Коды номенклатуры или коды номенклатуры - это различные своды правил, которые регулируют биологическую таксономическую номенклатуру , каждый в своей широкой области организмов. Для конечного пользователя, который имеет дело только с названиями видов, с некоторым пониманием того, что виды могут быть отнесены к семействам , может быть незаметно, что существует более одного кода, но за пределами этого базового уровня они довольно сильно различаются по способу работы .
Успешное введение Линнеем двухчастных названий видов стало началом постоянно расширяющейся системы номенклатуры. Когда все натуралисты во всем мире приняли этот подход к придумыванию имен, возникло несколько школ мысли о деталях. Становилось все более очевидным, что для управления научными названиями необходим подробный свод правил . С середины XIX века и далее было несколько инициатив, направленных на выработку общепринятых сводов правил. В настоящее время номенклатурные коды регулируют наименования:
- Водоросли , грибы и растения - Международный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений ( ICN ), который в июле 2011 года заменил Международный кодекс ботанической номенклатуры ( ICBN ) и более ранние Международные правила ботанической номенклатуры .
- Животные - Международный кодекс зоологической номенклатуры ( ICZN )
- Бактерии и археи - Международный кодекс номенклатуры прокариот ( ICNP ), который в 2008 году заменил Международный кодекс номенклатуры бактерий ( ICNB )
- Культурные растения - Международный кодекс номенклатуры культурных растений ( ICNCP )
- Растительные ассоциации - Международный кодекс фитосоциологической номенклатуры (ICPN)
- Вирусы - Международный кодекс классификации и номенклатуры вирусов (ICVCN); см. также классификацию вирусов
Различия между кодами [ править ]
Отправная точка [ править ]
Отправная точка, то есть время, с которого эти коды вступают в силу (обычно задним числом), варьируется от группы к группе, а иногда и от ранга к рангу. [1] В ботанике и микологии отправной точкой часто является 1 мая 1753 г. ( Linnaeus , Species plantarum ), в зоологии 1758 г. [ требуется пояснение ] (Linnaeus, Systema Naturae , 10-е издание ). С другой стороны, бактериология началась заново, начав в 1980 г. (Скерман и др., «Утвержденные списки названий бактерий»), сохранив при этом первоначальных авторов и даты публикации. [2]
Исключения в ботанике: [3] [4] [5]
- Spermatophyta и Pteridophyta , надродовые названия: 4 августа 1789 г. ( Jussieu , Genera plantarum );
- Musci (кроме Sphagnaceae): 1 января 1801 г. ( Hedwig , Species muscorum );
- Sphagnaceae и Hepaticae (включая Anthocerotae ), надродовые названия: 4 августа 1789 г. (Jussieu, Genera plantarum );
- ( Грибы :) Microsporidia регулируются ICZN (рассматриваются как животные), и см. Ниже для ископаемых грибов; [6]
- ( Водоросли :)
- Nostocaceae homocysteae: 1 января 1892 г. (Гомон, « Монография осциллярий »);
- Nostocaceae heterocysteae: 1 января 1886 г. ( Bornet & Flahault , « Révision des Nostocacées hétérocystées »);
- Desmidiaceae : 1 января 1848 г. ( Ralfs , British Desmidieae );
- Oedogoniaceae : 1 января 1900 г. ( Hirn , « Monographie und Iconographie der Oedogoniaceen »);
- Ископаемые растения , водоросли (заисключением диатомовых водорослей ) и грибы: 31 декабря 1820 г. ( Sternberg , Flora der Vorwelt ).
Исключения в зоологии: [7]
- Пауки : 1757 г. [ требуется уточнение ] ( Клерк , Араней Свечичи ).
Работы [ править ]
Существуют также различия в способах работы кодов. Например, ICN (код водорослей, грибов и растений) запрещает тавтонимы , а ICZN (код животных) их разрешает.
