Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
5.8S рибосомная РНК
RF00002.jpg
Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности рибосомальной РНК 5.8S
Идентификаторы
Символ5_8S_rRNA
РфамRF00002
Прочие данные
Тип РНКДжин ; рРНК
Домен (ы)Эукариоты ; Археи [ необходима ссылка ]
ИДТИGO: 0003735 GO: 0005840
ТАКТАК: 0000375
Структуры PDBPDBe

В молекулярной биологии рибосомная РНК 5.8S ( 5.8S рРНК ) является некодирующим компонентом РНК большой субъединицы эукариотической рибосомы и поэтому играет важную роль в трансляции белков . Он расшифрован с помощью РНК - полимеразы I в составе предшественника 45S , который также содержит 18S и 28S рРНК . Считается, что его функция заключается в транслокации рибосом. [1] Также известно, что он образует ковалентную связь с белком-супрессором опухоли p53 . [2] 5.8S рРНК может быть использована в качестве эталонного гена для микроРНК.обнаружение. [3] Рибосомная РНК 5.8S используется для лучшего понимания других процессов и путей рРНК в клетке. [4]

РРНК 5.8S гомологична 5'-концу неэукариотической рРНК LSU . У эукариот вставка ITS2 разрушает рРНК LSU на 5.8S и 28S рРНК . [5] У некоторых мух 5.8 рРНК дополнительно расщепляется на две части. [6]

Структура [ править ]

Структура рРНК L567.5 имеет размер примерно 150 нуклеотидов и состоит из большого количества свернутых цепей, некоторые из которых считаются одноцепочечными. [7] Эта рибосомная РНК вместе с 28S и 5S рРНК, а также 46 рибосомных белков образует большую субъединицу рибосомы (LSU) . [7] 5.8S рРНК первоначально транскрибируется вместе с 18S и 28S рРНК в прерибосомной РНК 45S, вместе с ITS 1 и ITS 2 ( внутренний транскрибируемый спейсер ) и 5 ​​'и 3' ETS ( внешний транскрибируемый спейсер ). [8]5.8S рРНК расположена между двумя ITS-областями, причем ITS1 отделяет ее от 18S рРНК в 5 'направлении, а ITS2 отделяет ее от 28S рРНК в 3' направлении. ITS и ETS отщепляются во время созревания рРНК. Это достигается посредством непрерывного пути расщепления, осуществляемого ферментами эндонуклеаз и экзонуклеаз , разрезая спейсеры в определенных местах. [8]

Ссылки [ править ]

  1. ^ Abou Elela S, Назар Р.Н. (май 1997). «Роль 5.8S рРНК в транслокации рибосом» . Исследования нуклеиновых кислот . 25 (9): 1788–1794. DOI : 10.1093 / NAR / 25.9.1788 . PMC  146658 . PMID  9108162 .
  2. ^ Fontoura Б.М., Атьенса CA, Сорокина Е.А., Моримото T, Carroll РБ (июнь 1997). «Цитоплазматический полипептид p53 связан с рибосомами» . Молекулярная и клеточная биология . 17 (6): 3146–3154. DOI : 10,1128 / MCB.17.6.3146 . PMC 232167 . PMID 9154813 .  
  3. ↑ Shi R, Chiang VL (октябрь 2005 г.). «Простые средства для количественной оценки экспрессии микроРНК с помощью ПЦР в реальном времени» . Биотехнологии . 39 (4): 519–525. DOI : 10.2144 / 000112010 . PMID 16235564 . 
  4. ^ Назар RN (июнь 1984). «Рибосомная РНК 5.8S: эукариотическая адаптация или вариант процессинга?». Канадский журнал биохимии и клеточной биологии . 62 (6): 311–320. DOI : 10.1139 / o84-044 . PMID 6380683 . 
  5. ^ Лафонтен, DLJ; Толлервей, Д. (2001). «Функция и синтез рибосом». Обзоры природы Молекулярная клеточная биология . 2 (7): 514–520. DOI : 10.1038 / 35080045 . hdl : 1842/729 . PMID 11433365 . 
  6. ^ Shimada, T. (август 1992). «Распределение расщепленной рибосомной РНК 5.8S у двукрылых». Молекулярная биология насекомых . 1 (1): 45–48. DOI : 10.1111 / j.1365-2583.1993.tb00076.x . PMID 1343775 . 
  7. ^ a b Уокер Т.А., Пейс Н.Р. (июнь 1983 г.). «5.8S рибосомная РНК» . Cell . 33 (2): 320–322. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (83) 90413-0 . PMID 6861202 . 
  8. ^ a b Хенрас А.К., Плиссон-Частанг C, О'Донохью MF, Чакраборти A, Gleizes PE (27 октября 2014 г.). «Обзор прерибосомной обработки РНК у эукариот» . Междисциплинарные обзоры Wiley: РНК . 6 (2): 225–242. DOI : 10.1002 / wrna.1269 . PMC 4361047 . PMID 25346433 .  

Внешние ссылки [ править ]

  • Страница для 5.8S рибосомальной РНК в Rfam
  • Последовательность рРНК 5.8S Arabidopsis
  • Последовательность риса 5.8S рРНК