UDP-глюкозо - 6-дегидрогеназы является цитозольным ферментом , который в организме человека кодируются ЯГКИ гена . [5] [6] [7]
UGDH | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | UGDH , GDH, UDP-GlcDH, UDPGDH, UGD, UDP-глюкозо-6-дегидрогеназа, EIEE84, DEE84 | ||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | OMIM : 603370 MGI : 1306785 HomoloGene : 2520 GeneCards : ЯГДК | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||||||||||
Разновидность | Человек | Мышь | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ансамбль |
|
| |||||||||||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (белок) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Расположение (UCSC) | Chr 4: 39,5 - 39,53 Мб | Chr 5: 65.41 - 65.44 Мб | |||||||||||||||||||||||
PubMed поиск | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||
|
Белок, кодируемый этим геном, превращает UDP-глюкозу в UDP-глюкуронат и тем самым участвует в биосинтезе гликозаминогликанов, таких как гиалуронан, хондроитинсульфат и гепарансульфат. Эти гликозилированные соединения являются обычными компонентами внеклеточного матрикса и, вероятно, играют роль в передаче сигналов, миграции клеток, а также в росте и метастазировании рака. Экспрессия этого гена активируется трансформирующим фактором роста бета и подавляется гипоксией. [7]
Этот фермент участвует в 4 - метаболических путях : пентозы и глюкуроновое взаимопревращение , аскорбат и aldarate обмен веществ , крахмал и метаболизм сахарозы , и нуклеотидная сахара метаболизм .
Потеря UGDH недавно была связана с эпилептической энцефалопатией у людей [8]
Номенклатура
Этот фермент принадлежит к семейству оксидоредуктаз , особенно тех, которые действуют на группу CH-OH донора с НАД + или НАДФ + в качестве акцептора. Систематическое название данного фермента класса UDP-глюкозы: NAD + 6-оксидоредуктаз .
Другие широко используемые имена включают:
- UDP-глюкозодегидрогеназа,
- уридиндифосфоглюкозодегидрогеназа,
- UDPG дегидрогеназа,
- UDPG: НАД оксидоредуктаза,
- UDP-альфа-D-глюкоза: НАД оксидоредуктаза,
- UDP-глюкоза: НАД + оксидоредуктаза,
- уридиндифосфатглюкозодегидрогеназа,
- UDP-D-глюкозодегидрогеназа и
- уридиндифосфат-D-глюкозодегидрогеназа.
Биохимия
UDP-глюкозо 6-дегидрогеназа | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | ||||||||
ЕС нет. | 1.1.1.22 | |||||||
№ CAS | 9028-26-6 | |||||||
Базы данных | ||||||||
IntEnz | Просмотр IntEnz | |||||||
BRENDA | BRENDA запись | |||||||
ExPASy | Просмотр NiceZyme | |||||||
КЕГГ | Запись в KEGG | |||||||
MetaCyc | метаболический путь | |||||||
ПРИАМ | профиль | |||||||
Структуры PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | |||||||
Генная онтология | Amigo / QuickGO | |||||||
|
В энзимологии , A UDP-глюкозо - 6-дегидрогеназы ( EC 1.1.1.22 ) представляет собой фермент , который катализирует в химическую реакцию
- UDP-глюкоза + 2 НАД + + H 2 O UDP-глюкуронат + 2 НАДН + 2 Н +
Три субстрата этого фермента - UDP-глюкоза , NAD + и H 2 O , тогда как его 3 продукта - UDP-глюкуронат , NADH и H +.
Ссылки: [9] [10] [11] [12]
Рекомендации
- ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000109814 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029201 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Спайсер А.П., Кабак Л.А., Смит Т.Дж., Селдин М.Ф. (сентябрь 1998 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика генов UDP-глюкозодегидрогеназы человека и мыши» . Журнал биологической химии . 273 (39): 25117–24. DOI : 10.1074 / jbc.273.39.25117 . PMID 9737970 .
- ^ Марку О., Статакис Д.Г., Марш Д.Л. (январь 2000 г.). «Отнесение локуса UGDH, кодирующего UDP-глюкозодегидрогеназу, к полосе хромосомы человека 4p15.1 с помощью радиационного гибридного картирования». Цитогенетика и клеточная генетика . 86 (3–4): 244–5. DOI : 10.1159 / 000015350 . PMID 10575217 . S2CID 25740995 .
- ^ а б «Ген Entrez: UGDH UDP-глюкозодегидрогеназа» .
- ^ Хенгель, Х., Боссо-Лефевр, К., Грейди, Г. и др. Мутации потери функции в UDP-глюкозо-6-дегидрогеназе вызывают рецессивную эпилептическую энцефалопатию развития. Нац Коммуна 11, 595 (2020). https://doi.org/10.1038/s41467-020-14360-7
- ^ Дружинина Т.Н., Кусов Ю.Ю., Шибаев В.Н., Кочетков Н.К., Бели П., Куцар С., Бауэр С. (фев 1975). «Уридиндифосфат 2-дезоксиглюкоза. Химический синтез, ферментативное окисление и эпимеризация». Biochimica et Biophysica Acta . 381 (2): 301–7. DOI : 10.1016 / 0304-4165 (75) 90236-6 . PMID 1091296 .
- ^ Kalckar HM, Maxwell ES, Strominger JL (ноябрь 1956 г.). «Некоторые свойства уридиндифосфоглюкозодегидрогеназы». Архивы биохимии и биофизики . 65 (1): 2–10. DOI : 10.1016 / 0003-9861 (56) 90171-0 . PMID 13373402 .
