Ретропозоны - это повторяющиеся фрагменты ДНК, которые вставляются в хромосомы после их обратной транскрипции с любой молекулы РНК .
Разница между ретропозонами и ретротранспозонами [ править ]
В отличие от ретротранспозонов , ретропозоны никогда не кодируют обратную транскриптазу (ОТ) (но см. Ниже). Следовательно, они являются неавтономными элементами в отношении транспозиционной активности (в отличие от транспозонов ). Ретротранспозоны с недлинным концевым повтором (LTR), такие как элементы LINE1 человека , иногда ошибочно называют ретропозонами. Однако это зависит от автора. Например, Ховард Темин опубликовал следующее определение: Ретропозоны кодируют RT, но лишены длинных концевых повторов (LTR), например длинных вкрапленных элементов (LINE). Ретротранспозоны также содержат LTR и ретровирусы., кроме того, упакованы в виде вирусных частиц (вирионов). Ретро-последовательности - это неавтономные элементы, лишенные RT. Они ретропозиционируются с помощью механизма автономных элементов, таких как ЛИНИИ; примерами являются короткие вкрапленные ядерные элементы (SINE) или полученные из мРНК ретро (псевдо) гены . [2] [3] [4]
Дупликации генов [ править ]
На ретропозицию приходится примерно 10 000 случаев дупликации генов в геноме человека, из которых примерно 2-10%, вероятно, являются функциональными. [5] Такие гены называются ретрогенами и представляют собой определенный тип ретропозонов. Классическим событием является ретропозиция сплайсированной молекулы пре-мРНК гена c-src в провирусного предка вируса саркомы Рауса (RSV) . Ретропозиционная пре-мРНК c-src все еще содержала единственный интрон и в RSV теперь называется геном v-src.
Ссылки [ править ]
- ^ Нильссон, Массачусетс; Чураков, Г .; Sommer, M .; Тран, Невада; Земанн, А .; Brosius, JR; Шмитц, младший (2010). «Отслеживание эволюции сумчатых животных с использованием вставок архаичных геномных ретропозонов» . PLOS Биология . 8 (7): e1000436. DOI : 10.1371 / journal.pbio.1000436 . PMC 2910653 . PMID 20668664 .
- ^ Тёмин HM (1989). «Ретроны в бактериях». Природа . 339 (6222): 254–5. Bibcode : 1989Natur.339..254T . DOI : 10.1038 / 339254a0 . PMID 2471077 .
- ^ Makałowski W, Y Тода (2007). «Модуляция генов-хозяев переносными элементами млекопитающих». В Volff JN, Schmid M (ред.). Эволюция генов и белков . Геномная динамика (3-е изд.). Базель: С. Каргер. п. 166. DOI : 10,1159 / 000107610 . ISBN 978-3-8055-8341-1. OCLC 729848415 . PMID 18753791 .
- ^ Makałowski Вт, Gotea В, Панда А, Makałowska I (2019). Анисимова М (ред.). «Мобильные элементы: классификация, идентификация и их использование в качестве инструмента сравнительной геномики» . Методы молекулярной биологии . Клифтон, штат Нью-Джерси, 1910 : 185–86. DOI : 10.1007 / 978-1-4939-9074-0_6 . ISBN 978-3-8055-8341-1. OCLC 145014779 . PMID 31278665 .
- ^ Эмерсон JJ, Кессманн H, Betrán E, Long M (январь 2004). «Обширный генный трафик на Х-хромосоме млекопитающих». Наука . 303 (5657): 537–40. Bibcode : 2004Sci ... 303..537E . DOI : 10.1126 / science.1090042 . PMID 14739461 .
