Область холодного шока

CSD

структура раствора одноцепочечного ДНК-связывающего домена холодного шока (csd) человеческого y-бокса белка 1 (yb1), определенная с помощью ЯМР (10 низкоэнергетических структур)

Идентификаторы

Условное обозначение

CSD

Pfam

Клан пфам

ИнтерПро

PROSITE

SCOP2

1МЖК / СФЕРА / СУПФАМ

CDD

cd04458

Доступные белковые структуры:
Pfam	структуры / ECOD
PDB	RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsum	краткое изложение структуры

В молекулярной биологии домен холодового шока ( CSD ) представляет собой белковый домен из примерно 70 аминокислот, который был обнаружен в прокариотических и эукариотических ДНК- связывающих белках . ^[1]^[2]^[3] Часть этого домена очень похожа на мотив связывания РНК RNP-1 . ^[4]

Когда Escherichia coli подвергается воздействию падения температуры с 37 до 10 градусов по Цельсию, наступает фаза задержки на 4–5 часов, после которой рост возобновляется с меньшей скоростью . ^[5] Во время лаг-фазы экспрессия примерно 13 белков, содержащих домены холодного шока, увеличивается в 2-10 раз. ^[6] Считается, что эти так называемые белки « холодного шока » помогают клетке выживать при температурах ниже оптимальной температуры роста, в отличие от белков теплового шока , которые помогают клетке выживать при температурах выше оптимальной, возможно, за счет конденсация хромосомы и организация прокариотического нуклеоида . ^[5]

Ссылки [ править ]

^ Донайджер J, D Ландсман, Гонда М.А., Wistow С (апрель 1992 г.). «Продукт unr, высококонсервативного гена перед N-ras, содержит множество повторов, подобных домену холодового шока (CSD), предполагаемому ДНК-связывающему мотиву». New Biol . 4 (4): 389–95. PMID 1622933 .
^ Wistow G (апрель 1990). «Холодовой шок и связывание ДНК» . Природа . 344 (6269): 823–4. DOI : 10.1038 / 344823c0 . PMID 2184368 . S2CID 4307500 .
^ Jones PG, Иноуай M (март 1994). «Реакция на холодовой шок - горячая тема» . Мол. Microbiol . 11 (5): 811–8. DOI : 10.1111 / j.1365-2958.1994.tb00359.x . PMID 8022259 .
^ Ландсман D (июнь 1992). «РНП-1, РНК-связывающий мотив, консервативен в ДНК-связывающем домене холодового шока» . Nucleic Acids Res . 20 (11): 2861–4. DOI : 10.1093 / NAR / 20.11.2861 . PMC 336933 . PMID 1614871 .
^ a b Obokata J, Ohme M, Hayashida N (октябрь 1991 г.). «Нуклеотидная последовательность клона кДНК, кодирующего предполагаемый богатый глицином белок с массой 19,7 кДа у Nicotiana sylvestris». Завод Мол. Биол . 17 (4): 953–5. DOI : 10.1007 / bf00037080 . PMID 1912512 . S2CID 11927654 .
^ Тафури SR, Wolffe AP (ноябрь 1990). «Факторы транскрипции Xenopus Y-box: молекулярное клонирование, функциональный анализ и регуляция развития» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 87 (22): 9028–32. DOI : 10.1073 / pnas.87.22.9028 . PMC 55094 . PMID 2247479 .

Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR002059

[pmid1622933-1] Донайджер J, D Ландсман, Гонда М.А., Wistow С (апрель 1992 г.). «Продукт unr, высококонсервативного гена перед N-ras, содержит множество повторов, подобных домену холодового шока (CSD), предполагаемому ДНК-связывающему мотиву». New Biol . 4 (4): 389–95. PMID 1622933 .

[pmid2184368-2] Wistow G (апрель 1990). «Холодовой шок и связывание ДНК» . Природа . 344 (6269): 823–4. DOI : 10.1038 / 344823c0 . PMID 2184368 . S2CID 4307500 .

[pmid8022259-3] Jones PG, Иноуай M (март 1994). «Реакция на холодовой шок - горячая тема» . Мол. Microbiol . 11 (5): 811–8. DOI : 10.1111 / j.1365-2958.1994.tb00359.x . PMID 8022259 .

[pmid1614871-4] Ландсман D (июнь 1992). «РНП-1, РНК-связывающий мотив, консервативен в ДНК-связывающем домене холодового шока» . Nucleic Acids Res . 20 (11): 2861–4. DOI : 10.1093 / NAR / 20.11.2861 . PMC 336933 . PMID 1614871 .

[pmid1912512-5] Obokata J, Ohme M, Hayashida N (октябрь 1991 г.). «Нуклеотидная последовательность клона кДНК, кодирующего предполагаемый богатый глицином белок с массой 19,7 кДа у Nicotiana sylvestris». Завод Мол. Биол . 17 (4): 953–5. DOI : 10.1007 / bf00037080 . PMID 1912512 . S2CID 11927654 .

[pmid2247479-6] Тафури SR, Wolffe AP (ноябрь 1990). «Факторы транскрипции Xenopus Y-box: молекулярное клонирование, функциональный анализ и регуляция развития» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 87 (22): 9028–32. DOI : 10.1073 / pnas.87.22.9028 . PMC 55094 . PMID 2247479 .

[1]