Варианты количества копий 1q21.1

Структура 1q21.1; похожие регионы одного цвета

Вариации числа копий 1q21.1 (CNV) ^[1] - редкие аберрации хромосомы 1 человека .

В обычной ситуации человеческая клетка имеет одну пару идентичных хромосом на хромосоме 1. С CNV 1q21.1 одна хромосома из пары не является полной, потому что часть последовательности хромосомы отсутствует или переполнена, потому что некоторые части хромосомы последовательность дублируется. В результате одна хромосома имеет нормальную длину, а другая слишком длинную или слишком короткую.

Структура 1q21.1 [ править ]

Структура 1q21.1 сложна. Область имеет размер примерно 6 Mega базы (Мб) (от 141,5 до 147,9 Mb Mb). В пределах 1q21.1 есть две области, где могут быть обнаружены CNV: проксимальная область или область TAR (144,1–144,5) и дистальная область (144,7–145,9). CNV 1q21.1 обычно находится в одной из этих областей, но возможно наложение с другой областью или частями, находящимися за пределами этих областей. 1q21.1 имеет несколько повторений одной и той же структуры: только 25% структуры не дублируется. В последовательности есть несколько пробелов. Дополнительная информация о ДНК-последовательности в этих областях до сих пор отсутствует. Промежутки составляют примерно 700 килобаз. Ожидаются новые гены в пробелах. Область 1q21.1 - одна из самых сложных для картирования частей генома человека.

CNVs возникают из -за неаллельной гомологичной рекомбинации, опосредованной низкокопийными повторами (последовательно сходными областями), обычно обнаруживаемыми в 1q21.1.

Формы CNV 1q21.1 [ править ]

В литературе упоминаются четыре отдельные формы CNV 1q21.1.

• в 1q21.1 проксимальные делеции и дупликации
• синдром ТАР
• дистальная делеция, известная как синдром делеции 1q21.1
• дистальная дупликация, известная как синдром дупликации 1q21.1

CNVs приводят к очень вариабельному фенотипу, и проявления у людей весьма вариабельны. Некоторые люди с CNV могут нормально функционировать, в то время как другие имеют симптомы умственной отсталости и различных физических аномалий.

Причина синдрома [ править ]

Мейоз - это процесс деления клеток у человека. В мейозе пары хромосом расщепляются, и представитель каждой пары переходит в одну дочернюю клетку. Таким образом, количество хромосом будет уменьшено вдвое в каждой ячейке, в то время как все части хромосомы (гены) останутся после рандомизации. Какая информация из родительской клетки попадает в дочернюю, решается чисто случайно. Помимо этого случайного процесса существует второй случайный процесс. Во втором случайном процессе ДНК будет зашифрована таким образом, что части будут опущены ( удаление ), добавлены ( дублирование ), перемещены из одного места в другое ( транслокация ) и инвертированы ( инверсия).). Это обычный процесс, который приводит к вариации ДНК примерно на 0,4%. Это объясняет, почему даже однояйцевые близнецы не идентичны на 100% генетически.

Проблема второго случайного процесса в том, что могут произойти генетические ошибки. В частности, из-за процесса делеции и дупликации хромосомы, которые объединяются в новую клетку, могут быть короче или длиннее. Результатом этого спонтанного изменения структуры ДНК является так называемое изменение числа копий . Благодаря CNV хромосомы разного размера могут быть объединены в новую клетку. Если это произойдет во время зачатия, результатом будет первая человеческая клетка с генетической вариацией. Это может быть как положительное, так и отрицательное. В положительных случаях этот новый человек будет способен к особым навыкам, которые оцениваются положительно, например, в спорте или науке. В отрицательных случаях вам придется иметь дело с синдромом или тяжелой инвалидностью, как в этом случае CNV 1q21.1.

В зависимости от мейотического процесса синдром может возникать двумя путями.

• 1. спонтанное отклонение (ситуация «de novo»): две хромосомы объединяются, одна из которых имеет вариацию числа копий в результате процесса мейоза.
• 2. родитель неосознанно является носителем хромосомы с вариацией числа копий и передает ее при зачатии ребенку с различными последствиями для ребенка.

Из-за этой генетической ошибки эмбрион может испытывать проблемы в развитии в течение первых месяцев беременности. Примерно через 20-40 дней после оплодотворения что-то идет не так в строении частей тела и мозга, что приводит к цепной реакции.

Из-за повторов в 1q21.1 существует большая вероятность неравного кроссинговера во время мейоза .

Связанные гены [ править ]

Гены , связанные с этой области проксимального являются HFE2 , TXNIP , POLR3GL , LIX1L , RBM8A , PEX11B , ИНТЕГРИН АЛЬФА-10 , ANKRD35 , PIAS3 , NUDT17 , POLR3C , RNF115 , CD160 , PDZK1 и GPR89A
Гены , связанные с дистальным области являются PDE4DIP , HYDIN2 , PRKAB2 , PDIA3P , FMO5 , CHD1L , BCL9 , ACP6, GJA5 , GJA8 , NBPF10 , GPR89B , GPR89C , PDZK1P1 и NBPF11 .

Ссылки [ править ]