В области генетики человека , А человек митохондриальная гаплогруппа ДНК является гаплогруппа определяется различиями в митохондриальной ДНК человека . Гаплогруппы используются для обозначения основных точек ветвления митохондриального филогенетического дерева. Понимание эволюционного пути женского происхождения помогло популяционным генетикам проследить матрилинейную наследственность современных людей до происхождения человека в Африке и последующего распространения по всему миру.
Буквенные названия гаплогрупп (а не только гаплогрупп митохондриальной ДНК) идут от A до Z. Поскольку гаплогруппы были названы в порядке их открытия, алфавитный порядок не имеет никакого значения с точки зрения реальных генетических отношений.
Гипотетическая женщина, лежащая в основе всех этих групп (имея в виду только гаплогруппы митохондриальной ДНК), является самым последним общим предком по матрилине (MRCA) для всех ныне живущих людей . Ее обычно называют митохондриальной Евой .
Скорость мутации митохондриальной ДНК известна как митохондриальные молекулярные часы . Это область постоянных исследований, в одном исследовании сообщается об одной мутации за 8000 лет. [2]
Филогения [ править ]
Часть серии по |
Генетическая генеалогия |
---|
Концепции |
похожие темы |
Это филогенетическое древо основано Ван Овеном (2009). [4]
- L ( митохондриальный канун )
- L0
- L1-6
- L1
- L2-6
- L5
- L2'3'4'6
- L2
- L3'4'6
- L6
- L3'4
- L4
- L3
- N
- N1 : Я
- N2 : W
- N9: Y
- А
- S
- Икс
- р
- R0 (FMKA pre-HV)
- HV : ( H , V )
- pre-JT или R2'JT
- JT : ( Дж , Т )
- R9: F
- R11'B: B
- п
- U (ранее Великобритания )
- U8 : K
- R0 (FMKA pre-HV)
- О
- M
- M9: E
- M12'G: G
- M29'Q: Q
- D
- M8: CZ ( C , Z )
- N
Хронология [ править ]
Гаплогруппа | Стандартное восточное время. время происхождения ( тыс. лет назад ) [5] | Возможное место происхождения | Самые высокие частоты |
---|---|---|---|
L | 200 | ||
L1-6 | 170 | Восточная Африка | |
L2-6 | 150 | Восточная Африка | |
L0 | 150 | Восточная Африка | |
L1 | 140 | Центральная Африка | |
L3-6 | 130 | ||
L5 | 120 | ||
L2 | 90 | ||
L3 | 70 | Восточная Африка | |
N | 70 | Восточная Африка или Западная Азия | |
M | 60 | Восточная Африка, Западная Азия или Южная Азия | |
р | 60 | ||
U | 55 | Северо-Восточная Африка или Индия (Южная Азия) | |
RT'JT | 55 | Средний Восток | |
JT | 50 | Средний Восток | |
U8 | 50 | Западная Азия | |
R9 | 47 | ||
B4 | 44 | ||
F | 43 год | ||
U4'9 | 42 | Центральная Азия | |
U5 | 35 год | Западная Азия | |
U6 | 35 год | Северная Африка | |
J | 35 год | ||
Икс | 30 | ||
K | 30 | ||
U5a | 27 | ||
HV | 27 | Ближний Восток | |
J1a | 27 | Ближний Восток | |
Т | 27 | Месопотамия | |
K1 | 27 | ||
я | 26 | ||
J1 | 24 | Ближний Восток | |
W | 20 | ||
U4 | 20 | Центральная Азия | |
X2 | 20 | ||
ЧАС | 20 | Западная Азия | |
U5a1 | 18 | Европа | |
J1b | 11 | ||
V | 14 | ||
X2a | 13 | Северная Америка | |
H1 | 12 | ||
H3 | 12 | ||
X1 | 10 |
Географическое распространение [ править ]
В документе 2004 года было высказано предположение, что наиболее распространенными гаплогруппами в современных европейских популяциях были: H, J, K, N1, T, U4, U5, V, X и W. [6]
Африканские гаплогруппы: L0, L1, L2, L3, L4, L5, L6, T, U5a
Австралийские гаплогруппы: M42a, M42c, M14, M15, Q, S, O, N, P. (ссылки 1, 2, 3, 4, 5, 6)
Азиатские гаплогруппы: F, C, W, M, D, N, K, U, T, A, B, C, Z, U множество вариантов номеров для каждого раздела
См. Также [ править ]
- Митохондриальная генетика человека
- Генетическая генеалогия
- Матрилинейность
- Гаплогруппы ДНК Y-хромосомы человека
- Популяционная генетика
Ссылки [ править ]
- ^ Rishishwar L, Иордания IK (2017). «Последствия эволюции человека и добавки для митохондриальной заместительной терапии» . BMC Genomics . 18 (1): 140. DOI : 10,1186 / s12864-017-3539-3 . PMC 5299762 . PMID 28178941 .
