| Стрептококки Viridans | |
|---|---|
 | |
| Научная классификация | |
| Королевство: | |
| Тип: | |
| Класс: | |
| Заказ: | |
| Семья: | |
| Род: | Стрептококк |
В viridans стрептококков являются большой группой синантропных стрептококковых гр-положительных бактерий видов , которые являются α-гемолитическим , производя зеленую окраску на крови агара пластин (отсюда и название «viridans», от латинского «Viridis», зеленый). Pseudotaxonomic термин «Streptococcus viridans» часто используется для обозначения этой группы видов, но писатели , которые не любят использовать термин pseudotaxonomic (который лечит группу видов , как если бы они были одного вида) предпочитают термины viridans стрептококков , [1] стрептококки группы viridans ( VGS ) или виды стрептококков viridans .
Эти виды не обладают антигенами Лэнсфилда . [2] В целом патогенность низкая. [3]
Идентификация [ править ]
Streptococci Viridans можно отличить от Streptococcus pneumoniae с помощью оптохинового теста, поскольку стрептококки viridans устойчивы к оптохинам; они также не имеют либо полисахарида основанное капсулу , типичное для S. пневмонии или Lancefield антигенов из гнойных членов рода. [4]
| Стрептококки Viridans | Пневмококк | |
|---|---|---|
| С желчью | Нерастворимый | Растворимый |
| Ферментация инулина | Не ферментер | Ферментер с производством кислоты |
| Чувствительность к оптохину | Не чувствительный | Чувствительный |
| Патогенность для мышей | Непатогенный | Патогенный |
| Тест Quellung (активно не используется) | Отрицательный | Положительный |
Патология [ править ]
Эти организмы наиболее многочисленны во рту, и один из представителей этой группы, S. mutans , в большинстве случаев и популяций является причиной кариеса зубов . S. sanguinis - еще одна потенциальная причина. Другие могут быть вовлечены в другие инфекции полости рта или десен, такие как перикоронит . Если они попадают в кровоток, они могут вызвать эндокардит , особенно у людей с поврежденными сердечными клапанами . Они являются наиболее частыми причинами подострого бактериального эндокардита . Стрептококки Viridans выявляются при неонатальных инфекциях . [5]
Viridans стрептококков обладают уникальной способностью синтезировать декстраны от глюкозы , что позволяет им придерживаться фибрина - пластинчатые агрегаты на поврежденных клапанах сердца. Этот механизм лежит в основе их способности вызывать подострый порок клапанов сердца после их попадания в кровоток (например, после удаления зубов ).
Идентификация [ править ]
Фенотипическая и биохимическая идентификация
Идентификация VGS на уровне вида может быть трудной, а фенотипическая идентификация не всегда точна. Название «вириданс» является неправильным, поскольку многие виды не вызывают гемолиза на кровяном агаре. С точки зрения классификации, бесполезно пытаться дифференцировать альфа-гемолиз от отсутствия гемолиза на чашках с кровяным агаром (иногда называемый «гамма-гемолизом»); эта функция может широко варьироваться в зависимости от питательной среды, используемой для культивирования организма, а также от температуры инкубации. Отсутствие альфа-гемолиза, по-видимому, не коррелирует с клиническим исходом или тяжестью заболевания; не было зарегистрировано ни одного ферментативного или токсигенного эффекта как побочного продукта альфа-гемолиза.
Под микроскопом бактерии из группы viridans представляют собой цепочечные грамположительные кокки. Они не экспрессируют каталазу и поэтому являются каталазо-отрицательными. [6] Они являются лейцинаминопептидазоположительными, отрицательными по пирролидонилариламидазе и не растут в 6,5% NaCl, и почти все виды отрицательны для роста на желчном эскулиновом агаре. Они отличаются от пневмококков тем, что устойчивы к оптохинам и не растворяются в желчи. Однако Richter et al. исследовали ошибочную идентификацию VGS, представленных в программах антимикробного надзора как пневмококки, и обнаружили, что отличить S. pneumoniae от VGS может быть сложно, что неудивительно в свете того факта, что S. mitis и S. oralis обладают> 99% гомологией последовательностей. с участиемS. pneumoniae (47). Авторы также обнаружили, что тестирование оптохинового диска не работает так же хорошо, как тестирование растворимости желчи для идентификации; в обзоре 1733 протестированных изолятов тестирование растворимости в желчи имело более высокую чувствительность и специфичность для дифференциации VGS от пневмококков (47).
