Ectodysplasin рецептор ( EDAR ) представляет собой белок , который у человека кодируется ГДДИ гена . EDAR является рецептором клеточной поверхности для ectodysplasin А , который играет важную роль в развитии эктодермы тканей , такие как кожа . [5] [6] [7] Он структурно связан с членами суперсемейства рецепторов TNF . [8]
ЕДАР | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | EDAR , DL, ECTD10A, ECTD10B, ED1R, ED3, ED5, EDA-A1R, EDA1R, EDA3, HRM1, рецептор эктодисплазина А | ||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | OMIM : 604095 MGI : 1343498 HomoloGene : 7699 GeneCards : Гадер | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||||||||||
Разновидность | Человек | Мышь | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ансамбль |
|
| |||||||||||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (белок) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Расположение (UCSC) | Chr 2: 108,89 - 108,99 Мб | Chr 10: 58,6 - 58,68 Мб | |||||||||||||||||||||||
PubMed поиск | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||
|
Функция
EDAR и другие гены предоставляют инструкции по созданию белков, которые работают вместе во время эмбрионального развития . Эти белки являются частью сигнального пути, который имеет решающее значение для взаимодействия между двумя клеточными слоями, эктодермой и мезодермой . В раннем эмбрионе эти клеточные слои составляют основу многих органов и тканей тела. Взаимодействия эктодермы и мезодермы необходимы для правильного формирования нескольких структур, которые возникают из эктодермы, включая кожу, волосы, ногти, зубы и потовые железы. [7]
Клиническое значение
Мутации в этом гене были связаны с гипогидротической эктодермальной дисплазией , заболеванием, характеризующимся более низкой плотностью потовых желез . [7]
Производный аллель EDAR
Производная G-аллель точечной мутации ( SNP ) с плейотропными эффектами в ГДДИ , 370ы или rs3827760, найденных в большинстве современных восточных азиатов и коренных американцах , но не распространены в африканском или европейских популяциях, считаются одним из ключевых генов , ответственных за количество различий между этими популяциями, включая более густые волосы, более многочисленные потовые железы, меньшую грудь и зубной ряд Sinodont (так называемые резцы лопатки ), характерные для жителей Восточной Азии. [9] Было высказано предположение , что естественный отбор благоприятствовал эту аллель во время последнего ледникового периода в популяции людей , живущих изолированно в Берингия , так как он может играть определенную роль в синтезе грудного молока под витамином D Бедные условиях. [10] [11] [12] Мутация 370A возникла у людей примерно 30 000 лет назад, и в настоящее время обнаруживается у 93% китайцев хань и у большинства людей в соседних азиатских популяциях. Эта мутация также связана с различиями в морфологии ушей и уменьшением выпячивания подбородка. [13] Производный G-аллель является мутацией предкового A-аллеля, версии, обнаруженной в большинстве современных популяций не восточноазиатских и некоренных американцев.
В исследовании 2015 года три (из шести) образцов древней ДНК (7 900–7 500 лет назад) из Моталы , Швеция; два (3300–3000 до н.э.) из афанасьевской культуры и один (400–200 до н.э.) скифский образец несут мутацию rs3827760. [14]
В исследовании 2018 года было обнаружено, что несколько образцов древней ДНК из Америки, включая USR1 с участка Upward Sun River , Anzick-1 и человека 9600 лет назад из Лапа-ду-Санту , не несли производный аллель. Это говорит о том, что повышенная частота производного аллеля произошла независимо как в Восточной Азии, так и в Америке. [15]
Смотрите также
- Рецептор эктодисплазина А2
Рекомендации
- ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000135960 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000003227 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Monreal AW, Ferguson BM, Headon DJ, Street SL, Overbeek PA, Zonana J (август 1999). «Мутации в человеческом гомологе dl мыши вызывают аутосомно-рецессивную и доминантную гипогидротическую эктодермальную дисплазию». Генетика природы . 22 (4): 366–9. DOI : 10,1038 / 11937 . PMID 10431241 . S2CID 11348633 .
- ^ Асвеган А.Л., Джозефсон К.Д., Моубрей Р., Паули Р.М., Спритц Р.А., Уильямс М.С. (ноябрь 1997 г.). «Аутосомно-доминантная гипогидротическая эктодермальная дисплазия в большой семье». Американский журнал медицинской генетики . 72 (4): 462–7. DOI : 10.1002 / (SICI) 1096-8628 (19971112) 72: 4 <462 :: AID-AJMG17> 3.0.CO; 2-П . PMID 9375732 .
- ^ а б в «Ген Entrez: рецептор эктодисплазина А EDAR» .
