Фактор элонгации G 1, митохондриальный является белком , который в организме человека кодируется GFM1 геном . Это гомолог EF-G . [4] [5] [6]
Эукариоты содержат две системы трансляции белков: одну в цитоплазме, а другую в митохондриях. Трансляция митохондрий имеет решающее значение для поддержания функции митохондрий, и мутации в этой системе приводят к нарушению системы окислительного фосфорилирования дыхательной цепи и нарушению поддержания митохондриальной ДНК . Этот ген кодирует один из факторов элонгации митохондриальной трансляции. Его роль в регуляции нормальной функции митохондрий и в различных болезненных состояниях, связанных с дисфункцией митохондрий, неизвестна. [6]
Модельные организмы [ править ]
Фенотип мышей с нокаутом Gfm1
Характерная черта
Фенотип
Жизнеспособность гомозигот
Аномальный
Рецессивное летальное исследование
Аномальный
Плодородие
Обычный
Вес тела
Обычный
Беспокойство
Обычный
Неврологическое обследование
Обычный
Сила захвата
Обычный
Горячая тарелка
Обычный
Дисморфология
Обычный
Косвенная калориметрия
Обычный
Тест толерантности к глюкозе
Обычный
Слуховой ответ ствола мозга
Обычный
DEXA
Обычный
Рентгенография
Обычный
Температура тела
Обычный
Морфология глаза
Обычный
Клиническая химия
Аномальный [7]
Гематология
Обычный
Лимфоциты периферической крови
Нормальный [8]
Микроядерный тест
Обычный
Вес сердца
Обычный
Гистопатология глаз
Обычный
Сальмонеллезная инфекция
Нормальный [9]
Citrobacter инфекция
Нормальный [10]
Все тесты и анализ из [11] [12]
Модельные организмы использовались при изучении функции GFM1. Линия условно нокаутных мышей , получившая название Gfm1 tm1a (EUCOMM) Wtsi [13] [14], была создана в рамках программы International Knockout Mouse Consortium - проекта высокопроизводительного мутагенеза для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых. [15] [16] [17]
Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения эффектов делеции. [11] [18] Двадцать четыре теста были проведены на мутантных мышах, и были обнаружены три значительных отклонения от нормы. [11] Ни один гомозиготный мутантный эмбрион не был идентифицирован во время беременности, и поэтому ни один из них не выжил до отъема . Остальные тесты проводили на гетерозиготных мутантных взрослых мышах, и у самцов животных наблюдали снижение уровней циркулирующей амилазы . [11]
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000168827 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
Перейти ↑ Gao J, Yu L, Zhang P, Jiang J, Chen J, Peng J, Wei Y, Zhao S (май 2001 г.). «Клонирование и характеристика фактора удлинения митохондрий человека и мыши G, GFM и Gfm, а также картирование GFM на хромосоме человека 3q25.1-q26.2». Геномика . 74 (1): 109–14. DOI : 10.1006 / geno.2001.6536 . PMID 11374907 .
^ Hammarsund МЫ, Уилсон Вт, Коркорэны М, Merup М, Эйнхорн S, D Грандер, Sangfelt вывод (декабрь 2001). «Идентификация и характеристика двух новых генов фактора элонгации митохондрий человека, hEFG2 и hEFG1, филогенетически законсервированных в процессе эволюции». Hum Genet . 109 (5): 542–50. DOI : 10.1007 / s00439-001-0610-5 . PMID 11735030 . S2CID 24508386 .
^ a b «Ген Entrez: фактор элонгации GFM1 G, митохондрия 1» .
^ «Данные клинической химии для Gfm1» . Wellcome Trust Институт Сэнгера.
^ «Данные лимфоцитов периферической крови для Gfm1» . Wellcome Trust Институт Сэнгера.
^ « Данные о заражении сальмонеллой для Gfm1» . Wellcome Trust Институт Сэнгера.