Терминология [ править ]
Эти кодексы различаются по терминологии, и существует долгосрочный проект по их «согласованию». Например, ICN использует «действительный» в «действительной публикации имени» (= акт публикации официального имени) с «установлением имени» в качестве эквивалента ICZN . В МКЗНА используют «действительный» в «действительном имени» (= «правильное название»), с «правильным именем» , как ICN эквивалент. Гармонизация идет очень ограниченно.
Типы [ править ]
Существуют различия в том, какие типы используются. Бактериологический код предпочитает живые типовые культуры, но допускает другие виды. Продолжаются дискуссии о том, какой тип более полезен для таких случаев, как цианобактерии . [8]
Другие коды [ править ]
Биокод [ править ]
Более радикальный подход был применен в 1997 г., когда Международный комитет по биономенклатуре (ICB) IUBS / IUMS представил долго обсуждаемый проект биокода , в котором было предложено заменить все существующие кодексы на их гармонизацию. [9] [10] Первоначально запланированной датой реализации проекта Биокода было 1 января 2000 г., но соглашение о замене существующих Кодов не было достигнуто.
В 2011 году был предложен пересмотренный Биокод, который вместо замены существующих кодов обеспечит для них единый контекст, ссылаясь на них, когда это необходимо. [11] [12] [13] В предлагаемых направлениях постепенно вносятся изменения в существующие коды. [14] [15]
PhyloCode [ править ]
Некоторые авторы столкнулись с проблемами при использовании системы Линнея в филогенетической классификации. [16] Другой Кодекс, разрабатываемый с 1998 года, - это Филокод , который будет регулировать то, что их создатели назвали филогенетической номенклатурой вместо традиционной номенклатуры Линнея (то есть он требует филогенетических определений как «типа», присваиваемых каждому имени, и не содержит обязательные звания). В Кодексе и сопровождающий объем (призвано служить в качестве списка не-подавленных имен и новая отправной точки, как 1980 - х года Утвержденных списков бактериальных названий [17] функции по отношению к бактериологическому кодексу , как иSystema naturae ( функции по отношению к Зоологическому кодексу ), однако, все еще находится на стадии разработки, и неизвестно, когда или даже будет ли код реализован в какой-либо форме.
Протисты амбирегнала [ править ]
Некоторые протисты , иногда называемые амбирегнальными протистами , считаются как простейшими, так и водорослями , или простейшими и грибами , и их названия были опубликованы либо под ICZN, либо под обоими ICZN и ICN . [18] [19] В результате двоякий язык во всех классификационных схемах протистов привел к путанице. [20] [21] [22]
Группы , заявленные как протозоологи и phycologists включают euglenids , динофлагелат , криптофитовые водоросли , гаптофитовые водоросли , глаукофитовые водоросли , многие heterokonts (например, золотистые , raphidophytes , silicoflagellates , некоторые xanthophytes , proteromonads ), некоторые monadoid зеленых водорослей ( volvocaleans и prasinophytes ), хоанофлагеллат , bicosoecids , ebriids ихлорарахниофиты .
Slime форма , плазмодии форма и другие « грибок типа » организмов , заявленных как протозоологи и микологии включают mycetozoans , plasmodiophorids , acrasids и labyrinthulomycetess . Грибы , заявленные как протозоологи и микологии включают chytrids , blastoclads , и кишечник грибки .
Другими проблемными группами являются цианобактерии (ICNP / ICN) и микроспоридии (ICZN / ICN).
