Gracilicutes

Gracilicutes
Клетки Escherichia coli увеличены в 25000 раз
Научная классификация
Домен:	Бактерии
(без рейтинга):	Gracilicutes Гиббонс и Мюррей 1978 [1]
Superphyla / Phyla
Протеобактерии Planctobacteria Sphingobacteria Spirochaetae Acidobacteria

Gracilicutes ( лат . Gracilis , стройный и кутис , кожа, относится к клеточной стенке) является кладой бактериальной филогении. ^[2]

Традиционно Граму результаты были наиболее часто используется в качестве инструмента классификации, следовательно , до появления молекулярной филогении , Королевство Monera (как домены Бактерии и археи были известны в то время ) был разделен на четыре фил , ^{[3] [4]}

• Gracilicutes ( грамотрицательный , делится на множество групп, но некоторые авторы все еще используют его в более узком смысле)
• Firmacutes [sic] ( грамположительный , впоследствии исправленный на Firmicutes, ^[5] сегодня он исключает Actinobacteria )
• Молликуты (граммовая переменная, переименованная кзади в Tenericutes , например Mycoplasma )
• Mendosicutes (неравномерное окрашивание по Граму, «метаногенные бактерии», теперь известные как метаногены и классифицируемые как археи )

От этой системы классификации отказались в пользу трехдоменной системы, основанной на молекулярной филогении, начатой ​​К. Вёзе. ^{[6] [7]}

Этот таксон был возрожден в 2006 году Кавалье-Смитом как инфракиндгом, содержащий типы Spirochaetae , Sphingobacteria (FCB), Planctobacteria (PVC) и Proteobacteria . ^[8] Это грамотрицательная клада, ответвившаяся от других бактерий непосредственно перед эволюционной потерей внешней мембраны или капсулы и сразу после эволюции жгутиков . ^[8] Этот таксон не является общепринятым, и используется трехдоменная система. ^[9]

Практически идентичный таксон под названием Hydrobacteria был определен в 2009 году с использованием биоинфоматических методов. Это контрастирует с другой основной группой эубактерий, называемой террабактериями . Анализ также изменил внутреннюю филогению этой группы: PVC-FCB-Spirochaetae были помещены в кладу рядом с Proteobacteria. То, что было ПВХ, описывается как полифилетическое . ^[10] Однако в других последующих филогенетических анализах группа ПВХ была выделена как монофилетическая.

Отношения [ править ]

Филогенетическое дерево согласно филогенетическому анализу Баттистуцци (2009) выглядит следующим образом и с калибровкой молекулярных часов . ^[10]

Недавний филогенетический анализ показал, что протеобактерии представляют собой парафилетический тип, который может охватывать несколько недавно обнаруженных типов-кандидатов и других типов, таких как Acidobacteria , Chrysiogentes , Deferribacteres и, возможно, Aquificae . Это предполагает, что Gracilicutes или Hydrobacteria в качестве клады могут включать несколько кандидатов, более близких к Proteobacteria, Spirochaetes, группе PVC и группе FCB, чем к бактериям из клады Terrabacteria. Некоторые из этих типов были отнесены к протеобактериям. Например, Кавальер-Смит в своем предложении о шести царствах включал Acidobacteria , Aquificae , Chrysiogentes иДеферрибактерии как часть протеобактерий. ^[11]

Филогенетический анализ выявил примерно следующую филогению между основными и некоторыми более тесно связанными типами. ^{[12] [13] [14] [15]}

Согласно филогенетическому анализу Hug (2016), отношения могли быть следующими. ^[16]

Согласно филогенетическому анализу Zhu (2019), отношения могут быть следующими: ^[15]

На следующем графике показана версия Древа жизни Кавалье-Смита , указывающая на статус Грасиликутов. Однако это дерево не подтверждается каким-либо молекулярным анализом, поэтому его не следует считать филогенетическим.

Ссылки [ править ]