Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
RN7SL1
Идентификаторы
ПсевдонимыRN7SL1 , 7L1a , 7SL, RN7SL, RNSRP1, РНК частицы распознавания сигнала, РНК, 7SL, цитоплазматическая 1, РНК-компонент частицы распознавания сигнала 7SL1
Внешние идентификаторыOMIM : 612177 GeneCards : RN7SL1
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

6029

н / д

Ансамбль

ENSG00000276168

н / д

UniProt

н
а

н / д

RefSeq (мРНК)

н / д

н / д

RefSeq (белок)

н / д

н / д

Расположение (UCSC)н / дн / д
PubMed поиск[1]н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Вторичная структура РНК SRP человека. Спирали пронумерованы от 2 до 8. Винтовые секции серого цвета обозначаются строчными буквами. Остатки нумеруются с шагом в десять. Указаны 5'- и 3'-концы. Выделены два шарнира, а также малый (Alu) и большой (S, «специфический») домен SRP РНК.

РНК частиц распознавания сигнала , (также известный как 7SL, 6S, эф или 4.5S РНК) является частью частицы распознавания сигнала (SRP) рибонуклеопротеинового комплекса. SRP распознает сигнальный пептид и связывается с рибосомой , останавливая синтез белка. SRP-рецептор - это белок, который встроен в мембрану и содержит трансмембранную пору . Когда комплекс SRP-рибосома связывается с рецептором SRP, SRP высвобождает рибосому и уносится прочь. Рибосома возобновляет синтез белка, но теперь белок движется через трансмембранную пору SRP-рецептора .

Таким образом, SRP направляет движение белков внутри клетки для связывания с трансмембранной порой, что позволяет белку пересекать мембрану туда, где это необходимо. РНК и белковые компоненты этого комплекса очень консервативны, но различаются в зависимости от царства жизни.

Общее семейство SINE Alu, вероятно, произошло из гена 7SL РНК после делеции центральной последовательности. [2]

Эукариотической SRP состоит из 300 нуклеотидов 7S в РНК и шесть белков: SRPS 72, 68, 54, 19, 14 и 9. архейных SRP состоит из РНК и гомологов эукариотической SRP19 7S и SRP54 белков. 7S РНК эукариот и архей имеют очень похожие вторичные структуры. [3]

У большинства бактерий SRP состоит из молекулы РНК (4.5S) и белка Ffh (гомолог эукариотического белка SRP54). Некоторые грамположительные бактерии (например, Bacillus subtilis ) имеют более длинную эукариотоподобную РНК SRP, которая включает домен Alu . [4]

У эукариот и архей восемь спиральных элементов складываются в домены Alu и S, разделенные длинной линкерной областью. [5] [6] Полагают, что домен Alu опосредует функцию замедления удлинения пептидной цепи SRP. [5] Универсально консервативная спираль, которая взаимодействует с M-доменом SRP54, опосредует распознавание сигнальной последовательности. [6] [7] Считается, что комплекс SRP19-спираль 6 участвует в сборке SRP и стабилизирует спираль 8 для SRP54. связывание [5] У людей есть три функциональных гена РНК SRP, которые удобно назвать RN7SL1, RN7SL2 и RN7SL3. В частности, известно, что геном человека содержит большое количество последовательности, связанной с РНК SRP, включая Alu-повторы .[4]

Открытие [ править ]

