Класс: | Бациллы |
Заказ: | Лактобациллы |
Семья: | Streptococcaceae |
Род: | Стрептококк |
Разновидность: | S. sanguinis |
Биномиальное имя | |
Streptococcus sanguinis Уайт и Нивен 1946 |
Патогенность
S. sanguinis может попасть в кровоток, когда представится возможность (чистка зубов и операции), и колонизировать сердечные клапаны, особенно митральный и аортальный клапаны , где он является наиболее частой причиной подострого бактериального эндокардита . По этой причине хирурги-стоматологи часто назначают короткий курс антибиотиков за несколько дней до операции или через несколько дней после операции. После того, как инфекция возникла, лечение значительно усложняется и обычно включает введение в течение нескольких недель пенициллина и аминогликозидных антибиотиков.
Геном
Полная геномная последовательность из S. Sanguinis была определена в 2007 году в лабораториях Университета Вирджинии . [2] Размер генома составляет 2 388 435 п.н. и больше, чем у большинства других секвенированных геномов 21 стрептококка. Содержание GC в геноме S. sanguinis составляет 43,4% (выше, чем содержание GC других стрептококков). Геном кодирует 2274 предсказанных белка , 61 тРНК и четыре оперона рРНК . Около 22% открытых рамок считывания представляют собой консервативные гипотетические белки (присутствующие у нескольких видов, но имеющие неизвестные функции), и примерно 645 предсказанных белков были подтверждены масс-спектрометрией . [2]
Естественная генетическая трансформация
S. sanguinis от природы способен к генетической трансформации . [3] Естественная генетическая трансформация - это половой процесс, включающий передачу ДНК от одной бактериальной клетки к другой через промежуточную среду и интеграцию донорной последовательности в геном реципиента путем гомологичной рекомбинации .
Идентификация основных генов
Все основные гены исследуются у S. sanguinis . [4] Незаменимые гены - это незаменимые гены для организмов, чтобы они могли расти и воспроизводить потомство в определенных условиях. Использование метаболических сетей для изучения всех основных генов в целом указывает на то, что важные гены связаны с биологическими функциями обработки генетической информации, клеточной оболочки и производства энергии. [4] На основе этого открытия разработана база данных основных генов (ePath) для> 4000 видов бактерий. [5]
Рекомендации
- ^ Paik, S .; Senty, L .; Das, S .; Noe, JC; Munro, CL; Котенок, Т. (2005). «Идентификация детерминант вирулентности эндокардита в Streptococcus sanguinis с помощью сигнатурно-маркированного мутагенеза» . Инфекция и иммунитет . 73 (9): 6064–6074. DOI : 10.1128 / IAI.73.9.6064-6074.2005 . PMC 1231064 . PMID 16113327 .
- ^ а б Xu P, Alves JM, Kitten T, Brown A, Chen Z, Ozaki LS, Manque P, Ge X, Serrano MG, Puiu D, Hendricks S, Wang Y, Chaplin MD, Akan D, Paik S, Peterson DL, Macrina FL , Buck GA (апрель 2007 г.). «Геном условно-патогенного возбудителя Streptococcus sanguinis» . J Bacteriol . 189 (8): 3166–75. DOI : 10.1128 / JB.01808-06 . PMC 1855836 . PMID 17277061 .
- ^ Родригес А.М., Каллахан Дж. Э., Фосетт П., Ге X, Сюй П., Котенок Т. (2011). «Физиологическая и молекулярная характеристика генетической компетентности Streptococcus sanguinis» . Mol Oral Microbiol . 26 (2): 99–116. DOI : 10.1111 / j.2041-1014.2011.00606.x . PMC 3076142 . PMID 21375701 .
- ^ а б Сюй, Пин; Ге, Сючунь; Чен, Лэй; Ван, Сяоцзин; Доу Юэтань; Сюй, Джерри З .; Patel, Jenishkumar R .; Стоун, Виктория; Трин, Мой; Эванс, Карра; Котенок, Тодд (2011-10-20). «Общегеномная идентификация основных генов Streptococcus sanguinis» . Научные отчеты . 1 (1): 125. DOI : 10.1038 / srep00125 . ISSN 2045-2322 . PMC 3216606 . PMID 22355642 .
- ^ Конг, Сянчжэнь; Чжу, Бин; Stone, Victoria N .; Ге, Сючунь; Эль-Рами, Фади Э .; Дунхай, Хуанфу; Сюй, Пин (10.09.2019). «ePath: онлайн-база данных для исчерпывающей аннотации основных генов прокариот» . Научные отчеты . 9 (1): 12949. DOI : 10.1038 / s41598-019-49098-ш . ISSN 2045-2322 . PMID 31506471 . S2CID 202160195 .
дальнейшее чтение
- Морита, Чисато; Сумиока, Рюичи; Наката, Масанобу; Окахаши, Нобуо; Вада, Сатоши; Ямасиро, Такаши; Хаяси, Микако; Хамада, Шигеюки; Сумитомо, Томоко; Кавабата, Шигетада (1 августа 2014 г.). «Заякоренная в клеточной стенке нуклеаза Streptococcus sanguinis способствует побегу нейтрофилов от бактерицидной активности, опосредованной внеклеточными ловушками» . PLOS ONE . 9 (8): e103125. Bibcode : 2014PLoSO ... 9j3125M . DOI : 10.1371 / journal.pone.0103125 . PMC 4118848 . PMID 25084357 .
Внешние ссылки
- Типовой штамм Streptococcus sanguinis в Bac Dive - база метаданных по бактериальному разнообразию