- ^ Интернет Менделирующее наследование в человеке (OMIM): 604095
- ^ Камберов Ю.Г., Ван С., Тан Дж., Жербо П., Варк А., Тан Л., Ян И., Ли С., Тан К., Чен Х, Пауэлл А., Итан И., Фуллер Д., Ломюллер Дж., Мао Дж., Шахар А., Пеймер М. , Хостеттер Э., Бирн Э., Бернетт М., МакМахон А.П., Томас М.Г., Либерман Д.Е., Джин Л., Табин С.Дж., Морган Б.А., Sabeti PC (февраль 2013 г.). «Моделирование недавней эволюции человека на мышах путем экспрессии выбранного варианта EDAR» . Cell . 152 (4): 691–702. DOI : 10.1016 / j.cell.2013.01.016 . PMC 3575602 . PMID 23415220 .
- ^ Лозовский, Александра (24 апреля 2018 г.). «Древние зубы обнаруживают, что ген, связанный с грудным вскармливанием, помог ранним американцам пережить ледниковый период [исследование]» . Inquisitr . Проверено 25 апреля 2018 года .
- ^ Николас Уэйд (14 февраля 2013 г.). «Восточноазиатские физические черты, связанные с мутацией возрастом 35 000 лет» . Нью-Йорк Таймс . Проверено 15 февраля 2013 года .
- ^ Hlusko, Leslea J .; Карлсон, Джошуа П .; Чаплин, Джордж; Элиас, Скотт А .; Хоффекер, Джон Ф .; Хаффман, Микаэла; Яблонски, Нина Г .; Monson, Tesla A .; О'Рурк, Деннис Х. (8 мая 2018 г.). «Экологический отбор во время последнего ледникового периода в отношении передачи витамина D и жирных кислот от матери ребенку через грудное молоко» . Труды Национальной академии наук . 115 (19): E4426 – E4432. DOI : 10.1073 / pnas.1711788115 . ISSN 0027-8424 . PMC 5948952 . PMID 29686092 .
- ^ Адхикари, Каустубх (19 мая 2016 г.). «Сканирование ассоциаций всего генома позволяет выявить DCHS2, RUNX2, GLI3, PAX1 и EDAR в вариациях лица человека» . Nature Communications . 7 : 11616. дои : 10.1038 / ncomms11616 . PMC 4874031 . PMID 27193062 .
- ^ Мэтисон, Иэн; Лазаридис, Иосиф (23 ноября 2015 г.). «Полногеномные модели отбора у 230 древних евразийцев» . Природа . 528 (7583): 499–503. DOI : 10,1038 / природа16152 . PMC 4918750 . PMID 26595274 .
- ^ Пост, Козимо; Накацука, Натан; Лазаридис, Иосиф; Скоглунд, Понт; Маллик, Свапан; Lamnidis, Thiseas C .; Роланд, Надин; Нэгеле, Катрин; Адамски, Николь; Бертолини, Эмили; Брумандхошбахт, Насрин; Купер, Алан; Каллтон, Брендан Дж .; Феррас, Тьяго; Ферри, Мэтью; Фуртвенглер, Аня; Хаак, Вольфганг; Харкинс, Келли; Харпер, Томас К .; Хюнемайер, Табита; Лоусон, Энн Мари; Ламы, Бастьен; Мишель, Меган; Нельсон, Элизабет; Оппенгеймер, Йонас; Паттерсон, Ник; Шиффельс, Стефан; Седиг, Якоб; Стюардсон, Кристин; Таламо, Сахра; Ван, Чуан-Чао; Хублин, Жан-Жак; Хуббе, Марк; Харвати, Катерина; Нуэво-Делоне, Амалия; Байер, Джудит; Франкен, Майкл; Каулике, Питер; Рейес-Сентено, Хьюго; Радемейкер, Курт; Траск, Вилла Р .; Робинсон, Марк; Gutierrez, Said M .; Прюфер, Кейт М .; Salazar-García, Domingo C .; Chim, Eliane N .; Мюллер Пламм Гомеш, Лизиан; Алвес, Марконь L .; Лирио, Андерсен; Инглез, Мариана; Oliveira, Rodrigo E .; Бернардо, Данило В .; Бариони, Альберто; Весоловски, Вероника; Scheifler, Nahuel A .; Ривера, Марио А .; Plens, Claudia R .; Messineo, Pablo G .; Фигути, Леви; Корач, Дэниел; Скабуццо, Клара; Эггерс, Сабина; ДеБласис, Пауло; Рейндель, Маркус; Мендес, Сезар; Политис, Густаво; Томасто-Кагигао, Эльза; Kennett, Douglas J .; Штраус, Андре; Ферен-Шмитц, Ларс; Краузе, Йоханнес; Райх, Дэвид (2018). «Реконструкция глубокой истории населения Центральной и Южной Америки» . Cell . Elsevier BV. 175 (5): 1185–1197.e22. DOI : 10.1016 / j.cell.2018.10.027 . ЛВП : 10550/67985 . ISSN 0092-8674 . PMC 6327247 . PMID 30415837 .
дальнейшее чтение
- Thesleff I, Mikkola ML (май 2002 г.). «Сигнализация рецептора смерти, дающая жизнь эктодермальным органам». STKE науки . 2002 (131): PE22. DOI : 10.1126 / stke.2002.131.pe22 . PMID 11997580 . S2CID 36068881 .
