| Дрозоцин | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Плодовая муха, Drosophila melanogaster | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Дрозоцин, Dro или Drc | ||||||||
| Pfam | Тусклый | ||||||||
| |||||||||
Дрозоцин представляет собой антимикробный пептид (АМФ) из 19 остатков мух, впервые выделенный у плодовой мухи Drosophila melanogaster , а позднее, как было показано, сохраняется у всех представителей рода Drosophila . [1] [2] Дрозоцин регулируется сигнальным путем NF-κB Imd у мух.
Структура и функции [ править ]
Дрозоцин в первую очередь активен против грамотрицательных бактерий . Пептид богат пролином и содержит пролин- аргининовые повторы, а также критический остаток треонина . Этот треонин является O - гликозилированный , который необходим для антимикробной активности. [1] Это O- гликозилирование может осуществляться моно- или дисахаридами, которые имеют разные спектры активности. [3] Как антимикробные пептиды pyrrhocoricin и abaecin , drosocin связывается с бактериальной DnaK, ингибирующий клеточные машинами и репликацию. [4] [5]Действие этих дрозоциноподобных пептидов усиливается присутствием порообразующих пептидов, что облегчает проникновение дрозоцин-подобных пептидов в бактериальную клетку. [6] Пептиды, богатые пролином, такие как дрозоцин, также могут связываться с рибосомами микробов , предотвращая трансляцию белков . [7] В отсутствие порообразующих пептидов родственный АМФ-пиррокорицин попадает в бактерии под действием пермеаз захвата. [8]
Drosocin ген Drosophila neotestacea однозначно кодирует тандемные повторы Drosocin зрелых пептидов между сайтами расщепления. В результате один белок расщепляется на несколько пептидов дрозоцина. [2] Эта структура тандемных повторов также обнаружена в апидецине АМФ медоносной пчелы и предположительно является эволюционным механизмом для увеличения скорости иммунного ответа и выработки АМФ. [9]
Молекулярная структура [ править ]
Жирный шрифт остаток треонина действует как сайт для O-гликозилирования, также находится в АМПАХ abaecin и pyrrhocoricin . Подчеркнутые мотивы PRP являются ключевыми для связывания таких пептидов с белками DnaK бактерий. [4] [10]
D. melanogaster дрозоцин: GK PRP YS PRP T SH PRP IRV
Дальнейшее чтение [ править ]
- Дрозоцин - UniProtKB - P36193 (DROS_DROME)
Ссылки [ править ]
- ^ a b Bulet P, Dimarcq JL, Hetru C, Lagueux M, Charlet M, Hegy G, Van Dorsselaer A, Hoffmann JA (июль 1993 г.). «Новый индуцибельный антибактериальный пептид Drosophila несет O-гликозилированную замену» . Журнал биологической химии . 268 (20): 14893–7. DOI : 10.1016 / S0021-9258 (18) 82417-6 . PMID 8325867 .
- ^ a b Hanson MA, Hamilton PT, Perlman SJ (октябрь 2016 г.). «Иммунные гены и дивергентные антимикробные пептиды у мух подрода Drosophila» . BMC Evolutionary Biology . 16 (1): 228. DOI : 10,1186 / s12862-016-0805-у . PMC 5078906 . PMID 27776480 .
- ^ Уттенвайлер-Joseph S, M Moniatte, Lagueux МЫ, Ван Dorsselaer A, Hoffmann JA, Bulet P (сентябрь 1998). «Дифференциальное отображение пептидов, индуцированных во время иммунного ответа Drosophila: масс-спектрометрическое времяпролетное исследование с использованием матричной лазерной десорбционной ионизации» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (19): 11342–7. Bibcode : 1998PNAS ... 9511342U . DOI : 10.1073 / pnas.95.19.11342 . PMC 21644 . PMID 9736738 .
- ^ a b Bikker, Флорис Дж .; Каман-ван Зантен, Венди Э .; де Врис-ван де Руит, Анн-Маридж, Британская Колумбия; Воскамп-Виссер, Ингрид; ван Хоофт, Питер А.В.; Mars-Groenendijk, Roos H .; де Виссер, Питер С .; Ноорт, Даан (2006). «Оценка антибактериального спектра аналогов дрозоцина» . Химическая биология и дизайн лекарств . 68 (3): 148–153. DOI : 10.1111 / j.1747-0285.2006.00424.x . ISSN 1747-0277 . PMID 17062012 . S2CID 41618771 .
- ^ Зан М, Бертольд Н, Kieslich В, Д Knappe, Хоффман R, Стратера Н (июль 2013 г. ). «Структурные исследования способов прямого и обратного связывания пептидов с шапероном DnaK». Журнал молекулярной биологии . 425 (14): 2463–79. DOI : 10.1016 / j.jmb.2013.03.041 . PMID 23562829 .
- ^ Rahnamaeian М, Cytryńska М, Zdybicka-Барабас А, Dobslaff К, Визнер Дж, Твимэн Р. М., Zuchner Т, Садд БМ, Regoes РР, Schmid-Гемпель Р, Vilcinskas А (май 2015). «Противомикробные пептиды насекомых проявляют потенцирующие функциональные взаимодействия против грамотрицательных бактерий» . Ход работы. Биологические науки . 282 (1806): 20150293. DOI : 10.1098 / rspb.2015.0293 . PMC 4426631 . PMID 25833860 .
- ^ Флорин Т., Мараччи С., Граф М., Карки П., Клепаки Д., Бернингхаузен О., Бекманн Р., Васкес-Ласлоп Н., Уилсон Д. Н., Роднина М. В., Манкин А. С. (сентябрь 2017 г.). «Антимикробный пептид, который ингибирует трансляцию, улавливая факторы высвобождения на рибосоме» . Структурная и молекулярная биология природы . 24 (9): 752–757. DOI : 10.1038 / nsmb.3439 . PMC 5589491 . PMID 28741611 .
- ^ Нарайанан S, Modak JK, Райан CS, Гарсия-Бустос J, Дэвис JK, Roujeinikova A (май 2014). «Механизм устойчивости Escherichia coli к пиррокорицину» . Противомикробные препараты и химиотерапия . 58 (5): 2754–62. DOI : 10,1128 / AAC.02565-13 . PMC 3993218 . PMID 24590485 .
- ^ Casteels-Josson, K; Capaci, T; Casteels, P; Темпст, П. (1993). «Структура предшественника мультипептида апидецина: предполагаемый механизм усиления антибактериального ответа насекомых» . EMBO J . 12 (4): 1569–78. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1993.tb05801.x . PMC 413370 . PMID 8467807 .
- ^ Зан, М; Straeter, N (2013). «Кристаллическая структура субстрат-связывающего домена E.coli DnaK в комплексе с мечниковином (остатки от 20 до 26)». Банк данных белков . DOI : 10.2210 / pdb4EZS / PDB .
