 | Эта статья может быть слишком технической, чтобы ее могло понять большинство читателей . ( Май 2017 г. ) ( Узнайте, как и когда удалить этот шаблон сообщения ) |
главный комплекс гистосовместимости (человек), класс I, Cw * 16 | ||
| Аллели | Cw * 1601 Cw * 1602 | |
| Структура (см. HLA-C ) | ||
| Идентификаторы | 1601 1602 | |
| Символ (ы) | HLA-C [ постоянная неработающая ссылка ] | |
| EBI-HLA | Cw * * 1601 | |
| Cw * * 1602 | ||
| Общие данные | ||
| Locus | чр.6 6п21.31 | |
HLA-Cw * 16 (Cw * 16) представляет собой HLA - С аллель -группа. Серотип определяет наиболее распространенные генные продукты HLA-Cw * 16. [1] Эта группа аллелей чаще всего встречается в Западной Африке, но единственный гаплотип Cw16 встречается в Западной Европе с необычно высокими частотами. Полезных серологических тестов на Cw * 16 нет. [2]
Аллели [ править ]
| частота | ||
| исх. | численность населения | (%) |
| [3] | Бандиагара ( Мали ) | 28,3 |
| [3] | Фулани ( Буркина-Фасо ) | 21,4 |
| [3] | Мосси (Буркина-Фасо) | 17,9 |
| [3] | Ниохоло Мандинка ( Сенегал ) | 16,8 |
| [3] | Гипускоа Баск ( Испания ) | 16,6 |
| [3] | Римаильбе (Буркина-Фасо) | 16.0 |
| [3] | Ибицы (Испания) | 11,4 |
| [3] | Буби (Биоко, уравнение, Гвинея) | 10,5 |
| [3] | Лусака (Замбия) | 10.0 |
| [3] | Жирона ( Каталония , Испания) | 9,8 |
| [3] | Кения | 8,4 |
| [3] | Шона (Хараре, Зимбабве) | 8.0 |
| [3] | Тунис | 7.2 |
| [3] | Майорка и Менорка (Испания) | 7.1 |
| [3] | Восточная Андалусия (Испания) | 6,7 |
| [3] | Бети ( Камерун ) | 6.0 |
| [3] | Юго-Восточная Франция | 5.1 |
| [3] | E. Andalusia Gypsy (Испания) | 5.1 |
| [3] | Северная Ирландия | 5.0 |
| [3] | Суданский | 5.0 |
| [3] | Кампала ( Уганда ) | 4.9 |
| [3] | Бамилеке (Камерун) | 4.5 |
| [3] | Луо ( Кения ) | 4.5 |
| [3] | Нанди (Кения) | 4.4 |
| [3] | Кавказцы ( Великобритания ) | 4.1 |
| [3] | Сава (Камерун) | 3.8 |
| [3] | Маратхи ( Мумбаи , Индия ) | 3,7 |
| [3] | Центральная Португалия | 3,7 |
| [3] | Корсика ( Франция ) | 3.5 |
| [3] | Надор М. Бербер ( Марокко ) | 3,2 |
| [3] | Бергамо ( Италия ) | 3.0 |
| [3] | Женева ( Швейцария ) | 2,7 |
| [3] | Тибилиси (Грузия) | 1.9 |
| [3] | Курды (Грузия) | 1,7 |
| [3] | Мбензеле (Центральноафриканская республика) | 1.5 |
| [3] | Синдхи (Пакистан) | 1.5 |
| [3] | Guraiat & Hail ( Саудовская Аравия ) | 1.2 |
| [3] | Белудж ( Иран ) | 1.0 |
| [3] | Натал Тамил ( Южная Африка ) | 1.0 |
| [3] | (Сирая) Тайвань | 1.0 |
| [3] | Западная Франция | 0,5 |
| [3] | Ливан | 0,5 |
| [3] | Тегеран ( Иран ) | 0,4 |
| [3] | индюк | 0,4 |
| [3] | Амман, Иордания) | 0,3 |
| [3] | Лакота Сиу (США) | 0,3 |
| [3] | Юпик Эскимос (США) | 0,2 |
Cw * 1601 [ редактировать ]
Хотя Cw * 1601, вероятно, не эволюционировал в Западной Африке , он определенно расширился, и это регион, в котором наблюдается большая часть разнообразия гаплотипов. Поскольку таблица частот для Cw * 1601 показывает, что самые высокие частоты для данной северной широты, более или менее, следует за 0 - м меридианом от Западной Африки до Соединенного Королевства , за исключением пучности в Западной Франции , что указывает на смещение в этих регионах. или ядро миграции несущих Cw * 16 вдоль Восточного региона. Есть вторичный узел у басков в Испании., однако, учитывая очень небольшую диверсификацию гаплотипов (см. гаплотип A29-Cw * 16-B44 на этой странице), указывает на то, что это результат асимметричной экспансии или отбора аллеля в пределах Басков.