SRP РНК была впервые обнаружена в онкогенных РНК (окорна) вирусных частицах птиц и мышей . [8] Впоследствии было обнаружено, что РНК SRP является стабильным компонентом неинфицированных клеток HeLa, где она связана с мембранами и фракциями полисом . [9] [10] В 1980 году , клеточные биологи , очищенные из собачьей поджелудочной железы в 11S «белок распознавания сигнала» (также сокращенно единичными «SRP») , который способствовал транслокацию секреторных белков через мембрану из эндоплазматического ретикулума . [11] Затем было обнаружено, что SRP содержит РНК.компонент. [12] Сравнение генов РНК SRP разных видов показало, что спираль 8 РНК SRP является высококонсервативной во всех сферах жизни . [13] Области около 5'- и 3'-концов SRP РНК млекопитающих аналогичны доминантному семейству Alu со средними повторяющимися последовательностями генома человека . [14] Теперь понятно, что Alu ДНК произошла из SRP РНК путем вырезания центрального SRP РНК-специфического (S) фрагмента с последующей обратной транскрипцией и интеграцией во множество участков хромосом человека . [2]РНК SRP были идентифицированы также в некоторых органеллах , например в пластидных SRP многих фотосинтезирующих организмов. [15]

Транскрипция и обработка [ править ]

РНК SRP эукариот транскрибируются из ДНК с помощью РНК-полимеразы III (Pol III). [16] РНК-полимераза III также транскрибирует гены 5S рибосомной РНК, тРНК , 7SK РНК и сплайсосомной РНК U6 . В промоторы генов SRP РНК человека включают в себя элементы , расположенные ниже по потоку от стартового сайта транскрипции. Промоторы РНК SRP растений содержат расположенный выше стимулирующий элемент (USE) и ТАТА-бокс . [ необходима цитата ] У генов дрожжевой SRP РНК есть блок ТАТАи дополнительные внутригенные промоторные последовательности (называемые A- и B-блоками), которые играют роль в регуляции транскрипции гена SRP с помощью Pol III. [17] В бактериях , гены организованы в опероне и транскрибируются РНК - полимераза . [ Править ] 5'-конец небольшой (4.5S) расщепляется SRP РНК многих бактерий РНКазы Р . [ необходима цитата ] Концы РНК SRP Bacillus subtilis процессируются РНКазой III . Пока нет интронов SRP РНКнаблюдались. [ необходима цитата ]

Функция [ править ]

Классическая функция SRP в трансляции-транслокации. Мембрана отделяет цитозоль от эндоплазматической сети . Рибосомы (светло - серый с участками А, Р и Е) синтезирует белок с сигнального пептида (зеленый) , кодируемой матричной РНК (обозначенной линией с 5'- и 3'-концах). Удлиненный SRP (синий) с его большим (LD) и малым (SD) доменами образует комплекс с мембранно-резидентным рецептором SRP (SR). Когда SRP отделяется, белок пересекает мембрану через канал или транслокон . Сигнальный пептид может быть удален сигнальной пептидной пептидазой (SP), а белок модифицирован с помощьюолигосахарилтрансфераза (ОТ).

Совместная транслокация [ править ]

РНК SRP является неотъемлемой частью малого и большого домена SRP. Функция малого домена состоит в том, чтобы задерживать трансляцию белка до тех пор, пока связанный с рибосомами SRP не получит возможность связываться с резидентным мембранным рецептором SRP (SR). Внутри большого домена РНК SRP заряженной сигнальным пептидом SRP способствует гидролизу двух молекул гуанозинтрифосфата (GTP). Эта реакция высвобождает SRP из рецептора SRP и рибосомы , позволяя трансляции продолжаться и белку поступать в транслокон . [18]Белок пересекает мембрану совместно (во время трансляции) и входит в другой клеточный компартмент или внеклеточное пространство. В эукариот , мишень представляет собой мембрану из эндоплазматического ретикулума (ER). У архей SRP доставляет белки к плазматической мембране . [19] У бактерий SRP в первую очередь включает белки во внутреннюю мембрану. [20]

Посттрансляционный транспорт [ править ]

SRP также участвует в сортировке белков после завершения их синтеза (посттрансляционная сортировка белков). У эукариот заякоренные в хвосте белки, обладающие гидрофобной последовательностью вставки на их С-конце, доставляются в эндоплазматический ретикулум (ER) с помощью SRP. [21] Точно так же SRP способствует посттрансляционному импорту ядерно-кодируемых белков на тилакоидную мембрану хлоропластов . [22]

Структура [ править ]

Характеристики и номенклатура РНК SRP. Вторичная структура РНК SRP человека обведена светло-серым цветом и указаны 5'- и 3'-концы. Сохраненные мотивы показаны темно-серым цветом. Спирали пронумерованы от 1 до 12, винтовые секции обозначены строчными буквами, а винтовые вставки - цифрами, пунктирными. Третичные взаимодействия между апикальными петлями спиралей 3 и 4 и между спиралями 6 и 8 обозначены пунктирными линиями.