Нерегулируемые таксоны [ править ]
Зоологический код не регулирует названия таксонов ниже , чем подвиды или выше , чем надсемейство. Было много попыток навести некоторый порядок в номенклатуре этих таксонов [23] [24], включая Филокод , или также в ограничительной номенклатуре . [25] [26]
Ботанический код применяется в основном в ряды семьи и ниже. Существуют некоторые правила для имен выше ранга семьи, но принцип приоритета к ним не применяется, а принцип типизации не является обязательным. Эти имена могут быть либо автоматически типизированными именами, либо описательными именами . [27] [28] В некоторых случаях таксон имеет два возможных названия (например, Chrysophyceae Pascher, 1914, ном. Описание ; Hibberd, 1976, ном. Типификатум). Описательные названия проблематичны, поскольку, если таксон разделен, не очевидно, какая новая группа получит существующее название. Между тем, с типизированными именами существующее имя принимается новой группой, которая все еще носит тип этого имени. Однако типизированные названия представляют собой особые проблемы для микроорганизмов. [22]
См. Также [ править ]
- Биноминальная номенклатура
- Ботаническая номенклатура
- Химическая номенклатура
- Распространенное имя
- Номенклатура генов
- Глоссарий научного нейминга
- Список таксонов, названных анаграммами
- Зоологическая номенклатура
Ссылки [ править ]
- ^ Николсон Дэн (1991). «История ботанической номенклатуры» . Летопись ботанического сада Миссури . 78 (1): 33–56. DOI : 10.2307 / 2399589 . JSTOR 2399589 .
- ^ Skerman ВБД, McGowan В., Снит PHA (1980). «Утвержденные списки названий бактерий» . Int. J. Syst. Бактериол . 30 : 225–420. DOI : 10.1099 / 00207713-30-1-225 .CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
- ^ Chitwood BG (1958). «Обозначение официальных названий высших таксонов беспозвоночных» . Бык. Zool. Номенклатурный . 15 : 860–895. DOI : 10.5962 / bhl.part.19410 .
- Перейти ↑ Silva PC (1958). «Более поздние отправные точки в водорослях» (PDF) . Таксон . 7 (7): 181–184. DOI : 10.2307 / 1216399 . JSTOR 1216399 .
- ^ ( Turland et al.2018 , статья 13)
- ^ ( Turland и др. 2018 , статья F.1.1)
- ^ ICZN - Международная комиссия по зоологической номенклатуре (1999). Международный кодекс зоологической номенклатуры . Четвертый выпуск. Международный фонд зоологической номенклатуры, Лондон, Великобритания. 306 с., [1] .
- ^ Ahoren Орен (2004). «Предложение о дальнейшей интеграции цианобактерий в соответствии с Бактериологическим кодексом» . Int. J. Syst. Evol. Microbiol . 54 (Pt 5): 1895–1902. DOI : 10.1099 / ijs.0.03008-0 . PMID 15388760 .
- ^ «Проект биокода » . 1997 г.
- ^ Джон Макнил (1996-11-04). «Глава 2. Биокод: интегрированная биологическая номенклатура 21 века?» . Материалы мини-симпозиума по биологической номенклатуре в 21 веке .
- ^ «Проект биокода (2011)» . Международный комитет по биономенклатуре (ICB).
- ↑ Greuter W., Garrity G., Hawksworth DL, Jahn R., Kirk PM, Knapp S., McNeill J., Michel E., Patterson DJ, Pyle R., Tindall BJ (2011). «Проект Биокода (2011 г.): Принципы и правила, регулирующие наименования организмов». Таксон . 60 : 201–212. DOI : 10.1002 / tax.601019 .CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
- ^ Hawksworth DL (2011). «Представляем черновой вариант биокода (2011 г.)» . Таксон . 60 (1): 199–200. DOI : 10.1002 / tax.601018 .
- ^ DL Hawksworth (2011) BioCode 2011. Введение. http://www.bionomenclature.net/biocode2011.html
- ^ Вернер Гройтер (2011) BioCode 2011. Пояснительный пролог. http://www.bionomenclature.net/biocode2011.html
- ^ de Queiroz, K .; Готье, Дж. (1990). Филогения как центральный принцип в таксономии: филогенетические определения названий таксонов. Syst. Zool. (39): 307–322. DOI: 10.2307 / 2992353 http://vertebrates.si.edu/herps/herps_pdfs/deQueiroz_pdfs/1990deQ_GauSZ.pdf .
