Малая РНК, специфичная для тельца Кахаля

РНК, специфичная для малых тельцов Кахаля 1
Прогнозируемая вторичная структура специфической РНК малых тельцов Кахаля 1
Идентификаторы
Условное обозначение	SCARNA1
Рфам	RF00553
Прочие данные
Тип РНК	Ген , мяРНК , snoRNA , scaRNA;
Домен (ы)	Позвоночные
Структуры PDB	PDBe

Малые РНК, специфичные для тельца Кахаля ( scaRNAs ), представляют собой класс малых ядрышковых РНК (snoRNAs), которые специфически локализуются в тельце Кахаля , ядерной органелле (клеточной суборганелле), участвующей в биогенезе малых ядерных рибонуклеопротеидов (snRNPs или snurps). ScaRNAs направляют модификацию ( метилирование и псевдоуридилирование ) транскрибируемых РНК-полимеразой II сплайсосомных РНК U1 , U2 , U4 , U5 и U12 .

Первой идентифицированной скаРНК была U85. ^[1] Он отличается от типичных snoRNAs тем, что представляет собой составные snoRNAs C / D box и H / ACA box и может управлять как псевдоуридилированием, так и 2'-O-метилированием. Не все scaRNA являются составными snoRNA C / D и H / ACA box, и большинство scaRNA структурно и функционально неотличимы от snoRNAs, управляя модификацией рибосомной РНК (рРНК) в ядрышке .

ScaRNA дрозофилы [ править ]

Несколько исследований идентифицировали scaRNAs у Drosophila . ^[1]^[2]^[3]^[4]^[5] Одно из исследований показало, что несколько scaRNA дрозофилы могут одинаково хорошо функционировать в нуклеоплазме мутантных мух, у которых отсутствуют тельца Кахаля. ^[4] Дальнейшее исследование показало, что scaRNA pugU6-40 нацелена на U6 snRNA, модификация которой происходит в ядрышке, а не в CB, и что pugU1-6 и pug U2-55 направляют 2 РНК: snRNA и 28s рРНК. ^[5]

Малые тельца Кахаля РНК 1 [ править ]

В молекулярной биологии специфическая РНК 1 для малых тел Кахаля (также известная как SCARNA1 или ACA35) представляет собой небольшую ядрышковую РНК, обнаруженную в тельцах Кахаля и, как полагают, участвует в псевдоуридилировании сплайсосомальной РНК U2 по остатку U89.

scaRNA1 - это некодирующая РНК , которая является функциональным продуктом генов, не транслируемых в белки . Такие молекулы РНК обычно содержат важные вторичные структуры или лиганд- связывающие мотивы и участвуют во многих важных биологических процессах в клетке. ^[6]

scaRNA1 принадлежит к классу snoRNAs H / ACA box , поскольку он имеет предсказанную структуру шпилька-шарнир-шпилька-хвост, консервативные мотивы H / ACA-box и, как обнаружено, ассоциирован с белком GAR1 . ^[7]

Ссылки [ править ]