В 2005 г. номенклатура всех РНК SRP предлагала систему нумерации из 12 спиралей. Секции спирали именуются суффиксом строчной буквы (например, 5a). Вставки или «ответвления» спирали обозначены пунктирными номерами (например, 9.1 и 12.1).

РНК SRP охватывает широкий филогенетический спектр по размеру и количеству ее структурных особенностей (см. Примеры вторичной структуры SRP РНК ниже). Наименьшие функциональные РНК SRP были обнаружены у микоплазм и родственных видов. SRP-РНК Escherichia coli (также называемая 4.5S-РНК) состоит из 114 нуклеотидных остатков и образует стержневую петлю РНК . Грамположительные бактерии Bacillus зиЫШз кодирует больший 6S SRP РНК , которые напоминают архейные гомологи , но не хватает SRP РНК спирал 6. архейная SRP РНК обладает спиралями от 1 до 8, отсутствие спирали 7, и характеризуетсятретичная структура, которая включает апикальные петли спирали 3 и спирали 4. В SRP РНК эукариот отсутствует спираль 1 и они содержат спираль 7 переменного размера. Некоторые SRP-РНК простейших имеют уменьшенные спирали 3 и 4. SRP-РНК ascomycota имеют в целом уменьшенный малый домен и не имеют спиралей 3 и 4. Наибольшие известные на сегодняшний день SRP-РНК обнаружены у дрожжей ( Saccharomycetes ), которые приобрели спирали 9-12 как вставки в спираль 5, а также в удлиненную спираль 7. Семенные растения экспрессируют многочисленные сильно дивергентные РНК SRP. [3]

Мотивы [ править ]

Были идентифицированы четыре консервативных свойства (мотива) (показаны на рисунке темно-серым цветом): (1) связывающий мотив SRP54, (2) мотив тетрапетли Helix 6 GNAR, (3) мотив 5e и (4) UGU (NR). мотив. [ необходима цитата ]

Привязка SRP54 [ править ]

Асимметричная петля между спиральными участками 8a и 8b и смежным участком 8b с парными основаниями является заметным свойством каждой SRP РНК. Спиральный участок 8b содержит пары оснований, отличных от Ватсона-Крика, которые способствуют образованию плоской малой бороздки в РНК, подходящей для связывания белка SRP54 (называемого у бактерий Ffh). [6] апикальная петля спирали 8 содержит четыре, пять, шесть или остатков, в зависимости от вида . Он имеет высококонсервативный гуанозин в качестве первого и аденозин в качестве последнего остатка петли. Эта функция необходима для взаимодействия с третьим аденозином.остаток спирали 6 GNAR тетрапетли. [23]

Helix 6 GNAR tetraloop [ править ]

SRP РНК эукариот и архей имеют тетрапетлю GNAR (N - для любого нуклеотида , R - для пурина ) в спирали 6. Его консервативный аденозиновый остаток важен для связывания белка SRP19. [24] Этот аденозин вступает в третичное взаимодействие с другим остатком аденозина, расположенным в апикальной петле спирали 8. [25]

5e [ править ]

11 нуклеотидов мотива 5e образуют четыре пары оснований, которые прерываются петлей из трех нуклеотидов . [4] У эукариот первым нуклеотидом петли является аденозин, который необходим для связывания белка SRP72. [26]

UGU (NR) [ править ]