^ « Данные о заражении Citrobacter для Gfm1» . Wellcome Trust Институт Сэнгера.
^ а б в г Гердин А.К. (2010). «Программа генетики мыши Сэнгера: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica . 88 : 925–7. DOI : 10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x . S2CID 85911512 .
^ Портал ресурсов мыши , Wellcome Trust Sanger Institute.
^ "Международный Консорциум Нокаут-Мышей" .
^ "Информатика генома мыши" .
^ Скарнес, WC; Rosen, B .; Запад, AP; Koutsourakis, M .; Бушелл, Вт .; Iyer, V .; Мухика, АО; Thomas, M .; Harrow, J .; Cox, T .; Джексон, Д .; Severin, J .; Biggs, P .; Fu, J .; Нефедов, М .; Де Йонг, П.Дж.; Стюарт, AF; Брэдли, А. (2011). «Ресурс с условным нокаутом для полногеномного исследования функции генов мыши» . Природа . 474 (7351): 337–342. DOI : 10,1038 / природа10163 . PMC 3572410 . PMID 21677750 .
^ Долгин E (2011). "Библиотека мыши настроена на нокаут" . Природа . 474 (7351): 262–3. DOI : 10.1038 / 474262a . PMID 21677718 .
^ Коллинз Ф., Rossant Дж, Вурст Вт (2007). «Мышь на все случаи жизни». Cell . 128 (1): 9–13. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.12.018 . PMID 17218247 . S2CID 18872015 .
↑ van der Weyden L, White JK, Adams DJ, Logan DW (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма» . Genome Biol . 12 (6): 224. DOI : 10.1186 / GB-2011-12-6-224 . PMC 3218837 . PMID 21722353 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Бек Дж., Керьян П., Жа XD, Уоллер Дж. П. (1990). «Валил-тРНК синтетаза из печени кролика. I. Очистка как гетеротипический комплекс в сочетании с фактором элонгации 1» . J. Biol. Chem . 264 (35): 21131–7. DOI : 10.1016 / S0021-9258 (19) 30056-0 . PMID 2556394 .
Моторин Ю.А. Wolfson AD; Орловский А.Ф .; Гладилин К.Л. (1988). «Валил-тРНК синтетаза млекопитающих образует комплекс с первым фактором элонгации». FEBS Lett . 238 (2): 262–4. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (88) 80492-7 . PMID 3169261 . S2CID 45934458 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. DOI : 10,1038 / нг1285 . PMID 14702039 .
Бхаргава К., Темплтон П., Спремулли Л.Л. (2005). «Экспрессия и характеристика изоформы 1 фактора G удлинения митохондрий человека». Protein Expr. Purif . 37 (2): 368–76. DOI : 10.1016 / j.pep.2004.06.030 . PMID 15358359 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. DOI : 10.1101 / gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Коенен М.Дж., Антоника Х., Угальде С. и др. (2004). «Мутантный фактор элонгации митохондрий G1 и дефицит комбинированного окислительного фосфорилирования» . N. Engl. J. Med . 351 (20): 2080–6. DOI : 10.1056 / NEJMoa041878 . ЛВП : 2066/143650 . PMID 15537906 .
Антоника Х., Сасарман Ф., Кеннауэй Н.Г., Шубридж Э.А. (2006). «Молекулярная основа тканевой специфичности дефицита окислительного фосфорилирования у пациентов с мутациями митохондриального фактора трансляции EFG1» . Гм. Мол. Genet . 15 (11): 1835–46. DOI : 10,1093 / HMG / ddl106 . PMID 16632485 .
Валенте Л., Тиранти В., Марсано Р.М. и др. (2007). «Детская энцефалопатия и дефектная трансляция митохондриальной ДНК у пациентов с мутациями факторов элонгации митохондрий EFG1 и EFTu» . Являюсь. J. Hum. Genet . 80 (1): 44–58. DOI : 10.1086 / 510559 . PMC 1785320 . PMID 17160893 .