- ^ Строминджер Дж. Л., Мапсон Л. В. (август 1957 г.). «Уридиндифосфоглюкозодегидрогеназа проростков гороха» . Биохимический журнал . 66 (4): 567–72. DOI : 10.1042 / bj0660567 . PMC 1200063 . PMID 13459898 .
- ^ Axelrod J, Kalckar HM, Maxwell ES, Strominger JL (январь 1957 г.). «Ферментативное образование уридиндифосфоглюкуроновой кислоты» . Журнал биологической химии . 224 (1): 79–90. DOI : 10.1016 / S0021-9258 (18) 65012-4 . PMID 13398389 .
дальнейшее чтение
- Пэн Х.Л., Лу, доктор медицины, Чанг М.Л., Чанг Х.Й. (октябрь 1998 г.). «Клонирование кДНК и анализ экспрессии человеческой UDP-глюкозодегидрогеназы». Труды Национального научного совета Китайской Республики. Часть B, Науки о жизни . 22 (4): 166–72. PMID 9850599 .
- Bontemps Y, Maquart FX, Wegrowski Y (сентябрь 2000 г.). «Ген UDP-глюкозодегидрогеназы человека: полное клонирование и картирование начала транскрипции». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 275 (3): 981–5. DOI : 10.1006 / bbrc.2000.3389 . PMID 10973831 .
- Bontemps Y, Vuillermoz B, Antonicelli F, Perreau C, Danan JL, Maquart FX, Wegrowski Y (июнь 2003 г.). «Специфический протеин-1 является универсальным регулятором экспрессии UDP-глюкозодегидрогеназы: его положительное участие в трансформации передачи сигналов бета-фактора роста и ингибировании при гипоксии» . Журнал биологической химии . 278 (24): 21566–75. DOI : 10.1074 / jbc.M209366200 . PMID 12682078 .
- Sommer BJ, Barycki JJ, Simpson MA (май 2004 г.). «Характеристика человеческой UDP-глюкозодегидрогеназы. CYS-276 требуется для второго из двух последовательных окислений» . Журнал биологической химии . 279 (22): 23590–6. DOI : 10.1074 / jbc.M401928200 . PMID 15044486 .
- Бранденбергер Р., Вэй Х., Чжан С., Лей С., Мурадж Дж., Фиск Дж. Дж., Ли И, Сюй С., Фанг Р., Гуглер К., Рао М. С., Мандалам Р., Лебковски Дж., Стэнтон Л. В. (июнь 2004 г.) «Характеристика транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку человеческих ES-клеток». Природа Биотехнологии . 22 (6): 707–16. DOI : 10,1038 / NBT971 . PMID 15146197 . S2CID 27764390 .
- Ха Дж. У., Юн Хай, Ли Х. Дж., Чой В. Б., Ян SJ, Чо Ю (сентябрь 2004 г.). «Важность Gly-13 для связывания кофермента человеческой UDP-глюкозодегидрогеназы» . Журнал биологической химии . 279 (36): 37491–8. DOI : 10.1074 / jbc.M404234200 . PMID 15247292 .
- Ха Дж. У., Ли Х. Дж., Чхве ММ, Ян С. Дж., Юн С. Ю., Ким Д. В., Ким СИ, Чой С.и, Чо С.В. (2005). «Идентификация UDP-глюкозосвязывающего сайта человеческой UDP-глюкозодегидрогеназы с помощью фотоаффинного мечения и кассетного мутагенеза». Биоконъюгатная химия . 16 (3): 710–6. DOI : 10.1021 / bc0500387 . PMID 15898741 .
- Вацяян Дж., Пэн Х.Л., Чанг Х.Й. (июнь 2005 г.). «Анализ промотора гена UDP-глюкозодегидрогеназы человека: идентификация сайта связывания Sp1, имеющего решающее значение для экспрессии большого транскрипта». Журнал биохимии . 137 (6): 703–9. DOI : 10.1093 / Jb / mvi082 . PMID 16002992 .
- Ван Л., Чжу Ю.Ф., Го XJ, Хо Р., Ма Х, Линь М., Чжоу З.М., Ша Дж.Х. (октябрь 2005 г.). «Двумерная справочная карта электрофореза яичников человека». Журнал молекулярной медицины . 83 (10): 812–21. DOI : 10.1007 / s00109-005-0676-у . PMID 16021519 . S2CID 6644433 .
- Вацяян Дж., Линь СТ, Пэн Х.Л., Чанг Х.Й. (февраль 2006 г.). «Идентификация цис-действующего элемента, ответственного за негативную регуляцию экспрессии гена UDP-глюкозодегидрогеназы человека». Биология, биотехнология и биохимия . 70 (2): 401–10. DOI : 10.1271 / bbb.70.401 . PMID 16495656 . S2CID 25853385 .
- Ха JW, Робинсон Р.С., Ли Х.С., Ли Джи, Хео Ю.С., Ким Х.Т., Ли ХД, Чо С.В., Чхве Х. (2006). «Экспрессия, очистка, кристаллизация и предварительный рентгеновский анализ человеческой UDP-глюкозодегидрогеназы» . Буквы о белках и пептидах . 13 (8): 859–62. DOI : 10.2174 / 092986606777841253 . PMID 17073734 . S2CID 28298102 .
- Исли К.Е., Соммер Б.Дж., Боанка Дж., Барики Дж.Дж., Симпсон М.А. (январь 2007 г.). «Характеристика человеческой UDP-глюкозодегидрогеназы показывает критическую каталитическую роль лизина 220 и аспартата 280». Биохимия . 46 (2): 369–78. DOI : 10.1021 / bi061537d . PMID 17209547 .