Мотив UGU (NR) соединяет спирали 3 и 4 в малом (Alu) домене SRP. Грибковые РНК SRP, лишенные спиралей 3 и 4, содержат мотив внутри петли спирали 2. [4] Это важно для связывания гетеродимера белка SRP9 / 14 как части разворота РНК . [27]

Вторичный [ править ]

Примеры вторичных структур SRP РНК

  • Бактериальная РНК SRP (4.5S РНК) из E. coli

  • Бактериальная РНК SRP (6S РНК) из Bacillus subtilis

  • Архейная SRP РНК Archaeoglobus fulgidus

  • SRP РНК эукариотических протистов из Trypanosoma brucei

  • SRP РНК эукариотических дрожжей из Saccharomyces cerevisiae

Высшее [ править ]

SRP РНК
Идентификаторы
РфамCL00003
Прочие данные
Структуры PDBPDBe 2IY3 , 1Z43 , 1RY1 , 1QZW , 1MFQ , 1L9A , 1LNG , 1JID , 1E8S , 1E8O , 1DUL , 1DUH , 1D4R , 28SR , 28SP

Рентгеновская кристаллография , ядерный магнитный резонанс (ЯМР) и криоэлектронная микроскопия (крио-ЭМ) использовались для определения молекулярной структуры частей РНК SRP различных видов . Доступные структуры PDB показывают, что молекула РНК либо свободна. или когда он связан с одним или несколькими белками SRP .

Кристаллографические структуры репрезентативных SRP.

  • SRP19-7S.S РНК-комплекс SRP из M. jannaschii [25]

  • S-домен человеческого SRP [28]

Связывающие белки [ править ]

См. Также: Частица распознавания сигнала

Один или несколько белков SRP связываются с РНК SRP для сборки функционального SRP. Белки SRP названы в соответствии с их приблизительной молекулярной массой, измеренной в килодальтонах . [29] Большинство бактериальных Политики SRP состоят из SRP РНК и SRP54 (также названный FFH для « F ifty- е нашей ч УДОСТОВЕРЕ»). Архейных SRP содержит белки SRP54 и SRP19. У эукариот РНК SRP объединяется с импортированными белками SRP SRP9 / 14, SRP19 и SRP68 / 72 в области ядрышка . Этот пре-SRP транспортируется в цитозоль.где он связывается с белком SRP54. [30] В молекулярные структуры свободной или SRP РНК-связанных белков SRP9 / 14, SRP19 или SRP54 известны с высоким разрешением.

SRP9 и SRP14 [ править ]

SRP9 и SRP14 структурно родственны и образуют гетеродимер SRP9 / 14, который связывается с SRP РНК малого (Alu) домена. [27] SRP дрожжей лишен SRP9 и содержит структурно родственный белок SRP21. SRP14 дрожжей образует гомодимер . [31] SRP9 / 14 отсутствует в SRP трипаносомы, которая вместо этого содержит молекулу, подобную тРНК . [32]

SRP19 [ править ]

SRP19 обнаружен в SRP эукариот и архей . Его основная роль заключается в подготовке РНК SRP для связывания SRP54, SRP68 и SRP72 путем правильной организации спиралей 6 и 8 РНК SRP. [28] SRP дрожжей содержит Sec65p, более крупный гомолог SRP19. [33]

SRP54 [ править ]

Белок SRP54 (называемый у бактерий Ffh ) является важным компонентом каждого SRP. Он состоит из трех функциональных доменов : N-концевого (N) домена, домена GTPase (G) и домена, богатого метионином (M). [34] [35]

SRP68 и SRP72 [ править ]

Белки SRP68 и SRP72 являются составными частями большого домена эукариотического SRP. Они образуют стабильный гетеродимер SRP68 / 72. Было показано, что около одной трети человеческого белка SRP68 связывается с РНК SRP. [36] Относительно небольшая область, расположенная рядом с С-концом SRP72, связывается с мотивом РНК 5e SRP. [26] [37]

Ссылки [ править ]

