Протеин тирозин фосфатаза, тип рецептора, С также известный как PTPRC представляет собой фермент , который, в организме человека, кодируется PTPRC гена . [5] PTPRC также известен как антиген CD45 (CD означает кластер дифференцировки ), который первоначально назывался общим антигеном лейкоцитов ( LCA ). [6]
PTPRC |
---|
|
Доступные конструкции |
---|
PDB | Ортолог поиск: PDBe RCSB |
---|
Список идентификационных кодов PDB |
---|
1YGU , 1YGR , 5FMV , 5FN6 , 5FN7 |
|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | PTPRC , B220, CD45, CD45R, GP180, L-CA, LCA, LY5, T200, протеинтирозинфосфатаза, рецептор типа C, рецептор протеинтирозинфосфатазы типа C |
---|
Внешние идентификаторы | OMIM : 151460 MGI : 97810 HomoloGene : 2126 GeneCards : PTPRC |
---|
Расположение гена ( человек ) |
---|
| Chr. | Хромосома 1 (человека) [1] |
---|
| Группа | 1q31.3-q32.1 | Начинать | 198 638 457 п.н. [1] |
---|
Конец | 198 757 476 п.н. [1] |
---|
|
Расположение гена ( Мышь ) |
---|
| Chr. | Хромосома 1 (мышь) [2] |
---|
| Группа | 1 E4 | 1 60,73 см | Начинать | 138 062 861 п.н. [2] |
---|
Конец | 138 175 708 п.н. [2] |
---|
|
|
Онтология генов |
---|
Молекулярная функция | • фосфопротеином фосфатазы • фосфатазы • ГО: связывание белка 0001948 • трансмембранный белок рецептора тирозин фосфатазы • протеинкиназы связывания • гидролазная активность • протеин - тирозин - фосфатазы
|
---|
Сотовый компонент | • составной компонент мембраны • мембрана • очаговая адгезия • плазматическая мембрана • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • поверхность клетки • мембранный слой • внеклеточная экзосома • внешняя сторона плазматической мембраны • мембрана секреторных гранул
|
---|
Биологический процесс | • рецепторов В - клеток сигнального пути • фазовый переход клеточного цикла • высвобождение поглощенных ионов кальция в цитозоле • отрицательное регулирование активности протеинкиназы • развитие костного мозга • стволовых развития клеток • белок дефосфорилирование • отрицательное регулирование цитокин-опосредованного сигнального пути • положительное регулирование миграция гемопоэтических стволовых клеток • регуляция клеточного цикла • негативная регуляция клеточной адгезии, участвующая в миграции клеток, связанных с субстратом • негативная регуляция опосредованной Т-клетками цитотоксичности • сигнальный путь рецептора клеточной поверхности • пролиферация В-клеток • дифференцировка Т-клеток • позитивная регуляция В-клеток пролиферация • защитный ответ на вирус • позитивная регуляция пролиферации Т-клеток • дифференцировка гемопоэтических клеток-предшественников • позитивная регуляция сигнального пути, опосредованного рецептором антигена • сигнальный путь рецептора Т-клеток • позитивная регуляция пролиферации стволовых клеток • дефосфорилирование • позитивная регуляция протеинкиназы ac активность • дефосфорилирование пептидилтирозина • дегрануляция нейтрофилов
|
---|
Источники: Amigo / QuickGO |
|
Ортологи |
---|
Разновидность | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ансамбль | |
---|
ENSG00000081237 ENSG00000262418 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | |
---|
NM_001267798 NM_002838 NM_080921 NM_080922 |
| |
---|
NM_001111316 NM_001268286 NM_011210 |
|
---|
RefSeq (белок) | |
---|
NP_001254727 NP_002829 NP_563578 NP_563578.2 NP_002829.3 |
| |
---|
NP_001104786 NP_001255215 NP_035340 |
|
---|
Расположение (UCSC) | Chr 1: 198.64 - 198.76 Мб | Chr 1: 138.06 - 138.18 Мб |
---|
PubMed поиск | [3] | [4] |
---|
Викиданные |
Просмотр / редактирование человека | Просмотр / редактирование мыши |
|
Белковый продукт этого гена, наиболее известный как CD45, является членом семейства протеинтирозинфосфатаз (PTP). PTP - это сигнальные молекулы, которые регулируют множество клеточных процессов, включая рост клеток, дифференцировку, митотический цикл и онкогенную трансформацию. CD45 содержит внеклеточный домен, один трансмембранный сегмент и два тандемных внутрицитоплазматических каталитических домена и, таким образом, принадлежит к семейству PTP рецепторного типа. [ необходима цитата ]
CD45 представляет собой трансмембранный белок типа I, который присутствует в различных изоформах на всех дифференцированных гемопоэтических клетках (кроме эритроцитов и плазматических клеток ). [7] Было показано, что CD45 является важным регулятором передачи сигналов Т- и В-клеточного антигенного рецептора. Он функционирует либо посредством прямого взаимодействия с компонентами комплексов рецептора антигена через его внеклеточный домен (форма костимуляции ), либо путем активации различных киназ семейства Src, необходимых для передачи сигналов рецептора антигена через его цитоплазматический домен. CD45 также подавляет киназы JAK и, таким образом, действует как негативный регулятор передачи сигналов рецептора цитокина . [ необходима цитата ]