^ a b Jády BE, Kiss T (февраль 2001 г.). «Малая ядрышковая направляющая РНК действует как в метилировании 2'-O-рибозы, так и в псевдоуридилировании сплайсосомной РНК U5» . Журнал EMBO . 20 (3): 541–551. DOI : 10.1093 / emboj / 20.3.541 . PMC 133463 . PMID 11157760 .
^ Tortoriello G, Аккардо MC, Scialò F, Angrisani A, турано M, Furia M (май 2009). «Новая антисмысловая scaRNA дрозофилы с предсказанной направляющей функцией». Джин . 436 (1–2): 56–65. DOI : 10.1016 / j.gene.2009.02.005 . PMID 19230845 .
^ Tycowski KT, Шу MD, Kukoyi A, Steitz JA (апрель 2009). «Консервативный белок WD40 связывает сигнал локализации тельца Кахаля частиц scaRNP» . Молекулярная клетка . 34 (1): 47–57. DOI : 10.1016 / j.molcel.2009.02.020 . PMC 2700737 . PMID 19285445 .
^ a b Дерюшева С., Галл Дж. Г. (декабрь 2009 г.). «Малые тельца Кахаля РНК дрозофилы функционируют в отсутствие тельцов Кахаля» . Молекулярная биология клетки . 20 (24): 5250–5259. DOI : 10,1091 / mbc.E09-09-0777 . PMC 2793299 . PMID 19846657 .
^ a b Дерюшева С., Галл Дж. Г. (декабрь 2013 г.). «Новые малые РНК, специфичные для тельца Кахаля, идентифицированные у Drosophila: функция зондирующих направляющих РНК» . РНК . 19 (12): 1802–1814. DOI : 10,1261 / rna.042028.113 . PMC 3884663 . PMID 24149844 .
^ Darzacq X, Jady BE, Verheggen C, Поцелуй AM, Бертран E, Поцелуй T (июнь 2002 г.). «Малые ядерные РНК, специфичные для тельца Кахаля: новый класс управляющих РНК 2'-O-метилирования и псевдоуридилирования» . Журнал EMBO . 21 (11): 2746–2756. DOI : 10.1093 / emboj / 21.11.2746 . PMC 126017 . PMID 12032087 .
^ Поцелуй А.М., Jady BE, Бертрана Е, Поцелуй Т (июль 2004 г.). «Human box H / ACA pseudouridylation guide RNA machinery» . Молекулярная и клеточная биология . 24 (13): 5797–5807. DOI : 10.1128 / MCB.24.13.5797-5807.2004 . PMC 480876 . PMID 15199136 .

Внешние ссылки [ править ]

snoRNAbase: база данных snoRNA H / ACA и C / D-бокса человека
Страница для РНК малых тельцов Кахаля в Rfam

Эта статья по биохимии незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

Эта статья о генетике - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[pmid11157760-1] Jády BE, Kiss T (февраль 2001 г.). «Малая ядрышковая направляющая РНК действует как в метилировании 2'-O-рибозы, так и в псевдоуридилировании сплайсосомной РНК U5» . Журнал EMBO . 20 (3): 541–551. DOI : 10.1093 / emboj / 20.3.541 . PMC 133463 . PMID 11157760 .

[2] Tortoriello G, Аккардо MC, Scialò F, Angrisani A, турано M, Furia M (май 2009). «Новая антисмысловая scaRNA дрозофилы с предсказанной направляющей функцией». Джин . 436 (1–2): 56–65. DOI : 10.1016 / j.gene.2009.02.005 . PMID 19230845 .

[3] Tycowski KT, Шу MD, Kukoyi A, Steitz JA (апрель 2009). «Консервативный белок WD40 связывает сигнал локализации тельца Кахаля частиц scaRNP» . Молекулярная клетка . 34 (1): 47–57. DOI : 10.1016 / j.molcel.2009.02.020 . PMC 2700737 . PMID 19285445 .

[:0-4] Дерюшева С., Галл Дж. Г. (декабрь 2009 г.). «Малые тельца Кахаля РНК дрозофилы функционируют в отсутствие тельцов Кахаля» . Молекулярная биология клетки . 20 (24): 5250–5259. DOI : 10,1091 / mbc.E09-09-0777 . PMC 2793299 . PMID 19846657 .

[:1-5] Дерюшева С., Галл Дж. Г. (декабрь 2013 г.). «Новые малые РНК, специфичные для тельца Кахаля, идентифицированные у Drosophila: функция зондирующих направляющих РНК» . РНК . 19 (12): 1802–1814. DOI : 10,1261 / rna.042028.113 . PMC 3884663 . PMID 24149844 .

[darzacq_2002-6] Darzacq X, Jady BE, Verheggen C, Поцелуй AM, Бертран E, Поцелуй T (июнь 2002 г.). «Малые ядерные РНК, специфичные для тельца Кахаля: новый класс управляющих РНК 2'-O-метилирования и псевдоуридилирования» . Журнал EMBO . 21 (11): 2746–2756. DOI : 10.1093 / emboj / 21.11.2746 . PMC 126017 . PMID 12032087 .

[pmid15199136-7] Поцелуй А.М., Jady BE, Бертрана Е, Поцелуй Т (июль 2004 г.). «Human box H / ACA pseudouridylation guide RNA machinery» . Молекулярная и клеточная биология . 24 (13): 5797–5807. DOI : 10.1128 / MCB.24.13.5797-5807.2004 . PMC 480876 . PMID 15199136 .

[1]