  1. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  2. ^ а б Уллу Э, Чуди С (1984). «Последовательности Alu процессируются генами 7SL РНК». Природа . 312 (5990): 171–172. Bibcode : 1984Natur.312..171U . DOI : 10.1038 / 312171a0 . PMID 6209580 . S2CID 4328237 .  
  3. ^ a b Rosenblad MA, Larsen N, Samuelsson T, Zwieb C (2009). «Родство в семействе SRP РНК» . Биология РНК . 6 (5): 508–516. DOI : 10,4161 / rna.6.5.9753 . PMID 19838050 . 
  4. ^ a b c d Regalia M, Rosenblad MA, Samuelsson T (август 2002 г.). «Прогнозирование распознавания сигналов генами РНК частиц» . Исследования нуклеиновых кислот . 30 (15): 3368–3377. DOI : 10.1093 / NAR / gkf468 . PMC 137091 . PMID 12140321 .  
  5. ^ a b c Wild K, Weichenrieder O, Strub K, Sinning I, Cusack S (февраль 2002 г.). «К структуре частицы распознавания сигнала млекопитающих». Текущее мнение в структурной биологии . 12 (1): 72–81. DOI : 10.1016 / S0959-440X (02) 00292-0 . PMID 11839493 . 
  6. ^ a b c Бэйти RT, Рэмбо Р.П., Лукаст Л., Ра Б., Дудна Дж. А. (февраль 2000 г.). «Кристаллическая структура рибонуклеопротеинового ядра сигнальной распознающей частицы». Наука . 287 (5456): 1232–1239. Bibcode : 2000Sci ... 287.1232B . DOI : 10.1126 / science.287.5456.1232 . PMID 10678824 . 
  7. ^ Бэйти RT, Сагар MB, Doudna JA (март 2001). «Структурный и энергетический анализ распознавания РНК универсально консервативным белком из сигнальной частицы распознавания». Журнал молекулярной биологии . 307 (1): 229–246. DOI : 10.1006 / jmbi.2000.4454 . PMID 11243816 . 
  8. ^ Бишоп Ю.М., Левинсон WE, Салливан D, Fanshier л, Quintrell N, Джексон J (декабрь 1970). "Низкомолекулярные РНК вируса саркомы Рауса. II. РНК 7 S". Вирусология . 42 (4): 927–937. DOI : 10.1016 / 0042-6822 (70) 90341-7 . PMID 4321311 . 
  9. Перейти ↑ Walker TA, Pace NR, Erikson RL, Erikson E, Behr F (сентябрь 1974 г.). «РНК 7S, общая для онкорнавирусов и нормальных клеток, связана с полирибосомами» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 71 (9): 3390–3394. Bibcode : 1974PNAS ... 71.3390W . DOI : 10.1073 / pnas.71.9.3390 . PMC 433778 . PMID 4530311 .  
  10. ^ Zieve G, Penman S (май 1976). «Малые виды РНК клетки HeLa: метаболизм и субклеточная локализация». Cell . 8 (1): 19–31. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (76) 90181-1 . PMID 954090 . S2CID 26928799 .  
  11. ^ Walter P, Ибрагим I, Блобля G (ноябрь 1981). «Транслокация белков через эндоплазматический ретикулум. I. Белок распознавания сигналов (SRP) связывается с собранными in vitro полисомами, синтезирующими секреторный белок» . Журнал клеточной биологии . 91 (2 Pt 1): 545–550. DOI : 10,1083 / jcb.91.2.545 . PMC 2111968 . PMID 7309795 .  
  12. Перейти ↑ Walter P, Blobel G (октябрь 1982 г.). «Частица распознавания сигнала содержит 7S РНК, необходимую для транслокации белка через эндоплазматический ретикулум». Природа . 299 (5885): 691–698. Bibcode : 1982Natur.299..691W . DOI : 10.1038 / 299691a0 . PMID 6181418 . S2CID 4237513 .  
