| Вибрион-регуляторная РНК OmpA | |
|---|---|
 Представление вторичной структуры VrrA, включая цветовую схему, которая указывает степень сохранения последовательности. | |
| Идентификаторы | |
| Символ | VrrA |
| Рфам | RF00024 |
| Прочие данные | |
| Тип РНК | Ген антисмысловой РНК |
| Домен (ы) | Бактерии |
| Структуры PDB | PDBe |
VrrA ( Vibrio-регуляторная РНК OmpA ) представляет собой некодирующую РНК, которая сохраняется у всех видов бактерий Vibrio и действует как репрессор для синтеза белка внешней мембраны OmpA . Эта некодирующая РНК была первоначально идентифицирована из библиотек мутантных транспозонов Tn5 Vibrio cholerae, и ее расположение в бактериальном геноме было сопоставлено с межгенной областью между генами VC1741 и VC1743 с помощью анализа RACE . [1]
Везикулы наружной мембраны секретируются с поверхности грамотрицательных бактерий , где, как считается, они способствуют вирулентности . Мало что известно о том, как эти везикулы способствуют вирулентности, но есть предположения, что они могут вносить свой вклад, выделяя токсины и помогая уклоняться от иммунной системы . [2] [3] [4]
Недавние исследования показали, что экспрессия VrrA активируется альтернативным стрессовым сигма-фактором , сигма E; в отличие от других штаммов бактерий, таких как E. coli и Salmonella , ему не требуется белок Hfq для регулирования сигма-фактора. Также было показано, что транскрипция VrrA увеличивается под воздействием УФ-света и что сверхэкспрессия VrrA приводит к увеличению секретируемых везикул внешней мембраны. На основании этих исследований было высказано предположение, что VrrA действует для снятия стресса на внешней мембране, ограничивая синтез белка OmpA, и что везикулы внешней мембраны обеспечивают физическую защиту бактерий от ультрафиолетового излучения. [1]
Ссылки [ править ]
- ^ a b Song T, Wai SN (июль 2009 г.). «Новая мРНК, которая модулирует вирулентность и экологическую пригодность холерного вибриона» . RNA Biol . 6 (3): 254–258. DOI : 10,4161 / rna.6.3.8371 . PMID 19411843 .
- ^ Kölling GL, Мэттьюс KR (май 1999). «Экспорт генов вирулентности и токсина Шига мембранными везикулами Escherichia coli O157: H7» . Прил. Environ. Microbiol . 65 (5): 1843–1848. PMC 91264 . PMID 10223967 .
- ^ Сондерс Н.Б., Сапожник DR, Brandt BL, Moran EE, Larsen T, Золлингера WD (январь 1999). «Иммуногенность менингококковых везикул нативной внешней мембраны, вводимых интраназально, у мышей» . Заразить. Иммун . 67 (1): 113–119. PMC 96285 . PMID 9864204 .
- ^ Kouokam JC, Wai С.Н., Fällman M, Dobrindt U, J Хакер, Uhlin BE (апрель 2006). «Активный цитотоксический некротический фактор 1, связанный с везикулами наружной мембраны из уропатогенной Escherichia coli» . Заразить. Иммун . 74 (4): 2022–2030. DOI : 10.1128 / IAI.74.4.2022-2030.2006 . PMC 1418910 . PMID 16552031 .
Внешние ссылки [ править ]
- Страница регуляторной РНК Vibrio OmpA в Rfam