Мандинка в Сенегале связана с Бандиагара в Мали, потому что Малийская империя заселила Сенегал. Bubi находятся на островах у берегов Экваториальной Гвинеи (Нажмите на карту , чтобы увеличить до полного размера , чтобы увидеть острова)
Другие аллели и гаплотипы следуют аналогичной схеме. DR7-DQ2, DR3-DQ2 и A * 2901 следуют аналогичной схеме очевидного потока генов из Африки в Западную Европу. Хотя для DR3-DQ2 миграция, по-видимому, связана с B8 и, вероятно, произошла в раннем поселении AMH в Европе.
Гаплотипы [ править ]
A29-Cw * 16-B44 [ редактировать ]
| частота | ||
| исх. | численность населения | (%) |
| A29-Cw16-B44 (A * 2902: Cw * 1601: B * 4403) | ||
| Басков, Гипускоа (Испания) | 10,3 | |
| Басков, Сан-Себастион (Испания) | 7,5 | |
| Долина Пасьегос (Испания) | 5,4 | |
| Басков, Арратия (Испания) | 5,3 | |
| [4] | Корнуолл (Греч. Британия) | 5,3 |
| [4] | испанский | 5.0 |
| Уате Корс (Франция) | 4.3 | |
| Париж, Франция) | 3.9 | |
| португальский | 3.5 | |
| [4] | французкий язык | 3,4 |
| Ирландский | 3,4 | |
| Южноафриканский (Индиг.) | 2,7 | |
| N. Irish | 2,8 | |
| [4] | Датчанин | 2.2 |
| Тунис | 2.0 | |
| Уэльс | 2.0 | |
| Тосканский | 1,7 | |
| нидерландский язык | 1.4 | |
| Немецкий | 1.3 | |
| Тропический лес (Камерун) | 1.3 | |
A29-Cw16-B44 (A * 2902: Cw * 1601: B * 4403), по-видимому, произошел в Западной Африке, где частота Cw * 16 была самой высокой и претерпела большее равновесие по сцеплению. Cw * 16 медленно снижается в направлении на север и более быстро на восток и северо-восток, с самой высокой частотой / широтой к северу, как правило, вдоль Восточной Испании в Британские Ильзы, некоторые текут вверх по каналу, но частота гаплотипов падает во внутренних частях Европы.
Этот гаплотип в общем случае может быть увеличен с A- до -DQ , как А29 - Cw16 - В44 - DR7 - DQ2.2 :
A * 2901 : Cw * 1601 : B * 4403 : DRB1 * 0701 : DQA1 * 0201 : DQB1 * 0202
И компонент Cw16 находится в сильном неравновесии по сцеплению с компонентом DR7-DQ2.2, указывая тем самым, что с момента появления гаплотипов в Европе не было достаточно времени для уравновешивания, поддерживая его недавнее внедрение в Европу. Этот конкретный гаплотип поддерживает теории миграции, которые более многочисленны, чем те, которые поддерживаются мтДНК или информацией о Y-хромосоме, многие такие «меньшие» миграции очевидны с гаплотипами HLA, предполагая гораздо большую сложность для человеческой популяции, чем гаплоидные локусы.
Ссылки [ править ]
- ^ Cianetti L, Testa U, Scotto L, et al. (1989). «Три новых аллеля HLA класса I: структура мРНК и альтернативные механизмы процессинга». Иммуногенетика . 29 (2): 80–91. DOI : 10.1007 / BF00395855 . PMID 2914713 .
- ^ Марш, SG; Альберт, ED; Бодмер, ВФ; Bontrop, RE; Dupont, B .; Эрлих, HA; Fernández-Viña, M .; Geraghty, DE; Holdsworth, R .; Херли, СК; Lau, M .; Ли, кВт; Мах, Б .; Maiers, M .; Mayr, WR; Мюллер, CR; Parham, P .; Петерсдорф, EW; Sasazuki, T .; Строминджер, JL; Svejgaard, A .; Терасаки, ИП; Tiercy, JM; Троусдейл, Дж. (2010). «Номенклатура факторов системы HLA, 2010» . Тканевые антигены . 75 (4): 291–455. DOI : 10.1111 / j.1399-0039.2010.01466.x . PMC 2848993 . PMID 20356336 .
- ^ a b c d e f g h i j k l m n o p q r s t u v w x y z aa ab ac ad ae af ag ah ai aj ak al am an ao ap aq ar as at au Middleton D , Menchaca L, Rood H, Komerofsky R (2003). «Новая база данных частот аллелей: http://www.allelefrequencies.net ».Тканевые антигены . 61 (5): 403–7. DOI : 10.1034 / j.1399-0039.2003.00062.x . PMID 12753660 . Внешняя ссылка в
|title=( помощь ) - ^ a b c d Сасадзуки, Такехико; Цудзи, Кимиёси; Айзава, Мики (1992). HLA 1991: Труды одиннадцатого Международного гистосовместимости семинара и конференции, состоявшейся в Иокогаме, Япония, 6-13 ноября 1991 . Оксфорд [Оксфордшир]: Издательство Оксфордского университета. ISBN 978-0-19-262390-4.
