Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено с ацидофилов (организмов) )
Перейти к навигации Перейти к поиску
Для использования в других целях, см Ацидофил (значения) .

Ацидофилы или ацидофильные организмы - это те организмы , которые процветают в очень кислых условиях (обычно при pH 2,0 или ниже). Эти организмы могут быть найдены в различных отраслях дерева жизни , в том числе и архей , бактерий , [1] и Eukarya .

Список ацидофильных организмов [ править ]

Список этих организмов включает:

Археи [ править ]

Бактерии [ править ]

Эукария [ править ]

Механизмы адаптации к кислой среде [ править ]

Большинство ацидофильных организмов развили чрезвычайно эффективные механизмы выкачивания протонов из внутриклеточного пространства, чтобы поддерживать цитоплазму на уровне или близком к нейтральному pH. Следовательно, внутриклеточные белки не должны приобретать кислотную стабильность в процессе эволюции. Однако другие ацидофилы, такие как Acetobacter aceti , имеют подкисленную цитоплазму, которая заставляет почти все белки в геноме приобретать кислотную стабильность. [7] По этой причине Acetobacter aceti стал ценным ресурсом для понимания механизмов, с помощью которых белки могут достичь кислотной стабильности.

Исследования белков, адаптированных к низкому pH, выявили несколько общих механизмов, с помощью которых белки могут достичь кислотной стабильности. В большинстве кислотоустойчивых белков (таких как пепсин и белок soxF из Sulfolobus acidocaldarius ) имеется переизбыток кислотных остатков, что сводит к минимуму дестабилизацию низкого pH, вызванную накоплением положительного заряда. Другие механизмы включают минимизацию доступности кислотных остатков для растворителя или связывания кофакторов металлов. В специализированном случае кислотной стабильности было показано , что белок NAPase из Nocardiopsis alba перемещает чувствительные к кислоте солевые мостики.вдали от регионов, которые играют важную роль в разворачивающемся процессе. В этом случае кинетической кислотной стабильности долговечность белка достигается в широком диапазоне pH, как кислотных, так и основных.

См. Также [ править ]

  • Ацидофилы в кислых шахтных дренажах
  • Нейтрофил

Ссылки [ править ]

  1. ^ Беккер, А., Типы бактерий, живущих в кислой среде pH » . Проверено 10 мая 2017 г.
  2. ^ a b c Дворкин М, Фалькоу С (2006). Прокариоты: справочник по биологии бактерий .
  3. Перейти ↑ Singh OV (2012). Экстремофилы: устойчивые ресурсы и биотехнологические последствия . Джон Вили и сыновья . С. 76–79. ISBN 978-1-118-10300-5.
  4. ^ Quaiser, Ахим; Оксенрайтер, Торстен; Ланц, Криста; Schuster, Stephan C .; Treusch, Александр Х .; Эк, Юрген; Шлепер, Криста (27 августа 2003 г.). «Ацидобактерии образуют связную, но очень разнообразную группу в бактериальной области: данные экологической геномики». Молекулярная микробиология . 50 (2): 563–575. DOI : 10.1046 / j.1365-2958.2003.03707.x . PMID 14617179 . S2CID 25162803 .  
  5. ^ Петтифер GL; Osmundson ME; Мерфи Дж. М. (март 1997 г.). «Методы обнаружения и подсчета Alicyclobacillus acidoterrestris, а также исследования роста и образования запаха во фруктовых соках и фруктовых сокосодержащих напитках». Письма по прикладной микробиологии . 24 (3): 185–189. DOI : 10.1046 / j.1472-765X.1997.00373.x . PMID 9080697 . S2CID 6976998 .  
  6. ^ a b c Роулингс, Дуглас; Джонсон, Д. Барри. «Эукариотические ацидофилы» . Энциклопедия систем жизнеобеспечения (EOLSS) . Издательство Eolss. Архивировано из оригинала на 2014-10-13 . Проверено 3 февраля 2014 года .
  7. ^ Menzel, U .; Готшалк, Г. (1985). «Внутренний pH Acetobacterium wieringae и Acetobacter aceti во время роста и производства уксусной кислоты». Arch Microbiol . 143 (1): 47–51. DOI : 10.1007 / BF00414767 . S2CID 6477488 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Купер, JB; Хан, G .; Taylor, G .; Щекотать, IJ; Бланделл, Т.Л. (июль 1990 г.). «Рентгеновский анализ аспарагиновых протеиназ. II. Трехмерная структура гексагональной кристаллической формы свиного пепсина при разрешении 2,3 A». J Mol Biol . 214 (1): 199–222. DOI : 10.1016 / 0022-2836 (90) 90156-G . PMID  2115088 .
  • Bonisch, H .; Шмидт, CL; Schafer, G .; Ладенштейн, Р. (июнь 2002 г.). «Структура растворимого домена архейного железо-серного белка Риске при разрешении 1,1 A». J Mol Biol . 319 (3): 791–805. DOI : 10.1016 / S0022-2836 (02) 00323-6 . PMID  12054871 .
  • Шафер, К; Magnusson, U; Scheffel, F; Шифнер, А; Сандгрен, Миссури; Diederichs, K; Велте, Вт; Hülsmann, A; Schneider, E; Моубрей, SL (январь 2004 г.). «Рентгеновские структуры связывающего мальтозу-мальтодекстрин белка термоацидофильной бактерии Alicyclobacillus acidocaldarius позволяют понять кислотную стабильность белков» . Журнал молекулярной биологии . 335 (1): 261–74. DOI : 10.1016 / j.jmb.2003.10.042 . PMID  14659755 .
  • Уолтер, Р.Л .; Ealick, SE; Фридман, AM; Блейк, RC 2-й; Проктор, П .; Шохам, М. (ноябрь 1996 г.). «Кристаллическая структура рустицианина с множественной аномальной дифракцией (MAD): высокоокисляющий купредоксин с чрезвычайной кислотной стабильностью». J Mol Biol . 263 (5): 730–51. DOI : 10.1006 / jmbi.1996.0612 . PMID  8947572 .
  • Ботуян М.В. Toy-Palmer, A .; Chung, J .; Блейк, RC 2-й; Бероза, П .; Дело, DA; Дайсон, HJ (1996). «Структура раствора ЯМР рустицианина Cu (I) из Thiobacillus ferrooxidans: структурная основа экстремальной кислотной стабильности и редокс-потенциала». J Mol Biol . 263 (5): 752–67. DOI : 10.1006 / jmbi.1996.0613 . PMID  8947573 .
  • Kelch, BA; Иген, КП; Erciyas, FP; Хамфрис, ЭЛ; Томасон, штат Арканзас; Mitsuiki, S .; Агард, Д.А. (май 2007 г.). «Структурные и механические исследования кислотостойкости: кинетическая стабильность способствует развитию экстремофильного поведения». J Mol Biol . 368 (3): 870–883. CiteSeerX  10.1.1.79.3711 . DOI : 10.1016 / j.jmb.2007.02.032 . PMID  17382344 .