Сообщалось о многих альтернативно сплайсированных вариантах транскриптов этого гена, которые кодируют различные изоформы. [6] Антитела против различных изоформ CD45 используются в рутинной иммуногистохимии для дифференциации типов иммунных клеток, а также для различения гистологических срезов лимфом и карцином. [8]
Семейство белков CD45 состоит из нескольких членов, которые являются продуктами одного сложного гена. Этот ген содержит 34 экзона , производящих массивный белок с необычно большими внеклеточными и цитоплазматическими доменами. Экзоны 4, 5 и 6 (соответствующие областям белка A, B и C) альтернативно сплайсируются для получения до восьми различных белковых продуктов, содержащих комбинации из нуля, одного, двух или всех трех экзонов. [9]
Большой внеклеточный домен CD45 сильно гликозилирован, и эти восемь изоформ допускают широкие вариации в структуре его боковых цепей. Изоформы влияют на N-концевую область белка, которая линейно выходит из клетки и несет О-связанные гликановые цепи. [ необходима цитата ]
Изоформы CD45 демонстрируют специфическую экспрессию клеточного типа и стадии дифференцировки, паттерн, который довольно хорошо сохраняется у млекопитающих. [10] Эти изоформы часто используются в качестве маркеров, которые идентифицируют и различают разные типы иммунных клеток.
Наивные Т-лимфоциты обычно положительны в отношении CD45RA, который включает только область белка А. Активированные Т-лимфоциты памяти экспрессируют CD45RO, самую короткую изоформу CD45, в которой отсутствуют все три области A, B и C. Эта кратчайшая изоформа способствует активации Т-клеток. [ необходима цитата ]
CD45R (также известный как CD45RABC) содержит все три возможных экзона. Это самый длинный белок, который при выделении из Т-клеток мигрирует при 200 кДа. В-клетки также экспрессируют CD45R с более тяжелым гликозилированием, в результате чего молекулярная масса достигает 220 кДа, отсюда и название B220 (изоформа В-клеток 220 кДа). Экспрессия B220 не ограничивается В-клетками, а также может экспрессироваться на активированных Т-клетках, на подмножестве дендритных клеток и на других антигенпрезентирующих клетках. [ необходима цитата ]
Было показано, что PTPRC взаимодействует с:
- ГАНАБ , [11] [12] [13]
- LYN , [14]
- Lck , [15] [16] и
- SKAP1 . [17]
Недавно было показано, что CD45 взаимодействует с белком UL11 HCMV . Это взаимодействие приводит к функциональному параличу Т-клеток . [18] Кроме того, было показано, что CD45 является мишенью для белка E3 / 49K аденовируса 19a вида D. Он ингибирует активацию NK- и Т-клеток. [19]
CD45 представляет собой белок пан-лейкоцитов с активностью тирозинфосфатазы, участвующий в регуляции передачи сигнала в кроветворении. CD45 не колокализуется с липидными рафтами на нетрансформированных гемопоэтических клетках мыши и человека, но расположение CD45 внутри липидных рафтов модифицируется во время их онкогенной трансформации в острый миелоидный лейкоз . CD45 колокализуется с липидными рафтами на клетках AML, что способствует повышению интенсивности сигнала GM-CSF, участвующего в пролиферации лейкозных клеток. [ необходима цитата ]
У мышей есть два идентифицируемых аллеля CD45: CD45.1 (исторически Ly5.1) и CD45.2 (исторически Ly5.2). [20] Считается, что эти два типа CD45 функционально идентичны. Таким образом, они обычно используются в научных исследованиях для идентификации клеток. Например, лейкоциты могут быть перенесены от мыши-донора CD45.1 в мышь-хозяин CD45.2 и впоследствии могут быть идентифицированы благодаря экспрессии ими CD45.1. Этот метод также обычно используется при создании химер. Альтернативной системой является использование аллелей CD90 (Thy1), причем система CD90.1 / CD90.2 используется так же, как система CD45.1 / CD45.2. [ необходима цитата ]
В 2016 году на фоне C57Bl / 6 была создана новая мышь с нокаутом, которая стала идеальным конгенным штаммом. [21] Эта мышь, названная мышью CD45.1STEM, отличается от штамма C57Bl / 6 одной парой оснований, приводящей к одной замене аминокислоты, которая придает различие в реактивности анти-CD45.1 и анти-CD45. 2 антитела. Этот штамм был разработан для конкурентных анализов трансплантации костного мозга и продемонстрировал полную эквивалентность, в отличие от предыдущего стандарта, мыши "SJL", более официально известной как Pep Boy. [22]