Семейство транскриптов генов, усиленных семенниками (TEGT), включает белки транскриптов генов, усиленных семенниками млекопитающих, которые экспрессируются на высоком уровне в семенниках, предполагаемые глутамат / аспартат-связывающие белки растений и животных, белок YccA Escherichia coli и белок YeJ из Bacillus subtilis . Эти белки имеют длину около 200-250 остатков и содержат 7 ТМС. [1]
Семейство транскриптов генов, усиленных семенниками | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | ||||||||
Символ | TEGT | |||||||
Pfam | PF01027 | |||||||
TCDB | 1.A.14 | |||||||
OPM суперсемейство | 703 | |||||||
Белок OPM | 4пгр | |||||||
|
Гомология
Гомологи обнаружены у множества грамотрицательных и грамположительных бактерий , дрожжей, грибов, растений, животных и вирусов. E.coli , геном кодирует три паралогов, YbhL, YbhM и YccA. Отдаленные гомологи, обнаруженные у Drosophilia melanogaster и крысы, представляют собой белок, связанный с рецептором N-метил-D-аспартата (NMDARAI), и глутамат-связывающую цепь рецептора N-метил-D-аспартата, соответственно. Двумя другими являются белок 35 нервной мембраны крысы и белок ингибитор-1 Bax Arabidopsis thaliana (BI-1), способный подавлять индуцированную Bax гибель клеток у дрожжей .
БИ-1
Один из этих белков, TEGT или Bax Inhibitor-1 ( TC # 1.A.14.1.1 ), имеет C-концевой домен, который формирует Ca 2+ -проницаемый канал. [2] BI-1 представляет собой белок, локализованный в ER, который защищает от апоптоза и стресса ER. Предполагается, что BI-1 модулирует гомеостаз ER Ca 2+ , действуя как канал утечки Ca 2+ . Эти белки отдаленно родственны ионотропному глутамат-связывающему белку рецептора N-метил-D-аспартата (NMDA) человека. Гомологи включают предполагаемый белок, индуцируемый холодовым шоком, и белок, стабилизирующий SecY. [1]
Функция
Основываясь на экспериментальном определении топологии BI-1, Bultynck et al. предполагает, что его C-концевой α-спиральный пептид из 20 аминокислот катализирует поток Ca 2+ как in vivo, так и in vitro . [2] Свойства утечки Ca 2+ были сохранены у животных, но не у ортологов растений и дрожжей. Мутировав один из критических остатков аспартата (D 213 ) в предполагаемой поре Ca 2+ -канала в полноразмерном BI-1, D 213 оказался существенным для BI-1-зависимой утечки ER Ca 2+ .
Состав
Chang et al. опубликовали кристаллические структуры бактериального гомолога, YetJ ( TC # 1.A.14.2.3 ) с разрешением 1,9 Å, и охарактеризовали его активность по утечке кальция. Его складка из семи трансмембранных спиралей состоит из двух сэндвичей с тройной спиралью, обернутых вокруг центральной С-концевой спирали. [3] Структуры, полученные в закрытой и открытой конформации, обратимо взаимопревращаемы при изменении pH. Связанная водородными связями нарушенная пара консервативных аспартильных остатков объясняет зависимость этого перехода от pH, а pH регулирует приток кальция в протеолипосомы. Гомологические модели человеческого BI-1 позволили понять его цитопротекторную активность. [3]
Транспортная реакция
Обобщенная реакция, катализируемая каналами TEGT:
- катионы (выход) ⇌ катионы (вход)
Рекомендации
- ^ a b van Stelten J, Silva F, Belin D, Silhavy TJ (август 2009 г.). «Влияние антибиотиков и гомолога протоонкогена на разрушение транслокатора белка SecY» . Наука . 325 (5941): 753–6. Bibcode : 2009Sci ... 325..753V . DOI : 10.1126 / science.1172221 . PMC 2832214 . PMID 19661432 .
- ^ а б Bultynck G, Kiviluoto S, Henke N, Ivanova H, Schneider L, Rybalchenko V, Luyten T, Nuyts K, De Borggraeve W., Bezprozvanny I, Parys JB, De Smedt H, Missiaen L, Methner A (январь 2012 г.). «С-конец ингибитора Вах-1 образует поры канала, проницаемые для Са2 +» . Журнал биологической химии . 287 (4): 2544–57. DOI : 10.1074 / jbc.M111.275354 . PMC 3268414 . PMID 22128171 .
- ^ а б Чанг И, Бруни Р., Клосс Б., Ассур З., Клоппманн Э., Рост Б., Хендриксон В.А., Лю К. (июнь 2014 г.). «Структурная основа для утечки кальция через мембраны, чувствительной к pH» . Наука . 344 (6188): 1131–5. Bibcode : 2014Sci ... 344.1131C . DOI : 10.1126 / science.1252043 . PMC 4119810 . PMID 24904158 .
На момент редактирования в этой статье используется контент из "1.A.14 Семейство Testis-Enhanced Gene Transfer (TEGT)" , которое лицензировано таким образом, чтобы разрешить повторное использование в соответствии с непортированной лицензией Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 , но не под GFDL . Все соответствующие условия должны быть соблюдены.