База J

База J
Имена

Название ИЮПАК 5 - [[(3 R 4 S , 5 S , 6 R ) -3,4,5-тригидрокси-6- (гидроксиметил) тетрагидропиран-2-ил] оксиметил] -1 Н пиримидин-2,4-дион
Другие названия β- D- глюкозил-5-гидроксиметилурацил β- D- глюкозил-гидроксиметилурацил
Идентификаторы
Количество CAS	53910-89-7
3D модель ( JSmol )	Интерактивное изображение
ChemSpider	32742278
PubChem CID	129852278
ИнЧИ InChI = 1S / C11H16N2O8 / c14-2-5-6 (15) 7 (16) 8 (17) 10 (21-5) 20-3-4-1-12-11 (19) 13-9 (4) 18 / h1,5-8,10,14-17H, 2-3H2, (H2,12,13,18,19) / t5-, 6-, 7 +, 8-, 10- / м1 / с1 Ключ: SUDBRAWXUGTELR-HPFNVAMJSA-N InChI = 1 / C11H16N2O8 / c14-2-5-6 (15) 7 (16) 8 (17) 10 (21-5) 20-3-4-1-12-11 (19) 13-9 (4) 18 / h1,5-8,10,14-17H, 2-3H2, (H2,12,13,18,19) / t5-, 6-, 7 +, 8-, 10- / м1 / с1 Ключ: SUDBRAWXUGTELR-HPFNVAMJBD
Улыбки c1c (c (= O) [nH] c (= O) [nH] 1) CO [C @ H] 2 [C @@ H] ([C @ H] ([C @@ H] ([C @ H] (O2) CO) O) O) O
Характеристики
Химическая формула	C ₁₁H ₁₆N ₂O ₈
Молярная масса	304,255 г · моль ^-1
Если не указано иное, данные приведены для материалов в их стандартном состоянии (при 25 ° C [77 ° F], 100 кПа).
Ссылки на инфобоксы

β- D -Glucopyranosyloxymethyluracil или основание J является hypermodified нуклеотидных найдено в ДНК из кинетопластиды включая человека патогенных трипаносом . Он был открыт в 1993 году в трипаносоме Trypanosoma brucei и был первым гипермодифицированным азотистым основанием, обнаруженным в ДНК эукариот; с тех пор он был обнаружен в других кинетопластидах, включая Leishmania . ^[1] В этих организмах основание J действует как терминатор транскрипции РНК-полимеразы II и удаляется в нокаутных клетках.сопровождается массивным считыванием сайтов терминации РНК-полимеразы II, что в конечном итоге оказывается смертельным для клетки. ^[2]^[3]

База J формируются начальным гидроксилирования из тимидина и последующего гликозилирования с помощью еще неустановленной гликозилтрансферазой . ^[1]

Биосинтез основания J. A : тимидингидроксилаза; B : бета-глюкозилтранфераза; 1 : dT (дезокситимидин); 2 : HOCH3dU; 3 : диджей

Ссылки [ править ]

^ ^a ^b Борст, Пит; Сабатини, Роберт (октябрь 2008 г.). «База J: открытие, биосинтез и возможные функции». Ежегодный обзор микробиологии . 62 (1): 235–251. DOI : 10.1146 / annurev.micro.62.081307.162750 . PMID 18729733 .
^ ван Люенен, Анри ГАМ; Фаррис, Кэрол; Ян, Сабрина; Дженест, Поль-Андре; Трипати, Панкадж; Велдс, Арно; Керховен, Рон М .; Ньюланд, Марья; Хейдок, Эндрю; Рамасами, Гаутхаман; Вайнио, Саара; Хайдебрехт, Татьяна; Перракис, Анастассис; Пейджи, Людо; ван Стинзель, Бас; Майлер, Питер Дж .; Борст, Пит (август 2012). «Глюкозилированный гидроксиметилурацил, основание ДНК J, предотвращает прохождение транскрипции при лейшмании» . Cell . 150 (5): 909–921. DOI : 10.1016 / j.cell.2012.07.030 . PMC 3684241 . PMID 22939620 .
^ Hazelbaker, датчанин З .; Буратовски, Стивен (ноябрь 2012 г.). "Транскрипция: База J преграждает путь" . Текущая биология . 22 (22): R960 – R962. DOI : 10.1016 / j.cub.2012.10.010 . PMC 3648658 . PMID 23174300 .

[borst-1] Борст, Пит; Сабатини, Роберт (октябрь 2008 г.). «База J: открытие, биосинтез и возможные функции». Ежегодный обзор микробиологии . 62 (1): 235–251. DOI : 10.1146 / annurev.micro.62.081307.162750 . PMID 18729733 .

[2] ван Люенен, Анри ГАМ; Фаррис, Кэрол; Ян, Сабрина; Дженест, Поль-Андре; Трипати, Панкадж; Велдс, Арно; Керховен, Рон М .; Ньюланд, Марья; Хейдок, Эндрю; Рамасами, Гаутхаман; Вайнио, Саара; Хайдебрехт, Татьяна; Перракис, Анастассис; Пейджи, Людо; ван Стинзель, Бас; Майлер, Питер Дж .; Борст, Пит (август 2012). «Глюкозилированный гидроксиметилурацил, основание ДНК J, предотвращает прохождение транскрипции при лейшмании» . Cell . 150 (5): 909–921. DOI : 10.1016 / j.cell.2012.07.030 . PMC 3684241 . PMID 22939620 .

[3] Hazelbaker, датчанин З .; Буратовски, Стивен (ноябрь 2012 г.). "Транскрипция: База J преграждает путь" . Текущая биология . 22 (22): R960 – R962. DOI : 10.1016 / j.cub.2012.10.010 . PMC 3648658 . PMID 23174300 .

[1]