- Хо Л., Уильямс М.С., Спритц Р.А. (май 1998 г.). «Ген аутосомно-доминантной гипогидротической эктодермальной дисплазии (EDA3) отображается на хромосоме 2q11-q13» . Американский журнал генетики человека . 62 (5): 1102–6. DOI : 10,1086 / 301839 . PMC 1377096 . PMID 9545409 .
- Кумар А., Эби М.Т., Синха С., Жасмин А., Чаудхари П.М. (январь 2001 г.). «Рецептор эктодермальной дисплазии активирует ядерный фактор-каппаB, JNK и пути гибели клеток и связывается с эктодисплазином А» . Журнал биологической химии . 276 (4): 2668–77. DOI : 10.1074 / jbc.M008356200 . PMID 11035039 .
- Ян М., Ван LC, Химовиц С.Г., Шильбах С., Ли Дж., Годдард А., де Вос А.М., Гао В.К., Диксит В.М. (октябрь 2000 г.). «Молекулярный переключатель из двух аминокислот в эпителиальном морфогене, который регулирует связывание с двумя разными рецепторами». Наука . 290 (5491): 523–7. DOI : 10.1126 / science.290.5491.523 . PMID 11039935 .
- Эломаа О., Пулккинен К., Ханнелиус Ю., Миккола М., Саариалхо-Кере Ю., Кере Дж. (Апрель 2001 г.). «Эктодисплазин высвобождается протеолитическим шеддингом и связывается с белком EDAR» . Молекулярная генетика человека . 10 (9): 953–62. DOI : 10.1093 / HMG / 10.9.953 . PMID 11309369 .
- Коппинен П., Писпа Дж., Лауриккала Дж., Теслефф И., Миккола М.Л. (октябрь 2001 г.). «Сигнализация и субклеточная локализация рецептора TNF Edar». Экспериментальные исследования клеток . 269 (2): 180–92. DOI : 10.1006 / excr.2001.5331 . PMID 11570810 .
- Headon DJ, Emmal SA, Ferguson BM, Tucker AS, Justice MJ, Sharpe PT, Zonana J, Overbeek PA (2002). «Дефект гена при эктодермальной дисплазии вовлекает адаптер домена смерти в развитие». Природа . 414 (6866): 913–6. DOI : 10.1038 / 414913a . PMID 11780064 . S2CID 4380080 .
- Ян М., Чжан З., Брэди Дж. Р., Шильбах С., Фэйрбротер В. Дж., Диксит В. М. (март 2002 г.). «Идентификация новой адапторной молекулы, содержащей домен смерти, для рецептора эктодисплазина-А, который мутирован у морщинистых мышей». Текущая биология . 12 (5): 409–13. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (02) 00687-5 . PMID 11882293 . S2CID 9911697 .
- Синха С.К., Захария С., Киньонес Х.И., Шиндо М., Чаудхари П.М. (ноябрь 2002 г.). «Роль TRAF3 и -6 в активации путей NF-каппа B и JNK с помощью X-связанного рецептора эктодермальной дисплазии» . Журнал биологической химии . 277 (47): 44953–61. DOI : 10.1074 / jbc.M207923200 . PMID 12270937 .
- Шу Х, Чен С., Би К., Мамби М., Бреккен Д.Л. (март 2004 г.). «Идентификация фосфопротеинов и их сайтов фосфорилирования в клеточной линии лимфомы WEHI-231 B» . Молекулярная и клеточная протеомика . 3 (3): 279–86. DOI : 10.1074 / mcp.D300003-MCP200 . PMID 14729942 .
- Zhang Z, Henzel WJ (октябрь 2004 г.). «Прогнозирование сигнального пептида на основе анализа экспериментально подтвержденных сайтов расщепления» . Белковая наука . 13 (10): 2819–24. DOI : 10.1110 / ps.04682504 . PMC 2286551 . PMID 15340161 .
- Хашимото Т., Цуй С.Й., Шлессингер Д. (апрель 2006 г.). «Репертуар изоформ эктодисплазина-A (EDA-A) мыши» . Джин . 371 (1): 42–51. DOI : 10.1016 / j.gene.2005.11.003 . PMID 16423472 .
- Chassaing N, Bourthoumieu S, Cossee M, Calvas P, Vincent MC (март 2006 г.). «Мутации в EDAR составляют четверть гипогидротической эктодермальной дисплазии, не связанной с ED1». Мутация человека . 27 (3): 255–9. DOI : 10.1002 / humu.20295 . PMID 16435307 . S2CID 32110651 .
- Тарик М., Васиф Н., Ахмад В. (июль 2007 г.). «Новая делеционная мутация в гене EDAR в пакистанской семье с аутосомно-рецессивной гипогидротической эктодермальной дисплазией». Британский журнал дерматологии . 157 (1): 207–9. DOI : 10.1111 / j.1365-2133.2007.07949.x . PMID 17501952 . S2CID 310090 .
Внешние ссылки
- Запись GeneReview / NIH / UW о гипогидротической эктодермальной дисплазии