С. anginosus группа С. anginosusгруппа организмов может быть бета-, альфа- или nonhemolytic. Изоляты, лишенные бета-гемолиза, обычно относятся к группе VGS.S. constellatus,скорее всего, является бета-гемолитиком из этой группы. Имеются некоторые свидетельства причастности бета-гемолитическогоS. constellatussubsp. pharyngis как причина фарингита (55).S. intermediateus- это вид из этой группы, который чаще всего выделяют из абсцессов головного мозга и печени. ГруппаS. anginosusможет обладать антигенами группы Lancefield A, C, G и F, хотяS. intermediateusпочти никогда не обладает антигенами группы Lancefield. ИзолятыS. anginosusгруппы имеют характерный запах «ириски». Члены группы универсально положительны по трем биохимическим реакциям: выработка ацетоина из глюкозы (положительная реакция Вогеса-Проскауэра ), аргинина и сорбита. Они очень полезны для дифференциации этой группы от других VGS.
Группа S. mitis . ВS. тШзагруппа организмов содержит несколько видов и биохимически очень инертны, который может сделать идентификацию уровня вида очень сложной. Использование неверных названий видов также было особой проблемой для группыS. mitis. Изоляты этой группы отрицательны в отношении продукции ацетоина, аргинина, эскулина и маннита и отрицательны при ферментации сорбита (14).S. pneumoniae- недавно охарактеризованный представитель группыS. mitis(1). Поскольку этот организм тесно связан с S. pneumoniae и другими организмами группы S. mitis, точная идентификация может быть затруднена.С. псевдопневмониине имеет пневмококковой капсулы и устойчив к оптохину при инкубации в атмосфере с повышенным содержанием CO 2, но чувствителен при инкубации на воздухе. Растворимость в желчи - более специфический тест на S. pseudopneumoniae, чем чувствительность к оптохинам, поскольку этот организм не растворяется в желчи (1).
Группа S. sanguinis Генетически гетерогеннаягруппаS. sanguinisранее была известна какS. sanguinis. Некоторые систематики объединили группуS. sanguinisс группойS. mitisна основании анализа последовательности гена 16S рРНК, ноорганизмы группыS. sanguinisдемонстрируют различные фенотипические характеристики. Изоляты в группеS. sanguinisявляются положительными по аргинину и эскулину. Как и представители группыS. mitis, они отрицательны в отношении продукции ацетоина и ферментации маннита и сорбита. ГруппаS. sanguinisвключаетS. sanguinis,S. parasanguinisиS. gordonii (14).
S. salivarius группа TheS. salivariusгруппа тесно связана сS. Бовигруппы. Виды из этой группы, которые были изолированы от инфекции человека, включаютS. salivariusиS. vestibularis, а такжеS. thermophilus, который был идентифицирован из молочных продуктов. Организмы группыS. salivariusположительны на продукцию ацетоина и положительны на эскулин, но отрицательны на гидролиз аргинина и ферментацию маннита и сорбита.
Группа S. mutans Члены группыS. mutansв основном изолированы от ротовой полости человека и включают несколько видов, фенотипически сходных.S. mutansиS. sobrinusявляются видами в этой группе, наиболее часто выделяемыми от инфекции человека. Они не гидролизуют аргинин, но положительны в отношении продукции ацетоина, гидролиза эскулина и ферментации маннита и сорбита.
Автоматизированные биохимические методы идентификации Для VGS использование автоматизированных систем для идентификации исторически считалось проблематичным, и эта тема применима к множеству автоматизированных методологий. Одним из основных факторов, влияющих на качество генерируемых идентификаций, является то, что системы могут не иметь всех видов, представленных в их базах данных (32). В одном исследовании, сравнивающем точность карты Vitek2 ID-GPC с точностью традиционных биохимических методов на основе агара для идентификации различных грамположительных и грамотрицательных организмов, 72% грамположительных изолятов были точно идентифицированы с помощью Vitek2. система (21). Среди наиболее проблемных идентификаций (неправильно идентифицированных или неразрешенных) были VGS; S. anginosus , S. mutans, и S. sanguinis были ошибочно идентифицированы как другие виды VGS и, в некоторых случаях, как S. pneumoniae (21).