  13. ^ Larsen N, Zwieb C (январь 1991). «Выравнивание последовательностей SRP-РНК и вторичная структура» . Исследования нуклеиновых кислот . 19 (2): 209–215. DOI : 10.1093 / NAR / 19.2.209 . PMC 333582 . PMID 1707519 .  
  14. ^ Улла E, S Murphy, Мелли M (май 1982 г.). «Человеческая 7SL РНК состоит из 140 нуклеотидной средне повторяющейся последовательности, вставленной в последовательность alu». Cell . 29 (1): 195–202. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (82) 90103-9 . PMID 6179628 . S2CID 12709599 .  
  15. ↑ Rosenblad MA, Samuelsson T (ноябрь 2004 г.). «Идентификация генов РНК частиц распознавания сигнала хлоропластов» . Физиология растений и клеток . 45 (11): 1633–1639. DOI : 10.1093 / PCP / pch185 . PMID 15574839 . 
  16. ^ Dieci G, Fiorino G, Кастельнуово M, Teichmann M, Пагано A (декабрь 2007). «Расширяющийся транскриптом РНК-полимеразы III». Тенденции в генетике . 23 (12): 614–622. DOI : 10.1016 / j.tig.2007.09.001 . hdl : 11381/1706964 . PMID 17977614 . 
  17. ^ Dieci G, Giuliodori S, M Catellani, Percudani R, Ottonello S (март 2002). «Внутригенная адаптация промотора и облегчение рециклинга РНК-полимеразы III в транскрипции SCR1, гена 7SL РНК Saccharomyces cerevisiae» . Журнал биологической химии . 277 (9): 6903–6914. DOI : 10.1074 / jbc.M105036200 . PMID 11741971 . 
  18. Перейти ↑ Shan SO, Walter P (февраль 2005 г.). «Ко-трансляционное нацеливание белка с помощью частицы распознавания сигнала» . Письма FEBS . 579 (4): 921–926. DOI : 10.1016 / j.febslet.2004.11.049 . PMID 15680975 . S2CID 46046514 .  
  19. ^ Zwieb C, Eichler J (март 2002). «Попадание в цель: частица распознавания сигнала архей» . Археи . 1 (1): 27–34. DOI : 10.1155 / 2002/729649 . PMC 2685543 . PMID 15803656 .  
  20. ^ Ulbrandt ND, Newitt JA, Bernstein HD (январь 1997). «Частица распознавания сигнала E. coli необходима для встраивания подмножества белков внутренней мембраны». Cell . 88 (2): 187–196. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81839-5 . PMID 9008159 . S2CID 15246619 .  
  21. ↑ Abell BM, Pool MR, Schlenker O, Sinning I, High S (июль 2004 г.). «Частица распознавания сигнала опосредует пост-трансляционное нацеливание у эукариот» . Журнал EMBO . 23 (14): 2755–2764. DOI : 10.1038 / sj.emboj.7600281 . PMC 514945 . PMID 15229647 .  
  22. ^ Schuenemann D, Гупта S, Persello-Cartieaux F, Климюк VI, Jones JD, Nussaume L, Хоффман NE (август 1998). «Новая частица, распознающая сигнал, направляет светособирающие белки на мембраны тилакоидов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (17): 10312–10316. Bibcode : 1998PNAS ... 9510312S . DOI : 10.1073 / pnas.95.17.10312 . PMC 21505 . PMID 9707644 .  
  23. ^ Zwieb С, ван Nues RW, Розенблада М. А., Браун JD, Самуэлссон Т (январь 2005 г.). «Номенклатура для всех РНК частиц распознавания сигналов» . РНК . 11 (1): 7–13. DOI : 10,1261 / rna.7203605 . PMC 1370686 . PMID 15611297 .  
  24. ^ Zwieb C (август 1992). «Распознавание тетрануклеотидной петли сигнальной РНК частицы распознавания белком SRP19». Журнал биологической химии . 267 (22): 15650–15656. PMID 1379233 . 