- ^ Loogvali, Eva-Liis; Кивисилд, Тоомас; Маргус, Тыну; Виллемс, Ричард (2009), О'Рурк, Деннис (редактор), «Объясняя несовершенство молекулярных часов митохондрий гоминид», PLOS ONE , 4 (12): e8260, Bibcode : 2009PLoSO ... 4.8260L , doi : 10.1371 / journal.pone.0008260 , PMC 2794369 , PMID 20041137
- ^ Кивисильд Т (2015). «Материнское происхождение и история популяции из целых митохондриальных геномов» . Исследование Genet . 6 : 3. DOI : 10,1186 / s13323-015-0022-2 . PMC 4367903 . PMID 25798216 .
- ^ a b van Oven M, Kayser M (февраль 2009 г.). «Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека» . Мутация человека . 30 (2): E386–94. DOI : 10.1002 / humu.20921 . PMID 18853457 . S2CID 27566749 .
- ^ «Исправление для очищающего отбора: Дополнение к улучшенным митохондриальным молекулярным часам человека» (PDF) . 2009: 82–83 [89]. Архивировано из оригинального (PDF) 29 декабря 2009 года. Цитировать журнал требует
|journal=
( помощь ) - ^ Виллемс, Ричард; Усанга, Эсиен; Микерези, Илья; Гельге, Мукаддес; Клаустр, Мирей; Michalodimitrakis, Emmanuel N .; Папа, Каллиопи I .; Anagnou, Николас П .; Шавентре, Андре; Мойзан, Жан-Поль; Ричард, Кристель; Гречанина, Елена; Балановская, Елена В .; Рудан, Павао; Пузырев, Валерий; Степанов, Вадим; Хуснутдинова, Эльза К .; Гусар, Владислава; Балановский, Олег П .; Перичич, Марияна; Барак, Ловорка; Голубенко, Мария; Лункина, Арина; Лаос, Сирль; Пеннарун, Эрван; Парик, Юри; Толк, Хелле-Вийви; Рейдла, Маэре; Тамбец, Кристина; Мецпалу, Эне; Кивисилд, Тоомас; Деренко, Мирослава В .; Малярчук, Борис А .; Роосталу, Урмас; Лоогвяли, Ева-Лийс (1 ноября 2004 г.). «Разъединяющая однородность: пестрый кладистический холст гаплогруппы H мтДНК в Евразии» . Молекулярная биология и эволюция. 21 (11): 2012–2021. DOI : 10.1093 / molbev / msh209 . PMID 15254257 - через Acade.oup.com .
Внешние ссылки [ править ]
Викискладе есть медиафайлы, связанные с гаплогруппами мтДНК человека . |
- Митохондриальные филогенетические деревья
- PhyloTree.org Манниса ван Овена
- PhyloD3 - основанное на D3.js филогенетическое дерево на основе PhyloTree
- Скелет митохондриальной гаплогруппы
- Мотивы митохондриальной гаплогруппы Винсента Маколея
- Список проектов гаплогрупп мтДНК
- MitoTool: веб-сервер для анализа и поиска вариаций последовательности митохондриальной ДНК человека
- HaploGrep: определение гаплогруппы мтДНК на основе PhyloTree.org
- HaploFind - быстрый конвейер автоматического назначения гаплогрупп для митохондриальной ДНК человека
Филогенетическое дерево гаплогрупп митохондриальной ДНК человека (мтДНК) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Митохондриальная Ева ( L ) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L0 | L1–6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L1 | L2 | L3 | L4 | L5 | L6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
M | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CZ | D | E | грамм | Q | О | А | S | р | я | W | Икс | Y | |||||||||||||||||||||||||||
C | Z | B | F | R0 | pre-JT | п | U | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HV | JT | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ЧАС | V | J | Т |