Исследование способности панели SMIC / ID BD Phoenix system идентифицировать Streptococcus spp. классифицировали 97 последовательных клинических изолятов стрептококков, в том числе 34 изолята VGS, используя биохимические методы в качестве эталонного метода (26). Девяносто один процент изолятов стрептококков показал соответствие между Phoenix и эталонным методом. Из 12 протестированных изолятов группы S. mitis система Phoenix правильно идентифицировала семь изолятов с двумя противоречивыми идентификациями, и было три изолята, для которых система Phoenix не дала никакой идентификации. Из 22 S. anginosusгруппы изолятов, 18 были правильно идентифицированы, а четыре были несовместимы. Во втором исследовании оценивалась панель Phoenix SMIC / ID-2 с использованием системы API 20 Strep в качестве метода сравнения (разрешение противоречивых результатов с помощью секвенирования гена 16S рРНК, а также амплификации и секвенирования генов домашнего хозяйства) (5). Для VGS был проанализирован 31 изолят, с соответствием только 53% между методами Phoenix и референсными методами для организмов группы S. mitis , 100% соответствием для группы S. anginosus и 75% соответствием для организмов группы S. sanguinis (5). .
Идентификация на основе последовательностей Исторически, исследования гибридизации ДНК-ДНК использовались для подтверждения идентификации на уровне видов для VGS. Однако клинические лаборатории не могут использовать эти процедуры для идентификации этих организмов. Впоследствии для идентификации на уровне видов VGS были введены другие системы идентификации на основе последовательностей. В общем, секвенирование гена 16S рРНК приводит к плохому разрешению до видового уровня в VGS. Это связано с высокой степенью гомологии гена 16S рРНК в этой группе организмов; S. mitis , S. oralis , S. pseudopneumoniae и S. pneumoniae.почти всегда гомология последовательности в этом гене составляет> 99%. В свете высокой степени сходства последовательностей гена 16S рРНК было исследовано секвенирование альтернативных генов-мишеней для надежной идентификации на уровне видов. Одна многообещающая мишень, rnpB, была исследована Innings et al., Которые проанализировали две вариабельные области rnpB с помощью пиросеквенирования (28). Из 43 проанализированных видов все были идентифицированы до уровня вида, за исключением двух изолятов: S. anginosus / S. constellatus и S. infantis / S. peroris.. rnpB может использоваться для идентификации VGS с высоким разрешением. Еще один успешный подход - анализ последовательности гена марганец-зависимой супероксиддисмутазы, описанный Poyart et al. Этот метод был использован для точной дифференциации более 29 видов стрептококков, включая 16 видов VGS, с четкой дифференциацией S. mitis , S. oralis и S. pneumoniae (44, 45). Другие методы, которые использовались с разной степенью успеха, включают анализ последовательности межгенной спейсерной области 16S-23S, секвенирование гена d-аланин-d-аланин лигазы и секвенирование гена гиалуронатлиазы.
Ссылки [ править ]
- ^ Иллюстрированный медицинский словарь Дорланда, заглавное слово "streptococcus", подстатья "viridans streptococci".
- ^ Райан KJ, Рэй CG, ред. (2004). Шеррис Медицинская микробиология (4-е изд.). Макгроу Хилл. С. 293–4. ISBN 978-0-8385-8529-0.
- ^ Viridans + Streptococci в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
- ^ Patterson MJ (1996). «Стрептококк» . В Baron S; и другие. (ред.). Медицинская микробиология Барона (4-е изд.). Univ Техасского медицинского отделения. ISBN 978-0-9631172-1-2.
- ^ Baucells, BJ; Mercadal Hally, M .; Álvarez Sánchez, AT; Фигерас Алой, Дж. (2015). "Asociaciones de probióticos para la pretérmino de menos de 1.500g: una revisión sistemática" . Anales de Pediatría . 85 (5): 247–255. DOI : 10.1016 / j.anpedi.2015.07.038 . ISSN 1695-4033 . PMID 26611880 .
- ^ Doern, Кристофер D .; Бернхэм, Кэри-Энн Д. (ноябрь 2010 г.). «Непросто быть зеленым: стрептококки группы Вириданс с акцентом на педиатрические клинические проявления» . Журнал клинической микробиологии . 48 (11): 3829–3835. DOI : 10.1128 / JCM.01563-10 . ISSN 0095-1137 . PMC 3020876 . PMID 20810781 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Навин Кумар, Венкатесан; ван дер Линден, Марк; Менон, Тангам; Патрик Ницше-Шмитц, Д. (май 2014 г.). «Стрептококки группы Viridans и bovis, вызывающие инфекционный эндокардит в двух регионах с противоположной эпидемиологией». Международный журнал медицинской микробиологии . 304 (3–4): 262–268. DOI : 10.1016 / j.ijmm.2013.10.004 . PMID 24220665 .