  25. ^ a b Hainzl T, Huang S, Sauer-Eriksson AE (июнь 2002 г.). «Структура комплекса РНК SRP19 и значение для сборки частиц распознавания сигнала». Природа . 417 (6890): 767–771. Bibcode : 2002Natur.417..767H . DOI : 10,1038 / природа00768 . PMID 12050674 . S2CID 2509475 .  
  26. ^ a b Яхьяева E, Wower J, Wower IK, Zwieb C (июнь 2008 г.). «Мотив 5e эукариотической РНК частицы, распознающей сигнал, содержит консервативный аденозин для связывания SRP72» . РНК . 14 (6): 1143–1153. DOI : 10,1261 / rna.979508 . PMC 2390789 . PMID 18441046 .  
  27. ^ a b Weichenrieder O, Wild K, Strub K, Cusack S (ноябрь 2000 г.). «Структура и сборка домена Alu сигнальной частицы распознавания млекопитающих» . Природа . 408 (6809): 167–173. Bibcode : 2000Natur.408..167W . DOI : 10.1038 / 35041507 . PMID 11089964 . S2CID 4427070 .  
  28. ^ a b Kuglstatter A, Oubridge C, Nagai K (2002). «Вызванные структурные изменения 7SL РНК во время сборки человеческих сигнальных частиц». Nat Struct Biol . 9 (10): 740–744. DOI : 10.1038 / nsb843 . PMID 12244299 . S2CID 9543041 .  
  29. Перейти ↑ Walter P, Blobel G (сентябрь 1983 г.). «Разборка и воссоздание частицы распознавания сигнала». Cell . 34 (2): 525–533. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (83) 90385-9 . PMID 6413076 . S2CID 17907778 .  
  30. ^ Politz JC, Яровая S, Килра С.М., Говда К, Zwieb С, Педерсеном Т (январь 2000 г.). «Компоненты частиц распознавания сигналов в ядрышке» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (1): 55–60. Bibcode : 2000PNAS ... 97 ... 55P . DOI : 10.1073 / pnas.97.1.55 . PMC 26615 . PMID 10618370 .  
  31. ^ Брукс М.А., Ravelli РБ, McCarthy А.А., Strub K, S Кьюсак (май 2009). «Структура SRP14 из частицы распознавания сигнала Schizosaccharomyces pombe» . Acta Crystallographica Раздел D . 65 (Pt 5): 421–433. DOI : 10.1107 / S0907444909005484 . PMID 19390147 . 
  32. ↑ Лю Л., Бен-Шломо Х, Сюй YX, Стерн М.З., Гончаров И., Чжан Ю., Михаэли С. (май 2003 г.). «Частица распознавания сигнала трипаносоматиды состоит из двух молекул РНК, гомолога 7SL РНК и новой тРНК-подобной молекулы» . Журнал биологической химии . 278 (20): 18271–18280. DOI : 10.1074 / jbc.M209215200 . PMID 12606550 . 
  33. Перейти ↑ Hann BC, Stirling CJ, Walter P (апрель 1992 г.). «Продукт гена SEC65 представляет собой субъединицу частицы, распознающей сигнал дрожжей, необходимую для ее целостности». Природа . 356 (6369): 532–533. Bibcode : 1992Natur.356..532H . DOI : 10.1038 / 356532a0 . PMID 1313947 . S2CID 4287636 .  
  34. ^ Römisch К, Уэбб Дж, Герц Дж, Prehn S, R Франк, Vingron М, Dobberstein Б (август 1989 г.). «Гомология белка 54K частицы распознавания сигнала, стыковочного белка и двух белков E. coli с предполагаемыми GTP-связывающими доменами» (PDF) . Природа . 340 (6233): 478–482. Bibcode : 1989Natur.340..478R . DOI : 10.1038 / 340478a0 . PMID 2502717 . S2CID 4343347 .   
  35. ^ Bernstein HD, Poritz MA, Strub K, Hoben PJ, Brenner S, Walter P (август 1989). «Модель распознавания сигнальной последовательности из аминокислотной последовательности 54К-субъединицы сигнальной распознающей частицы». Природа . 340 (6233): 482–486. Bibcode : 1989Natur.340..482B . DOI : 10.1038 / 340482a0 . PMID 2502718 . S2CID 619959 .  
