Эмбековирус | |
---|---|
Электронная микрофотография вириона мышиного коронавируса (MHV) , схематическая структура и геном. | |
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Царство : | Рибовирия |
Королевство: | Орторнавиры |
Тип: | Писувирикота |
Учебный класс: | Pisoniviricetes |
Заказ: | Нидовиралес |
Семья: | Coronaviridae |
Род: | Бетакоронавирус |
Подрод: | Эмбековирус |
Типовой вид | |
Коронавирус мышей | |
Виды [1] | |
Embecovirus является подвидом из коронавирусов в роде Betacoronavirus . [1] Вирусы этого подрода, в отличие от других коронавирусов , имеютген гемагглютининэстеразы (HE). [2] Вирусы этого подрода ранее были известны как коронавирусы группы 2а . [3] [4]
Структура [ править ]
Вирусы этого подрода, как и другие коронавирусы, имеют липидную двухслойную оболочку, в которой заякорены структурные белки мембраны (M), оболочки (E) и шипа (S) . [5] В отличие от других коронавирусов, вирусы этого подрода также имеют дополнительный более короткий шиповидный структурный белок, называемый гемагглютининэстеразой (HE). [2] [6]
Рекомбинация [ править ]
Генетическая рекомбинация может происходить, когда два или более вирусных генома присутствуют в одной и той же клетке-хозяине. Верблюд верблюд бета-коронавируса (бета-коронавирус HKU23) имеет генетическое разнообразие в африканской верблюжьего населения. [7] Этому разнообразию способствуют несколько событий рекомбинации, которые имели место в прошлом между близкородственными Beta-CoV подрода Embecovirus. [7]
См. Также [ править ]
- Сарбековирус (группа 2b)
- Мербековирус (группа 2c)
- Нобековирус (группа 2d)
Ссылки [ править ]
- ^ a b «Таксономия вирусов: выпуск 2018» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Октябрь 2018. Архивировано 4 марта 2018 года . Проверено 24 января 2019 .
- ^ а б Ву, Патрик CY; Хуанг, Йи; Лау, Сусанна КП; Юэнь, Квок-Юнг (24.08.2010). «Геномика и биоинформатический анализ коронавирусов» . Вирусы . 2 (8): 1804–1820. DOI : 10,3390 / v2081803 . ISSN 1999-4915 . PMC 3185738 . PMID 21994708 .
У всех представителей подгруппы А бетакоронавируса ген гемагглютининэстеразы (HE), который кодирует гликопротеин с нейраминат-O-ацетил-эстеразной активностью и активным сайтом FGDS, присутствует ниже ORF1ab и выше гена S (Рисунок 1).
- ^ Ву, Патрик CY; Ван, Мин; Лау, Сусанна КП; Сюй, Хуйфан; Пун, Розана WS; Го, Ронгтун; Вонг, Беатрис Х.Л .; Гао, Кай; Цой, Хой-вау; Хуанг, Йи; Ли, Кеннет С.М. (февраль 2007 г.). «Сравнительный анализ двенадцати геномов трех новых коронавирусов группы 2c и 2d выявил уникальные особенности групп и подгрупп» . Журнал вирусологии . 81 (4): 1574–1585. DOI : 10,1128 / JVI.02182-06 . ISSN 0022-538X . PMC 1797546 . PMID 17121802 .
См. Рисунок 2.
- ^ Вонг, Антонио CP; Ли, Синь; Лау, Сусанна КП; Ву, Патрик CY (20.02.2019). «Глобальная эпидемиология коронавирусов летучих мышей» . Вирусы . 11 (2): 174. DOI : 10,3390 / v11020174 . ISSN 1999-4915 . PMC 6409556 . PMID 30791586 .
КоВ подразделяются на четыре рода: альфакоронавирус, бетакоронавирус, гаммакоронавирус и дельтакоронавирус. Внутри Betacoronavirus они могут быть далее подклассифицированы на линии A, B, C и D [1]. В 2018 году эти четыре линии были переклассифицированы как подроды Betacoronavirus и переименованы в Embecovirus (предыдущая линия A), Sarbecovirus (предыдущая линия B), Merbecovirus (предыдущая линия C) и Nobecovirus (предыдущая линия D) [2]. Кроме того, был включен пятый подрод, Hibecovirus (рис. 1) [2].
- ^ Лай, Майкл MC; Кавана, Дэвид (1997-01-01), Мараморош, Карл; Мерфи, Фредерик А .; Шаткин, Аарон Дж. (Ред.), «Молекулярная биология коронавирусов; III. Структура вирионов; А. Морфология вирионов» , « Достижения в вирусных исследованиях» , Academic Press, 48 , стр. 5–6 , извлечено 2020-02- 28
- ^ Ву, Патрик CY; Хуанг, Йи; Лау, Сусанна КП; Юэнь, Квок-Юнг (24.08.2010). «Геномика и биоинформатический анализ коронавирусов» . Вирусы . 2 (8): 1804–1820. DOI : 10,3390 / v2081803 . ISSN 1999-4915 . PMC 3185738 . PMID 21994708 .
Присутствие генов HE исключительно у членов подгруппы A Betacoronavirus, но не у членов подгрупп B, C и D бетакоронавирусов, предполагает, что рекомбинация, вероятно, произошла у предка членов подгруппы A Betacoronavirus после отклонения от предков других подгрупп Бетакоронавирус.
- ^ a b Разнообразие коронавируса одногорбого верблюда HKU23 у африканских верблюдов выявило множественные случаи рекомбинации среди близкородственных бета-коронавирусов подрода Embecovirus. Итак, RTY и др. J Virol. 2019. PMID: 31534035