РНК-вирусы с положительной цепью ( +ssRNA вирусы ) представляют собой группу родственных вирусов , которые имеют одноцепочечные геномы с положительным смыслом, состоящие из рибонуклеиновой кислоты . Геном с положительным смыслом может действовать как матричная РНК (мРНК) и может напрямую транслироваться в вирусные белки рибосомами клетки -хозяина . РНК-вирусы с положительной цепью кодируют РНК-зависимую РНК-полимеразу (RdRp), которая используется во время репликации генома для синтеза антигенома с отрицательным смыслом, который затем используется в качестве матрицы для создания нового вирусного генома с положительным смыслом.
РНК-вирусы с положительной цепью делятся на типы Kitrinoviricota , Lenarviricota и Pisuviricota (в частности, классы Pisoniviricetes и Stelpavirictes ), все из которых относятся к царству Orthornavirae и царству Riboviria . [1] Они монофилетичны и произошли от общего предка РНК-вируса. В системе классификации Балтимора вирусы +ssRNA относятся к группе IV. [2]
РНК-вирусы с положительным смыслом включают патогены , такие как вирус гепатита С , вирус Западного Нила , вирус денге и коронавирусы MERS , SARS и SARS-CoV-2 [3] , а также менее клинически серьезные патогены, такие как коронавирусы и риновирусы , вызывающие простуду . [4] [5] [6]
Геномы РНК-вирусов с положительной цепью обычно содержат относительно немного генов, обычно от трех до десяти, включая РНК-зависимую РНК-полимеразу. [4] Коронавирусы имеют самые большие из известных геномов РНК, длиной от 27 до 32 тысяч оснований , и, вероятно, обладают механизмами проверки репликации в форме экзорибонуклеазы в неструктурном белке nsp14. [7]
РНК-вирусы с положительной цепью имеют генетический материал, который может функционировать как в качестве генома , так и в качестве матричной РНК ; он может быть непосредственно переведен в белок в клетке-хозяине с помощью рибосом хозяина . [8] Первые белки, экспрессируемые после заражения, выполняют функции репликации генома; они рекрутируют вирусный геном с положительной цепью в комплексы репликации вируса , образующиеся в ассоциации с внутриклеточными мембранами. Эти комплексы содержат белки как вирусного, так и клеточного происхождения и могут быть связаны с мембранами различных органелл — частошероховатый эндоплазматический ретикулум , но также включая мембраны, происходящие из митохондрий , вакуоли , аппарат Гольджи , хлоропласты , пероксисомы , плазматические мембраны , аутофагосомные мембраны и новые цитоплазматические компартменты. [4]
Репликация генома РНК с положительным смыслом происходит через двухцепочечные РНК- промежуточные соединения, и целью репликации в этих мембранных инвагинациях может быть предотвращение клеточного ответа на присутствие dsRNA. Во многих случаях во время репликации также создаются субгеномные РНК. [8] После инфицирования весь механизм трансляции клетки-хозяина может быть переключен на производство вирусных белков в результате очень высокого сродства к рибосомам элементов сайта внутренней посадки рибосомы (IRES) вирусного генома ; у некоторых вирусов, таких как полиовирусы и риновирусы , нормальный синтез белка в дальнейшем нарушается вирусной инфекцией.протеазы , расщепляющие компоненты, необходимые для инициации трансляции клеточной мРНК. [6]