  36. ^ Iakhiaeva E, Bhuiyan SH, Инь J, Zwieb C (июнь 2006). «Белок SRP68 частицы распознавания сигнала человека: идентификация связывающих доменов РНК и SRP72» . Белковая наука . 15 (6): 1290–1302. DOI : 10.1110 / ps.051861406 . PMC 2242529 . PMID 16672232 .  
  37. ^ Iakhiaeva Е, Инь - J, Zwieb С (январь 2005 г.). «Идентификация РНК-связывающего домена в человеческом SRP72». Журнал молекулярной биологии . 345 (4): 659–666. DOI : 10.1016 / j.jmb.2004.10.087 . PMID 15588816 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Kuglstatter A, Oubridge C, Nagai K (октябрь 2002 г.). «Вызванные структурные изменения 7SL РНК во время сборки человеческих сигнальных частиц». Структурная биология природы . 9 (10): 740–744. DOI : 10.1038 / nsb843 . PMID  12244299 . S2CID  9543041 .
  • Ван Т., Тиан Ч., Чжан В., Ло К., Саркис П. Т., Ю Л, Лю Б., Ю Й, Ю XF (декабрь 2007 г.). «7SL РНК опосредует упаковку вириона противовирусной цитидиндезаминазы APOBEC3G» . Журнал вирусологии . 81 (23): 13112–13124. DOI : 10,1128 / JVI.00892-07 . PMC  2169093 . PMID  17881443 .
  • Уллу Э., Вайнер А.М. (декабрь 1984 г.). «Человеческие гены и псевдогены для компонента 7SL РНК частицы распознавания сигнала» . Журнал EMBO . 3 (13): 3303–3310. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1984.tb02294.x . PMC  557853 . PMID  6084597 .
  • Энглерт М., Фелис М., Юнкер В., Байер Х (декабрь 2004 г.). «Новые вышестоящие и внутригенные элементы контроля для зависимой от РНК-полимеразы III транскрипции генов 7SL РНК человека». Биохимия . 86 (12): 867–874. DOI : 10.1016 / j.biochi.2004.10.012 . PMID  15667936 .
  • Обридж К., Куглштаттер А., Джовин Л., Нагаи К. (июнь 2002 г.). «Кристаллическая структура SRP19 в комплексе с S доменом SRP РНК и ее значение для сборки сигнальной частицы распознавания». Молекулярная клетка . 9 (6): 1251–1261. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (02) 00530-0 . PMID  12086622 .
  • Ван Т., Тиан Ч., Чжан В., Саркис П. Т., Ю XF (январь 2008 г.). «Для упаковки вириона APOBEC3F необходимо взаимодействие с 7SL РНК, но не с геномной РНК ВИЧ-1 или Р-тельцами». Журнал молекулярной биологии . 375 (4): 1098–1112. DOI : 10.1016 / j.jmb.2007.11.017 . PMID  18067920 .

Внешние ссылки [ править ]

  • База данных SRP (SRPDB): выравнивание РНК SRP и связанных белков, вторичных структур SRP РНК и трехмерных моделей.
  • Запись Rfam для РНК частицы распознавания сигнала типа Metazoan
  • Запись Rfam для РНК бактериальной частицы, распознающей малый сигнал
  • Запись Rfam для РНК бактериальной частицы с большим сигналом распознавания
  • Запись Rfam для РНК частицы, распознающей сигнал грибка
  • Запись Rfam для РНК частицы распознавания сигнала растений
  • Запись Rfam для РНК частицы распознавания сигнала простейшими
  • Запись Rfam для РНК частицы, распознающей сигнал архей
  • Фильм о распознавании сигналов Dnatube Particle