- ^ ВБД Skerman, Vicki McGowan, и PHA Снит, 1989. Утвержденные списки Бактериальные имен, дополненного издания . Вашингтон (округ Колумбия): ASM Press
- ^ Корлисс, JO (1995). «Амбирегнальные протисты и коды номенклатуры: краткий обзор проблемы и предлагаемых решений» . Вестник зоологической номенклатуры . 52 : 11–17. DOI : 10.5962 / bhl.part.6717 .
- ^ ( Макнил и др. 2012 , Преамбула: 8)
- ^ Адл, С.М. и др. Разнообразие, номенклатура и таксономия простейших. Систематическая биология , стр. 684-689, 2007, [2] .
- ^ Elbrächter, M. et al. Составление программы исследований известковых динофлагеллят (Thoracosphaeraceae, Dinophyceae), включая номенклатурный синопсис родовых названий. Таксон 57, стр. 1289–1303, 2008, [3]
- ^ a b ( Лар и др., 2012 г. )
- Перейти ↑ Dubois, A. (2006). Предлагаемые правила включения имен зоологических таксонов более высокого ранга в Международный кодекс зоологической номенклатуры. 2. Предлагаемые Правила и их обоснование. Зоосистема , 28 (1): 165–258, [4] .
- ^ Frost, DR et al. (2006). Земноводное Древо Жизни. Бюллетень Американского музея естественной истории 297: 1–291, [5] ,
- ^ Клюге, штат НьюДжерси (2010). Обводные названия высших таксонов Hexapoda. Биономина, 1, 15-55, [6] .
- Перейти ↑ Kluge, NJ (1999). «Система альтернативных номенклатур надвидовых таксонов. Линнеевские и постлиннеевские принципы систематики». Энтомологическое обозрение . 79 (2): 133–147.
- ^ ( McNeill et al.2012 , статья 16)
- ^ ( Turland et al.2018 , статья 16)
Библиография [ править ]
- Лар, Daniel JG, Enrique Lara, и Эдвард Д. Митчелл (2012), "Время для регулирования микробных эукариотов номенклатуры", Биологический журнал Общества Линнея , 107 (3): 469-476, DOI : 10.1111 / j.1095-8312.2012 .01962.xCS1 maint: использует параметр авторов ( ссылка )
- McNeill, J .; Барри, Франция; Бак, WR; Демулин, В .; Greuter, W .; Хоксворт, DL; Herendeen, PS; Knapp, S .; Мархольд, К .; Prado, J .; Прюдом Ван Рейн, ВФ; Smith, GF; Wiersema, JH; Турланд, штат Нью-Джерси (2012). Международный кодекс ботанической номенклатуры (Мельбурн кодекс) , принятый на восемнадцатом Международном ботаническом конгрессе Мельбурн, Австралия, июль 2011 года . Regnum Vegetabile 154. ARG Gantner Verlag KG. ISBN 978-3-87429-425-6.
- Турланд, штат Нью-Джерси; Wiersema, JH; Барри, Франция; Greuter, W .; Хоксворт, DL; Herendeen, PS; Knapp, S .; Кусбер, WH; Ли, Д.-З .; Мархольд, К .; Май, TW; McNeill, J .; Монро, AM; Prado, J .; Цена, МДж; Смит, GF (2018). Международный кодекс ботанической номенклатуры (Shenzhen кодекс) , принятый Девятнадцатый Международный ботанический конгресс Шэньчжэнь, Китай, июль 2017 года . Regnum Vegetabile 159. Ботанические книги Кельца. ISBN 978-3-946583-16-5.
Внешние ссылки [ править ]
- Биокод в действии на портале Смитсоновского океана
- ICN : Кодекс Шэньчжэня (2018)
- МКЗН : «зеленая книга» (1999)
- Список прокариотических имен со статусом в номенклатуре (1997), JP Euzéby
- Введение в биокод (2011)
- Филокод